41 genes were found for organism Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Slin_6974  CDS  NC_013733  115  669  -  555  hypothetical protein  YP_003391717  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6975  CDS  NC_013733  840  1250  -  411  hypothetical protein  YP_003391718  normal  1  normal  0.83066  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6976  CDS  NC_013733  1432  1788  -  357  hypothetical protein  YP_003391719  normal  1  normal  0.819705  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6977  CDS  NC_013733  2177  2320  -  144  hypothetical protein  YP_003391720  normal  1  normal  0.973049  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6978  CDS  NC_013733  2759  3088  -  330  hypothetical protein  YP_003391721  normal  1  normal  0.802196  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6979  CDS  NC_013733  3261  4004  -  744  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_003391722  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6980  CDS  NC_013733  4053  5594  -  1542  Integrase catalytic region  YP_003391723  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6981  CDS  NC_013733  5919  7577  +  1659  hypothetical protein  YP_003391724  normal  1  normal  0.478053  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6982  CDS  NC_013733  7622  8596  +  975  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_003391725  normal  1  normal  0.699134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6983  CDS  NC_013733  8619  9311  +  693  two component transcriptional regulator, LytTR family  YP_003391726  normal  0.659349  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6984  CDS  NC_013733  9547  10002  -  456  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  YP_003391727  normal  0.497869  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6985  CDS  NC_013733  10209  10505  +  297  transposase IS3/IS911 family protein  YP_003391728  normal  0.345794  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6986    NC_013733  10511  10900  +  390      normal  0.244734  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6987  CDS  NC_013733  11499  13022  +  1524  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_003391729  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6988  CDS  NC_013733  13015  13545  +  531  Integrase catalytic region  YP_003391730  normal  1  normal  0.870361  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6989  CDS  NC_013733  14085  16862  +  2778  small GTP-binding protein  YP_003391731  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6990  CDS  NC_013733  17022  18305  -  1284  hypothetical protein  YP_003391732  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6991  CDS  NC_013733  18391  19035  -  645  hypothetical protein  YP_003391733  normal  0.713453  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6992  CDS  NC_013733  19032  19811  -  780  transposase IS4 family protein  YP_003391734  normal  0.593642  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6993  CDS  NC_013733  19847  20347  -  501  hypothetical protein  YP_003391735  normal  0.397687  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6994  CDS  NC_013733  20452  20931  -  480  hypothetical protein  YP_003391736  normal  0.554663  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6995  CDS  NC_013733  21045  21152  -  108  hypothetical protein  YP_003391737  normal  0.258963  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6996  CDS  NC_013733  21743  22285  +  543  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  YP_003391738  normal  0.185924  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6997  CDS  NC_013733  22328  22615  +  288  hypothetical protein  YP_003391739  normal  0.333752  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6998  CDS  NC_013733  22653  22940  -  288  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  YP_003391740  normal  0.337811  normal  0.775047  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6999  CDS  NC_013733  23017  23301  -  285  plasmid maintenance system killer  YP_003391741  normal  0.17446  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7000  CDS  NC_013733  23621  23872  +  252  hypothetical protein  YP_003391742  normal  0.395075  normal  0.747066  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7001  CDS  NC_013733  23940  24419  -  480  hypothetical protein  YP_003391743  normal  0.632264  normal  0.82517  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7002  CDS  NC_013733  24416  24982  -  567  hypothetical protein  YP_003391744  normal  1  normal  0.643238  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7003  CDS  NC_013733  26503  26634  +  132  hypothetical protein  YP_003391745  normal  0.610546  normal  0.727239  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7004  CDS  NC_013733  26829  26981  +  153  hypothetical protein  YP_003391746  normal  0.525053  normal  0.743196  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7005  CDS  NC_013733  26978  27280  -  303  hypothetical protein  YP_003391747  normal  0.425281  normal  0.994099  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7006  CDS  NC_013733  27549  28520  -  972  hypothetical protein  YP_003391748  normal  0.68287  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7007  CDS  NC_013733  28968  29897  -  930  plasmid encoded RepA protein  YP_003391749  normal  0.543469  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7008  CDS  NC_013733  29894  30193  -  300  hypothetical protein  YP_003391750  normal  0.354331  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7009  CDS  NC_013733  30162  30833  -  672  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_003391751  normal  0.295052  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7010  CDS  NC_013733  31471  32121  +  651  Resolvase domain protein  YP_003391752  normal  0.998314  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7011  CDS  NC_013733  33601  34581  +  981  Thioredoxin domain protein  YP_003391753  normal  0.817681  normal  0.78664  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7012  CDS  NC_013733  34717  35412  +  696  hypothetical protein  YP_003391754  normal  0.932672  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7013  CDS  NC_013733  35535  35921  +  387  hypothetical protein  YP_003391755  normal  0.916387  normal  0.819705  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_7014  CDS  NC_013733  36163  36387  +  225  hypothetical protein  YP_003391756  normal  1  normal  0.769679  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>