7130 genes were found for organism Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Slin_0001  CDS  NC_013730  60  1469  1410  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003384874  normal  0.280164  normal  0.937405  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0002  CDS  NC_013730  1537  2535  999  hypothetical protein  YP_003384875  hitchhiker  0.00618291  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0003  CDS  NC_013730  2565  3431  867  hypothetical protein  YP_003384876  hitchhiker  1.612e-05  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0004  CDS  NC_013730  3527  4132  606  hypothetical protein  YP_003384877  hitchhiker  4.0409e-08  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0005  CDS  NC_013730  4301  6628  2328  polymorphic outer membrane protein  YP_003384878  unclonable  7.10623e-08  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0006  CDS  NC_013730  6752  7306  555  hypothetical protein  YP_003384879  decreased coverage  3.84761e-09  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0007  CDS  NC_013730  7293  8048  756  transposase IS4 family protein  YP_003384880  decreased coverage  3.81041e-09  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0008  CDS  NC_013730  8242  9033  792  hypothetical protein  YP_003384881  hitchhiker  5.1301e-08  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0009  CDS  NC_013730  9064  10095  1032  aminopeptidase  YP_003384882  hitchhiker  7.16532e-07  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0010  CDS  NC_013730  10206  10847  642  isochorismatase hydrolase  YP_003384883  hitchhiker  2.2819e-07  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0011  CDS  NC_013730  10899  12182  1284  beta-lactamase  YP_003384884  hitchhiker  1.20746e-06  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0012  CDS  NC_013730  12245  12832  588  acetyltransferase  YP_003384885  hitchhiker  3.88792e-06  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0013  CDS  NC_013730  12840  13940  1101  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_003384886  hitchhiker  6.40501e-05  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0014  CDS  NC_013730  14015  15139  1125  amidohydrolase 2  YP_003384887  hitchhiker  0.00386007  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0015  CDS  NC_013730  15164  15643  480  2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_003384888  normal  0.0237994  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0016  CDS  NC_013730  15640  15849  210  hypothetical protein  YP_003384889  normal  0.0766024  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0017  CDS  NC_013730  15870  16016  147  hypothetical protein  YP_003384890  normal  0.161875  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0018  CDS  NC_013730  16029  16382  354  DNA polymerase beta domain protein region  YP_003384891  normal  0.21199  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0019  CDS  NC_013730  16399  17640  1242  peptidase M16 domain protein  YP_003384892  normal  0.638871  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0020  CDS  NC_013730  17739  18857  1119  hypothetical protein  YP_003384893  normal  0.641333  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0021  CDS  NC_013730  19274  22204  2931  TonB-dependent receptor  YP_003384894  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0022  CDS  NC_013730  22250  23938  1689  RagB/SusD domain protein  YP_003384895  normal  0.201745  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0023  CDS  NC_013730  24042  26036  1995  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_003384896  normal  0.0608754  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0024  CDS  NC_013730  26272  27069  798  Ion transport protein  YP_003384897  normal  0.0306194  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0025  CDS  NC_013730  27147  28484  1338  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003384898  decreased coverage  0.00511907  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0026  CDS  NC_013730  28851  29558  708  hypothetical protein  YP_003384899  hitchhiker  0.00586095  normal  0.766607  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0027  CDS  NC_013730  29890  31419  1530  Esterase/lipase-like protein  YP_003384900  normal  0.0272532  normal  0.692184  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0028  CDS  NC_013730  31922  32269  348  hypothetical protein  YP_003384901  normal  0.146692  normal  0.834607  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0029  CDS  NC_013730  32394  33710  1317  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  YP_003384902  normal  0.919202  normal  0.63493  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0030  CDS  NC_013730  33811  36171  2361  TonB-dependent receptor plug  YP_003384903  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0031  CDS  NC_013730  36174  37211  1038  hypothetical protein  YP_003384904  normal  normal  0.618499  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0032  CDS  NC_013730  37215  38456  1242  Lytic transglycosylase catalytic  YP_003384905  normal  normal  0.367331  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0033  CDS  NC_013730  38586  39683  1098  Lytic transglycosylase catalytic  YP_003384906  normal  normal  0.356034  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0034  CDS  NC_013730  40076  41143  1068  Lytic transglycosylase catalytic  YP_003384907  normal  0.312775  normal  0.0969684  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0035  CDS  NC_013730  41332  43455  2124  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_003384908  normal  0.142382  normal  0.0608085  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0036  CDS  NC_013730  43666  44238  573  hypothetical protein  YP_003384909  hitchhiker  0.00243745  normal  0.0775702  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0037  CDS  NC_013730  44372  44893  522  hypothetical protein  YP_003384910  decreased coverage  0.00120893  normal  0.0749843  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0038  CDS  NC_013730  45015  47438  2424  peptidase S45 penicillin amidase  YP_003384911  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0039  CDS  NC_013730  47569  49368  1800  arginyl-tRNA synthetase  YP_003384912  normal  0.285018  normal  0.0776701  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0040  CDS  NC_013730  49436  50056  621  Peroxiredoxin  YP_003384913  normal  normal  0.0496109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0041  CDS  NC_013730  50157  51050  894  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  YP_003384914  normal  normal  0.0820844  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0042  CDS  NC_013730  51177  53501  2325  metallophosphoesterase  YP_003384915  normal  normal  0.0825488  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0043  CDS  NC_013730  53593  53937  345  hypothetical protein  YP_003384916  normal  normal  0.0999473  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0044  CDS  NC_013730  54189  57635  3447  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_003384917  normal  normal  0.192264  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0045  CDS  NC_013730  57815  58840  1026  hypothetical protein  YP_003384918  normal  normal  0.242935  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0046  CDS  NC_013730  58840  60138  1299  OmpA/MotB domain protein  YP_003384919  normal  0.970824  normal  0.132697  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0047  CDS  NC_013730  60393  61808  1416  oxidoreductase domain protein  YP_003384920  normal  normal  0.145616  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0048  CDS  NC_013730  61969  63366  1398  hypothetical protein  YP_003384921  normal  0.883134  normal  0.195885  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0049  CDS  NC_013730  63469  64644  1176  oxidoreductase domain protein  YP_003384922  normal  0.0595236  normal  0.22981  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0050  CDS  NC_013730  64815  65309  495  hypothetical protein  YP_003384923  normal  0.104101  normal  0.143319  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0051  CDS  NC_013730  65514  65969  456  hypothetical protein  YP_003384924  normal  0.0978625  normal  0.136632  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0052  CDS  NC_013730  65941  66189  249  protein of unknown function UPF0175  YP_003384925  normal  0.0476842  normal  0.242874  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0053    NC_013730  66233  66418  186      normal  0.0723262  normal  0.173998  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0054  CDS  NC_013730  66635  67147  513  hypothetical protein  YP_003384926  normal  0.125239  normal  0.187529  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0055  CDS  NC_013730  67144  68046  903  hypothetical protein  YP_003384927  normal  0.128014  normal  0.217775  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0056  CDS  NC_013730  68211  68684  474  hypothetical protein  YP_003384928  normal  0.305512  normal  0.187529  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0057  CDS  NC_013730  68684  69709  1026  protein of unknown function DUF262  YP_003384929  normal  0.542599  normal  0.294632  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0058  CDS  NC_013730  69864  71945  2082  Glycoside hydrolase 97  YP_003384930  normal  normal  0.52966  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0059  CDS  NC_013730  72173  73513  1341  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_003384931  normal  normal  0.447453  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0060  CDS  NC_013730  73770  75167  1398  Pyridoxal-dependent decarboxylase  YP_003384932  normal  normal  0.474391  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0061  CDS  NC_013730  75252  77219  1968  K potassium transporter  YP_003384933  normal  normal  0.685026  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0062  CDS  NC_013730  77707  79428  1722  potassium-transporting ATPase, A subunit  YP_003384934  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0063  CDS  NC_013730  79772  80101  330  hypothetical protein  YP_003384935  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0064  CDS  NC_013730  80121  82280  2160  K+-transporting ATPase, B subunit  YP_003384936  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0065  CDS  NC_013730  82362  82970  609  potassium-transporting ATPase, C subunit  YP_003384937  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0066  CDS  NC_013730  83020  84135  1116  hypothetical protein  YP_003384938  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0067  CDS  NC_013730  84266  85390  1125  Osmosensitive K channel His kinase sensor  YP_003384939  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0068  CDS  NC_013730  85393  87207  1815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003384940  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0069  CDS  NC_013730  87249  88082  834  Crp/FNR family transcriptional regulator  YP_003384941  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0070  CDS  NC_013730  88095  89051  957  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  YP_003384942  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0071  CDS  NC_013730  89185  89463  279  hypothetical protein  YP_003384943  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0072  CDS  NC_013730  89460  89924  465  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003384944  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0073  CDS  NC_013730  89915  90523  609  hypothetical protein  YP_003384945  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0074  CDS  NC_013730  90536  91438  903  NmrA family protein  YP_003384946  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0075  CDS  NC_013730  91549  91938  390  transcriptional regulator, HxlR family  YP_003384947  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0076  CDS  NC_013730  92041  92964  924  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  YP_003384948  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0077  CDS  NC_013730  93157  94080  924  ribonuclease BN  YP_003384949  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0078  CDS  NC_013730  94083  94808  726  protein of unknown function DUF72  YP_003384950  normal  0.483229  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0079  CDS  NC_013730  94832  95314  483  protein of unknown function DUF1452  YP_003384951  normal  0.469341  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0080  CDS  NC_013730  95882  96397  516  hypothetical protein  YP_003384952  normal  0.366209  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0081  CDS  NC_013730  96568  97122  555  hypothetical protein  YP_003384953  normal  0.0519356  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0082  CDS  NC_013730  97162  98550  1389  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  YP_003384954  normal  0.106273  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0083  CDS  NC_013730  98650  99873  1224  hypothetical protein  YP_003384955  normal  0.240195  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0084  CDS  NC_013730  99936  101099  1164  3-dehydroquinate synthase  YP_003384956  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0085  CDS  NC_013730  101321  102073  753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003384957  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0086  CDS  NC_013730  102134  102952  819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003384958  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0087  CDS  NC_013730  102985  103866  882  hypothetical protein  YP_003384959  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0088  CDS  NC_013730  103992  105017  1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_003384960  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0089  CDS  NC_013730  105221  105892  672  hypothetical protein  YP_003384961  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0090  CDS  NC_013730  105899  106429  531  hypothetical protein  YP_003384962  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0091  CDS  NC_013730  106463  106924  462  hypothetical protein  YP_003384963  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0092  CDS  NC_013730  106991  107434  444  transcriptional regulator, MarR family  YP_003384964  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0093  CDS  NC_013730  107529  108533  1005  Bile acid:sodium symporter  YP_003384965  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0094    NC_013730  108853  111941  3089      normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0095  CDS  NC_013730  111967  113388  1422  hypothetical protein  YP_003384966  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0096  CDS  NC_013730  113479  114399  921  Ppx/GppA phosphatase  YP_003384967  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0097  CDS  NC_013730  114457  114654  198  ribosomal protein S21  YP_003384968  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0098  CDS  NC_013730  115041  115937  897  integrase family protein  YP_003384969  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0099  CDS  NC_013730  116280  118520  2241  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_003384970  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_0100  CDS  NC_013730  118526  118951  426  response regulator receiver protein  YP_003384971  normal  normal  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>