4470 genes were found for organism Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dtox_0001  CDS  NC_013216  31  1371  1341  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003189589  decreased coverage  2.08181e-06  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0002  CDS  NC_013216  1591  2694  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003189590  normal  0.226085  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0003  CDS  NC_013216  2713  2928  216  RNA-binding S4 domain protein  YP_003189591  normal  0.518781  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0004  CDS  NC_013216  2952  4082  1131  DNA replication and repair protein RecF  YP_003189592  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0005  CDS  NC_013216  4083  4331  249  hypothetical protein  YP_003189593  normal  normal  0.929615  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0006  CDS  NC_013216  4580  6487  1908  DNA gyrase, B subunit  YP_003189594  normal  normal  0.98095  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0007  CDS  NC_013216  6533  8968  2436  DNA gyrase, A subunit  YP_003189595  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0008  CDS  NC_013216  9395  9616  222  hypothetical protein  YP_003189596  normal  0.424203  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0009  CDS  NC_013216  9951  11333  1383  FAD dependent oxidoreductase  YP_003189597  normal  0.225553  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0010  CDS  NC_013216  11364  12647  1284  adenylosuccinate synthetase  YP_003189598  decreased coverage  0.000465701  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0011  CDS  NC_013216  13021  15402  2382  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  YP_003189599  hitchhiker  0.00580778  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0012    NC_013216  15672  16171  500      normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0013  CDS  NC_013216  16460  16975  516  hypothetical protein  YP_003189600  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0014  CDS  NC_013216  16965  17210  246  hypothetical protein  YP_003189601  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0015  CDS  NC_013216  17213  17644  432  hypothetical protein  YP_003189602  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0016  CDS  NC_013216  18103  18381  279  hypothetical protein  YP_003189603  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0017  CDS  NC_013216  18498  19040  543  protein of unknown function DUF820  YP_003189604  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0018  CDS  NC_013216  19563  20468  906  hypothetical protein  YP_003189605  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0019  CDS  NC_013216  20864  21844  981  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003189606  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0020  CDS  NC_013216  22081  22455  375  LrgA family protein  YP_003189607  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0021  CDS  NC_013216  22461  23162  702  LrgB family protein  YP_003189608  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0022  CDS  NC_013216  23189  23683  495  transcriptional regulator, AsnC family  YP_003189609  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0023  CDS  NC_013216  24271  25284  1014  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  YP_003189610  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0024  CDS  NC_013216  25296  25958  663  methyltransferase cognate corrinoid protein  YP_003189611  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0025  CDS  NC_013216  25960  27348  1389  Monomethylamine methyltransferase MtmB  YP_003189612  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0026  CDS  NC_013216  27663  29606  1944  ferredoxin  YP_003189613  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0027  CDS  NC_013216  29729  30565  837  Pyrrolysine-tRNA ligase  YP_003189614  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0028  CDS  NC_013216  30609  31715  1107  Radical SAM domain protein  YP_003189615  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0029  CDS  NC_013216  31706  32866  1161  protein of unknown function DUF201  YP_003189616  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0030  CDS  NC_013216  32918  33733  816  hypothetical protein  YP_003189617  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0031  CDS  NC_013216  33752  34114  363  hypothetical protein  YP_003189618  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0032  CDS  NC_013216  34794  36182  1389  ammonium transporter  YP_003189619  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0033  CDS  NC_013216  36240  36578  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_003189620  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0034  CDS  NC_013216  36797  37036  240  hypothetical protein  YP_003189621  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0035  CDS  NC_013216  37173  37316  144  hypothetical protein  YP_003189622  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0036  CDS  NC_013216  37341  38129  789  protein of unknown function DUF45  YP_003189623  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0037  CDS  NC_013216  38143  38841  699  protein of unknown function DUF1648  YP_003189624  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0038  CDS  NC_013216  38838  39107  270  transcriptional regulator, ArsR family  YP_003189625  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0039  CDS  NC_013216  39354  40082  729  spore cortex-lytic enzyme  YP_003189626  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0040  CDS  NC_013216  40101  41465  1365  germination protein YpeB  YP_003189627  normal  normal  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0041  CDS  NC_013216  41935  43143  1209  aminotransferase class I and II  YP_003189628  normal  0.782752  normal  0.197817  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0042  CDS  NC_013216  43421  44719  1299  Phenylacetate--CoA ligase  YP_003189629  normal  normal  0.125903  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0043    NC_013216  44861  45118  258      normal  normal  0.0929889  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0044  CDS  NC_013216  45177  46634  1458  transposase, IS605 OrfB family  YP_003189630  normal  normal  0.0131962  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0045  CDS  NC_013216  46902  48671  1770  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  YP_003189631  normal  normal  0.0266791  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0046  CDS  NC_013216  48664  49239  576  Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  YP_003189632  normal  normal  0.0352334  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0047  CDS  NC_013216  49431  51647  2217  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_003189633  normal  hitchhiker  0.00846465  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0048  CDS  NC_013216  51719  52291  573  hypothetical protein  YP_003189634  normal  hitchhiker  0.00451249  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0049  CDS  NC_013216  52663  54123  1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_003189635  normal  hitchhiker  0.00627609  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0050  CDS  NC_013216  54120  56735  2616  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003189636  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0051  CDS  NC_013216  57041  57463  423  hypothetical protein  YP_003189637  hitchhiker  8.57319e-06  decreased coverage  0.000703978  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0052  CDS  NC_013216  57471  59183  1713  arginyl-tRNA synthetase  YP_003189638  unclonable  9.95895e-08  decreased coverage  0.000521306  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0053  CDS  NC_013216  59197  59370  174  hypothetical protein  YP_003189639  unclonable  3.91068e-10  hitchhiker  0.000694436  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0054  CDS  NC_013216  59444  61054  1611  CTP synthetase  YP_003189640  unclonable  5.43339e-08  hitchhiker  0.00121166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0055  CDS  NC_013216  61350  61751  402  response regulator receiver protein  YP_003189641  normal  0.0166098  hitchhiker  0.000805427  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0056  CDS  NC_013216  61854  62534  681  hypothetical protein  YP_003189642  normal  0.0454278  hitchhiker  0.000913581  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0057  CDS  NC_013216  62600  63454  855  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  YP_003189643  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0058  CDS  NC_013216  63460  64119  660  transaldolase  YP_003189644  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0059  CDS  NC_013216  64192  65502  1311  transcription termination factor Rho  YP_003189645  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0060  CDS  NC_013216  65587  66549  963  Peptidase M23  YP_003189646  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0061  CDS  NC_013216  66645  67910  1266  Radical SAM domain protein  YP_003189647  unclonable  1.35006e-08  hitchhiker  0.00291545  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0062  CDS  NC_013216  68055  68261  207  ribosomal protein L31  YP_003189648  unclonable  3.50095e-10  hitchhiker  0.00194298  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0063  CDS  NC_013216  68532  69407  876  protein of unknown function DUF1385  YP_003189649  unclonable  3.82e-09  hitchhiker  0.00259146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0064  CDS  NC_013216  69400  70467  1068  peptide chain release factor 1  YP_003189650  unclonable  7.29315e-09  hitchhiker  0.00306425  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0065  CDS  NC_013216  70489  71358  870  modification methylase, HemK family  YP_003189651  hitchhiker  7.87039e-08  hitchhiker  0.00284292  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0066  CDS  NC_013216  71904  72830  927  response regulator receiver modulated CheW protein  YP_003189652  hitchhiker  1.19617e-06  hitchhiker  0.00287896  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0067  CDS  NC_013216  73077  73337  261  hypothetical protein  YP_003189653  hitchhiker  1.40816e-06  hitchhiker  0.0049933  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0068  CDS  NC_013216  73396  73548  153  hypothetical protein  YP_003189654  hitchhiker  5.34426e-06  hitchhiker  0.00487275  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0069  CDS  NC_013216  73616  74974  1359  Radical SAM domain protein  YP_003189655  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0070  CDS  NC_013216  75136  75741  606  TPR repeat-containing protein  YP_003189656  hitchhiker  1.34059e-05  normal  0.0131239  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0071  CDS  NC_013216  75959  76873  915  hypothetical protein  YP_003189657  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0072  CDS  NC_013216  76973  78229  1257  UDP-N-acetylglucosamine1- carboxyvinyltransferase  YP_003189658  hitchhiker  0.000298929  normal  0.037429  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0073  CDS  NC_013216  78247  78726  480  protein of unknown function DUF163  YP_003189659  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0074  CDS  NC_013216  78981  79169  189  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003189660  normal  0.112658  normal  0.013412  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0075  CDS  NC_013216  79361  80230  870  Nitrate reductase gamma subunit  YP_003189661  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0076  CDS  NC_013216  80217  81581  1365  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  YP_003189662  normal  normal  0.0100734  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0077  CDS  NC_013216  81736  82053  318  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  YP_003189663  normal  hitchhiker  0.00595568  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0078  CDS  NC_013216  82275  83684  1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_003189664  normal  hitchhiker  0.00826564  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0079  CDS  NC_013216  83925  85343  1419  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  YP_003189665  normal  hitchhiker  0.00895791  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0080  CDS  NC_013216  85377  86564  1188  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  YP_003189666  normal  0.580502  hitchhiker  0.00395825  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0081  CDS  NC_013216  86595  86828  234  Dissimilatory sulfite reductase D  YP_003189667  normal  0.310625  hitchhiker  0.00257513  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0082  CDS  NC_013216  86931  87557  627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003189668  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0083  CDS  NC_013216  87560  88153  594  protein of unknown function UPF0153  YP_003189669  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0084  CDS  NC_013216  88158  88358  201  hypothetical protein  YP_003189670  normal  0.237654  hitchhiker  0.00252735  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0085  CDS  NC_013216  88463  89593  1131  hypothetical protein  YP_003189671  normal  0.42821  hitchhiker  0.00374678  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0086  CDS  NC_013216  89597  89842  246  regulatory protein, FmdB family  YP_003189672  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0087  CDS  NC_013216  90047  90214  168  hypothetical protein  YP_003189673  normal  0.75683  hitchhiker  0.00259146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0088  CDS  NC_013216  90540  94163  3624  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_003189674  normal  hitchhiker  0.000440462  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0089  CDS  NC_013216  94315  96738  2424  S-layer domain protein  YP_003189675  normal  hitchhiker  0.00025043  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0090  CDS  NC_013216  96839  97030  192  hypothetical protein  YP_003189676  normal  hitchhiker  1.72014e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0091  CDS  NC_013216  97058  99118  2061  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  YP_003189677  normal  hitchhiker  1.01658e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0092  CDS  NC_013216  99928  101511  1584  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_003189678  normal  hitchhiker  8.33689e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0093  CDS  NC_013216  101549  101863  315  hypothetical protein  YP_003189679  normal  0.790212  hitchhiker  3.5436e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0094  CDS  NC_013216  101875  102474  600  recombination protein RecR  YP_003189680  normal  0.427132  hitchhiker  3.95528e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0095  CDS  NC_013216  102577  102840  264  pro-sigmaK processing inhibitor BofA  YP_003189681  normal  0.136251  hitchhiker  3.33931e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0096  CDS  NC_013216  103104  106628  3525  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_003189682  decreased coverage  0.000539296  hitchhiker  3.56908e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0097  CDS  NC_013216  106834  107010  177  hypothetical protein  YP_003189683  normal  hitchhiker  4.6764e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0098  CDS  NC_013216  106965  107231  267  hypothetical protein  YP_003189684  normal  hitchhiker  6.1351e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0099  CDS  NC_013216  107386  108915  1530  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_003189685  normal  hitchhiker  1.31597e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Dtox_0100  CDS  NC_013216  109028  109729  702  thymidylate kinase  YP_003189686  normal  hitchhiker  7.2842e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>