53 genes were found for organism Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dret_2500    NC_013224  28  651  +  624      normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2501  CDS  NC_013224  661  888  +  228  hypothetical protein  YP_003199360  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2502  CDS  NC_013224  930  1361  -  432  hypothetical protein  YP_003199361  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2503  CDS  NC_013224  1500  1853  -  354  transcriptional regulator, XRE family  YP_003199362  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2504  CDS  NC_013224  1822  2100  -  279  putative cytoplasmic protein  YP_003199363  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2505  CDS  NC_013224  2420  2821  +  402  hypothetical protein  YP_003199364  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2506  CDS  NC_013224  2835  3653  +  819  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_003199365  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2507  CDS  NC_013224  3657  5123  +  1467  hypothetical protein  YP_003199366  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2508    NC_013224  5159  6566  +  1408      normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2509  CDS  NC_013224  6547  6786  +  240  hypothetical protein  YP_003199367  normal  1  normal  0.914773  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2510  CDS  NC_013224  6987  7610  +  624  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_003199368  normal  1  normal  0.746062  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2511  CDS  NC_013224  7620  7847  +  228  hypothetical protein  YP_003199369  normal  1  normal  0.526212  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2512  CDS  NC_013224  8925  9404  +  480  hypothetical protein  YP_003199370  normal  1  normal  0.698397  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2513  CDS  NC_013224  9533  10174  +  642  hypothetical protein  YP_003199371  normal  1  normal  0.709117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2514  CDS  NC_013224  10683  10805  +  123  hypothetical protein  YP_003199372  normal  1  normal  0.819087  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2515  CDS  NC_013224  10786  11451  +  666  nuclease (SNase domain protein)  YP_003199373  normal  1  normal  0.893874  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2516  CDS  NC_013224  11423  11635  +  213  hypothetical protein  YP_003199374  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2517  CDS  NC_013224  11686  12366  +  681  hypothetical protein  YP_003199375  normal  1  normal  0.792598  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2518  CDS  NC_013224  12631  12978  +  348  hypothetical protein  YP_003199376  normal  1  normal  0.871393  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2519  CDS  NC_013224  13024  13407  +  384  hypothetical protein  YP_003199377  normal  1  normal  0.769591  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2520  CDS  NC_013224  13404  14297  +  894  Integrase catalytic region  YP_003199378  normal  1  normal  0.820258  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2521  CDS  NC_013224  14311  15426  +  1116  hypothetical protein  YP_003199379  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2522  CDS  NC_013224  15496  16902  +  1407  transcriptional regulator, XRE family  YP_003199380  normal  0.153243  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2523  CDS  NC_013224  16873  17844  -  972  hypothetical protein  YP_003199381  decreased coverage  0.000860556  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2524  CDS  NC_013224  17825  18055  -  231  transcriptional regulator, XRE family  YP_003199382  hitchhiker  0.000972778  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2525    NC_013224  18471  19216  +  746      normal  0.011661  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2526    NC_013224  19393  19716  +  324      normal  0.216699  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2527  CDS  NC_013224  19838  20239  +  402  hypothetical protein  YP_003199383  normal  0.466302  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2528  CDS  NC_013224  20229  20822  +  594  Excinuclease ABC C subunit domain protein  YP_003199384  normal  0.370584  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2529  CDS  NC_013224  20925  21581  -  657  integrase family protein  YP_003199385  normal  0.305462  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2530  CDS  NC_013224  22822  23283  +  462  hypothetical protein  YP_003199386  normal  1  normal  0.606957  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2531  CDS  NC_013224  23319  23747  +  429  hypothetical protein  YP_003199387  normal  1  normal  0.538016  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2532  CDS  NC_013224  23849  24571  +  723  hypothetical protein  YP_003199388  normal  1  normal  0.363811  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2533  CDS  NC_013224  25239  25475  +  237  hypothetical protein  YP_003199389  normal  0.855229  normal  0.521462  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2534    NC_013224  26056  27180  -  1125      hitchhiker  0.00291093  normal  0.672393  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2535  CDS  NC_013224  27776  28258  +  483  putative transposase  YP_003199390  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2536  CDS  NC_013224  28324  29301  +  978  Integrase catalytic region  YP_003199391  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2537  CDS  NC_013224  30203  30607  +  405  transcriptional regulator, MucR family  YP_003199392  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2538    NC_013224  30699  30872  -  174      hitchhiker  5.45175e-21  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2539  CDS  NC_013224  30965  32182  -  1218  protein of unknown function DUF262  YP_003199393  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2540  CDS  NC_013224  32807  32935  +  129  hypothetical protein  YP_003199394  hitchhiker  0.00000131147  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2541  CDS  NC_013224  33990  34469  -  480  hypothetical protein  YP_003199395  normal  0.063578  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2542  CDS  NC_013224  35091  35288  -  198  hypothetical protein  YP_003199396  normal  0.876251  normal  0.955388  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2543  CDS  NC_013224  35641  35877  +  237  hypothetical protein  YP_003199397  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2544  CDS  NC_013224  35877  39185  +  3309  hypothetical protein  YP_003199398  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2545  CDS  NC_013224  40214  40417  +  204  hypothetical protein  YP_003199399  normal  1  normal  0.512047  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2546  CDS  NC_013224  40444  41844  +  1401  hypothetical protein  YP_003199400  normal  1  normal  0.666829  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2547  CDS  NC_013224  41841  42299  +  459  hypothetical protein  YP_003199401  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2548  CDS  NC_013224  42389  43027  +  639  metallophosphoesterase  YP_003199402  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2549  CDS  NC_013224  43139  43897  +  759  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  YP_003199403  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2550  CDS  NC_013224  43922  44275  +  354  hypothetical protein  YP_003199404  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2551  CDS  NC_013224  44265  44822  -  558  hypothetical protein  YP_003199405  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Dret_2552  CDS  NC_013224  44877  45173  +  297  hypothetical protein  YP_003199406  normal  1  normal  1  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>