3184 genes were found for organism Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Elen_0001  CDS  NC_013204  67  1182  1116  transcriptional regulator, TrmB  YP_003180385  decreased coverage  6.56108e-07  hitchhiker  1.26577e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0002  CDS  NC_013204  1306  2868  1563  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003180386  decreased coverage  2.22997e-06  hitchhiker  1.4852e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0003  CDS  NC_013204  3231  4331  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003180387  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0004  CDS  NC_013204  4350  5612  1263  DNA replication and repair protein RecF  YP_003180388  hitchhiker  1.1529e-05  hitchhiker  4.44236e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0005  CDS  NC_013204  5609  6184  576  hypothetical protein  YP_003180389  decreased coverage  1.14784e-07  hitchhiker  3.16421e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0006  CDS  NC_013204  6356  8302  1947  DNA gyrase, B subunit  YP_003180390  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0007  CDS  NC_013204  8374  11172  2799  DNA gyrase, A subunit  YP_003180391  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0008    NC_013204  11273  11530  258      normal  0.169995  hitchhiker  0.000156253  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0009  CDS  NC_013204  11586  13253  1668  multi antimicrobial extrusion protein MatE  YP_003180392  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0010  CDS  NC_013204  13285  13794  510  protein of unknown function DUF151  YP_003180393  normal  hitchhiker  0.000315658  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0011  CDS  NC_013204  14418  15536  1119  hypothetical protein  YP_003180394  normal  hitchhiker  0.00105941  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0012  CDS  NC_013204  16015  16584  570  heat shock protein DnaJ domain protein  YP_003180395  normal  hitchhiker  0.00155448  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0013  CDS  NC_013204  16797  18608  1812  GTP-binding protein TypA  YP_003180396  normal  hitchhiker  0.00331586  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0014  CDS  NC_013204  18856  20112  1257  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_003180397  normal  hitchhiker  0.00968773  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0015  CDS  NC_013204  20306  21316  1011  ABC transporter related  YP_003180398  normal  normal  0.0396331  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0016  CDS  NC_013204  21777  23657  1881  Ricin B lectin  YP_003180399  normal  normal  0.111216  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0017  CDS  NC_013204  24125  25105  981  hypothetical protein  YP_003180400  normal  normal  0.684098  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0018  CDS  NC_013204  25115  28177  3063  hypothetical protein  YP_003180401  normal  normal  0.69615  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0019  CDS  NC_013204  28191  28646  456  hypothetical protein  YP_003180402  normal  0.541166  normal  0.616185  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0020  CDS  NC_013204  28791  29261  471  transcriptional regulator, MarR family  YP_003180403  normal  0.275315  normal  0.608175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0021  CDS  NC_013204  30020  30538  519  hypothetical protein  YP_003180404  hitchhiker  0.00366615  normal  0.596997  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0022  CDS  NC_013204  31390  31683  294  ribosomal protein S6  YP_003180405  decreased coverage  4.173e-08  normal  0.882806  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0023  CDS  NC_013204  31742  32197  456  single-strand binding protein  YP_003180406  decreased coverage  8.13945e-08  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0024  CDS  NC_013204  32219  32479  261  ribosomal protein S18  YP_003180407  hitchhiker  1.75752e-05  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0025  CDS  NC_013204  32495  33031  537  ribosomal protein L9  YP_003180408  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0026  CDS  NC_013204  33333  34745  1413  replicative DNA helicase  YP_003180409  normal  0.44109  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0027  CDS  NC_013204  34782  36068  1287  metallophosphoesterase  YP_003180410  normal  0.747459  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0028  CDS  NC_013204  36065  38371  2307  hypothetical protein  YP_003180411  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0029  CDS  NC_013204  38682  38939  258  transcriptional regulator, XRE family  YP_003180412  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0030  CDS  NC_013204  39176  39901  726  transcriptional regulator, AraC family  YP_003180413  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0031  CDS  NC_013204  40070  40990  921  Auxin Efflux Carrier  YP_003180414  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0032  CDS  NC_013204  41048  42631  1584  Amidohydrolase 3  YP_003180415  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0033  CDS  NC_013204  42668  43894  1227  Glutamate N-acetyltransferase  YP_003180416  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0034  CDS  NC_013204  44000  44923  924  Auxin Efflux Carrier  YP_003180417  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0035  CDS  NC_013204  45426  46742  1317  adenylosuccinate synthetase  YP_003180418  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0036  CDS  NC_013204  47085  48377  1293  phosphoribosylamine/glycine ligase  YP_003180419  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0037  CDS  NC_013204  48378  49694  1317  Coproporphyrinogen dehydrogenase  YP_003180420  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0038  CDS  NC_013204  49982  54097  4116  GLUG domain protein  YP_003180421  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0039  CDS  NC_013204  54097  54738  642  hypothetical protein  YP_003180422  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0040  CDS  NC_013204  54738  55058  321  hypothetical protein  YP_003180423  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0041  CDS  NC_013204  55060  55596  537  hypothetical protein  YP_003180424  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0042  CDS  NC_013204  55597  57303  1707  type II secretion system protein E  YP_003180425  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0043  CDS  NC_013204  57367  58422  1056  twitching motility protein  YP_003180426  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0044  CDS  NC_013204  58422  59630  1209  type II secretion system protein  YP_003180427  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0045  CDS  NC_013204  59734  60126  393  pilin like competence factor  YP_003180428  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0046  CDS  NC_013204  60130  61023  894  peptidase A24A domain protein  YP_003180429  normal  0.967031  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0047  CDS  NC_013204  61060  62055  996  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  YP_003180430  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0048  CDS  NC_013204  62058  62702  645  hypothetical protein  YP_003180431  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0049  CDS  NC_013204  62689  63288  600  hypothetical protein  YP_003180432  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0050  CDS  NC_013204  63330  65837  2508  diguanylate cyclase with extracellular sensor  YP_003180433  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0051  CDS  NC_013204  66333  66863  531  hypothetical protein  YP_003180434  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0052  CDS  NC_013204  67084  67263  180  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  YP_003180435  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0053  CDS  NC_013204  67427  68065  639  transcriptional regulator, TetR family  YP_003180436  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0054  CDS  NC_013204  68128  68598  471  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, catalytic subunit  YP_003180437  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0055  CDS  NC_013204  69375  69947  573  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003180438  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0056  CDS  NC_013204  69940  71709  1770  hypothetical protein  YP_003180439  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0057  CDS  NC_013204  71857  74064  2208  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  YP_003180440  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0058  CDS  NC_013204  74057  74653  597  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_003180441  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0059  CDS  NC_013204  74855  75841  987  diguanylate cyclase  YP_003180442  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0060  CDS  NC_013204  76198  77439  1242  Phenylacetate--CoA ligase  YP_003180443  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0061  CDS  NC_013204  77497  78900  1404  putative transcriptional regulator  YP_003180444  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0062  CDS  NC_013204  78936  80177  1242  hypothetical protein  YP_003180445  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0063  CDS  NC_013204  80167  83577  3411  putative ATP-binding protein  YP_003180446  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0064  CDS  NC_013204  83561  84244  684  hypothetical protein  YP_003180447  normal  0.333166  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0065  CDS  NC_013204  84244  85722  1479  hypothetical protein  YP_003180448  normal  0.950662  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0066  CDS  NC_013204  85881  86987  1107  hypothetical protein  YP_003180449  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0067  CDS  NC_013204  86987  89113  2127  hypothetical protein  YP_003180450  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0068  CDS  NC_013204  89977  91515  1539  Na+/solute symporter  YP_003180451  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0069  CDS  NC_013204  92318  93319  1002  protein of unknown function DUF218  YP_003180452  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0070  CDS  NC_013204  93685  95343  1659  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_003180453  normal  0.837679  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0071  CDS  NC_013204  95799  97337  1539  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  YP_003180454  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0072  CDS  NC_013204  97589  99022  1434  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003180455  normal  0.323936  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0073  CDS  NC_013204  99340  100260  921  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  YP_003180456  normal  0.35707  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0074  CDS  NC_013204  100493  100969  477  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  YP_003180457  normal  0.216243  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0075  CDS  NC_013204  101023  102339  1317  natural resistance-associated macrophage protein  YP_003180458  normal  0.289103  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0076  CDS  NC_013204  102344  103723  1380  MgtE intracellular region  YP_003180459  normal  0.740588  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0077  CDS  NC_013204  104347  104958  612  hypothetical protein  YP_003180460  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0078  CDS  NC_013204  105050  105439  390  hypothetical protein  YP_003180461  normal  0.984341  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0079  CDS  NC_013204  105497  106294  798  hypothetical protein  YP_003180462  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0080  CDS  NC_013204  106287  107204  918  ABC transporter related  YP_003180463  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0081  CDS  NC_013204  107247  107882  636  transcriptional regulator, TetR family  YP_003180464  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0082  CDS  NC_013204  108357  109370  1014  hypothetical protein  YP_003180465  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0083  CDS  NC_013204  109763  110530  768  ABC transporter related  YP_003180466  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0084  CDS  NC_013204  110532  112118  1587  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_003180467  normal  0.689632  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0085  CDS  NC_013204  112482  113828  1347  citrate synthase  YP_003180468  normal  0.691353  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0086  CDS  NC_013204  114741  116288  1548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  YP_003180469  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0087  CDS  NC_013204  116600  117514  915  transcriptional regulator, LysR family  YP_003180470  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0088  CDS  NC_013204  117523  118026  504  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_003180471  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0089  CDS  NC_013204  118023  119024  1002  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritolkinase  YP_003180472  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0090  CDS  NC_013204  119150  119704  555  LemA family protein  YP_003180473  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0091  CDS  NC_013204  119870  121852  1983  histidine kinase  YP_003180474  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0092  CDS  NC_013204  121961  122326  366  hypothetical protein  YP_003180475  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0093  CDS  NC_013204  122513  124516  2004  membrane protein-like protein  YP_003180476  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0094  CDS  NC_013204  125011  126318  1308  transposase mutator type  YP_003180477  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0095  CDS  NC_013204  126609  127067  459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_003180478  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0096  CDS  NC_013204  127107  127622  516  Shikimate kinase  YP_003180479  normal  0.650156  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0097  CDS  NC_013204  127804  128877  1074  twitching motility protein  YP_003180480  normal  0.767539  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0098  CDS  NC_013204  128888  129352  465  hypothetical protein  YP_003180481  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0099  CDS  NC_013204  129349  129813  465  hypothetical protein  YP_003180482  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Elen_0100  CDS  NC_013204  129813  130325  513  hypothetical protein  YP_003180483  normal  normal  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>