9510 genes were found for organism Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 96    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sros_0001  CDS  NC_013595  361  2109  1749  DNA replication initiation ATPase- like protein  YP_003335806  hitchhiker  5.23076e-06  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0002  CDS  NC_013595  2672  3811  1140  DNA-directed DNA polymerase  YP_003335807  hitchhiker  0.000640008  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0003  CDS  NC_013595  3884  4615  732  hypothetical protein  YP_003335808  normal  0.0291657  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0004  CDS  NC_013595  4648  5589  942  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_003335809  normal  0.118647  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0005  CDS  NC_013595  5885  7057  1173  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  YP_003335810  normal  0.518698  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0006  CDS  NC_013595  7047  7667  621  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  YP_003335811  normal  0.358663  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0007  CDS  NC_013595  7964  9907  1944  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  YP_003335812  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0008  CDS  NC_013595  9950  12460  2511  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  YP_003335813  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0009  CDS  NC_013595  12533  13180  648  hypothetical protein  YP_003335814  normal  0.994144  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0010    NC_013595  13462  14170  709      normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0011  CDS  NC_013595  14215  14406  192  hypothetical protein  YP_003335815  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0012    NC_013595  14403  14687  285      normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0013  CDS  NC_013595  14832  16088  1257  hypothetical protein  YP_003335816  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0014  CDS  NC_013595  16098  16709  612  hypothetical protein  YP_003335817  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0015  CDS  NC_013595  17425  17706  282  hypothetical protein  YP_003335818  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0016  CDS  NC_013595  17862  19283  1422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_003335819  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0017  CDS  NC_013595  19379  19660  282  hypothetical protein  YP_003335820  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0018  CDS  NC_013595  19682  19894  213  copper-translocating P-type ATPase  YP_003335821  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0019  CDS  NC_013595  19891  20907  1017  hypothetical protein  YP_003335822  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0020  CDS  NC_013595  20939  23179  2241  heavy metal-transporting ATPase  YP_003335823  normal  normal  0.668167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0021  CDS  NC_013595  23422  24099  678  hypothetical protein  YP_003335824  normal  0.277737  normal  0.862144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0022  CDS  NC_013595  24157  24684  528  alkylhydroperoxidase  YP_003335825  normal  0.236735  normal  0.837132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0023  CDS  NC_013595  24757  25707  951  hypothetical protein  YP_003335826  normal  0.0611304  normal  0.899046  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0024  CDS  NC_013595  25704  26072  369  transcriptional repressor, CopY family  YP_003335827  normal  0.0474358  normal  0.79806  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0025  CDS  NC_013595  26497  27105  609  hypothetical protein  YP_003335828  decreased coverage  0.0014866  normal  0.629454  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0026  CDS  NC_013595  27114  29936  2823  hypothetical protein  YP_003335829  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0027  CDS  NC_013595  29933  31048  1116  hypothetical protein  YP_003335830  normal  0.0467374  normal  0.566604  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0028  CDS  NC_013595  31061  32506  1446  hypothetical protein  YP_003335831  normal  0.125752  normal  0.588325  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0029  CDS  NC_013595  32503  33903  1401  hypothetical protein  YP_003335832  normal  0.291175  normal  0.776913  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0030  CDS  NC_013595  33903  34394  492  hypothetical protein  YP_003335833  normal  0.043163  normal  0.66171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0031  CDS  NC_013595  34790  36136  1347  cell division cycle protein 48-related protein  YP_003335834  normal  0.230494  normal  0.523133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0032  CDS  NC_013595  36133  37368  1236  hypothetical protein  YP_003335835  normal  0.72548  normal  0.717658  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0033  CDS  NC_013595  37445  38170  726  hypothetical protein  YP_003335836  normal  normal  0.629454  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0034  CDS  NC_013595  38467  39645  1179  alkaline D-peptidase  YP_003335837  normal  normal  0.698522  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0035  CDS  NC_013595  39788  40996  1209  hypothetical protein  YP_003335838  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0036  CDS  NC_013595  41245  41949  705  putative transcriptional regulator, TetR family  YP_003335839  normal  normal  0.940738  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0037  CDS  NC_013595  42093  42611  519  hypothetical protein  YP_003335840  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0038  CDS  NC_013595  42800  43360  561  hypothetical protein  YP_003335841  normal  normal  0.90716  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0039  CDS  NC_013595  43461  44264  804  ABC-2 type transporter  YP_003335842  normal  normal  0.953662  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0040  CDS  NC_013595  44261  45226  966  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  YP_003335843  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0041  CDS  NC_013595  45297  46139  843  hypothetical protein  YP_003335844  normal  normal  0.552203  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0042  CDS  NC_013595  46222  46788  567  hypothetical protein  YP_003335845  normal  normal  0.53163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0043  CDS  NC_013595  47427  48071  645  hypothetical protein  YP_003335846  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0044  CDS  NC_013595  48068  48274  207  hypothetical protein  YP_003335847  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0045    NC_013595  49147  49668  522      normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0046  CDS  NC_013595  49961  50611  651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  YP_003335848  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0047  CDS  NC_013595  50823  50951  129  hypothetical protein  YP_003335849  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0048    NC_013595  51332  51463  132      normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0049  CDS  NC_013595  51524  52027  504  hypothetical protein  YP_003335850  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0050  CDS  NC_013595  53232  54239  1008  hypothetical protein  YP_003335851  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0051  CDS  NC_013595  54239  54604  366  transcriptional regulator protein-like protein  YP_003335852  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0052  CDS  NC_013595  54831  55286  456  hypothetical protein  YP_003335853  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0053  CDS  NC_013595  55525  56703  1179  hypothetical protein  YP_003335854  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0054  CDS  NC_013595  56780  57208  429  hypothetical protein  YP_003335855  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0055  CDS  NC_013595  57409  57849  441  hypothetical protein  YP_003335856  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0056    NC_013595  58251  58635  385      normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0057  CDS  NC_013595  59056  59682  627  hypothetical protein  YP_003335857  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0058  CDS  NC_013595  59767  60204  438  hypothetical protein  YP_003335858  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0059  CDS  NC_013595  60372  60854  483  hypothetical protein  YP_003335859  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0060  CDS  NC_013595  60944  61699  756  hypothetical protein  YP_003335860  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0061  CDS  NC_013595  61913  62929  1017  homoserine O-acetyltransferase  YP_003335861  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0062  CDS  NC_013595  63468  64724  1257  putative membrane transport protein  YP_003335862  normal  0.640827  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0063  CDS  NC_013595  64950  66041  1092  hypothetical protein  YP_003335863  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0064  CDS  NC_013595  66214  66687  474  putative ATP/GTP-binding protein  YP_003335864  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0065  CDS  NC_013595  66730  67140  411  acetyltransferase  YP_003335865  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0066  CDS  NC_013595  67254  67652  399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_003335866  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0067  CDS  NC_013595  67824  68195  372  anti-anti-sigma factor family protein  YP_003335867  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0068  CDS  NC_013595  68808  69092  285  hypothetical protein  YP_003335868  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0069  CDS  NC_013595  69261  69671  411  hypothetical protein  YP_003335869  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0070  CDS  NC_013595  69732  69944  213  hypothetical protein  YP_003335870  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0071  CDS  NC_013595  69974  70714  741  phosphatase-like protein  YP_003335871  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0072  CDS  NC_013595  71050  72192  1143  hypothetical protein  YP_003335872  normal  0.484765  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0073  CDS  NC_013595  72206  73435  1230  Histidine kinase  YP_003335873  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0074  CDS  NC_013595  73432  74055  624  response regulator receiver protein  YP_003335874  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0075  CDS  NC_013595  74314  76551  2238  putative terpene cyclase  YP_003335875  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0076  CDS  NC_013595  76991  77746  756  hypothetical protein  YP_003335876  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0077    NC_013595  78207  78956  750      normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0078  CDS  NC_013595  79038  79886  849  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  YP_003335877  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0079  CDS  NC_013595  79979  80449  471  hypothetical protein  YP_003335878  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0080  CDS  NC_013595  80662  80853  192  hypothetical protein  YP_003335879  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0081  CDS  NC_013595  80999  81826  828  hypothetical protein  YP_003335880  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0082  CDS  NC_013595  81834  82244  411  hypothetical protein  YP_003335881  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0083  CDS  NC_013595  82350  84635  2286  Serine/threonine protein kinase-like protein  YP_003335882  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0084  CDS  NC_013595  84900  85322  423  hypothetical protein  YP_003335883  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0085  CDS  NC_013595  85448  86173  726  putative transcriptional regulator, XRE family  YP_003335884  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0086  CDS  NC_013595  86249  87190  942  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  YP_003335885  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0087  CDS  NC_013595  87304  87927  624  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003335886  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0088  CDS  NC_013595  87924  88877  954  hypothetical protein  YP_003335887  normal  0.65002  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0089  CDS  NC_013595  88933  91356  2424  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  YP_003335888  normal  0.870844  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0090  CDS  NC_013595  91356  92087  732  ABC transporter related protein  YP_003335889  normal  0.197502  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0091  CDS  NC_013595  92179  92793  615  response regulator receiver protein  YP_003335890  normal  0.520551  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0092  CDS  NC_013595  92927  95107  2181  Signal transduction histidine kinase-like protein  YP_003335891  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0093  CDS  NC_013595  95301  96863  1563  Serine/threonine protein kinase-like protein  YP_003335892  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0094  CDS  NC_013595  97010  97357  348  lactoylglutathione lyase protein  YP_003335893  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0095  CDS  NC_013595  97616  98152  537  hypothetical protein  YP_003335894  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0096  CDS  NC_013595  98288  98800  513  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003335895  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0097  CDS  NC_013595  98797  100020  1224  hypothetical protein  YP_003335896  normal  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0098  CDS  NC_013595  100133  100744  612  transcriptional regulator, PadR family  YP_003335897  normal  0.846374  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0099  CDS  NC_013595  100722  101162  441  hypothetical protein  YP_003335898  normal  0.334796  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Sros_0100  CDS  NC_013595  101255  102229  975  hypothetical protein  YP_003335899  normal  0.133454  normal  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 96    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>