2295 genes were found for organism Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Daud_0001  CDS  NC_010424  103  1440  1338  chromosomal replication initiation protein  YP_001716202  hitchhiker  0.00343862  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0002  CDS  NC_010424  1579  2748  1170  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001716203  normal  0.105928  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0003  CDS  NC_010424  2761  3843  1083  DNA replication and repair protein RecF  YP_001716204  normal  0.447101  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0004  CDS  NC_010424  3847  4107  261  hypothetical protein  YP_001716205  normal  0.65212  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0005  CDS  NC_010424  4195  6102  1908  DNA gyrase, B subunit  YP_001716206  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0006  CDS  NC_010424  6092  6688  597  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001716207  normal  0.292815  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0007  CDS  NC_010424  7024  7293  270  hypothetical protein  YP_001716208  normal  0.737114  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0008  CDS  NC_010424  7452  9890  2439  DNA gyrase, A subunit  YP_001716209  hitchhiker  8.00696e-06  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0009  CDS  NC_010424  10065  10949  885  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_001716210  hitchhiker  7.01553e-08  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0010  CDS  NC_010424  10949  11518  570  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_001716211  unclonable  5.32264e-10  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0011  CDS  NC_010424  11897  13051  1155  aminotransferase, class V  YP_001716212  hitchhiker  1.96245e-05  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0012  CDS  NC_010424  13048  14628  1581  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  YP_001716213  normal  0.578759  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0013  CDS  NC_010424  14657  15934  1278  seryl-tRNA synthetase  YP_001716214  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0014  CDS  NC_010424  16973  17443  471  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  YP_001716215  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0015  CDS  NC_010424  17649  20099  2451  Alpha-glucosidase  YP_001716216  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0016  CDS  NC_010424  20671  21345  675  hypothetical protein  YP_001716217  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0017  CDS  NC_010424  21599  22210  612  hypothetical protein  YP_001716218  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0018  CDS  NC_010424  22313  23461  1149  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  YP_001716219  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0019  CDS  NC_010424  23472  24524  1053  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  YP_001716220  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0020  CDS  NC_010424  24564  25625  1062  polysaccharide biosynthesis protein CapD  YP_001716221  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0021  CDS  NC_010424  25618  26319  702  acylneuraminate cytidylyltransferase  YP_001716222  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0022  CDS  NC_010424  26316  27353  1038  oxidoreductase domain-containing protein  YP_001716223  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0023  CDS  NC_010424  27382  28917  1536  hypothetical protein  YP_001716224  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0024  CDS  NC_010424  28947  30455  1509  hypothetical protein  YP_001716225  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0025  CDS  NC_010424  30445  31446  1002  oxidoreductase domain-containing protein  YP_001716226  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0026  CDS  NC_010424  31450  32919  1470  hypothetical protein  YP_001716227  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0027  CDS  NC_010424  32925  33578  654  hexapaptide repeat-containing transferase  YP_001716228  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0028  CDS  NC_010424  33609  34820  1212  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  YP_001716229  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0029  CDS  NC_010424  35052  36725  1674  hypothetical protein  YP_001716230  normal  0.386547  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0030  CDS  NC_010424  36954  38372  1419  hypothetical protein  YP_001716231  hitchhiker  0.00177404  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0031  CDS  NC_010424  39142  40485  1344  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_001716232  decreased coverage  3.24435e-06  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0032  CDS  NC_010424  40503  40811  309  hypothetical protein  YP_001716233  hitchhiker  1.02998e-06  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0033  CDS  NC_010424  40842  41438  597  recombination protein RecR  YP_001716234  hitchhiker  0.00162242  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0034  CDS  NC_010424  41493  41762  270  SigmaK-factor processing regulatory BofA  YP_001716235  hitchhiker  0.00744406  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0035  CDS  NC_010424  41822  43309  1488  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  YP_001716236  normal  0.730375  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0036  CDS  NC_010424  43315  43980  666  dTMP kinase  YP_001716237  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0037  CDS  NC_010424  43986  45002  1017  DNA polymerase III, delta prime subunit  YP_001716238  normal  0.418255  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0038  CDS  NC_010424  44971  45783  813  PSP1 domain-containing protein  YP_001716239  normal  0.214386  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0039  CDS  NC_010424  45922  46770  849  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  YP_001716240  normal  0.350447  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0040  CDS  NC_010424  46820  47074  255  AbrB family transcriptional regulator  YP_001716241  normal  0.0507223  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0041  CDS  NC_010424  47283  48833  1551  methionyl-tRNA synthetase  YP_001716242  normal  0.367271  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0042  CDS  NC_010424  48835  49620  786  TatD family hydrolase  YP_001716243  normal  0.804298  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0043  CDS  NC_010424  49661  50191  531  cob(I)alamin adenosyltransferase  YP_001716244  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0044  CDS  NC_010424  50323  51339  1017  3D domain-containing protein  YP_001716245  normal  0.991775  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0045  CDS  NC_010424  51389  52288  900  dimethyladenosine transferase  YP_001716246  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0046  CDS  NC_010424  52330  52803  474  hypothetical protein  YP_001716247  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0047  CDS  NC_010424  52937  53755  819  glycosyl transferase family protein  YP_001716248  normal  0.760245  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0048  CDS  NC_010424  53880  54740  861  peptidase U57, YabG  YP_001716249  normal  0.403765  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0049  CDS  NC_010424  54845  55240  396  hypothetical protein  YP_001716250  normal  0.0485882  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0050  CDS  NC_010424  55899  56186  288  hypothetical protein  YP_001716251  hitchhiker  0.000332129  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0051  CDS  NC_010424  56360  57262  903  Allergen V5/Tpx-1 family protein  YP_001716252  decreased coverage  1.68583e-05  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0052  CDS  NC_010424  57426  58871  1446  hypothetical protein  YP_001716253  normal  0.0618003  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0053  CDS  NC_010424  58974  60611  1638  peptidoglycan-binding LysM  YP_001716254  normal  0.60632  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0054  CDS  NC_010424  60662  61261  600  hypothetical protein  YP_001716255  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0055    NC_010424  61261  61500  240      normal  0.573814  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0056  CDS  NC_010424  61602  62048  447  hypothetical protein  YP_001716256  normal  0.99034  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0057  CDS  NC_010424  62037  62744  708  zinc/iron permease  YP_001716257  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0058  CDS  NC_010424  62797  63717  921  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_001716258  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0059  CDS  NC_010424  63849  64538  690  GntR family transcriptional regulator  YP_001716259  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0060  CDS  NC_010424  64531  65292  762  hypothetical protein  YP_001716260  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0061  CDS  NC_010424  65355  65774  420  hypothetical protein  YP_001716261  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0062  CDS  NC_010424  65768  66052  285  prevent-host-death family protein  YP_001716262  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0063  CDS  NC_010424  66211  66420  210  SirA family protein  YP_001716263  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0064  CDS  NC_010424  66413  67501  1089  hypothetical protein  YP_001716264  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0065  CDS  NC_010424  67770  68660  891  LysR family transcriptional regulator  YP_001716265  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0066  CDS  NC_010424  68777  69853  1077  threonine dehydratase  YP_001716266  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0067  CDS  NC_010424  69859  70125  267  SpoVG family protein  YP_001716267  normal  0.746484  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0068  CDS  NC_010424  70344  71744  1401  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  YP_001716268  normal  0.923003  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0069  CDS  NC_010424  71768  72724  957  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_001716269  normal  0.829297  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0070  CDS  NC_010424  72773  73408  636  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  YP_001716270  normal  0.704852  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0071  CDS  NC_010424  73405  73992  588  aminoacyl-tRNA hydrolase  YP_001716271  normal  0.287226  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0072  CDS  NC_010424  74214  77744  3531  transcription-repair coupling factor  YP_001716272  normal  0.0902915  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0073  CDS  NC_010424  77857  78417  561  AbrB family transcriptional regulator  YP_001716273  normal  0.266096  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0074  CDS  NC_010424  78456  79919  1464  MazG family protein  YP_001716274  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0075  CDS  NC_010424  80008  80283  276  histone family protein DNA-binding protein  YP_001716275  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0076  CDS  NC_010424  80293  80559  267  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_001716276  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0077  CDS  NC_010424  80718  81026  309  YabP family protein  YP_001716277  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0078  CDS  NC_010424  81070  81525  456  hypothetical protein  YP_001716278  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0079  CDS  NC_010424  81520  81858  339  hypothetical protein  YP_001716279  normal  0.583894  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0080  CDS  NC_010424  81861  82151  291  hypothetical protein  YP_001716280  normal  0.950349  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0081  CDS  NC_010424  82703  82954  252  regulatory protein, LuxR  YP_001716281  normal  0.521751  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0082  CDS  NC_010424  82935  83279  345  septum formation initiator  YP_001716282  normal  0.567805  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0083  CDS  NC_010424  83597  84466  870  ATP phosphoribosyltransferase  YP_001716283  normal  0.156056  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0084  CDS  NC_010424  84737  85702  966  Ppx/GppA phosphatase  YP_001716284  normal  0.426171  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0085  CDS  NC_010424  85780  88200  2421  phosphoprotein phosphatase  YP_001716285  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0086  CDS  NC_010424  88288  89700  1413  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_001716286  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0087  CDS  NC_010424  89780  91642  1863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_001716287  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0088  CDS  NC_010424  91645  92097  453  nucleoside-diphosphate kinase  YP_001716288  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0089  CDS  NC_010424  92094  93794  1701  formate--tetrahydrofolate ligase  YP_001716289  normal  0.985231  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0090  CDS  NC_010424  93987  94448  462  hypothetical protein  YP_001716290  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0091  CDS  NC_010424  94476  95390  915  hypothetical protein  YP_001716291  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0092  CDS  NC_010424  95682  98723  3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001716292  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0093  CDS  NC_010424  98803  100074  1272  hypothetical protein  YP_001716293  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0094  CDS  NC_010424  100295  100546  252  hypothetical protein  YP_001716294  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0095  CDS  NC_010424  100543  101733  1191  dihydropteroate synthase  YP_001716295  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0096  CDS  NC_010424  101730  102101  372  dihydroneopterin aldolase  YP_001716296  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0097  CDS  NC_010424  102098  102607  510  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_001716297  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0098  CDS  NC_010424  102776  103525  750  silent information regulator protein Sir2  YP_001716298  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0099  CDS  NC_010424  103911  104804  894  oxidoreductase domain-containing protein  YP_001716299  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0100  CDS  NC_010424  104797  105627  831  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  YP_001716300  normal  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>