3598 genes were found for organism Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
GWCH70_0001  CDS  NC_012793  27  1379  1353  chromosomal replication initiation protein  YP_002948209  decreased coverage  4.47845e-09  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0002  CDS  NC_012793  1545  2681  1137  DNA polymerase III subunit beta  YP_002948210  decreased coverage  1.67002e-09  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0003  CDS  NC_012793  2784  3005  222  S4 domain protein YaaA  YP_002948211  hitchhiker  1.26771e-07  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0004  CDS  NC_012793  3017  4141  1125  recombination protein F  YP_002948212  hitchhiker  4.14234e-06  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0005  CDS  NC_012793  4180  6102  1923  DNA gyrase subunit B  YP_002948213  hitchhiker  0.00215329  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0006  CDS  NC_012793  6164  8641  2478  DNA gyrase subunit A  YP_002948214  normal  0.119691  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0007  CDS  NC_012793  8766  9845  1080  metal dependent phosphohydrolase  YP_002948215  hitchhiker  0.000616807  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0008  CDS  NC_012793  16184  17161  978  YaaC  YP_002948216  normal  0.754896  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0009  CDS  NC_012793  17290  18756  1467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  YP_002948217  normal  0.0212236  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0010  CDS  NC_012793  18857  20209  1353  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  YP_002948218  hitchhiker  0.00503294  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0011  CDS  NC_012793  20361  21245  885  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_002948219  hitchhiker  2.84564e-06  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0012  CDS  NC_012793  21263  21841  579  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_002948220  hitchhiker  1.28055e-07  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0013  CDS  NC_012793  22014  22187  174  hypothetical protein  YP_002948221  hitchhiker  3.01769e-08  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0014  CDS  NC_012793  22180  23454  1275  seryl-tRNA synthetase  YP_002948222  hitchhiker  3.07933e-07  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0015  CDS  NC_012793  23755  24423  669  deoxynucleoside kinase  YP_002948223  hitchhiker  2.20749e-08  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0016  CDS  NC_012793  24420  25058  639  deoxynucleoside kinase  YP_002948224  hitchhiker  2.59571e-08  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0017  CDS  NC_012793  25162  26448  1287  glycoside hydrolase family 18  YP_002948225  hitchhiker  3.50058e-08  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0018  CDS  NC_012793  26534  27016  483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_002948226  unclonable  2.22669e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0019  CDS  NC_012793  27453  29138  1686  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_002948227  unclonable  1.59056e-09  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0020  CDS  NC_012793  29161  29487  327  hypothetical protein  YP_002948228  unclonable  2.61671e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0021  CDS  NC_012793  29499  30095  597  recombination protein RecR  YP_002948229  unclonable  7.3919e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0022  CDS  NC_012793  30113  30337  225  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_002948230  unclonable  1.57824e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0023  CDS  NC_012793  30415  30681  267  pro-sigmaK processing inhibitor BofA  YP_002948231  unclonable  2.09525e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0024  CDS  NC_012793  36841  37047  207  hypothetical protein  YP_002948232  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0025  CDS  NC_012793  37259  38695  1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_002948233  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0026  CDS  NC_012793  38709  39341  633  thymidylate kinase  YP_002948234  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0027  CDS  NC_012793  39414  40427  1014  DNA polymerase III subunit delta'  YP_002948235  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0028  CDS  NC_012793  40420  41247  828  PSP1 domain protein  YP_002948236  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0029  CDS  NC_012793  41263  41628  366  DNA replication intiation control protein YabA  YP_002948237  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0030  CDS  NC_012793  41692  42441  750  methyltransferase small  YP_002948238  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0031  CDS  NC_012793  42455  43327  873  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_002948239  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0032  CDS  NC_012793  43366  43665  300  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002948240  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0033  CDS  NC_012793  44009  45955  1947  methionyl-tRNA synthetase  YP_002948241  normal  0.984575  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0034  CDS  NC_012793  46097  46867  771  hydrolase, TatD family  YP_002948242  normal  0.301628  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0035  CDS  NC_012793  47068  48288  1221  3D domain protein  YP_002948243  normal  0.686039  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0036  CDS  NC_012793  48529  49092  564  primase/topoisomerase like protein  YP_002948244  normal  0.278687  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0037  CDS  NC_012793  49085  49960  876  dimethyladenosine transferase  YP_002948245  normal  0.417941  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0038  CDS  NC_012793  50077  50961  885  sporulation peptidase YabG  YP_002948246  normal  0.344942  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0039  CDS  NC_012793  51169  51426  258  protein of unknown function DUF1021  YP_002948247  normal  0.0144278  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0040  CDS  NC_012793  51524  51709  186  small acid-soluble spore protein, minoralpha/beta-type SASP  YP_002948248  hitchhiker  0.00634825  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0041  CDS  NC_012793  51905  52774  870  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  YP_002948249  decreased coverage  0.000358804  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0042  CDS  NC_012793  52830  53654  825  pur operon repressor  YP_002948250  hitchhiker  0.00214648  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0043  CDS  NC_012793  53681  54055  375  endoribonuclease L-PSP  YP_002948251  hitchhiker  0.00285503  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0044  CDS  NC_012793  54212  54502  291  regulatory protein SpoVG  YP_002948252  hitchhiker  0.000451707  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0045  CDS  NC_012793  54630  56009  1380  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  YP_002948253  normal  0.0672685  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0046  CDS  NC_012793  56023  56970  948  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_002948254  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0047  CDS  NC_012793  57064  57696  633  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  YP_002948255  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0048  CDS  NC_012793  57762  58322  561  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_002948256  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0049  CDS  NC_012793  58387  58617  231  hypothetical protein  YP_002948257  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0050  CDS  NC_012793  58809  62342  3534  transcription-repair coupling factor  YP_002948258  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0051  CDS  NC_012793  62530  63066  537  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002948259  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0052  CDS  NC_012793  63229  64809  1581  polysaccharide biosynthesis protein  YP_002948260  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0053  CDS  NC_012793  64992  66455  1464  MazG family protein  YP_002948261  normal  0.464369  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0054  CDS  NC_012793  66471  66743  273  RNA-binding S4 domain protein  YP_002948262  normal  0.0449701  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0055  CDS  NC_012793  66872  67177  306  sporulation protein YabP  YP_002948263  hitchhiker  0.00412609  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0056  CDS  NC_012793  67174  67782  609  spore cortex biosynthesis protein YabQ  YP_002948264  hitchhiker  4.3897e-05  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0057  CDS  NC_012793  67802  68173  372  Septum formation initiator  YP_002948265  hitchhiker  5.96097e-09  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0058  CDS  NC_012793  68292  68690  399  hypothetical protein  YP_002948266  unclonable  2.38948e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0059  CDS  NC_012793  69486  71966  2481  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  YP_002948267  hitchhiker  0.00270426  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0060  CDS  NC_012793  72030  72764  735  hypothetical protein  YP_002948268  normal  0.0845382  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0061  CDS  NC_012793  72733  73710  978  serine/threonine protein kinase  YP_002948269  normal  0.130474  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0062  CDS  NC_012793  73833  75221  1389  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_002948270  normal  0.0340332  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0063  CDS  NC_012793  75243  75788  546  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  YP_002948271  hitchhiker  0.000259815  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0064  CDS  NC_012793  75883  77790  1908  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_002948272  hitchhiker  3.23168e-07  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0065  CDS  NC_012793  77888  78664  777  pantothenate kinase  YP_002948273  unclonable  1.07258e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0066  CDS  NC_012793  78679  79566  888  Hsp33-like chaperonin  YP_002948274  unclonable  1.94487e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0067  CDS  NC_012793  79644  80570  927  cysteine synthase A  YP_002948275  unclonable  2.00639e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0068    NC_012793  80683  83728  3046      normal  0.203635  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0069  CDS  NC_012793  81156  82469  1314  transposase IS4 family protein  YP_002948276  normal  0.140887  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0070  CDS  NC_012793  83739  84317  579  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_002948277  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0071  CDS  NC_012793  84322  85194  873  4-amino-4-deoxychorismate lyase  YP_002948278  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0072  CDS  NC_012793  85195  86052  858  dihydropteroate synthase  YP_002948279  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0073  CDS  NC_012793  86024  86404  381  dihydroneopterin aldolase  YP_002948280  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0074  CDS  NC_012793  86405  86932  528  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_002948281  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0075  CDS  NC_012793  86884  87105  222  transcriptional regulator, XRE family  YP_002948282  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0076    NC_012793  87123  89754  2632      normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0077  CDS  NC_012793  87350  88663  1314  transposase IS4 family protein  YP_002948283  normal  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0078  CDS  NC_012793  89844  91328  1485  lysyl-tRNA synthetase  YP_002948284  normal  0.312229  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0079  CDS  NC_012793  91475  92662  1188  transposase IS4 family protein  YP_002948285  decreased coverage  0.000349204  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0080  CDS  NC_012793  105679  106140  462  transcriptional repressor, CtsR  YP_002948286  decreased coverage  9.01486e-05  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0081  CDS  NC_012793  106154  106702  549  UvrB/UvrC protein  YP_002948287  hitchhiker  0.00231542  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0082  CDS  NC_012793  106707  107795  1089  ATP:guanido phosphotransferase  YP_002948288  hitchhiker  0.000334735  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0083  CDS  NC_012793  107795  110230  2436  ATPase AAA-2 domain protein  YP_002948289  normal  0.181403  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0084  CDS  NC_012793  110317  111690  1374  DNA repair protein RadA  YP_002948290  normal  0.391084  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0085  CDS  NC_012793  111802  112896  1095  PilT protein domain protein  YP_002948291  normal  0.0127482  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0086  CDS  NC_012793  112920  113606  687  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_002948292  hitchhiker  0.000836739  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0087  CDS  NC_012793  113623  114099  477  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_002948293  hitchhiker  6.99139e-07  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0088  CDS  NC_012793  114214  115674  1461  glutamyl-tRNA synthetase  YP_002948294  hitchhiker  5.07745e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0089  CDS  NC_012793  116019  116690  672  serine O-acetyltransferase  YP_002948295  hitchhiker  2.90545e-07  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0090  CDS  NC_012793  116668  118068  1401  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_002948296  hitchhiker  4.84516e-06  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0091  CDS  NC_012793  118075  118494  420  ribonuclease III  YP_002948297  hitchhiker  1.09584e-07  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0092  CDS  NC_012793  118497  119234  738  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  YP_002948298  hitchhiker  6.07271e-08  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0093  CDS  NC_012793  119239  119751  513  protein of unknown function DUF901  YP_002948299  hitchhiker  2.14809e-08  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0094  CDS  NC_012793  119822  120472  651  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002948300  unclonable  1.96498e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0095  CDS  NC_012793  120562  120711  150  ribosomal protein L33  YP_002948301  unclonable  2.18198e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0096  CDS  NC_012793  120754  120936  183  preprotein translocase subunit SecE  YP_002948302  unclonable  1.78196e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0097  CDS  NC_012793  121065  121598  534  transcription antitermination protein NusG  YP_002948303  unclonable  9.31665e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0098  CDS  NC_012793  121846  122271  426  50S ribosomal protein L11  YP_002948304  unclonable  4.46948e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0099  CDS  NC_012793  122380  123081  702  50S ribosomal protein L1  YP_002948305  unclonable  1.32548e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0100  CDS  NC_012793  123327  123827  501  50S ribosomal protein L10  YP_002948306  unclonable  6.89021e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>