3662 genes were found for organism Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tbis_0001  CDS  NC_014165  270  1853  1584  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003650631  normal  0.0861644  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0002  CDS  NC_014165  2390  3526  1137  DNA polymerase III subunit beta  YP_003650632  normal  0.0259305  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0003  CDS  NC_014165  3637  4581  945  6-phosphogluconate dehydrogenase  YP_003650633  decreased coverage  0.00950431  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0004  CDS  NC_014165  4719  5924  1206  DNA replication and repair protein RecF  YP_003650634  normal  0.0234523  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0005  CDS  NC_014165  5914  6465  552  hypothetical protein  YP_003650635  normal  0.0232127  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0006  CDS  NC_014165  6961  8904  1944  DNA gyrase subunit B  YP_003650636  normal  0.195447  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0007  CDS  NC_014165  8933  11437  2505  DNA gyrase subunit A  YP_003650637  normal  0.612132  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0008  CDS  NC_014165  11529  12353  825  hypothetical protein  YP_003650638  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0009  CDS  NC_014165  12943  13275  333  hypothetical protein  YP_003650639  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0010  CDS  NC_014165  13508  14350  843  putative periplasmic substrate-binding protein  YP_003650640  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0011  CDS  NC_014165  14699  15592  894  hypothetical protein  YP_003650641  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0012  CDS  NC_014165  15589  15990  402  PilT protein domain-containing protein  YP_003650642  normal  normal  0.948131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0013  CDS  NC_014165  16061  18298  2238  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_003650643  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0014  CDS  NC_014165  18495  18722  228  copper ion binding protein  YP_003650644  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0015  CDS  NC_014165  19035  20330  1296  citrate transporter  YP_003650645  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0016  CDS  NC_014165  20327  20770  444  CBS domain-containing protein  YP_003650646  normal  0.639879  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0017  CDS  NC_014165  21240  21773  534  hypothetical protein  YP_003650647  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0018  CDS  NC_014165  21805  22563  759  ABC transporter-like protein  YP_003650648  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0019  CDS  NC_014165  22560  23594  1035  transport system permease protein  YP_003650649  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0020  CDS  NC_014165  23591  24586  996  transport system permease protein  YP_003650650  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0021  CDS  NC_014165  24586  25551  966  periplasmic binding protein  YP_003650651  normal  0.36429  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0022  CDS  NC_014165  26118  26618  501  hypothetical protein  YP_003650652  normal  0.55037  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0023  CDS  NC_014165  27246  28928  1683  serine/threonine protein kinase  YP_003650653  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0024  CDS  NC_014165  28888  30606  1719  serine/threonine protein kinase  YP_003650654  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0025  CDS  NC_014165  31386  32066  681  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_003650655  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0026  CDS  NC_014165  32651  32770  120  hypothetical protein  YP_003650656  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0027  CDS  NC_014165  32810  33526  717  HAD-superfamily hydrolase  YP_003650657  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0028  CDS  NC_014165  33957  34805  849  hypothetical protein  YP_003650658  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0029  CDS  NC_014165  34833  35450  618  hypothetical protein  YP_003650659  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0030  CDS  NC_014165  36117  36611  495  hypothetical protein  YP_003650660  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0031  CDS  NC_014165  36798  38630  1833  hypothetical protein  YP_003650661  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0032  CDS  NC_014165  39113  41599  2487  hypothetical protein  YP_003650662  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0033  CDS  NC_014165  41499  43154  1656  hypothetical protein  YP_003650663  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0034  CDS  NC_014165  43212  43952  741  family 2 glycosyl transferase  YP_003650664  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0035  CDS  NC_014165  43959  44309  351  anti-sigma-factor antagonist  YP_003650665  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0036  CDS  NC_014165  44517  45068  552  hypothetical protein  YP_003650666  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0037  CDS  NC_014165  45108  45281  174  hypothetical protein  YP_003650667  normal  0.626372  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0038  CDS  NC_014165  45442  45897  456  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_003650668  normal  0.536506  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0039  CDS  NC_014165  46026  47942  1917  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_003650669  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0040  CDS  NC_014165  48039  48602  564  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  YP_003650670  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0041  CDS  NC_014165  48668  50041  1374  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  YP_003650671  normal  0.758493  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0042  CDS  NC_014165  50326  50649  324  rhodanese domain-containing protein  YP_003650672  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0043  CDS  NC_014165  50792  51670  879  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_003650673  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0044  CDS  NC_014165  51729  52346  618  TenA family transcriptional activator  YP_003650674  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0045  CDS  NC_014165  52385  53041  657  hypothetical protein  YP_003650675  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0046  CDS  NC_014165  53193  54155  963  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_003650676  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0047  CDS  NC_014165  54640  56202  1563  hypothetical protein  YP_003650677  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0048  CDS  NC_014165  56199  57203  1005  hypothetical protein  YP_003650678  normal  0.783092  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0049  CDS  NC_014165  57850  58587  738  FHA domain-containing protein  YP_003650679  hitchhiker  0.0038838  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0050  CDS  NC_014165  58606  59076  471  FHA domain-containing protein  YP_003650680  hitchhiker  0.00259691  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0051  CDS  NC_014165  59073  60353  1281  protein serine/threonine phosphatase  YP_003650681  hitchhiker  0.00361373  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0052  CDS  NC_014165  60350  61732  1383  cell cycle protein  YP_003650682  decreased coverage  0.00121731  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0053  CDS  NC_014165  61729  63186  1458  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003650683  hitchhiker  0.00491745  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0054  CDS  NC_014165  63183  64589  1407  serine/threonine protein kinase  YP_003650684  normal  0.0845441  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0055  CDS  NC_014165  64631  66478  1848  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  YP_003650685  normal  0.485948  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0056  CDS  NC_014165  66847  67437  591  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003650686  normal  0.454168  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0057  CDS  NC_014165  67590  67835  246  hypothetical protein  YP_003650687  normal  0.517765  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0058  CDS  NC_014165  67943  68803  861  rhomboid family protein  YP_003650688  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0059  CDS  NC_014165  68869  69399  531  peptidylprolyl isomerase  YP_003650689  normal  0.958253  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0060  CDS  NC_014165  69535  70017  483  hypothetical protein  YP_003650690  normal  0.813583  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0061    NC_014165  70076  71641  1566      normal  0.606458  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0062  CDS  NC_014165  72490  73785  1296  major facilitator superfamily protein  YP_003650691  normal  0.378864  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0063  CDS  NC_014165  74110  75369  1260  major facilitator superfamily protein  YP_003650692  normal  0.586585  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0064  CDS  NC_014165  76172  77542  1371  PAS sensor protein  YP_003650693  normal  0.106866  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0065  CDS  NC_014165  77768  79189  1422  hypothetical protein  YP_003650694  normal  0.701081  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0066  CDS  NC_014165  79520  80668  1149  chromate transporter  YP_003650695  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0067  CDS  NC_014165  80978  81865  888  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  YP_003650696  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0068  CDS  NC_014165  81862  82788  927  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  YP_003650697  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0069  CDS  NC_014165  82785  84131  1347  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003650698  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0070  CDS  NC_014165  84613  85980  1368  hypothetical protein  YP_003650699  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0071  CDS  NC_014165  86020  86994  975  prephenate dehydratase  YP_003650700  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0072  CDS  NC_014165  87439  88704  1266  seryl-tRNA synthetase  YP_003650701  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0073  CDS  NC_014165  89300  89503  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_003650702  normal  0.621224  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0074  CDS  NC_014165  89734  90543  810  HAD-superfamily hydrolase  YP_003650703  normal  0.542278  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0075  CDS  NC_014165  90561  91100  540  hypothetical protein  YP_003650704  normal  0.617604  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0076  CDS  NC_014165  91179  92141  963  NAD(P)H quinone oxidoreductase  YP_003650705  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0077  CDS  NC_014165  92965  94884  1920  chromosome partitioning-like ATPase  YP_003650706  normal  0.989213  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0078  CDS  NC_014165  95334  96704  1371  integrase family protein  YP_003650707  normal  0.144212  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0079  CDS  NC_014165  96701  96892  192  phage transcriptional regulator AlpA  YP_003650708  normal  0.04332  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0080  CDS  NC_014165  96889  98274  1386  hypothetical protein  YP_003650709  normal  0.0998986  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0081  CDS  NC_014165  98391  98507  117  hypothetical protein  YP_003650710  normal  0.0806258  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0082  CDS  NC_014165  98504  98680  177  hypothetical protein  YP_003650711  normal  0.0266692  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0083  CDS  NC_014165  98695  99426  732  hypothetical protein  YP_003650712  normal  0.0841499  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0084  CDS  NC_014165  99459  100841  1383  cell division FtsK/SpoIIIE  YP_003650713  normal  0.152806  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0085  CDS  NC_014165  100841  101176  336  hypothetical protein  YP_003650714  normal  0.050954  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0086  CDS  NC_014165  101315  101695  381  GntR family transcriptional regulator  YP_003650715  normal  0.266832  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0087  CDS  NC_014165  101961  102998  1038  hypothetical protein  YP_003650716  normal  0.955525  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0088  CDS  NC_014165  102995  103621  627  hypothetical protein  YP_003650717  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0089  CDS  NC_014165  103779  104075  297  hypothetical protein  YP_003650718  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0090  CDS  NC_014165  104080  104328  249  hypothetical protein  YP_003650719  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0091  CDS  NC_014165  104440  104859  420  GntR family transcriptional regulator  YP_003650720  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0092  CDS  NC_014165  106536  107603  1068  hypothetical protein  YP_003650721  normal  0.471562  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0093  CDS  NC_014165  108291  108851  561  hypothetical protein  YP_003650722  normal  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0094  CDS  NC_014165  109303  109680  378  hypothetical protein  YP_003650723  normal  0.395549  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0095  CDS  NC_014165  110124  110858  735  TetR family transcriptional regulator  YP_003650724  normal  0.222409  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0096  CDS  NC_014165  111370  111885  516  hypothetical protein  YP_003650725  normal  0.0718939  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0097  CDS  NC_014165  113180  115207  2028  serine/threonine protein kinase  YP_003650726  normal  0.255203  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0098  CDS  NC_014165  115606  116439  834  hypothetical protein  YP_003650727  normal  0.080433  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0099  CDS  NC_014165  116605  117480  876  NUDIX hydrolase  YP_003650728  normal  0.474769  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Tbis_0100  CDS  NC_014165  117524  117775  252  hypothetical protein  YP_003650729  normal  0.661364  normal  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>