4336 genes were found for organism Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
ECD_00001  CDS  CP001509  190  255  66  thr operon leader peptide  ACT41903  normal  0.548947  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00002  CDS  CP001509  336  2798  2463  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  ACT41904  normal  0.843244  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00003  CDS  CP001509  2800  3732  933  homoserine kinase  ACT41905  normal  0.646398  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00004  CDS  CP001509  3733  5019  1287  threonine synthase  ACT41906  normal  0.863935  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00005  CDS  CP001509  5232  5528  297  hypothetical protein  ACT41907  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00006  CDS  CP001509  5681  6457  777  hypothetical protein  ACT41908  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00007  CDS  CP001509  6527  7957  1431  predicted transporter  ACT41909  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00008  CDS  CP001509  8236  9189  954  transaldolase B  ACT41910  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00009  CDS  CP001509  9304  9891  588  molybdenum cofactor biosynthesis protein  ACT41911  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00010  CDS  CP001509  9926  10492  567  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  ACT41912  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00011  CDS  CP001509  10641  11354  714  hypothetical protein  ACT41913  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00012  CDS  CP001509  10828  11313  486  hypothetical protein  ACT41914  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00013  CDS  CP001509  11380  11784  405  hypothetical protein  ACT41915  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00014  CDS  CP001509  12161  14077  1917  molecular chaperone DnaK  ACT41916  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00015  CDS  CP001509  14166  15296  1131  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  ACT41917  normal  0.229266  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00016  CDS  CP001509  15443  16555  1113  IS186 hypothetical protein  ACT41918  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00017  CDS  CP001509  16749  16958  210  regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC  ACT41919  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00018  CDS  CP001509  17488  18654  1167  pH-dependent sodium/proton antiporter  ACT41920  normal  0.89758  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00019  CDS  CP001509  18714  19619  906  DNA-binding transcriptional activator  ACT41921  normal  0.537169  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00020  CDS  CP001509  19658  20617  960  hypothetical protein  ACT41922  normal  0.140967  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00021  CDS  CP001509  20630  21775  1146  putative usher protein  ACT41923  normal  0.102676  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00022  CDS  CP001509  22208  22912  705  conserved hypothetical protein  ACT41924  hitchhiker  0.00750286  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00023  CDS  CP001509  23346  23621  276  IS1 protein InsA  ACT41925  hitchhiker  0.0051984  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00024  CDS  CP001509  23540  24043  504  IS1 protein InsB  ACT41926  hitchhiker  0.00213822  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00025  CDS  CP001509  24054  24404  351  conserved hypothetical protein  ACT41927  hitchhiker  0.000432323  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00026  CDS  CP001509  24701  24865  165  hypothetical protein  ACT41928  hitchhiker  0.000268712  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00027  CDS  CP001509  24887  25150  264  30S ribosomal protein S20  ACT41929  unclonable  4.13778e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00028  CDS  CP001509  25253  25471  219  hypothetical protein  ACT41930  unclonable  4.13778e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00029  CDS  CP001509  25479  26420  942  putative regulator  ACT41931  unclonable  1.73781e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00030  CDS  CP001509  26463  29279  2817  isoleucyl-tRNA synthetase  ACT41932  hitchhiker  0.00300896  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00031  CDS  CP001509  29279  29773  495  signal peptidase II  ACT41933  hitchhiker  0.00165346  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00032  CDS  CP001509  29898  30347  450  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  ACT41934  hitchhiker  0.00464715  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00033  CDS  CP001509  30349  31299  951  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  ACT41935  hitchhiker  0.00914295  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00034  CDS  CP001509  31365  32279  915  ribonucleoside hydrolase 3  ACT41936  hitchhiker  0.00939814  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00035  CDS  CP001509  32446  33267  822  dihydrodipicolinate reductase  ACT41937  normal  0.0945677  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00036  CDS  CP001509  33723  34871  1149  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  ACT41938  normal  0.53844  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00037  CDS  CP001509  34889  38110  3222  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  ACT41939  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00038  CDS  CP001509  38372  38767  396  DNA-binding transcriptional activator  ACT41940  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00039  CDS  CP001509  38976  39566  591  predicted acyl transferase  ACT41941  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00040  CDS  CP001509  39572  40465  894  carnitinyl-CoA dehydratase  ACT41942  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00041  CDS  CP001509  40466  42034  1569  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  ACT41943  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00042    CP001509  42093  43309  1217      normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00043  CDS  CP001509  43438  44580  1143  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  ACT41944  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00044  CDS  CP001509  44611  46125  1515  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  ACT41945  normal  0.757112  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00045  CDS  CP001509  46599  47369  771  predicted electron transfer flavoprotein subunit, ETFP adenine nucleotide-binding domain protein  ACT41946  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00046  CDS  CP001509  47384  48325  942  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  ACT41947  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00047  CDS  CP001509  48376  49662  1287  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  ACT41948  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00048  CDS  CP001509  49659  49946  288  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  ACT41949  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00049  CDS  CP001509  50003  51334  1332  predicted transporter  ACT41950  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00050  CDS  CP001509  51442  51972  531  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein  ACT41951  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00051  CDS  CP001509  51965  53827  1863  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  ACT41952  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00052  CDS  CP001509  54019  54498  480  dihydrofolate reductase  ACT41953  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00053  CDS  CP001509  54576  55418  843  diadenosinetetraphosphatase  ACT41954  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00054  CDS  CP001509  55425  55802  378  hypothetical protein  ACT41955  normal  0.641296  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00055  CDS  CP001509  55805  56626  822  dimethyladenosine transferase  ACT41956  normal  0.139498  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00056  CDS  CP001509  56623  57612  990  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  ACT41957  normal  0.0362811  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00057  CDS  CP001509  57612  58898  1287  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  ACT41958  normal  0.0213586  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00058  CDS  CP001509  58951  61305  2355  organic solvent tolerance protein precursor  ACT41959  unclonable  1.14767e-05  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00059  CDS  CP001509  61560  62375  816  Dna-J like membrane chaperone protein  ACT41960  unclonable  4.86823e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00060  CDS  CP001509  62492  63151  660  pseudouridine synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32)  ACT41961  hitchhiker  0.00103207  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00061  CDS  CP001509  63163  66069  2907  ATP-dependent helicase HepA  ACT41962  normal  0.283033  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00062  CDS  CP001509  66234  68585  2352  DNA polymerase II  ACT41963  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00063  CDS  CP001509  68660  69355  696  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  ACT41964  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00064  CDS  CP001509  69640  71142  1503  L-arabinose isomerase  ACT41965  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00065  CDS  CP001509  71153  72853  1701  ribulokinase  ACT41966  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00066  CDS  CP001509  73192  74070  879  DNA-binding transcriptional dual regulator  ACT41967  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00067  CDS  CP001509  74156  74920  765  conserved inner membrane protein  ACT41968  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00068  CDS  CP001509  75034  75732  699  thiamin transporter subunit  ACT41969  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00069  CDS  CP001509  75716  77326  1611  thiamin ABC transporter membrane protein  ACT41970  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00070  CDS  CP001509  77302  78285  984  thiamin transporter subunit  ACT41971  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00071  CDS  CP001509  78449  80104  1656  DNA-binding transcriptional regulator  ACT41972  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00072  CDS  CP001509  80426  81604  1179  broad specificity sugar efflux system  ACT41973  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00073  CDS  CP001509  81653  82258  606  isopropylmalate isomerase small subunit  ACT41974  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00074  CDS  CP001509  82269  83669  1401  isopropylmalate isomerase large subunit  ACT41975  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00075  CDS  CP001509  83672  84763  1092  3-isopropylmalate dehydrogenase  ACT41976  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00076  CDS  CP001509  84763  86334  1572  2-isopropylmalate synthase  ACT41977  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00077  CDS  CP001509  86427  86513  87  leu operon leader peptide  ACT41978  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00078  CDS  CP001509  87173  88117  945  leucine transcriptional activator  ACT41979  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00079  CDS  CP001509  88435  90159  1725  acetolactate synthase III large subunit  ACT41980  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00080  CDS  CP001509  90162  90653  492  acetolactate synthase small subunit  ACT41981  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00081  CDS  CP001509  90833  91837  1005  DNA-binding transcriptional dual regulator  ACT41982  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00082  CDS  CP001509  92439  92897  459  hypothetical protein  ACT41983  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00083  CDS  CP001509  92899  93840  942  S-adenosyl-methyltransferase  ACT41984  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00084  CDS  CP001509  93837  94202  366  membrane bound cell division protein at septum containing leucine zipper motif  ACT41985  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00085  CDS  CP001509  94218  95984  1767  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  ACT41986  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00086  CDS  CP001509  95971  97458  1488  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate-2, 6-diaminopimelate ligase  ACT41987  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00087  CDS  CP001509  97455  98813  1359  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D- alanine ligase  ACT41988  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00088  CDS  CP001509  98807  99889  1083  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  ACT41989  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00089  CDS  CP001509  99892  101208  1317  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D- glutamatesynthetase  ACT41990  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00090  CDS  CP001509  101208  102452  1245  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  ACT41991  normal  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00091  CDS  CP001509  102449  103516  1068  N-acetylglucosaminyl transferase  ACT41992  normal  0.669731  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00092  CDS  CP001509  103570  105045  1476  UDP-N-acetylmuramate-L-alanine ligase  ACT41993  normal  0.587237  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00093  CDS  CP001509  105038  105958  921  D-alanylalanine synthetase  ACT41994  normal  0.149308  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00094  CDS  CP001509  105960  106790  831  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  ACT41995  normal  0.0158467  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00095  CDS  CP001509  106787  108049  1263  cell division protein  ACT41996  decreased coverage  3.25229e-05  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00096  CDS  CP001509  108110  109261  1152  cell division protein FtsZ  ACT41997  decreased coverage  2.823e-05  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00097  CDS  CP001509  109362  110279  918  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  ACT41998  hitchhiker  0.000126099  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00098  CDS  CP001509  110510  111022  513  SecA regulator SecM  ACT41999  hitchhiker  0.00024952  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00099  CDS  CP001509  111084  113789  2706  translocase  ACT42000  hitchhiker  0.00554961  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00100  CDS  CP001509  113849  114238  390  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  ACT42001  normal  0.126012  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>