506 genes were found for organism Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mnod_8254  CDS  NC_011892  211  657  +  447  hypothetical protein  YP_002494901  normal  0.243124  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8255  CDS  NC_011892  1228  2676  -  1449  sulfatase  YP_002494902  normal  0.229678  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8256  CDS  NC_011892  2781  2960  -  180  hypothetical protein  YP_002494903  normal  0.0319121  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8257  CDS  NC_011892  3399  4706  -  1308  hypothetical protein  YP_002494904  normal  0.043578  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8258    NC_011892  4929  5558  +  630      normal  0.634105  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8259  CDS  NC_011892  5953  6288  +  336  protein of unknown function DUF1452  YP_002494905  normal  0.653302  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8260  CDS  NC_011892  6526  6630  -  105  hypothetical protein  YP_002494906  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8261  CDS  NC_011892  6627  7031  -  405  hypothetical protein  YP_002494907  normal  0.898054  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8262  CDS  NC_011892  7375  7815  +  441  hypothetical protein  YP_002494908  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8263    NC_011892  7850  8041  -  192      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8264  CDS  NC_011892  8488  8964  -  477  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  YP_002494909  normal  0.677958  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8265    NC_011892  9325  9681  +  357      normal  0.881031  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8266    NC_011892  9630  10158  -  529      normal  0.484351  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8267  CDS  NC_011892  10155  10871  -  717  hypothetical protein  YP_002494910  normal  0.178597  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8268  CDS  NC_011892  10930  11226  -  297  hypothetical protein  YP_002494911  normal  0.0489738  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8269  CDS  NC_011892  11369  11674  +  306  addiction module killer protein  YP_002494912  normal  0.0194328  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8270  CDS  NC_011892  11667  11960  +  294  putative transcriptional regulator  YP_002494913  normal  0.0213067  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8271  CDS  NC_011892  12244  13524  +  1281  hypothetical protein  YP_002494914  normal  0.24763  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8272  CDS  NC_011892  13656  14240  +  585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002494915  normal  0.521962  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8273    NC_011892  14413  15165  -  753      normal  0.11171  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8274  CDS  NC_011892  15451  17598  +  2148  TonB-dependent siderophore receptor  YP_002494916  normal  0.0140393  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8275    NC_011892  17715  17834  +  120      decreased coverage  0.000772942  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8276    NC_011892  17851  18309  +  459      decreased coverage  0.00151051  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8277  CDS  NC_011892  18462  19448  -  987  hypothetical protein  YP_002494917  normal  0.0178279  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8278  CDS  NC_011892  19874  21511  +  1638  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  YP_002494918  normal  0.107933  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8279  CDS  NC_011892  21951  23480  +  1530  Hemolysin-type calcium-binding region  YP_002494919  normal  0.325429  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8280    NC_011892  23540  23821  +  282      normal  0.0289772  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8281  CDS  NC_011892  23952  24089  +  138  hypothetical protein  YP_002494920  normal  0.0471247  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8282  CDS  NC_011892  24202  25137  -  936  hypothetical protein  YP_002494921  normal  0.167728  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8283  CDS  NC_011892  25374  26447  -  1074  hypothetical protein  YP_002494922  normal  0.331955  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8284  CDS  NC_011892  26773  27204  +  432  transcriptional regulator, MucR family  YP_002494923  normal  0.647815  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8285  CDS  NC_011892  27238  27624  -  387  PilT protein domain protein  YP_002494924  normal  0.394847  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8286  CDS  NC_011892  27624  27878  -  255  Rv0623 family protein transcription factor  YP_002494925  normal  0.575362  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8287  CDS  NC_011892  27999  30128  -  2130  ParB domain protein nuclease  YP_002494926  normal  0.246382  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8288    NC_011892  30276  30485  +  210      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8289  CDS  NC_011892  30613  30828  +  216  hypothetical protein  YP_002494927  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8290  CDS  NC_011892  30911  31483  +  573  hypothetical protein  YP_002494928  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8291  CDS  NC_011892  31593  31784  +  192  transposase and inactivated derivatives-like protein  YP_002494929  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8292  CDS  NC_011892  31936  32577  +  642  Glutathione S-transferase domain protein  YP_002494930  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8293  CDS  NC_011892  32785  33117  +  333  hypothetical protein  YP_002494931  normal  0.988763  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8294  CDS  NC_011892  33126  33833  -  708  hypothetical protein  YP_002494932  normal  0.227886  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8295  CDS  NC_011892  33833  34780  -  948  domain of unknown function DUF1738  YP_002494933  normal  0.0399219  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8296    NC_011892  34980  35315  +  336      normal  0.0172471  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8297    NC_011892  35348  35503  +  156      normal  0.0126117  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8298    NC_011892  36064  36243  +  180      normal  0.013738  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8299  CDS  NC_011892  36529  37506  -  978  Lytic transglycosylase catalytic  YP_002494934  normal  0.103911  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8300  CDS  NC_011892  38446  39054  +  609  hypothetical protein  YP_002494935  normal  0.291535  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8301  CDS  NC_011892  39542  40420  -  879  beta-lactamase domain protein  YP_002494936  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8302  CDS  NC_011892  40458  41240  -  783  Creatininase  YP_002494937  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8303  CDS  NC_011892  41254  42690  -  1437  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002494938  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8304  CDS  NC_011892  42804  43475  +  672  transcriptional regulator, TetR family  YP_002494939  normal  0.505381  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8305    NC_011892  43623  44972  -  1350      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8306  CDS  NC_011892  45584  47065  -  1482  succinic semialdehyde dehydrogenase  YP_002494940  normal  0.985186  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8307  CDS  NC_011892  47214  48872  -  1659  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  YP_002494941  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8308  CDS  NC_011892  48971  50278  -  1308  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002494942  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8309  CDS  NC_011892  50444  51400  +  957  transcriptional regulator, LysR family  YP_002494943  normal  0.207125  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8310  CDS  NC_011892  51376  52419  -  1044  amidohydrolase 2  YP_002494944  normal  0.728961  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8311  CDS  NC_011892  52464  53297  -  834  citrate synthase  YP_002494945  normal  0.173148  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8312  CDS  NC_011892  53323  54600  -  1278  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_002494946  normal  0.0250341  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8313  CDS  NC_011892  54656  56131  -  1476  anion transporter  YP_002494947  normal  0.572418  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8314  CDS  NC_011892  56204  56446  +  243  hypothetical protein  YP_002494948  normal  0.118294  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8315  CDS  NC_011892  57504  57926  +  423  YCII-related  YP_002494949  normal  0.11198  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8316    NC_011892  57986  58128  +  143      normal  0.147013  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8317  CDS  NC_011892  58131  58883  -  753  hypothetical protein  YP_002494950  normal  0.324415  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8318  CDS  NC_011892  59190  60128  -  939  amidohydrolase 2  YP_002494951  normal  0.778214  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8319  CDS  NC_011892  60142  61062  -  921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  YP_002494952  normal  0.736171  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8320  CDS  NC_011892  61168  62502  -  1335  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002494953  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8321  CDS  NC_011892  62579  63253  -  675  hypothetical protein  YP_002494954  normal  0.242879  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8322  CDS  NC_011892  63298  64212  -  915  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  YP_002494955  normal  0.0469353  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8323  CDS  NC_011892  64243  67311  -  3069  FAD linked oxidase domain protein  YP_002494956  normal  0.109641  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8324  CDS  NC_011892  67316  68650  -  1335  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002494957  normal  0.822515  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8325  CDS  NC_011892  69126  69830  +  705  transcriptional regulator, IclR family  YP_002494958  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8326    NC_011892  69929  70147  +  219      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8327    NC_011892  70167  70561  +  395      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8328  CDS  NC_011892  70563  71495  -  933  transcriptional regulator, LysR family  YP_002494959  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8329  CDS  NC_011892  71628  72050  +  423  Cupin 2 conserved barrel domain protein  YP_002494960  normal  0.972022  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8330  CDS  NC_011892  72100  72867  +  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002494961  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8331  CDS  NC_011892  72867  73376  +  510  hypothetical protein  YP_002494962  normal  0.608789  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8332    NC_011892  73402  74460  +  1059      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8333  CDS  NC_011892  74542  75315  +  774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002494963  normal  0.319832  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8334  CDS  NC_011892  75328  76221  -  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_002494964  normal  0.671747  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8335  CDS  NC_011892  76389  77024  +  636  (2Fe-2S)-binding domain protein  YP_002494965  normal  0.733806  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8336  CDS  NC_011892  77021  77971  +  951  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  YP_002494966  normal  0.69279  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8337  CDS  NC_011892  77975  80194  +  2220  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_002494967  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8338  CDS  NC_011892  80215  80688  +  474  Cupin 2 conserved barrel domain protein  YP_002494968  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8339  CDS  NC_011892  80732  81454  +  723  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  YP_002494969  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8340  CDS  NC_011892  81745  81945  -  201  hypothetical protein  YP_002494970  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8341    NC_011892  82110  82637  -  528      normal  0.968036  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8342  CDS  NC_011892  82805  82996  +  192  hypothetical protein  YP_002494971  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8343  CDS  NC_011892  82984  83496  -  513  hypothetical protein  YP_002494972  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8344  CDS  NC_011892  83635  83859  +  225  addiction module antidote  YP_002494973  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8345  CDS  NC_011892  83870  84250  +  381  death-on-curing family protein  YP_002494974  normal  0.611324  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8346  CDS  NC_011892  84358  84504  +  147  hypothetical protein  YP_002494975  normal  0.494172  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8347  CDS  NC_011892  84595  85929  +  1335  transposase IS4 family protein  YP_002494976  normal  0.553537  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8348  CDS  NC_011892  86018  86875  +  858  transposase IS4 family protein  YP_002494977  normal  0.12651  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8349    NC_011892  86894  87207  -  314      normal  0.115317  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8350  CDS  NC_011892  87603  87887  -  285  hypothetical protein  YP_002494978  normal  0.477325  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8351  CDS  NC_011892  88345  88713  +  369  SPW repeat-containing protein  YP_002494979  normal  0.36663  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8352  CDS  NC_011892  88855  89229  +  375  hypothetical protein  YP_002494980  normal  0.956379  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_8353  CDS  NC_011892  89371  90411  +  1041  hypothetical protein  YP_002494981  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>