3025 genes were found for organism Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Nther_0001  CDS  NC_010718  146  1507  1362  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001916188  decreased coverage  2.08022e-10  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0002  CDS  NC_010718  1780  2892  1113  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001916189  hitchhiker  7.29086e-06  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0003  CDS  NC_010718  2912  3133  222  S4-like RNA binding protein  YP_001916190  hitchhiker  0.000208957  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0004  CDS  NC_010718  3167  4327  1161  DNA replication and repair protein RecF  YP_001916191  hitchhiker  0.00780262  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0005  CDS  NC_010718  4308  5210  903  hypothetical protein  YP_001916192  normal  0.0643796  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0006  CDS  NC_010718  5218  5517  300  hypothetical protein  YP_001916193  normal  0.0603717  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0007  CDS  NC_010718  5587  7509  1923  DNA gyrase subunit B  YP_001916194  normal  0.630363  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0008  CDS  NC_010718  7594  10017  2424  DNA gyrase subunit A  YP_001916195  normal  0.425562  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0009  CDS  NC_010718  16215  17795  1581  polysaccharide biosynthesis protein  YP_001916196  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0010  CDS  NC_010718  18000  20078  2079  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  YP_001916197  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0011  CDS  NC_010718  20325  21422  1098  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001916198  normal  0.133339  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0012  CDS  NC_010718  21504  22391  888  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_001916199  normal  0.0121717  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0013  CDS  NC_010718  22970  24238  1269  seryl-tRNA synthetase  YP_001916200  hitchhiker  2.1419e-10  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0014  CDS  NC_010718  24786  25262  477  tRNA-adenosine deaminase  YP_001916201  hitchhiker  5.74394e-11  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0015  CDS  NC_010718  26074  27843  1770  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_001916202  hitchhiker  0.00819086  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0016  CDS  NC_010718  27861  28178  318  hypothetical protein  YP_001916203  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0017  CDS  NC_010718  28179  28778  600  DNA replication and repair protein RecR  YP_001916204  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0018  CDS  NC_010718  28964  29284  321  hypothetical protein  YP_001916205  normal  normal  0.987465  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0019  CDS  NC_010718  29339  29620  282  pro-sigmaK processing inhibitor BofA  YP_001916206  normal  normal  0.959341  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0020  CDS  NC_010718  29826  30482  657  hypothetical protein  YP_001916207  normal  normal  0.921254  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0021  CDS  NC_010718  30553  34080  3528  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_001916208  normal  normal  0.769257  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0022  CDS  NC_010718  34212  35294  1083  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  YP_001916209  normal  0.105699  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0023  CDS  NC_010718  35322  36071  750  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, beta subunit  YP_001916210  hitchhiker  0.00245955  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0024  CDS  NC_010718  36074  36670  597  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, gamma subunit  YP_001916211  hitchhiker  0.00052621  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0025  CDS  NC_010718  36688  36948  261  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_001916212  decreased coverage  0.000336302  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0026  CDS  NC_010718  37023  38330  1308  transcriptional regulator, XRE family  YP_001916213  normal  0.0122456  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0027  CDS  NC_010718  38506  40578  2073  cell division protein FtsA  YP_001916214  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0028  CDS  NC_010718  40685  42049  1365  Integrase catalytic region  YP_001916215  normal  normal  0.98603  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0029  CDS  NC_010718  42241  43698  1458  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  YP_001916216  normal  normal  0.899515  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0030  CDS  NC_010718  43979  45328  1350  sodium:neurotransmitter symporter  YP_001916217  normal  normal  0.623873  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0031  CDS  NC_010718  45502  46953  1452  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_001916218  normal  normal  0.901763  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0032  CDS  NC_010718  46990  48327  1338  AAA ATPase  YP_001916219  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0033  CDS  NC_010718  48342  48962  621  dTMP kinase  YP_001916220  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0034  CDS  NC_010718  49007  49342  336  protein of unknown function DUF970  YP_001916221  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0035  CDS  NC_010718  49378  49839  462  protein of unknown function DUF327  YP_001916222  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0036  CDS  NC_010718  49918  50661  744  zinc/iron permease  YP_001916223  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0037  CDS  NC_010718  50786  51847  1062  Integrase catalytic region  YP_001916224  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0038  CDS  NC_010718  52041  53003  963  DNA-directed DNA polymerase  YP_001916225  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0039  CDS  NC_010718  53006  53914  909  PSP1 domain protein  YP_001916226  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0040  CDS  NC_010718  53936  55492  1557  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  YP_001916227  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0041  CDS  NC_010718  55590  56447  858  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_001916228  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0042  CDS  NC_010718  56542  56793  252  transcriptional regulator, AbrB family  YP_001916229  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0043  CDS  NC_010718  57085  59052  1968  methionyl-tRNA synthetase  YP_001916230  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0044  CDS  NC_010718  59054  59824  771  hydrolase, TatD family  YP_001916231  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0045  CDS  NC_010718  59836  60687  852  rare lipoprotein A  YP_001916232  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0046  CDS  NC_010718  60730  61638  909  dimethyladenosine transferase  YP_001916233  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0047  CDS  NC_010718  61686  62162  477  protein of unknown function DUF458  YP_001916234  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0048  CDS  NC_010718  62269  62535  267  protein of unknown function DUF1021  YP_001916235  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0049  CDS  NC_010718  62544  63005  462  hypothetical protein  YP_001916236  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0050  CDS  NC_010718  63196  64719  1524  Peptidoglycan-binding LysM  YP_001916237  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0051  CDS  NC_010718  64751  65023  273  protein of unknown function UPF0016  YP_001916238  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0052  CDS  NC_010718  65183  66433  1251  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  YP_001916239  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0053  CDS  NC_010718  66478  67518  1041  nicotinate phosphoribosyltransferase  YP_001916240  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0054  CDS  NC_010718  67617  68426  810  cyanophycinase  YP_001916241  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0055  CDS  NC_010718  68430  71114  2685  cyanophycin synthetase  YP_001916242  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0056  CDS  NC_010718  71216  72142  927  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_001916243  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0057  CDS  NC_010718  72142  72927  786  hypothetical protein  YP_001916244  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0058  CDS  NC_010718  72951  73793  843  pur operon repressor  YP_001916245  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0059  CDS  NC_010718  73850  74140  291  SpoVG family protein  YP_001916246  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0060  CDS  NC_010718  74232  75638  1407  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase, UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  YP_001916247  normal  0.867514  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0061  CDS  NC_010718  75631  76599  969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_001916248  normal  0.0325861  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0062  CDS  NC_010718  76689  77336  648  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  YP_001916249  hitchhiker  0.00391623  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0063  CDS  NC_010718  77360  77983  624  Aminoacyl-tRNA hydrolase  YP_001916250  hitchhiker  5.09944e-05  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0064  CDS  NC_010718  78114  79670  1557  AbgT putative transporter  YP_001916251  decreased coverage  8.77421e-10  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0065  CDS  NC_010718  79807  80352  546  protein of unknown function DUF204  YP_001916252  hitchhiker  0.00032233  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0066  CDS  NC_010718  80546  80953  408  hypothetical protein  YP_001916253  normal  0.0143949  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0067  CDS  NC_010718  81091  84681  3591  transcription-repair coupling factor  YP_001916254  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0068  CDS  NC_010718  84784  85338  555  transcriptional regulator, AbrB family  YP_001916255  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0069  CDS  NC_010718  85404  86558  1155  MazG family protein  YP_001916256  normal  0.645139  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0070  CDS  NC_010718  86675  86953  279  nucleoid protein Hbs  YP_001916257  normal  0.0240129  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0071  CDS  NC_010718  87070  88080  1011  SpoIID/LytB domain protein  YP_001916258  hitchhiker  0.000124334  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0072  CDS  NC_010718  88273  88557  285  sporulation protein YabP  YP_001916259  hitchhiker  6.30985e-07  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0073  CDS  NC_010718  88571  89077  507  hypothetical protein  YP_001916260  hitchhiker  1.85846e-08  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0074  CDS  NC_010718  89194  89574  381  cell division protein FtsL  YP_001916261  hitchhiker  1.18222e-10  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0075  CDS  NC_010718  89660  90022  363  RNA binding S1 domain protein  YP_001916262  decreased coverage  5.91466e-13  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0076  CDS  NC_010718  90085  91368  1284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_001916263  hitchhiker  6.70582e-06  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0077  CDS  NC_010718  91352  92251  900  Ppx/GppA phosphatase  YP_001916264  normal  0.0183258  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0078  CDS  NC_010718  92567  95068  2502  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  YP_001916265  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0079  CDS  NC_010718  95138  96667  1530  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_001916266  normal  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0080  CDS  NC_010718  96706  97251  546  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  YP_001916267  normal  0.297539  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0081  CDS  NC_010718  97364  99445  2082  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  YP_001916268  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0082  CDS  NC_010718  99610  100155  546  membrane protein  YP_001916269  normal  0.224712  normal  0.42558  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0083  CDS  NC_010718  100248  101918  1671  Formate-tetrahydrofolate ligase  YP_001916270  normal  0.784091  normal  0.246286  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0084  CDS  NC_010718  102079  103482  1404  hypothetical protein  YP_001916271  normal  0.32801  normal  0.0929618  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0085  CDS  NC_010718  103637  104608  972  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_001916272  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0086  CDS  NC_010718  104620  105390  771  pantothenate kinase  YP_001916273  decreased coverage  4.11745e-08  normal  0.0255424  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0087  CDS  NC_010718  105565  105801  237  hypothetical protein  YP_001916274  hitchhiker  5.56614e-09  normal  0.0131247  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0088  CDS  NC_010718  105798  106160  363  hypothetical protein  YP_001916275  decreased coverage  2.49893e-10  normal  0.0149794  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0089  CDS  NC_010718  106186  106602  417  hypothetical protein  YP_001916276  hitchhiker  4.64351e-07  normal  0.0107515  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0090  CDS  NC_010718  106768  108393  1626  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  YP_001916277  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0091  CDS  NC_010718  108439  108831  393  DRTGG domain protein  YP_001916278  normal  0.0978121  hitchhiker  0.00135297  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0092  CDS  NC_010718  108824  109258  435  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_001916279  normal  0.305697  hitchhiker  0.00140915  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0093  CDS  NC_010718  109303  110685  1383  Fe-S cluster domain protein  YP_001916280  normal  hitchhiker  0.000835421  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0094  CDS  NC_010718  110750  111097  348  HPr kinase  YP_001916281  normal  hitchhiker  2.48452e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0095  CDS  NC_010718  111090  111845  756  PHP domain protein  YP_001916282  normal  hitchhiker  1.29632e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0096  CDS  NC_010718  111915  112403  489  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  YP_001916283  normal  hitchhiker  1.08902e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0097  CDS  NC_010718  112406  112957  552  histidine kinase  YP_001916284  normal  hitchhiker  3.93331e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0098  CDS  NC_010718  112959  113333  375  ferredoxin-like protein  YP_001916285  normal  hitchhiker  3.32289e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0099  CDS  NC_010718  113355  115148  1794  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001916286  normal  0.953797  hitchhiker  5.56523e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0100  CDS  NC_010718  115206  117887  2682  formate dehydrogenase, alpha subunit  YP_001916287  hitchhiker  1.02152e-05  hitchhiker  2.06048e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>