4937 genes were found for organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 50    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
SeAg_A0001  CDS  NC_011148  79  240  162  hypothetical protein  YP_002144928  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0002  CDS  NC_011148  291  527  237  hypothetical protein  YP_002144929  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0003  CDS  NC_011148  663  890  228  hypothetical protein  YP_002144930  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0004  CDS  NC_011148  897  1148  252  hypothetical protein  YP_002144931  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0005  CDS  NC_011148  1160  1363  204  hypothetical protein  YP_002144932  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0006  CDS  NC_011148  1364  1759  396  hypothetical protein  YP_002144933  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0007  CDS  NC_011148  1762  2205  444  hypothetical protein  YP_002144934  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0008  CDS  NC_011148  2285  2698  414  hypothetical protein  YP_002144935  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0009  CDS  NC_011148  2747  3034  288  hypothetical protein  YP_002144936  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0010  CDS  NC_011148  3160  3318  159  hypothetical protein  YP_002144937  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0011  CDS  NC_011148  3474  3974  501  protein ParB  YP_002144938  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0012  CDS  NC_011148  3974  4189  216  hypothetical protein  YP_002144939  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0013  CDS  NC_011148  4210  4551  342  hypothetical protein  YP_002144940  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0014  CDS  NC_011148  4795  4998  204  hypothetical protein  YP_002144941  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0015  CDS  NC_011148  5010  5579  570  hypothetical protein  YP_002144942  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0016    NC_011148  5581  6399  819      n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0017  CDS  NC_011148  6629  6922  294  hypothetical protein  YP_002144943  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0018  CDS  NC_011148  6919  7257  339  hypothetical protein  YP_002144944  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0019  CDS  NC_011148  7270  7695  426  H-NS histone family  YP_002144945  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0020  CDS  NC_011148  7793  9973  2181  topoisomerase  YP_002144946  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0021  CDS  NC_011148  10015  10416  402  hypothetical protein  YP_002144947  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0022  CDS  NC_011148  10504  10869  366  YggA protein  YP_002144948  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0023  CDS  NC_011148  10886  12907  2022  conjugal transfer protein  YP_002144949  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0024  CDS  NC_011148  12929  13990  1062  P-type DNA transfer ATPase VirB11  YP_002144950  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0025  CDS  NC_011148  14067  15293  1227  conjugal transfer protein  YP_002144951  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0026  CDS  NC_011148  15286  16074  789  conjugal transfer outer membrane protein  YP_002144952  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0027  CDS  NC_011148  16096  16887  792  conjugal transfer protein  YP_002144953  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0028  CDS  NC_011148  16889  17062  174  hypothetical protein  YP_002144954  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0029  CDS  NC_011148  17112  17765  654  putative conjugal transfer protein  YP_002144955  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0030  CDS  NC_011148  17776  20301  2526  conjugal transfer protein  YP_002144956  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0031  CDS  NC_011148  20267  20665  399  hypothetical protein  YP_002144957  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0032  CDS  NC_011148  20726  21043  318  hypothetical protein  YP_002144958  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0033  CDS  NC_011148  21057  21734  678  conjugal transfer protein  YP_002144959  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0034  CDS  NC_011148  21828  22238  411  hypothetical protein  YP_002144960  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0035  CDS  NC_011148  22449  22952  504  hypothetical protein  YP_002144961  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0036  CDS  NC_011148  22953  24017  1065  plasmid replication protein  YP_002144962  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0037  CDS  NC_011148  25110  25358  249  hypothetical protein  YP_002144963  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0038  CDS  NC_011148  25378  26430  1053  putative conjugal transfer protein  YP_002144964  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0039  CDS  NC_011148  26531  27112  582  hypothetical protein  YP_002144965  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0040  CDS  NC_011148  27209  27466  258  hypothetical protein  YP_002144966  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0041  CDS  NC_011148  27694  27849  156  hypothetical protein  YP_002144967  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0042  CDS  NC_011148  27948  28274  327  hypothetical protein  YP_002144968  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0043  CDS  NC_011148  28412  29392  981  hypothetical protein  YP_002144969  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0044  CDS  NC_011148  29436  30134  699  hypothetical protein  YP_002144970  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0045  CDS  NC_011148  30196  30471  276  hypothetical protein  YP_002144971  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0046  CDS  NC_011148  30494  30847  354  hypothetical protein  YP_002144972  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0047  CDS  NC_011148  30880  31437  558  hypothetical protein  YP_002144973  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0048  CDS  NC_011148  31485  32291  807  TraL  YP_002144974  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0049  CDS  NC_011148  32284  32712  429  hypothetical protein  YP_002144975  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0050  CDS  NC_011148  33070  33459  390  hypothetical protein  YP_002144976  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0051  CDS  NC_011148  33440  37045  3606  relaxase  YP_002144977  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0052  CDS  NC_011148  37351  37563  213  hypothetical protein  YP_002144978  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_A0053  CDS  NC_011148  37611  37823  213  hypothetical protein  YP_002144979  n/a    n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0002  CDS  NC_011149  337  2799  2463  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  YP_002144980  normal  0.0437927  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0003  CDS  NC_011149  2801  3730  930  homoserine kinase  YP_002144981  normal  0.119068  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0004  CDS  NC_011149  3734  5020  1287  threonine synthase  YP_002144982  normal  0.153937  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0005  CDS  NC_011149  5113  5886  774  hypothetical protein  YP_002144983  normal  0.0915517  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0006  CDS  NC_011149  5965  7422  1458  amino-acid carrier protein AlsT  YP_002144984  normal  0.0332289  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0007  CDS  NC_011149  7664  8617  954  transaldolase B  YP_002144985  normal  0.111561  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0008  CDS  NC_011149  8728  9318  591  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_002144986  normal  0.184755  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0009  CDS  NC_011149  9375  9941  567  hypothetical protein  YP_002144987  normal  0.350527  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0010  CDS  NC_011149  10091  10804  714  hypothetical protein  YP_002144988  normal  0.503351  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0011  CDS  NC_011149  10840  11244  405  hypothetical protein  YP_002144989  normal  0.624687  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0012  CDS  NC_011149  11299  11424  126  hypothetical protein  YP_002144990  normal  0.448393  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0013  CDS  NC_011149  11593  13509  1917  molecular chaperone DnaK  YP_002144991  normal  0.693638  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0014  CDS  NC_011149  13595  14734  1140  chaperone protein DnaJ  YP_002144992  normal  0.65684  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0015  CDS  NC_011149  14846  14959  114  hypothetical protein  YP_002144993  normal  0.797139  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0016  CDS  NC_011149  15015  15962  948  putative transcriptional regulator, LysR family  YP_002144994  normal  0.709055  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0017  CDS  NC_011149  16131  16433  303  putative bacteriophage protein  YP_002144995  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0018  CDS  NC_011149  16494  17027  534  hypothetical protein  YP_002144996  normal  0.931727  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0019  CDS  NC_011149  17044  17487  444  hypothetical protein  YP_002144997  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0020  CDS  NC_011149  17614  17742  129  hypothetical protein  YP_002144998  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0021  CDS  NC_011149  17868  19967  2100  exochitinase  YP_002144999  normal  0.822563  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0022  CDS  NC_011149  20060  23056  2997  putative hydroxymethyltransferase  YP_002145000  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0023  CDS  NC_011149  23337  24041  705  putative cytoplasmic protein  YP_002145001  normal  0.524077  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0024  CDS  NC_011149  24471  25013  543  fimbrial subunit  YP_002145002  normal  0.585957  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0025  CDS  NC_011149  24973  25800  828  chaperone protein FimC  YP_002145003  normal  0.263689  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0026  CDS  NC_011149  25760  28426  2667  outer membrane usher protein FimD  YP_002145004  normal  0.213099  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0027  CDS  NC_011149  28427  29434  1008  mannose binding protein FimH  YP_002145005  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0028  CDS  NC_011149  29465  29980  516  fimbrial subunit  YP_002145006  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0029  CDS  NC_011149  29996  30514  519  fimbrial subunit  YP_002145007  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0030  CDS  NC_011149  30576  31211  636  fimbrial chaperone  YP_002145008  normal  0.8197  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0031    NC_011149  31276  32121  846      normal  0.524933  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0032    NC_011149  32160  32447  288      normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0033  CDS  NC_011149  32547  32996  450  hypothetical protein  YP_002145009  normal  0.901847  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0034  CDS  NC_011149  33366  34370  1005  putative transcriptional regulator  YP_002145010  normal  0.737803  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0035  CDS  NC_011149  34378  34815  438  putative transcription regulator  YP_002145011  normal  0.920795  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0036  CDS  NC_011149  34827  34973  147  hypothetical protein  YP_002145012  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0037  CDS  NC_011149  35338  37056  1719  arylsulfotransferase  YP_002145013  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0038  CDS  NC_011149  37102  38664  1563  5'-Nucleotidase domain protein  YP_002145014  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0039  CDS  NC_011149  38772  39533  762  putative outer membrane/exported protein  YP_002145015  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0040  CDS  NC_011149  40128  41621  1494  sulfatase  YP_002145016  normal  0.843312  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0041  CDS  NC_011149  41723  42910  1188  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  YP_002145017  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0042  CDS  NC_011149  42935  44182  1248  putative cytoplasmic protein  YP_002145018  normal  0.814834  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0043  CDS  NC_011149  44309  46024  1716  arylsulfotransferase  YP_002145019  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0044  CDS  NC_011149  46187  47353  1167  pH-dependent sodium/proton antiporter  YP_002145020  normal  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0045  CDS  NC_011149  47415  48314  900  transcriptional activator NhaR  YP_002145021  normal  0.87006  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0046  CDS  NC_011149  48369  50408  2040  glycoside hydrolase, family 31  YP_002145022  normal  0.118014  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0047  CDS  NC_011149  50448  51863  1416  xylose-proton symporter  YP_002145023  hitchhiker  2.45314e-08  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0048  CDS  NC_011149  52277  52540  264  30S ribosomal protein S20  YP_002145024  unclonable  1.61385e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 50    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>