3549 genes were found for organism Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Xcel_0001  CDS  NC_013530  150  1556  1407  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003324600  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0002  CDS  NC_013530  2111  3244  1134  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003324601  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0003  CDS  NC_013530  3297  4190  894  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  YP_003324602  normal  0.990629  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0004  CDS  NC_013530  4356  5813  1458  DNA replication and repair protein RecF  YP_003324603  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0005  CDS  NC_013530  5845  6360  516  protein of unknown function DUF721  YP_003324604  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0006  CDS  NC_013530  6655  8700  2046  DNA gyrase, B subunit  YP_003324605  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0007  CDS  NC_013530  8773  11343  2571  DNA gyrase, A subunit  YP_003324606  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0008  CDS  NC_013530  11355  12350  996  putative FHA domain containing protein  YP_003324607  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0009  CDS  NC_013530  12661  12780  120  hypothetical protein  YP_003324608  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0010  CDS  NC_013530  13018  14043  1026  hypothetical protein  YP_003324609  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0011  CDS  NC_013530  14119  14658  540  Peptidylprolyl isomerase  YP_003324610  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0012  CDS  NC_013530  14746  15594  849  Rhomboid family protein  YP_003324611  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0013  CDS  NC_013530  15637  15921  285  protein of unknown function UPF0233  YP_003324612  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0014  CDS  NC_013530  16046  16819  774  protein of unknown function DUF881  YP_003324613  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0015  CDS  NC_013530  16816  17628  813  peptidase C60 sortase A and B  YP_003324614  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0016  CDS  NC_013530  17628  17783  156  hypothetical protein  YP_003324615  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0017  CDS  NC_013530  17811  18479  669  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003324616  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0018  CDS  NC_013530  18721  20802  2082  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_003324617  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0019  CDS  NC_013530  20804  22474  1671  serine/threonine protein kinase  YP_003324618  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0020  CDS  NC_013530  22471  23940  1470  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003324619  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0021  CDS  NC_013530  23937  25427  1491  cell cycle protein  YP_003324620  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0022  CDS  NC_013530  25424  26959  1536  protein serine/threonine phosphatase  YP_003324621  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0023  CDS  NC_013530  26967  27479  513  FHA domain containing protein  YP_003324622  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0024  CDS  NC_013530  27490  28197  708  FHA domain containing protein  YP_003324623  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0025  CDS  NC_013530  29131  29520  390  hypothetical protein  YP_003324624  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0026  CDS  NC_013530  29777  30679  903  hypothetical protein  YP_003324625  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0027  CDS  NC_013530  30731  31834  1104  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  YP_003324626  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0028  CDS  NC_013530  31827  33713  1887  ABC transporter related protein  YP_003324627  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0029  CDS  NC_013530  33805  34350  546  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003324628  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0030  CDS  NC_013530  34347  35333  987  hypothetical protein  YP_003324629  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0031  CDS  NC_013530  35466  36656  1191  ATPase  YP_003324630  normal  0.42307  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0032  CDS  NC_013530  36783  37136  354  protein of unknown function DUF488  YP_003324631  normal  0.333631  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0033  CDS  NC_013530  37521  38426  906  NmrA family protein  YP_003324632  normal  0.230657  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0034  CDS  NC_013530  38500  39048  549  protein tyrosine phosphatase  YP_003324633  normal  0.297427  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0035  CDS  NC_013530  39089  39619  531  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003324634  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0036  CDS  NC_013530  39627  40664  1038  alpha/beta hydrolase fold family protein  YP_003324635  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0037  CDS  NC_013530  40690  41505  816  hypothetical protein  YP_003324636  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0038  CDS  NC_013530  41725  42936  1212  proteinase inhibitor I4 serpin  YP_003324637  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0039  CDS  NC_013530  43156  44325  1170  aminotransferase class I and II  YP_003324638  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0040  CDS  NC_013530  44386  45375  990  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_003324639  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0041  CDS  NC_013530  45402  45881  480  hypothetical protein  YP_003324640  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0042  CDS  NC_013530  45924  46253  330  hypothetical protein  YP_003324641  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0043  CDS  NC_013530  46315  47223  909  transcriptional regulator, LysR family  YP_003324642  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0044  CDS  NC_013530  47553  50684  3132  glycine dehydrogenase  YP_003324643  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0045  CDS  NC_013530  50695  51834  1140  glycine cleavage system T protein  YP_003324644  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0046  CDS  NC_013530  51863  52231  369  glycine cleavage system H protein  YP_003324645  normal  0.517546  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0047  CDS  NC_013530  52429  52671  243  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003324646  normal  0.284313  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0048  CDS  NC_013530  52761  53261  501  NUDIX hydrolase  YP_003324647  normal  0.393224  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0049  CDS  NC_013530  53166  54608  1443  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003324648  normal  0.200181  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0050  CDS  NC_013530  54803  55021  219  hypothetical protein  YP_003324649  normal  0.258445  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0051  CDS  NC_013530  55042  56013  972  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  YP_003324650  normal  0.756837  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0052  CDS  NC_013530  56227  57639  1413  protein of unknown function DUF88  YP_003324651  normal  0.315794  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0053  CDS  NC_013530  57756  58400  645  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_003324652  normal  0.639478  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0054  CDS  NC_013530  58417  59508  1092  hypothetical protein  YP_003324653  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0055  CDS  NC_013530  59513  60097  585  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_003324654  normal  0.773765  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0056  CDS  NC_013530  60188  61057  870  transcriptional regulator, TetR family  YP_003324655  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0057  CDS  NC_013530  61156  62244  1089  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  YP_003324656  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0058  CDS  NC_013530  62241  63056  816  ABC-2 type transporter  YP_003324657  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0059  CDS  NC_013530  63207  64688  1482  amino acid permease-associated region  YP_003324658  normal  0.32682  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0060  CDS  NC_013530  64783  65109  327  phage shock protein C, PspC  YP_003324659  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0061  CDS  NC_013530  65294  66319  1026  transcriptional regulator, LacI family  YP_003324660  normal  0.408611  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0062  CDS  NC_013530  66387  68048  1662  alpha amylase catalytic region  YP_003324661  normal  0.3547  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0063  CDS  NC_013530  68103  69530  1428  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003324662  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0064  CDS  NC_013530  69538  70491  954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003324663  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0065  CDS  NC_013530  70488  71468  981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003324664  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0066  CDS  NC_013530  71492  72403  912  transcriptional regulator, LysR family  YP_003324665  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0067  CDS  NC_013530  72612  73346  735  Endoribonuclease L-PSP  YP_003324666  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0068  CDS  NC_013530  73674  75347  1674  amine oxidase  YP_003324667  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0069  CDS  NC_013530  75441  75623  183  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  YP_003324668  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0070  CDS  NC_013530  75647  76051  405  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  YP_003324669  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0071  CDS  NC_013530  76053  76883  831  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  YP_003324670  normal  0.445423  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0072  CDS  NC_013530  77009  77983  975  aminoglycoside phosphotransferase  YP_003324671  hitchhiker  0.00601594  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0073  CDS  NC_013530  77983  78510  528  Appr-1-p processing domain protein  YP_003324672  hitchhiker  0.00241191  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0074  CDS  NC_013530  78585  83459  4875  ATP-dependent helicase HrpA  YP_003324673  normal  0.292944  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0075  CDS  NC_013530  83592  83960  369  hypothetical protein  YP_003324674  normal  0.501463  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0076  CDS  NC_013530  83957  84379  423  PilT protein domain protein  YP_003324675  normal  0.379626  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0077  CDS  NC_013530  84506  86272  1767  GAF sensor hybrid histidine kinase  YP_003324676  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0078  CDS  NC_013530  86375  87235  861  ketose-bisphosphate aldolase  YP_003324677  normal  0.34849  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0079  CDS  NC_013530  87248  87994  747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  YP_003324678  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0080  CDS  NC_013530  87991  88647  657  dihydroxyacetone kinase, L subunit  YP_003324679  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0081  CDS  NC_013530  88657  89652  996  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  YP_003324680  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0082  CDS  NC_013530  89655  91274  1620  urea amidolyase related protein  YP_003324681  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0083  CDS  NC_013530  91277  92191  915  LamB/YcsF family protein  YP_003324682  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0084  CDS  NC_013530  92466  94634  2169  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  YP_003324683  normal  0.334729  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0085  CDS  NC_013530  94935  95300  366  anti-sigma-factor antagonist  YP_003324684  normal  0.241628  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0086  CDS  NC_013530  95336  96016  681  hypothetical protein  YP_003324685  normal  0.393025  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0087  CDS  NC_013530  96099  96983  885  extracellular solute-binding protein family 3  YP_003324686  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0088  CDS  NC_013530  97026  97922  897  extracellular solute-binding protein family 3  YP_003324687  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0089  CDS  NC_013530  98098  98223  126  hypothetical protein  YP_003324688  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0090  CDS  NC_013530  98337  100238  1902  asparagine synthase  YP_003324689  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0091  CDS  NC_013530  100229  100489  261  hypothetical protein  YP_003324690  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0092  CDS  NC_013530  100486  100911  426  hypothetical protein  YP_003324691  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0093  CDS  NC_013530  100944  102764  1821  ABC transporter related protein  YP_003324692  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0094  CDS  NC_013530  102780  103442  663  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003324693  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0095  CDS  NC_013530  103548  104675  1128  histidine kinase  YP_003324694  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0096  CDS  NC_013530  104711  105415  705  ABC transporter related protein  YP_003324695  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0097  CDS  NC_013530  105412  106203  792  hypothetical protein  YP_003324696  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0098  CDS  NC_013530  106200  106943  744  hypothetical protein  YP_003324697  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0099  CDS  NC_013530  106936  107637  702  hypothetical protein  YP_003324698  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Xcel_0100  CDS  NC_013530  107746  108702  957  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_003324699  normal  n/a    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>