1413 genes were found for organism Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BbuZS7_0001  CDS  NC_011728  57  629  573  hypothetical protein  YP_002374535  normal  0.928929  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0002  CDS  NC_011728  720  1748  1029  glycosyl hydrolase family 3 N domain protein  YP_002374536  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0003  CDS  NC_011728  1736  3202  1467  hypothetical protein  YP_002374537  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0004  CDS  NC_011728  3348  5141  1794  phosphoglucomutase  YP_002374538  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0005  CDS  NC_011728  5204  6259  1056  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_002374539  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0006  CDS  NC_011728  6262  7350  1089  membrane protein  YP_002374540  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0007  CDS  NC_011728  7411  8268  858  hypothetical protein  YP_002374541  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0008  CDS  NC_011728  8380  9150  771  hypothetical protein  YP_002374542  normal  0.487751  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0009  CDS  NC_011728  9155  10159  1005  hypothetical protein  YP_002374543  normal  0.513062  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0010  CDS  NC_011728  10156  10530  375  holo-[acyl-carrier-protein] synthase (Holo-ACP synthase)  YP_002374544  normal  0.718255  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0011  CDS  NC_011728  10534  11373  840  hypothetical protein  YP_002374545  normal  0.622725  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0012  CDS  NC_011728  11374  12114  741  tRNA pseudouridine synthase A  YP_002374546  normal  0.732766  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0013  CDS  NC_011728  12107  12706  600  hypothetical protein  YP_002374547  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0014  CDS  NC_011728  12699  14681  1983  primosomal protein N'  YP_002374548  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0015  CDS  NC_011728  14678  15298  621  uridine kinase  YP_002374549  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0016  CDS  NC_011728  15298  15576  279  GlpE protein  YP_002374550  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0017  CDS  NC_011728  15948  16757  810  hypothetical protein  YP_002374551  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0018  CDS  NC_011728  16760  17740  981  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (rRNA-uridine isomerase D)  YP_002374552  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0019  CDS  NC_011728  17745  18257  513  hypothetical protein  YP_002374553  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0020  CDS  NC_011728  18265  19932  1668  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  YP_002374554  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0021  CDS  NC_011728  20004  21035  1032  S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase (Queuosine biosynthesis protein QueA)  YP_002374555  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0022  CDS  NC_011728  21010  22053  1044  Holliday junction DNA helicase RuvB  YP_002374556  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0023  CDS  NC_011728  22098  22691  594  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_002374557  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0024  CDS  NC_011728  22771  23910  1140  hypothetical protein  YP_002374558  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0025  CDS  NC_011728  23917  24648  732  hypothetical protein  YP_002374559  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0026  CDS  NC_011728  24649  25575  927  methylenetetrahydrofolate dehydrogenase  YP_002374560  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0027  CDS  NC_011728  25705  26343  639  hypothetical protein  YP_002374561  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0028  CDS  NC_011728  26351  27400  1050  putative lipoprotein  YP_002374562  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0029  CDS  NC_011728  27386  27817  432  YaiI/YqxD family protein  YP_002374563  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0030  CDS  NC_011728  27807  28442  636  signal peptidase I  YP_002374564  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0031  CDS  NC_011728  28444  29424  981  signal peptidase I  YP_002374565  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0032  CDS  NC_011728  29495  30967  1473  hypothetical protein  YP_002374566  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0033  CDS  NC_011728  30979  31431  453  SsrA-binding protein  YP_002374567  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0034  CDS  NC_011728  31502  32041  540  outer membrane protein P13  YP_002374568  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0035  CDS  NC_011728  32109  33989  1881  DNA topoisomerase IV subunit A  YP_002374569  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0036  CDS  NC_011728  33989  35788  1800  DNA topoisomerase IV subunit B  YP_002374570  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0037  CDS  NC_011728  35809  36561  753  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase (1-agpacyltransferase)  YP_002374571  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0038  CDS  NC_011728  36558  38075  1518  hypothetical protein  YP_002374572  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0039  CDS  NC_011728  38088  39590  1503  hypothetical protein  YP_002374573  normal  0.7297  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0040  CDS  NC_011728  39778  40629  852  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  YP_002374574  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0041  CDS  NC_011728  40713  41384  672  phosphate transport system regulatory protein PhoU  YP_002374575  normal  0.660859  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0042  CDS  NC_011728  41395  42435  1041  hypothetical protein  YP_002374576  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0043  CDS  NC_011728  42432  42833  402  hypothetical protein  YP_002374577  normal  0.757288  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0044  CDS  NC_011728  42859  45306  2448  P115 protein  YP_002374578  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0045  CDS  NC_011728  45398  45943  546  ribonuclease HII  YP_002374579  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0046  CDS  NC_011728  45963  46331  369  hypothetical protein  YP_002374580  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0047  tRNA  NC_011728  46482  46556  75  tRNA-Gly    normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0050  tmRNA  NC_011728  46640  47001  362      normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0051  CDS  NC_011728  47119  47793  675  transporter  YP_002374581  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0052  CDS  NC_011728  47857  48558  702  hypothetical protein  YP_002374582  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0053  CDS  NC_011728  48555  49211  657  tRNA/rRNA methyltransferase  YP_002374583  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0054  CDS  NC_011728  49293  49964  672  uracil-DNA glycosylase  YP_002374584  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0055  CDS  NC_011728  50064  50426  363  preprotein translocase subunit SecG  YP_002374585  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0056  CDS  NC_011728  50442  51203  762  triosephosphate isomerase  YP_002374586  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0057  CDS  NC_011728  51205  52386  1182  phosphoglycerate kinase  YP_002374587  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0058  CDS  NC_011728  52406  53413  1008  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  YP_002374588  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0059  CDS  NC_011728  53486  55456  1971  tetratricopeptide repeat domain protein  YP_002374589  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0060  CDS  NC_011728  55453  56232  780  CBS domain pair protein  YP_002374590  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0061  CDS  NC_011728  56233  56700  468  putative metalloprotease  YP_002374591  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0062  CDS  NC_011728  56784  57137  354  thioredoxin  YP_002374592  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0063  CDS  NC_011728  57211  57927  717  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  YP_002374593  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0064  CDS  NC_011728  57981  58934  954  pasta domain protein  YP_002374594  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0065  CDS  NC_011728  59052  59990  939  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_002374595  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0066    NC_011728  59987  60484  498      normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0067  CDS  NC_011728  60519  61208  690  hypothetical protein  YP_002374596  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0068  CDS  NC_011728  61205  62983  1779  putative peptidase  YP_002374597  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0069  CDS  NC_011728  63098  63979  882  haloacid dehalogenase-like hydrolase  YP_002374598  normal  0.707164  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0070  CDS  NC_011728  63989  65227  1239  aminopeptidase II  YP_002374599  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0071  CDS  NC_011728  65242  65703  462  hypothetical protein  YP_002374600  normal  0.447048  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0072  CDS  NC_011728  65719  67191  1473  hypothetical protein  YP_002374601  normal  0.411299  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0073  CDS  NC_011728  67199  69520  2322  hypothetical protein  YP_002374602  normal  0.0161028  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0074  CDS  NC_011728  69517  70077  561  hypothetical protein  YP_002374603  decreased coverage  0.000683844  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0075  CDS  NC_011728  70322  71170  849  peptide chain release factor 2  YP_002374604  hitchhiker  0.00578068  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0076  CDS  NC_011728  71152  72561  1410  hypothetical protein  YP_002374605  decreased coverage  0.00615233  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0077  CDS  NC_011728  72598  73443  846  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_002374606  hitchhiker  0.00144491  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0078  CDS  NC_011728  73440  74468  1029  hypothetical protein  YP_002374607  normal  0.0156526  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0079  CDS  NC_011728  74469  75722  1254  lipoprotein releasing factor  YP_002374608  normal  0.0109807  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0080  CDS  NC_011728  75724  76404  681  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_002374609  decreased coverage  0.0066194  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0081  CDS  NC_011728  76401  77651  1251  efflux ABC transporter, permease protein  YP_002374610  normal  0.108612  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0082  CDS  NC_011728  77661  78959  1299  hypothetical protein  YP_002374611  normal  0.105487  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0083  CDS  NC_011728  78952  79272  321  hypothetical protein  YP_002374612  normal  0.215487  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0084  CDS  NC_011728  79454  80722  1269  aminotransferase, class V superfamily protein  YP_002374613  normal  0.153468  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0085  CDS  NC_011728  80931  81356  426  hypothetical protein  YP_002374614  normal  0.0515914  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0086  CDS  NC_011728  81353  82888  1536  putative Mg chelatase homolog  YP_002374615  normal  0.428879  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0087  CDS  NC_011728  82918  83868  951  L-lactate dehydrogenase  YP_002374616  normal  0.839635  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0088  CDS  NC_011728  83989  85668  1680  GTP-binding protein LepA  YP_002374617  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0089  CDS  NC_011728  85828  86802  975  hypothetical protein  YP_002374618  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0090  CDS  NC_011728  86874  87308  435  V-type ATP synthase subunit K  YP_002374619  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0091    NC_011728  87325  89151  1827      normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0092  CDS  NC_011728  89148  89756  609  V-type ATP synthase subunit D  YP_002374620  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0093  CDS  NC_011728  89759  91063  1305  V-type ATP synthase subunit B  YP_002374621  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0094  CDS  NC_011728  91085  92812  1728  V-type ATP synthase subunit A  YP_002374622  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0095  CDS  NC_011728  92826  93371  546  hypothetical protein  YP_002374623  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0096  CDS  NC_011728  93381  93980  600  V-type ATP synthase subunit E  YP_002374624  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0097  CDS  NC_011728  94167  94553  387  hypothetical protein  YP_002374625  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0098  CDS  NC_011728  94559  96901  2343  MutS2 protein  YP_002374626  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0099  CDS  NC_011728  96891  97814  924  ribosome small subunit-dependent GTPase A  YP_002374627  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0100  CDS  NC_011728  97811  98728  918  glutamate racemase  YP_002374628  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0101  CDS  NC_011728  98764  100152  1389  asparaginyl-tRNA synthetase  YP_002374629  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
BbuZS7_0102  CDS  NC_011728  100175  100696  522  hypothetical protein  YP_002374630  normal  n/a    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>