120 genes were found for organism Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
ECH74115_B0001  CDS  NC_011350  78551  81247  +  2697  hypothetical protein  YP_002268496  normal  0.362485  normal  0.442936  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0002  CDS  NC_011350  81334  82209  +  876  general secretion pathway protein C  YP_002268497  normal  0.856958  normal  0.237385  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0003  CDS  NC_011350  82210  84177  +  1968  general secretion pathway protein D  YP_002268498  normal  1  normal  0.0438473  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0004  CDS  NC_011350  84177  85682  +  1506  general secretory pathway protein E  YP_002268499  normal  1  normal  0.0631782  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0005  CDS  NC_011350  85684  86907  +  1224  general secretion pathway protein F  YP_002268500  normal  1  normal  0.138499  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0006  CDS  NC_011350  86938  87372  +  435  general secretion pathway protein G  YP_002268501  normal  1  normal  0.0815216  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0007  CDS  NC_011350  87369  87923  +  555  general secretion pathway protein H  YP_002268502  normal  1  normal  0.183951  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0008  CDS  NC_011350  87920  88285  +  366  general secretion pathway protein I  YP_002268503  normal  1  normal  0.172677  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0009  CDS  NC_011350  88282  88881  +  600  general secretion pathway protein J  YP_002268504  normal  1  normal  0.264866  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0010  CDS  NC_011350  88878  89855  +  978  general secretion pathway protein K  YP_002268505  normal  1  normal  0.199585  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0011  CDS  NC_011350  89927  91066  +  1140  general secretion pathway protein L  YP_002268506  normal  1  normal  0.535604  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0012  CDS  NC_011350  91053  91565  +  513  EtpM  YP_002268507  normal  1  normal  0.804249  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0013  CDS  NC_011350  91632  92456  +  825  Peptidase A24 N- domain protein  YP_002268508  normal  1  normal  0.846368  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0014  CDS  NC_011350  92551  92949  +  399  EptO  YP_002268509  normal  1  normal  0.790586  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0015  CDS  NC_011350  93128  93433  +  306  IS911, transposase orfA  YP_002268510  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0016    NC_011350  93460  94299  +  840      normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0017  CDS  NC_011350  196  711  +  516  hemolysin-activating lysine-acyltransferase HlyC  YP_002268403  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0018  CDS  NC_011350  713  3709  +  2997  RTX C- domain protein  YP_002268404  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0019  CDS  NC_011350  3759  5879  +  2121  type I secretion system ATPase family protein  YP_002268405  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0020  CDS  NC_011350  5883  7322  +  1440  leukotoxin secretion protein D  YP_002268406  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0021    NC_011350  7389  7583  +  195      normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0022    NC_011350  7625  7897  +  273      normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0023  CDS  NC_011350  7898  8095  -  198  hypothetical protein  YP_002268407  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0024  CDS  NC_011350  8417  9157  +  741  site-specific recombinase  YP_002268408  normal  0.974565  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0025  CDS  NC_011350  9247  9366  +  120  hypothetical protein  YP_002268409  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0026  CDS  NC_011350  9442  10419  -  978  initiator RepB protein  YP_002268410  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0027  CDS  NC_011350  10412  10582  -  171  hypothetical protein  YP_002268411  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0028  CDS  NC_011350  10827  11027  -  201  w0044  YP_002268413  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0029  CDS  NC_011350  10719  10832  +  114  hypothetical protein  YP_002268412  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0030  CDS  NC_011350  11024  11644  -  621  hypothetical protein  YP_002268414  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0031  CDS  NC_011350  11641  12099  -  459  hypothetical protein  YP_002268415  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0032  CDS  NC_011350  12112  12606  +  495  w0046  YP_002268416  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0033    NC_011350  12955  13089  -  135      normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0034  CDS  NC_011350  12783  13001  +  219  plasmid maintenance protein CcdA  YP_002268417  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0035  CDS  NC_011350  13055  13942  -  888  IS629, transposase orfB  YP_002268418  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0036  CDS  NC_011350  13942  14268  -  327  IS629, transposase orfA  YP_002268419  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0037  CDS  NC_011350  14367  14621  +  255  plasmid maintenance protein CcdB  YP_002268420  normal  0.684176  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0038  CDS  NC_011350  14622  15428  +  807  resolvase  YP_002268421  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0039  CDS  NC_011350  15440  15562  +  123  hypothetical protein  YP_002268422  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0040  CDS  NC_011350  15622  15741  +  120  hypothetical protein  YP_002268423  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0041  CDS  NC_011350  16151  17038  -  888  IS629, transposase orfB  YP_002268424  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0042  CDS  NC_011350  17038  17364  -  327  IS629, transposase orfA  YP_002268425  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0043    NC_011350  17440  18195  +  756      normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0044  CDS  NC_011350  18675  18827  -  153  hypothetical protein  YP_002268426  normal  0.533068  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0045  CDS  NC_011350  18792  19949  +  1158  plasmid-partitioning protein SopA  YP_002268427  normal  0.257222  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0046  CDS  NC_011350  19949  20920  +  972  plasmid-partitioning protein  YP_002268428  normal  0.047127  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0047  CDS  NC_011350  22468  22689  -  222  hypothetical protein  YP_002268430  hitchhiker  0.00157201  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0048  CDS  NC_011350  21615  22517  +  903  hypothetical protein  YP_002268429  hitchhiker  0.000955656  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0049  CDS  NC_011350  22670  22795  -  126  hypothetical protein  YP_002268431  hitchhiker  0.00125127  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0050  CDS  NC_011350  22903  23586  +  684  putative methylase  YP_002268432  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0051  CDS  NC_011350  23587  23808  +  222  hypothetical protein  YP_002268433  decreased coverage  0.000207536  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0052  CDS  NC_011350  23822  24256  +  435  hypothetical protein  YP_002268434  hitchhiker  0.000878255  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0053  CDS  NC_011350  24302  25078  +  777  hypothetical protein  YP_002268435  decreased coverage  0.000741037  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0054  CDS  NC_011350  25208  25501  -  294  hypothetical protein  YP_002268436  hitchhiker  0.000807267  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0055  CDS  NC_011350  25496  25921  +  426  antirestriction protein  YP_002268437  hitchhiker  0.000895421  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0056  CDS  NC_011350  25968  26390  +  423  hypothetical protein  YP_002268438  hitchhiker  0.000369581  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0057    NC_011350  26548  27159  -  612      decreased coverage  0.000674339  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0058  CDS  NC_011350  26387  26578  +  192  hypothetical protein  YP_002268439  hitchhiker  0.000746296  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0059  CDS  NC_011350  27212  27340  +  129  hypothetical protein  YP_002268440  hitchhiker  0.000736303  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0060  CDS  NC_011350  27403  27552  -  150  hypothetical protein  YP_002268441  hitchhiker  0.000756281  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0061  CDS  NC_011350  27574  27804  +  231  hypothetical protein  YP_002268442  hitchhiker  0.000999675  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0062  CDS  NC_011350  27856  29217  +  1362  hypothetical protein  YP_002268443  hitchhiker  0.00411387  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0063  CDS  NC_011350  29264  29827  +  564  hypothetical protein  YP_002268444  normal  0.387558  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0064    NC_011350  29913  30380  -  468      normal  0.830805  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0065  CDS  NC_011350  30495  30656  +  162  hypothetical protein  YP_002268445  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0066  CDS  NC_011350  30682  31134  +  453  single-stranded DNA-binding protein  YP_002268446  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0067  CDS  NC_011350  31191  31424  +  234  hypothetical protein  YP_002268447  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0068  CDS  NC_011350  31490  33448  +  1959  plasmid partition protein B  YP_002268448  normal  1  normal  0.878087  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0069  CDS  NC_011350  33503  33937  +  435  plasmid SOS inhibition protein B  YP_002268449  normal  1  normal  0.629302  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0070  CDS  NC_011350  33934  34695  +  762  plasmid SOS inhibition protein A  YP_002268450  normal  1  normal  0.642426  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0071  CDS  NC_011350  34927  35085  +  159  small toxic polypeptide  YP_002268451  normal  1  normal  0.722776  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0072  CDS  NC_011350  35267  37240  +  1974  hypothetical protein  YP_002268452  normal  1  normal  0.385572  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0073    NC_011350  37308  37739  +  432      normal  1  normal  0.50858  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0074    NC_011350  38313  38711  -  399      normal  1  normal  0.376988  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0075  CDS  NC_011350  38854  39264  +  411  transposase  YP_002268453  normal  1  normal  0.36944  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0076  CDS  NC_011350  39533  49042  +  9510  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif family protein  YP_002268454  normal  0.933174  normal  0.8816  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0077  CDS  NC_011350  49333  49836  -  504  putative transposase family protein  YP_002268455  normal  0.302219  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0078    NC_011350  49798  49929  +  132      normal  0.202825  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0079  CDS  NC_011350  49983  51281  +  1299  protein TraI  YP_002268456  normal  0.342651  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0080  CDS  NC_011350  51301  52047  +  747  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  YP_002268457  normal  0.391686  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0081  CDS  NC_011350  52106  52966  +  861  hydrolase, alpha/beta fold family  YP_002268458  normal  0.221816  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0082  CDS  NC_011350  52994  53629  +  636  conjugal transfer fertility inhibition protein FinO  YP_002268459  normal  0.364802  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0083  CDS  NC_011350  53762  53974  +  213  hypothetical protein  YP_002268460  normal  0.219963  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0084  CDS  NC_011350  54219  54680  +  462  nuclease homolog  YP_002268461  normal  0.381949  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0085  CDS  NC_011350  54726  54935  +  210  hypothetical protein  YP_002268462  normal  0.143108  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0086  CDS  NC_011350  54973  55311  +  339  w0003  YP_002268463  normal  0.170261  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0087  CDS  NC_011350  55551  55805  +  255  replication protein  YP_002268464  normal  0.060246  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0088  ncRNA  NC_011350  55935  56023  -  89  CopA-like RNA    normal  0.0824959  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0089  CDS  NC_011350  56108  56965  +  858  replication protein  YP_002268465  normal  0.0314206  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0090  CDS  NC_011350  57040  57159  -  120  hypothetical protein  YP_002268466  normal  0.0105668  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0091  CDS  NC_011350  57282  57434  -  153  hypothetical protein  YP_002268467  hitchhiker  0.00540572  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0092  CDS  NC_011350  57878  58162  +  285  CopG family protein  YP_002268468  normal  0.0262945  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0093  CDS  NC_011350  58162  58437  +  276  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  YP_002268469  hitchhiker  0.00661999  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0094  CDS  NC_011350  58532  58738  +  207  hypothetical protein  YP_002268470  hitchhiker  0.00658264  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0095  CDS  NC_011350  58823  59044  -  222  hypothetical protein  YP_002268471  normal  0.0134415  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0096  CDS  NC_011350  59097  59831  -  735  ISSd1, transposase OrfB  YP_002268472  hitchhiker  0.00302265  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0097  CDS  NC_011350  59615  60124  -  510  transposase  YP_002268473  normal  0.0413363  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0098  CDS  NC_011350  60079  60264  -  186  IS91, Orf2  YP_002268474  normal  0.0453731  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0099  CDS  NC_011350  60441  62651  +  2211  catalase/peroxidase HPI  YP_002268475  normal  0.311773  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_B0100  CDS  NC_011350  62695  63084  +  390  cytochrome b562 family protein  YP_002268476  normal  0.277936  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>