6066 genes were found for organism Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 61    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
ECH74115_0001  CDS  NC_011353  133  351  219  hypothetical protein  YP_002268609  normal  0.965844  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0003  CDS  NC_011353  360  2816  2457  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  YP_002268610  normal  0.726282  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0004  CDS  NC_011353  2818  3750  933  homoserine kinase  YP_002268611  normal  0.528078  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0005  CDS  NC_011353  3751  5037  1287  threonine synthase  YP_002268612  normal  0.674616  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0006  CDS  NC_011353  5251  5547  297  hypothetical protein  YP_002268613  normal  0.0736332  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0007  CDS  NC_011353  5700  6476  777  hypothetical protein  YP_002268614  normal  0.132956  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0008  CDS  NC_011353  6546  7976  1431  amino acid carrier protein  YP_002268615  normal  0.248678  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0009  CDS  NC_011353  8192  9208  1017  transaldolase B  YP_002268616  normal  0.703316  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0010  CDS  NC_011353  9323  9910  588  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_002268617  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0011  CDS  NC_011353  9945  10511  567  hypothetical protein  YP_002268618  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0012  CDS  NC_011353  10660  11373  714  hypothetical protein  YP_002268619  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0013  CDS  NC_011353  11399  11803  405  hypothetical protein  YP_002268620  normal  0.813164  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0014  CDS  NC_011353  12180  14096  1917  molecular chaperone DnaK  YP_002268621  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0015  CDS  NC_011353  14185  15315  1131  chaperone protein DnaJ  YP_002268622  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0016  CDS  NC_011353  15419  15571  153  putative Hok/gef family protein  YP_002268623  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0017  CDS  NC_011353  16157  17323  1167  pH-dependent sodium/proton antiporter  YP_002268624  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0018  CDS  NC_011353  17383  18288  906  transcriptional activator NhaR  YP_002268625  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0019  CDS  NC_011353  18326  18853  528  hypothetical protein  YP_002268626  normal  0.435429  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0020    NC_011353  18960  19169  210      normal  0.232051  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0021    NC_011353  19299  19673  375      normal  0.196976  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0022    NC_011353  19848  21749  1902      normal  0.210619  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0023  CDS  NC_011353  21762  22445  684  pili assembly chaperone  YP_002268627  hitchhiker  0.000753719  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0024  CDS  NC_011353  22495  23028  534  putative fimbrial protein  YP_002268628  hitchhiker  0.000141293  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0025  CDS  NC_011353  23330  24751  1422  hypothetical protein  YP_002268629  hitchhiker  7.72571e-07  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0026  CDS  NC_011353  25221  25484  264  30S ribosomal protein S20  YP_002268630  unclonable  1.3085e-09  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0027  CDS  NC_011353  25819  26760  942  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  YP_002268631  hitchhiker  2.89378e-06  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0028  CDS  NC_011353  26803  29619  2817  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_002268632  normal  0.0184357  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0029  CDS  NC_011353  29619  30113  495  lipoprotein signal peptidase  YP_002268633  normal  0.0223845  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0030  CDS  NC_011353  30201  30650  450  FKBP-type 16 kDa peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_002268634  normal  0.301777  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0031  CDS  NC_011353  30652  31602  951  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  YP_002268635  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0032  CDS  NC_011353  31668  32582  915  ribonucleoside hydrolase RihC  YP_002268636  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0033  CDS  NC_011353  32749  33570  822  dihydrodipicolinate reductase  YP_002268637  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0034  CDS  NC_011353  33849  33986  138  hypothetical protein  YP_002268638  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0035  CDS  NC_011353  34026  35174  1149  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_002268639  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0036  CDS  NC_011353  35192  38413  3222  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_002268640  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0037  CDS  NC_011353  38421  38639  219  hypothetical protein  YP_002268641  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0038  CDS  NC_011353  38674  39069  396  DNA-binding transcriptional activator CaiF  YP_002268642  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0039  CDS  NC_011353  39188  39778  591  carnitine operon protein CaiE  YP_002268643  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0040  CDS  NC_011353  39784  40677  894  carnitinyl-CoA dehydratase  YP_002268644  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0041  CDS  NC_011353  40678  42231  1554  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  YP_002268645  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0042  CDS  NC_011353  42305  43522  1218  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  YP_002268646  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0043  CDS  NC_011353  43651  44793  1143  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  YP_002268647  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0044  CDS  NC_011353  44824  46338  1515  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  YP_002268648  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0045  CDS  NC_011353  46749  47582  834  putative electron transfer flavoprotein FixA  YP_002268649  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0046  CDS  NC_011353  47597  48538  942  putative electron transfer flavoprotein FixB  YP_002268650  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0047  CDS  NC_011353  48589  49875  1287  putative oxidoreductase FixC  YP_002268651  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0048  CDS  NC_011353  49872  50159  288  ferredoxin homolog FixX  YP_002268652  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0049  CDS  NC_011353  50217  51548  1332  major facilitator family transporter  YP_002268653  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0050  CDS  NC_011353  51656  52186  531  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  YP_002268654  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0051  CDS  NC_011353  52179  54041  1863  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  YP_002268655  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0052  CDS  NC_011353  54122  54712  591  dihydrofolate reductase  YP_002268656  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0053  CDS  NC_011353  54798  55031  234  hypothetical protein  YP_002268657  normal  0.563576  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0054  CDS  NC_011353  55345  56193  849  diadenosine tetraphosphatase  YP_002268659  normal  0.257316  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0055  CDS  NC_011353  55034  55348  315  CcdB protein  YP_002268658  normal  0.619921  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0056  CDS  NC_011353  56200  56577  378  ApaG  YP_002268660  normal  0.0915002  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0057  CDS  NC_011353  56580  57401  822  dimethyladenosine transferase  YP_002268661  normal  0.150906  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0058  CDS  NC_011353  57398  58387  990  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_002268662  normal  0.266884  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0059  CDS  NC_011353  58387  59673  1287  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  YP_002268663  normal  0.0538241  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0060  CDS  NC_011353  59726  62047  2322  organic solvent tolerance protein  YP_002268664  hitchhiker  0.00055163  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0061  CDS  NC_011353  62335  63150  816  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_002268665  decreased coverage  1.28159e-07  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0062    NC_011353  63445  64182  738      hitchhiker  0.00129884  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0063  CDS  NC_011353  64600  65259  660  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  YP_002268666  normal  0.0156615  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0064  CDS  NC_011353  65271  68030  2760  ATP-dependent helicase HepA  YP_002268667  normal  0.694047  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0065  CDS  NC_011353  68341  70692  2352  DNA polymerase II  YP_002268668  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0066  CDS  NC_011353  70767  71462  696  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  YP_002268669  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0067  CDS  NC_011353  71662  73164  1503  L-arabinose isomerase  YP_002268670  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0068  CDS  NC_011353  73175  74875  1701  ribulokinase  YP_002268671  normal  0.876967  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0069  CDS  NC_011353  75163  76092  930  DNA-binding transcriptional regulator AraC  YP_002268672  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0070  CDS  NC_011353  76178  76942  765  hypothetical protein  YP_002268673  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0071  CDS  NC_011353  77029  77727  699  thiamine transporter ATP-binding subunit  YP_002268674  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0072  CDS  NC_011353  77711  79321  1611  thiamine transporter membrane protein  YP_002268675  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0073  CDS  NC_011353  79297  80280  984  thiamine transporter substrate binding subunit  YP_002268676  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0075  CDS  NC_011353  80748  81221  474  hypothetical protein  YP_002268677  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0076  CDS  NC_011353  81450  83108  1659  transcriptional regulator SgrR  YP_002268678  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0077  ncRNA  NC_011353  83176  83401  226  SgrS RNA    normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0078  CDS  NC_011353  83436  84041  606  isopropylmalate isomerase small subunit  YP_002268679  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0079  CDS  NC_011353  84052  85452  1401  isopropylmalate isomerase large subunit  YP_002268680  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0080  CDS  NC_011353  85455  86546  1092  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_002268681  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0081  CDS  NC_011353  86546  88117  1572  2-isopropylmalate synthase  YP_002268682  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0083  CDS  NC_011353  88755  88877  123  hypothetical protein  YP_002268683  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0084  CDS  NC_011353  88954  89898  945  leucine transcriptional activator  YP_002268684  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0085  CDS  NC_011353  89934  90056  123  hypothetical protein  YP_002268685  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0086  CDS  NC_011353  90216  91940  1725  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  YP_002268686  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0087  CDS  NC_011353  91913  92434  522  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  YP_002268687  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0088  CDS  NC_011353  92614  93618  1005  DNA-binding transcriptional regulator FruR  YP_002268688  normal  normal  0.936017  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0089  CDS  NC_011353  94220  94678  459  cell division protein MraZ  YP_002268689  normal  normal  0.818798  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0090  CDS  NC_011353  94680  95621  942  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_002268690  normal  normal  0.929573  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0091  CDS  NC_011353  95618  95983  366  cell division protein FtsL  YP_002268691  normal  normal  0.803545  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0092  CDS  NC_011353  95999  97765  1767  peptidoglycan synthetase FtsI  YP_002268692  normal  normal  0.948544  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0093  CDS  NC_011353  97752  99239  1488  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  YP_002268693  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0094  CDS  NC_011353  99236  100594  1359  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  YP_002268694  normal  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0095  CDS  NC_011353  100588  101670  1083  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  YP_002268695  normal  0.655036  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0096  CDS  NC_011353  101673  102989  1317  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  YP_002268696  normal  0.248678  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0097  CDS  NC_011353  102989  104233  1245  cell division protein FtsW  YP_002268697  normal  0.301255  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0098  CDS  NC_011353  104230  105297  1068  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  YP_002268698  normal  0.371224  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0099  CDS  NC_011353  105351  106826  1476  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_002268699  normal  0.721089  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0100  CDS  NC_011353  106819  107739  921  D-alanine--D-alanine ligase  YP_002268700  normal  0.0814155  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0101  CDS  NC_011353  107741  108571  831  cell division protein FtsQ  YP_002268701  hitchhiker  0.00454958  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0102  CDS  NC_011353  108568  109830  1263  cell division protein FtsA  YP_002268702  hitchhiker  3.85207e-07  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_0103  CDS  NC_011353  109891  111042  1152  cell division protein FtsZ  YP_002268703  hitchhiker  3.59609e-06  normal  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 61    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>