4227 genes were found for organism Geobacter sp. M21



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
GM21_0001  CDS  NC_012918  119  1501  1383  chromosomal replication initiation protein  YP_003019846  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0002  CDS  NC_012918  1716  2834  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003019847  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0003  CDS  NC_012918  2949  4043  1095  DNA replication and repair protein RecF  YP_003019848  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0004  CDS  NC_012918  4052  6442  2391  DNA gyrase, B subunit  YP_003019849  n/a    normal  0.783567  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0005  CDS  NC_012918  6798  9308  2511  DNA gyrase, A subunit  YP_003019850  n/a    normal  0.301958  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0006  CDS  NC_012918  9425  10942  1518  hypothetical protein  YP_003019851  n/a    normal  0.572867  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0007  CDS  NC_012918  11002  12009  1008  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_003019852  n/a    normal  0.792922  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0008  CDS  NC_012918  12181  14448  2268  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003019853  n/a    normal  0.865749  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0009  CDS  NC_012918  14435  15964  1530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_003019854  n/a    normal  0.923259  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0010  CDS  NC_012918  16171  17262  1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003019855  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0011  CDS  NC_012918  17482  19629  2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_003019856  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0012  CDS  NC_012918  19721  20647  927  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  YP_003019857  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0013  CDS  NC_012918  20758  21513  756  ABC-2 type transporter  YP_003019858  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0014  CDS  NC_012918  21775  22851  1077  Radical SAM domain protein  YP_003019859  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0015  CDS  NC_012918  22944  23963  1020  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_003019860  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0016  CDS  NC_012918  24077  25030  954  magnesium and cobalt transport protein CorA  YP_003019861  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0017  CDS  NC_012918  25288  26160  873  histidine kinase  YP_003019862  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0018  CDS  NC_012918  26242  26523  282  Excinuclease ABC C subunit domain protein  YP_003019863  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0019  CDS  NC_012918  26549  27586  1038  Cytochrome-c peroxidase  YP_003019864  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0020  CDS  NC_012918  27918  29327  1410  putative oxidoreductase  YP_003019865  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0021  CDS  NC_012918  29324  30172  849  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  YP_003019866  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0022  CDS  NC_012918  30510  31385  876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_003019867  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0023  CDS  NC_012918  31709  32230  522  hypothetical protein  YP_003019868  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0024  CDS  NC_012918  32230  32421  192  hypothetical protein  YP_003019869  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0025  CDS  NC_012918  32492  33334  843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  YP_003019870  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0026  CDS  NC_012918  33455  34465  1011  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003019871  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0027  CDS  NC_012918  34634  35578  945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003019872  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0028  CDS  NC_012918  35696  36277  582  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  YP_003019873  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0029  CDS  NC_012918  36584  38581  1998  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003019874  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0030  CDS  NC_012918  38616  39569  954  CoB--CoM heterodisulfide reductase  YP_003019875  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0031  CDS  NC_012918  39566  40150  585  heterodisulfide reductase subunit  YP_003019876  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0032  CDS  NC_012918  40711  42420  1710  ABC transporter related  YP_003019877  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0033  CDS  NC_012918  42772  44580  1809  ABC transporter related  YP_003019878  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0034  CDS  NC_012918  44778  46688  1911  selenocysteine-specific translation elongation factor  YP_003019879  n/a    normal  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0035  CDS  NC_012918  46821  48770  1950  hypothetical protein  YP_003019880  n/a    normal  0.638764  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0036  CDS  NC_012918  48859  49677  819  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  YP_003019881  n/a    normal  0.0967142  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0037  CDS  NC_012918  49820  49999  180  hypothetical protein  YP_003019882  n/a    normal  0.0524919  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0038  CDS  NC_012918  49999  50952  954  ferrochelatase  YP_003019883  n/a    normal  0.0641223  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0039  CDS  NC_012918  51174  52721  1548  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003019884  n/a    normal  0.0381098  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0040  CDS  NC_012918  52913  53101  189  hypothetical protein  YP_003019885  n/a    hitchhiker  0.00609547  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0041  CDS  NC_012918  53368  54198  831  hypothetical protein  YP_003019886  n/a    hitchhiker  0.00194765  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0042  CDS  NC_012918  54227  55855  1629  cytochrome c oxidase, subunit I  YP_003019887  n/a    hitchhiker  0.00140919  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0043  CDS  NC_012918  55852  56451  600  cytochrome c oxidase subunit III  YP_003019888  n/a    hitchhiker  0.000712999  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0044  CDS  NC_012918  56571  56858  288  caa(3)-type oxidase, subunit IV  YP_003019889  n/a    hitchhiker  0.000561945  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0045  CDS  NC_012918  56869  57771  903  cytochrome c oxidase, subunit II  YP_003019890  n/a    hitchhiker  0.00101143  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0046  CDS  NC_012918  57768  58586  819  UbiA prenyltransferase  YP_003019891  n/a    hitchhiker  0.000129053  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0047  CDS  NC_012918  58603  58797  195  hypothetical protein  YP_003019892  n/a    hitchhiker  7.31108e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0048  CDS  NC_012918  59118  60308  1191  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  YP_003019893  n/a    hitchhiker  1.59697e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0049  CDS  NC_012918  60331  61374  1044  L-threonine 3-dehydrogenase  YP_003019894  n/a    hitchhiker  1.60501e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0050  CDS  NC_012918  61530  61709  180  hypothetical protein  YP_003019895  n/a    hitchhiker  2.22887e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0051  CDS  NC_012918  62136  63137  1002  OmpA/MotB domain protein  YP_003019896  n/a    hitchhiker  5.73223e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0052  CDS  NC_012918  63224  64150  927  peptidase M28  YP_003019897  n/a    hitchhiker  2.95021e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0053  CDS  NC_012918  64464  66569  2106  protein of unknown function DUF323  YP_003019898  n/a    hitchhiker  4.56443e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0054  CDS  NC_012918  66566  67744  1179  aminotransferase class I and II  YP_003019899  n/a    hitchhiker  1.77087e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0055  CDS  NC_012918  67764  68408  645  hypothetical protein  YP_003019900  n/a    hitchhiker  9.44015e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0056  CDS  NC_012918  68614  69240  627  protein of unknown function DUF1555  YP_003019901  n/a    hitchhiker  9.6981e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0057  CDS  NC_012918  69362  71128  1767  histidine kinase  YP_003019902  n/a    hitchhiker  1.85994e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0058  CDS  NC_012918  71658  72338  681  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  YP_003019903  n/a    hitchhiker  2.20235e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0059  CDS  NC_012918  72660  74855  2196  UvrD/REP helicase  YP_003019904  n/a    hitchhiker  1.5097e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0060  CDS  NC_012918  74912  75649  738  hypothetical protein  YP_003019905  n/a    hitchhiker  1.22132e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0061  CDS  NC_012918  75859  76905  1047  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_003019906  n/a    hitchhiker  2.14054e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0062  CDS  NC_012918  76930  77916  987  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003019907  n/a    hitchhiker  1.83207e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0063  CDS  NC_012918  78200  79273  1074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  YP_003019908  n/a    hitchhiker  2.56416e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0064  CDS  NC_012918  79292  81703  2412  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_003019909  n/a    hitchhiker  3.59154e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0065  CDS  NC_012918  81700  82704  1005  thiamine biosynthesis protein  YP_003019910  n/a    hitchhiker  1.96842e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0066  CDS  NC_012918  83210  84868  1659  General secretory system II protein E domain protein  YP_003019911  n/a    hitchhiker  7.36428e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0067  CDS  NC_012918  84881  85951  1071  twitching motility protein  YP_003019912  n/a    hitchhiker  2.78052e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0068  CDS  NC_012918  85955  87124  1170  hypothetical protein  YP_003019913  n/a    hitchhiker  3.19832e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0069  CDS  NC_012918  87315  88154  840  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_003019914  n/a    hitchhiker  9.55127e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0070  CDS  NC_012918  88586  88804  219  hypothetical protein  YP_003019915  n/a    hitchhiker  1.43942e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0071  CDS  NC_012918  88859  92758  3900  multicopper oxidase type 2  YP_003019916  n/a    hitchhiker  2.35326e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0072  CDS  NC_012918  92946  93920  975  Rhodanese domain protein  YP_003019917  n/a    hitchhiker  2.77875e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0073  CDS  NC_012918  94537  96366  1830  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_003019918  n/a    hitchhiker  1.653e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0074  CDS  NC_012918  96452  97828  1377  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  YP_003019919  n/a    hitchhiker  4.67407e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0075  CDS  NC_012918  97978  98535  558  hypothetical protein  YP_003019920  n/a    unclonable  7.95667e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0076  CDS  NC_012918  98532  100382  1851  Radical SAM domain protein  YP_003019921  n/a    unclonable  1.37421e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0077  CDS  NC_012918  100819  102669  1851  hypothetical protein  YP_003019922  n/a    unclonable  1.09082e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0078  CDS  NC_012918  102771  103808  1038  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  YP_003019923  n/a    hitchhiker  4.76224e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0079  CDS  NC_012918  104013  105290  1278  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003019924  n/a    hitchhiker  1.28688e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0080  CDS  NC_012918  105449  106474  1026  dihydrouridine synthase DuS  YP_003019925  n/a    hitchhiker  4.28082e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0081  CDS  NC_012918  106556  107047  492  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  YP_003019926  n/a    hitchhiker  5.58031e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0082  CDS  NC_012918  107204  107419  216  hypothetical protein  YP_003019927  n/a    hitchhiker  1.88298e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0083  CDS  NC_012918  107434  107913  480  hypothetical protein  YP_003019928  n/a    hitchhiker  2.06195e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0084  CDS  NC_012918  108222  108869  648  protein of unknown function DUF480  YP_003019929  n/a    hitchhiker  1.39751e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0085  CDS  NC_012918  108881  109183  303  hypothetical protein  YP_003019930  n/a    hitchhiker  7.13816e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0086  CDS  NC_012918  109196  109921  726  Protein of unknown function DUF1847  YP_003019931  n/a    hitchhiker  1.43245e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0087  CDS  NC_012918  110400  111218  819  flagellin domain protein  YP_003019932  n/a    hitchhiker  8.01522e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0088  CDS  NC_012918  111478  112032  555  2'-5' RNA ligase  YP_003019933  n/a    hitchhiker  3.85137e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0089  CDS  NC_012918  112152  113420  1269  seryl-tRNA synthetase  YP_003019934  n/a    hitchhiker  3.55791e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0090  CDS  NC_012918  113727  114206  480  hypothetical protein  YP_003019935  n/a    hitchhiker  4.04111e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0091  CDS  NC_012918  114514  114864  351  hypothetical protein  YP_003019936  n/a    hitchhiker  7.87501e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0092    NC_012918  115257  115457  201      n/a    hitchhiker  1.47983e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0093  CDS  NC_012918  115475  116041  567  hypothetical protein  YP_003019937  n/a    hitchhiker  5.64586e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0094  CDS  NC_012918  116038  118203  2166  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  YP_003019938  n/a    hitchhiker  3.75041e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0095  CDS  NC_012918  118118  120325  2208  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_003019939  n/a    hitchhiker  6.15428e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0096  CDS  NC_012918  120303  121082  780  hypothetical protein  YP_003019940  n/a    hitchhiker  8.27062e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0097  CDS  NC_012918  121169  121669  501  hypothetical protein  YP_003019941  n/a    hitchhiker  6.63376e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0098  CDS  NC_012918  121666  121950  285  hypothetical protein  YP_003019942  n/a    hitchhiker  5.52734e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0099  CDS  NC_012918  121958  122236  279  hypothetical protein  YP_003019943  n/a    hitchhiker  6.24449e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0100  CDS  NC_012918  122233  122481  249  hypothetical protein  YP_003019944  n/a    hitchhiker  0.000183318  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>