1601 genes were found for organism Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Aboo_0001  CDS  NC_013926  53  1300  1248  orc1/cdc6 family replication initiation protein  YP_003482375  normal  0.974406  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0002  CDS  NC_013926  1289  2116  828  signal peptidase I  YP_003482376  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0003  CDS  NC_013926  2204  2599  396  translation initiation factor eIF-5A  YP_003482377  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0004  CDS  NC_013926  2602  3474  873  agmatinase  YP_003482378  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0005  CDS  NC_013926  3509  4411  903  hypothetical protein  YP_003482379  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0006  CDS  NC_013926  4411  6048  1638  type II secretion system protein E  YP_003482380  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0007  CDS  NC_013926  6045  7043  999  Type II secretion system F domain protein  YP_003482381  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0008  CDS  NC_013926  7040  7912  873  Type II secretion system F domain protein  YP_003482382  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0009  CDS  NC_013926  7923  9566  1644  type II secretion system protein E  YP_003482383  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0010  CDS  NC_013926  9568  14079  4512  hypothetical protein  YP_003482384  normal  0.969118  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0011  CDS  NC_013926  17322  18362  1041  protein of unknown function Met10  YP_003482385  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0012  CDS  NC_013926  18387  19109  723  hypothetical protein  YP_003482386  normal  0.615096  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0013  CDS  NC_013926  19070  20200  1131  transglutaminase domain protein  YP_003482387  normal  0.854186  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0014  CDS  NC_013926  20197  21168  972  hypothetical protein  YP_003482388  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0015  CDS  NC_013926  21173  21379  207  hypothetical protein  YP_003482389  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0016  CDS  NC_013926  21414  21818  405  hypothetical protein  YP_003482390  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0017  CDS  NC_013926  21865  22464  600  hypothetical protein  YP_003482391  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0018  CDS  NC_013926  22553  26254  3702  hypothetical protein  YP_003482392  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0019  CDS  NC_013926  26271  26543  273  DNA-binding protein Alba  YP_003482393  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0020  CDS  NC_013926  26625  30704  4080  Patched family protein  YP_003482394  normal  0.637086  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0021  CDS  NC_013926  30851  31888  1038  transcriptional regulator, TrmB  YP_003482395  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0022  CDS  NC_013926  31874  33016  1143  amidohydrolase  YP_003482396  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0023  CDS  NC_013926  33093  33674  582  hypothetical protein  YP_003482397  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0024  CDS  NC_013926  33725  34177  453  Ribosomal protein S19e  YP_003482398  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0025  CDS  NC_013926  34184  34519  336  DNA-binding TFAR19-related protein  YP_003482399  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0026  CDS  NC_013926  34522  34677  156  Ribosomal protein L39e  YP_003482400  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0027  CDS  NC_013926  34689  34952  264  Ribosomal protein L31e  YP_003482401  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0028  CDS  NC_013926  34949  35605  657  translation initiation factor eIF-6  YP_003482402  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0029  CDS  NC_013926  35595  36230  636  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  YP_003482403  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0030  CDS  NC_013926  36284  36817  534  methylase  YP_003482404  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0031  CDS  NC_013926  36829  37083  255  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  YP_003482405  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0032  CDS  NC_013926  37061  37642  582  hypothetical protein  YP_003482406  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0033  CDS  NC_013926  37639  38331  693  hypothetical protein  YP_003482407  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0034  CDS  NC_013926  38427  39146  720  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003482408  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0035  CDS  NC_013926  39272  39469  198  hypothetical protein  YP_003482409  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0036  CDS  NC_013926  39610  40266  657  Putitive phosphate transport regulator  YP_003482410  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0037  CDS  NC_013926  40250  41167  918  phosphate transporter  YP_003482411  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0038  CDS  NC_013926  41201  41974  774  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_003482412  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0039  CDS  NC_013926  42007  42936  930  carbamate kinase  YP_003482413  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0040  CDS  NC_013926  43079  43414  336  hypothetical protein  YP_003482414  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0041  CDS  NC_013926  43417  44352  936  deoxyhypusine synthase  YP_003482415  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0042  CDS  NC_013926  44349  45365  1017  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_003482416  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0043  CDS  NC_013926  45436  46143  708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  YP_003482417  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0044  CDS  NC_013926  46176  47321  1146  cation diffusion facilitator family transporter  YP_003482418  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0045  CDS  NC_013926  47606  47818  213  hypothetical protein  YP_003482419  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0046  CDS  NC_013926  47825  48196  372  hypothetical protein  YP_003482420  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0047  CDS  NC_013926  48198  48671  474  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  YP_003482421  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0048  CDS  NC_013926  48740  49447  708  putative circadian clock protein, KaiC  YP_003482422  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0049  CDS  NC_013926  49451  50113  663  Zinc finger TFIIB-type domain protein  YP_003482423  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0050  CDS  NC_013926  50272  50625  354  hypothetical protein  YP_003482424  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0051  CDS  NC_013926  50635  52275  1641  flagellin  YP_003482425  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0052  CDS  NC_013926  52377  53327  951  Glyoxylate reductase  YP_003482426  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0053  CDS  NC_013926  53498  53746  249  hypothetical protein  YP_003482427  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0054  CDS  NC_013926  53778  55025  1248  histidyl-tRNA synthetase  YP_003482428  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0055  CDS  NC_013926  55094  56434  1341  MATE efflux family protein  YP_003482429  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0056  CDS  NC_013926  56704  57846  1143  hypothetical protein  YP_003482430  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0057  CDS  NC_013926  57959  58210  252  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003482431  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0058  CDS  NC_013926  58207  59325  1119  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_003482432  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0059  CDS  NC_013926  59322  60158  837  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  YP_003482433  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0060  CDS  NC_013926  60155  60700  546  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  YP_003482434  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0061  CDS  NC_013926  60703  62004  1302  Glycine hydroxymethyltransferase  YP_003482435  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0062  CDS  NC_013926  62033  62542  510  intracellular protease, PfpI family  YP_003482436  normal  0.594492  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0063  CDS  NC_013926  62628  63584  957  hypothetical protein  YP_003482437  normal  0.615997  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0064  CDS  NC_013926  63642  65549  1908  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  YP_003482438  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0065  CDS  NC_013926  65546  67120  1575  Radical SAM domain protein  YP_003482439  normal  0.109928  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0066  CDS  NC_013926  67092  67589  498  hypothetical protein  YP_003482440  normal  0.165023  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0067  CDS  NC_013926  67685  68200  516  ribosomal protein L10.e  YP_003482441  normal  0.0342271  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0068  CDS  NC_013926  68197  68799  603  Protein of unknown function DUF835  YP_003482442  hitchhiker  0.00278573  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0069  CDS  NC_013926  68819  69886  1068  Fmu (Sun) domain protein  YP_003482443  hitchhiker  1.55768e-07  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0070  CDS  NC_013926  70178  70606  429  ribosomal protein S23 (S12)  YP_003482444  hitchhiker  7.07157e-11  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0071  CDS  NC_013926  70612  71175  564  ribosomal protein S7  YP_003482445  hitchhiker  2.11426e-12  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0072  CDS  NC_013926  71186  73390  2205  translation elongation factor aEF-2  YP_003482446  unclonable  1.19399e-10  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0073  CDS  NC_013926  73444  74718  1275  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  YP_003482447  hitchhiker  0.000421656  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0074  CDS  NC_013926  74742  75056  315  ribosomal protein S10  YP_003482448  hitchhiker  0.0042171  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0075  CDS  NC_013926  75053  75850  798  protein of unknown function DUF147  YP_003482449  normal  0.104264  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0076  CDS  NC_013926  75875  76486  612  Translin  YP_003482450  normal  0.355906  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0077  CDS  NC_013926  76513  76884  372  hypothetical protein  YP_003482451  normal  0.825117  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0078  CDS  NC_013926  76881  77669  789  ATP-NAD/AcoX kinase  YP_003482452  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0079  CDS  NC_013926  77666  78442  777  Inositol-phosphate phosphatase  YP_003482453  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0080  CDS  NC_013926  78489  79754  1266  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_003482454  normal  0.303597  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0081  CDS  NC_013926  79736  80482  747  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  YP_003482455  normal  0.242431  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0082  CDS  NC_013926  80479  81291  813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  YP_003482456  normal  0.063095  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0083  CDS  NC_013926  81288  82307  1020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003482457  normal  0.249908  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0084  CDS  NC_013926  82460  83890  1431  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  YP_003482458  normal  0.0715068  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0085  CDS  NC_013926  83892  84722  831  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  YP_003482459  hitchhiker  0.00250473  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0086  CDS  NC_013926  84785  85942  1158  FAD dependent oxidoreductase  YP_003482460  normal  0.024354  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0087  CDS  NC_013926  85926  86207  282  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  YP_003482461  hitchhiker  0.000296094  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0088  CDS  NC_013926  86208  86708  501  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003482462  hitchhiker  0.00129439  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0089  CDS  NC_013926  86701  88137  1437  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  YP_003482463  decreased coverage  0.000828017  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0090  CDS  NC_013926  88253  88498  246  PRC-barrel domain protein  YP_003482464  hitchhiker  0.00611417  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0091  CDS  NC_013926  88499  90172  1674  glutamyl-tRNA synthetase  YP_003482465  normal  0.114333  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0092  CDS  NC_013926  90211  91023  813  integrase family protein  YP_003482466  normal  0.554655  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0093  CDS  NC_013926  91160  92113  954  small GTP-binding protein  YP_003482467  normal  0.333043  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0094  CDS  NC_013926  92184  94388  2205  methionyl-tRNA synthetase  YP_003482468  normal  0.168493  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0095  CDS  NC_013926  94385  95035  651  PHP domain protein  YP_003482469  normal  0.411706  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0096  CDS  NC_013926  95032  95364  333  Roadblock/LC7 family protein  YP_003482470  normal  0.398004  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0097  CDS  NC_013926  95465  96469  1005  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  YP_003482471  normal  0.625473  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0098  CDS  NC_013926  96460  96978  519  Resolvase, Holliday junction-type  YP_003482472  normal  0.955403  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0099  CDS  NC_013926  97058  97567  510  CBS domain containing protein  YP_003482473  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0100  CDS  NC_013926  97568  98695  1128  TPR repeat-containing protein  YP_003482474  normal  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>