2239 genes were found for organism Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Adeg_0001  CDS  NC_013385  188  1522  1335  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003238028  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0002  CDS  NC_013385  1663  2781  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003238029  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0003  CDS  NC_013385  2800  3876  1077  DNA replication and repair protein RecF  YP_003238030  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0004  CDS  NC_013385  3898  4149  252  hypothetical protein  YP_003238031  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0005  CDS  NC_013385  4168  6078  1911  DNA gyrase, B subunit  YP_003238032  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0006  CDS  NC_013385  6101  8509  2409  DNA gyrase, A subunit  YP_003238033  normal  0.540811  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0007  CDS  NC_013385  8588  9469  882  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_003238034  normal  0.396026  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0008  CDS  NC_013385  9463  10047  585  SNO glutamine amidotransferase  YP_003238035  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0009  CDS  NC_013385  10128  11279  1152  aminotransferase class V  YP_003238036  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0010  CDS  NC_013385  11280  12863  1584  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  YP_003238037  normal  0.155189  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0011  CDS  NC_013385  12900  14183  1284  seryl-tRNA synthetase  YP_003238038  normal  0.0824317  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0012  CDS  NC_013385  14446  15597  1152  integrase family protein  YP_003238039  hitchhiker  0.000168789  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0013  CDS  NC_013385  15743  15838  96  hypothetical protein  YP_003238040  hitchhiker  3.60347e-07  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0014  CDS  NC_013385  15835  16056  222  transcriptional regulator, XRE family  YP_003238041  hitchhiker  1.27273e-08  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0015  CDS  NC_013385  16221  16880  660  hypothetical protein  YP_003238042  decreased coverage  1.17096e-08  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0016  CDS  NC_013385  16995  17105  111  hypothetical protein  YP_003238043  hitchhiker  3.96892e-05  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0017  CDS  NC_013385  17111  17266  156  hypothetical protein  YP_003238044  hitchhiker  4.3032e-05  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0018  CDS  NC_013385  18222  18314  93  hypothetical protein  YP_003238045  normal  0.0154767  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0019  CDS  NC_013385  18311  18745  435  transcriptional regulator, XRE family  YP_003238046  normal  0.0401744  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0020  CDS  NC_013385  18729  18941  213  transcriptional regulator, XRE family  YP_003238047  normal  0.118071  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0021  CDS  NC_013385  18938  19294  357  hypothetical protein  YP_003238048  normal  0.152865  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0022  CDS  NC_013385  19275  19736  462  hypothetical protein  YP_003238049  normal  0.415977  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0023  CDS  NC_013385  19720  21450  1731  hypothetical protein  YP_003238050  normal  0.640701  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0024  CDS  NC_013385  21441  22043  603  zinc finger CHC2-family protein  YP_003238051  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0025  CDS  NC_013385  22091  22282  192  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003238052  normal  0.917253  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0026  CDS  NC_013385  22814  22921  108  hypothetical protein  YP_003238053  normal  0.668986  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0027  CDS  NC_013385  23083  23715  633  CBS domain containing protein  YP_003238054  normal  0.63793  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0028  CDS  NC_013385  23732  23869  138  hypothetical protein  YP_003238055  normal  0.684532  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0029  CDS  NC_013385  23950  25308  1359  Radical SAM domain protein  YP_003238056  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0030  CDS  NC_013385  25422  26759  1338  Peptidase M23  YP_003238057  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0031  CDS  NC_013385  26831  27409  579  Tetratricopeptide repeat protein  YP_003238058  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0032  CDS  NC_013385  27615  27800  186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003238059  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0033  CDS  NC_013385  27866  28630  765  Nitrate reductase gamma subunit  YP_003238060  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0034  CDS  NC_013385  28649  30049  1401  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  YP_003238061  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0035  CDS  NC_013385  30099  30416  318  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  YP_003238062  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0036  CDS  NC_013385  30514  31896  1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_003238063  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0037  CDS  NC_013385  31901  32227  327  CutA1 divalent ion tolerance protein  YP_003238064  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0038  CDS  NC_013385  32217  32897  681  Deoxyribonuclease V  YP_003238065  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0039  CDS  NC_013385  32881  33684  804  hypothetical protein  YP_003238066  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0040  CDS  NC_013385  33714  34118  405  HEPN domain protein  YP_003238067  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0041  CDS  NC_013385  34099  34452  354  DNA polymerase beta domain protein region  YP_003238068  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0042  CDS  NC_013385  34613  35299  687  spore cortex-lytic enzyme  YP_003238069  normal  0.415977  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0043    NC_013385  35313  36649  1337      normal  0.19912  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0044  CDS  NC_013385  36941  39205  2265  copper amine oxidase domain protein  YP_003238070  hitchhiker  0.00564883  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0045  CDS  NC_013385  39324  40436  1113  outer membrane efflux protein  YP_003238071  decreased coverage  0.00077566  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0046  CDS  NC_013385  40558  41961  1404  protein of unknown function UPF0236  YP_003238072  decreased coverage  0.00191865  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0047  CDS  NC_013385  42369  42857  489  transcriptional regulator, AsnC family  YP_003238073  hitchhiker  0.00562884  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0048  CDS  NC_013385  42854  44059  1206  aminotransferase class I and II  YP_003238074  hitchhiker  0.00536151  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0049  CDS  NC_013385  44056  44484  429  hypothetical protein  YP_003238075  normal  0.016779  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0050  CDS  NC_013385  44486  46180  1695  arginyl-tRNA synthetase  YP_003238076  normal  0.302748  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0051  CDS  NC_013385  46183  47826  1644  CTP synthetase  YP_003238077  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0052  CDS  NC_013385  47808  48698  891  signal peptide peptidase SppA, 36K type  YP_003238078  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0053  CDS  NC_013385  48695  49318  624  Protein of unknown function DUF2143  YP_003238079  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0054  CDS  NC_013385  49315  49644  330  response regulator receiver protein  YP_003238080  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0055  CDS  NC_013385  49736  50407  672  hypothetical protein  YP_003238081  normal  0.546371  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0056  CDS  NC_013385  50438  51301  864  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  YP_003238082  normal  0.955798  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0057  CDS  NC_013385  51328  51984  657  transaldolase  YP_003238083  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0058  CDS  NC_013385  52081  53457  1377  transcription termination factor Rho  YP_003238084  hitchhiker  0.00215813  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0059  CDS  NC_013385  53448  54038  591  phospholipase D (PLD) family protein  YP_003238085  hitchhiker  6.14493e-05  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0060  CDS  NC_013385  54028  54336  309  hypothetical protein  YP_003238086  hitchhiker  3.004e-06  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0061  CDS  NC_013385  54487  54687  201  50S ribosomal protein L31  YP_003238087  hitchhiker  1.49068e-06  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0062  CDS  NC_013385  54699  55586  888  protein of unknown function DUF1385  YP_003238088  hitchhiker  1.47112e-07  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0063  CDS  NC_013385  55549  56616  1068  peptide chain release factor 1  YP_003238089  unclonable  3.18273e-09  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0064  CDS  NC_013385  56625  57488  864  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  YP_003238090  hitchhiker  2.92458e-07  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0065  CDS  NC_013385  57504  58712  1209  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_003238091  hitchhiker  6.34714e-05  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0066  CDS  NC_013385  58962  60647  1686  transposase, IS605 OrfB family  YP_003238092  hitchhiker  0.000182083  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0067  CDS  NC_013385  60971  61987  1017  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_003238093  hitchhiker  0.0048533  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0068  CDS  NC_013385  61993  62544  552  protein of unknown function DUF204  YP_003238094  normal  0.132326  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0069  CDS  NC_013385  62545  63009  465  protein tyrosine phosphatase  YP_003238095  normal  0.326824  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0070  CDS  NC_013385  63055  63504  450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  YP_003238096  normal  0.212167  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0071  CDS  NC_013385  63505  64758  1254  Glycine hydroxymethyltransferase  YP_003238097  normal  0.30135  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0072  CDS  NC_013385  64763  65251  489  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  YP_003238098  normal  0.508443  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0073  CDS  NC_013385  65235  65552  318  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  YP_003238099  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0074  CDS  NC_013385  65549  66754  1206  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  YP_003238100  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0075  CDS  NC_013385  66888  67124  237  hypothetical protein  YP_003238101  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0076  CDS  NC_013385  67143  67550  408  hypothetical protein  YP_003238102  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0077  CDS  NC_013385  67601  68416  816  ATP synthase F0, A subunit  YP_003238103  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0078  CDS  NC_013385  68455  68688  234  ATP synthase F0, C subunit  YP_003238104  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0079  CDS  NC_013385  68838  69326  489  ATP synthase F0, B subunit  YP_003238105  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0080  CDS  NC_013385  69320  69868  549  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_003238106  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0081  CDS  NC_013385  69886  71409  1524  ATP synthase F1, alpha subunit  YP_003238107  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0082  CDS  NC_013385  71428  72291  864  ATP synthase F1, gamma subunit  YP_003238108  normal  0.863328  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0083  CDS  NC_013385  72328  73755  1428  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_003238109  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0084  CDS  NC_013385  73780  74199  420  ATP synthase F1, epsilon subunit  YP_003238110  normal  0.78895  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0085  CDS  NC_013385  74307  75251  945  stage II sporulation protein D  YP_003238111  normal  0.622828  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0086  CDS  NC_013385  75365  75649  285  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  YP_003238112  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0087  CDS  NC_013385  75677  79348  3672  S-layer domain protein  YP_003238113  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0088  CDS  NC_013385  79331  80281  951  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_003238114  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0089  CDS  NC_013385  80241  80888  648  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003238115  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0090  CDS  NC_013385  81028  81786  759  glycosyl transferase family 2  YP_003238116  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0091  CDS  NC_013385  81776  82150  375  hypothetical protein  YP_003238117  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0092  CDS  NC_013385  82231  82485  255  hypothetical protein  YP_003238118  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0093  CDS  NC_013385  82482  82820  339  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  YP_003238119  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0094  CDS  NC_013385  82817  84019  1203  hypothetical protein  YP_003238120  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0095  CDS  NC_013385  83997  84392  396  hypothetical protein  YP_003238121  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0096  CDS  NC_013385  84542  85441  900  protoheme IX farnesyltransferase  YP_003238122  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0097  CDS  NC_013385  85555  86013  459  transcriptional regulator, MarR family  YP_003238123  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0098  CDS  NC_013385  86014  87312  1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_003238124  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0099  CDS  NC_013385  87334  87996  663  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  YP_003238125  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_0100  CDS  NC_013385  88004  89578  1575  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_003238126  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>