1855 genes were found for organism Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
MmarC7_0001  CDS  NC_009637  120  2243  2124  hypothetical protein  YP_001329225  normal  0.426286  unclonable  1.68459e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0002  CDS  NC_009637  2225  4108  1884  UvrD/REP helicase  YP_001329226  hitchhiker  0.00501949  unclonable  1.52261e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0003  CDS  NC_009637  4131  5381  1251  hypothetical protein  YP_001329227  hitchhiker  0.00559809  unclonable  1.11615e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0004  CDS  NC_009637  5395  7932  2538  hypothetical protein  YP_001329228  decreased coverage  0.00169415  unclonable  3.10884e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0005  CDS  NC_009637  8074  10704  2631  hypothetical protein  YP_001329229  normal  0.424895  unclonable  3.47223e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0006  CDS  NC_009637  10706  13543  2838  UvrD/REP helicase  YP_001329230  normal  0.416534  hitchhiker  6.7994e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0007  CDS  NC_009637  13588  15549  1962  helicase c2  YP_001329231  normal  hitchhiker  0.000554419  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0008  CDS  NC_009637  15646  16239  594  TPR repeat-containing protein  YP_001329232  normal  0.508518  hitchhiker  0.000270685  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0009  CDS  NC_009637  16254  16508  255  excinuclease ABC subunit C  YP_001329233  normal  0.430316  hitchhiker  0.000229969  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0010  CDS  NC_009637  16976  17794  819  hypothetical protein  YP_001329234  normal  0.677214  hitchhiker  0.000264091  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0011  CDS  NC_009637  17862  18431  570  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  YP_001329235  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0012  CDS  NC_009637  18477  20765  2289  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001329236  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0013  CDS  NC_009637  21094  21975  882  hypothetical protein  YP_001329237  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0014    NC_009637  22026  22364  339      normal  0.0467901  hitchhiker  0.000793126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0015  CDS  NC_009637  22468  22908  441  hypothetical protein  YP_001329238  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0016  CDS  NC_009637  22909  24207  1299  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_001329239  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0017  CDS  NC_009637  24236  27334  3099  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  YP_001329240  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0018    NC_009637  27347  29046  1700      normal  hitchhiker  0.00149798  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0019  CDS  NC_009637  29062  30567  1506  N-6 DNA methylase  YP_001329241  normal  hitchhiker  0.00151011  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0020  CDS  NC_009637  30661  31539  879  hypothetical protein  YP_001329242  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0021  CDS  NC_009637  31658  32632  975  phage integrase family protein  YP_001329243  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0022  CDS  NC_009637  32642  32902  261  hypothetical protein  YP_001329244  normal  0.058362  hitchhiker  0.000968573  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0023  CDS  NC_009637  32904  33062  159  hypothetical protein  YP_001329245  normal  0.0808626  hitchhiker  0.000872485  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0024  CDS  NC_009637  33073  33228  156  hypothetical protein  YP_001329246  normal  0.188037  hitchhiker  0.000886834  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0025  CDS  NC_009637  33563  33880  318  hypothetical protein  YP_001329247  normal  0.124141  hitchhiker  0.000926825  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0026  CDS  NC_009637  34004  34348  345  hypothetical protein  YP_001329248  normal  0.137611  hitchhiker  0.000968573  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0027  CDS  NC_009637  34358  36388  2031  MCM family protein  YP_001329249  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0028  CDS  NC_009637  36385  36912  528  hypothetical protein  YP_001329250  normal  0.0978645  hitchhiker  0.000275224  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0029  CDS  NC_009637  36943  37209  267  hypothetical protein  YP_001329251  normal  0.302622  hitchhiker  0.00024837  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0030  CDS  NC_009637  37317  37514  198  hypothetical protein  YP_001329252  normal  0.13787  hitchhiker  0.000226296  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0031  CDS  NC_009637  37699  37986  288  putative transcriptional regulator  YP_001329253  normal  0.154381  hitchhiker  0.000228125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0032  CDS  NC_009637  38584  39546  963  hypothetical protein  YP_001329254  normal  0.245052  hitchhiker  0.00116714  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0033  CDS  NC_009637  40066  41577  1512  hypothetical protein  YP_001329255  normal  hitchhiker  0.0013954  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0034  CDS  NC_009637  41579  41878  300  hypothetical protein  YP_001329256  normal  hitchhiker  0.000211196  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0035  CDS  NC_009637  41919  42227  309  hypothetical protein  YP_001329257  normal  hitchhiker  0.000195612  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0036  CDS  NC_009637  42230  43198  969  HNH endonuclease  YP_001329258  normal  hitchhiker  0.000264091  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0037  CDS  NC_009637  43302  44279  978  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  YP_001329259  normal  hitchhiker  0.000954073  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0038  CDS  NC_009637  44388  44615  228  hypothetical protein  YP_001329260  normal  hitchhiker  0.000698096  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0039  CDS  NC_009637  44784  45158  375  hypothetical protein  YP_001329261  normal  hitchhiker  0.000219375  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0040  CDS  NC_009637  45262  46338  1077  metallophosphoesterase  YP_001329262  normal  hitchhiker  6.98173e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0041  CDS  NC_009637  46537  47091  555  resolvase domain-containing protein  YP_001329263  normal  decreased coverage  5.73211e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0042  CDS  NC_009637  47255  48205  951  hypothetical protein  YP_001329264  normal  decreased coverage  6.6001e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0043  CDS  NC_009637  48229  48924  696  glycosyl transferase family protein  YP_001329265  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0044  CDS  NC_009637  48924  50717  1794  hypothetical protein  YP_001329266  normal  0.127657  hitchhiker  0.00155578  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0045  CDS  NC_009637  51003  52421  1419  hypothetical protein  YP_001329267  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0046  CDS  NC_009637  52433  54322  1890  hypothetical protein  YP_001329268  hitchhiker  0.00660525  normal  0.0121603  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0047    NC_009637  54469  55219  751      normal  0.713724  normal  0.130933  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0048  CDS  NC_009637  55216  55683  468  hypothetical protein  YP_001329269  normal  0.651601  normal  0.115977  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0049  CDS  NC_009637  55694  56449  756  hypothetical protein  YP_001329270  normal  0.499528  normal  0.121455  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0050  CDS  NC_009637  56458  57810  1353  hypothetical protein  YP_001329271  normal  0.620647  normal  0.225924  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0051  CDS  NC_009637  57938  58477  540  hypothetical protein  YP_001329272  normal  normal  0.411582  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0052  CDS  NC_009637  58618  59058  441  hypothetical protein  YP_001329273  normal  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0053  CDS  NC_009637  59064  59543  480  hypothetical protein  YP_001329274  normal  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0054  CDS  NC_009637  59553  60287  735  hypothetical protein  YP_001329275  normal  0.879659  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0055  CDS  NC_009637  60649  60975  327  hypothetical protein  YP_001329276  normal  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0056  CDS  NC_009637  61002  61451  450  hypothetical protein  YP_001329277  normal  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0057  CDS  NC_009637  61550  63580  2031  hypothetical protein  YP_001329278  normal  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0058  CDS  NC_009637  63577  65466  1890  hypothetical protein  YP_001329279  normal  0.0425535  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0059  CDS  NC_009637  65468  65803  336  hypothetical protein  YP_001329280  normal  0.222888  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0060  CDS  NC_009637  66859  67881  1023  phage integrase family protein  YP_001329281  normal  0.106477  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0061  CDS  NC_009637  68251  71091  2841  UvrD/REP helicase  YP_001329282  normal  0.147591  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0062  CDS  NC_009637  71081  74140  3060  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  YP_001329283  normal  0.218127  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0063  CDS  NC_009637  74142  77330  3189  type III restriction protein res subunit  YP_001329284  normal  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0064  CDS  NC_009637  77687  78181  495  hypothetical protein  YP_001329285  normal  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0065  CDS  NC_009637  78558  80591  2034  MCM family protein  YP_001329286  normal  0.191549  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0066  CDS  NC_009637  81652  82044  393  hypothetical protein  YP_001329287  normal  0.372373  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0067  CDS  NC_009637  82615  83376  762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001329288  normal  0.947437  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0068  CDS  NC_009637  83385  84461  1077  hypothetical protein  YP_001329289  normal  0.893382  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0069  CDS  NC_009637  88418  88714  297  hypothetical protein  YP_001329290  normal  0.158952  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0070  CDS  NC_009637  90284  90631  348  hypothetical protein  YP_001329291  normal  0.0711532  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0071  CDS  NC_009637  91807  92028  222  seryl-tRNA synthetase related  YP_001329292  normal  0.38918  normal  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0072  CDS  NC_009637  92434  92757  324  hypothetical protein  YP_001329293  normal  0.265406  normal  0.924879  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0073  CDS  NC_009637  92940  93287  348  hypothetical protein  YP_001329294  normal  0.526092  normal  0.512091  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0074  CDS  NC_009637  93372  93893  522  hypothetical protein  YP_001329295  normal  0.175814  normal  0.524931  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0075  CDS  NC_009637  94127  94786  660  cobalamin B12-binding domain-containing protein  YP_001329296  normal  0.916725  normal  0.540278  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0076  CDS  NC_009637  94811  95902  1092  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_001329297  normal  0.541731  normal  0.38624  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0077  CDS  NC_009637  96026  97054  1029  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  YP_001329298  normal  normal  0.268466  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0078  CDS  NC_009637  97054  98832  1779  ferredoxin  YP_001329299  normal  0.483879  normal  0.0362162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0079  CDS  NC_009637  98890  99753  864  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_001329300  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0080  CDS  NC_009637  99819  101123  1305  major facilitator transporter  YP_001329301  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0081  CDS  NC_009637  101346  102467  1122  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase D-component  YP_001329302  hitchhiker  0.00790728  hitchhiker  0.00027984  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0082  CDS  NC_009637  102506  103111  606  ribonuclease H  YP_001329303  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  6.38977e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0083  CDS  NC_009637  103463  104131  669  hypothetical protein  YP_001329304  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  7.53316e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0084  CDS  NC_009637  104146  104610  465  hypothetical protein  YP_001329305  hitchhiker  0.00120536  hitchhiker  0.000282257  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0085  CDS  NC_009637  104681  105268  588  TetR family transcriptional regulator  YP_001329306  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  7.22764e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0086  CDS  NC_009637  106209  106607  399  hypothetical protein  YP_001329307  hitchhiker  0.00238522  hitchhiker  0.000273024  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0087  CDS  NC_009637  106712  106939  228  hypothetical protein  YP_001329308  hitchhiker  0.00121867  hitchhiker  0.000266375  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0088  CDS  NC_009637  107041  107784  744  hypothetical protein  YP_001329309  hitchhiker  0.00170259  hitchhiker  0.000347929  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0089  CDS  NC_009637  107810  108154  345  hypothetical protein  YP_001329310  normal  0.0195922  hitchhiker  0.000300079  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0090  CDS  NC_009637  108474  108743  270  hypothetical protein  YP_001329311  normal  0.0514804  hitchhiker  0.00027984  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0091  CDS  NC_009637  108770  109369  600  hypothetical protein  YP_001329312  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0092  CDS  NC_009637  109402  109875  474  peptide methionine sulfoxide reductase  YP_001329313  normal  0.570537  decreased coverage  6.98173e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0093  CDS  NC_009637  110123  110746  624  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001329314  normal  0.60262  decreased coverage  7.34751e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0094  CDS  NC_009637  110771  112024  1254  amino acid permease-associated region  YP_001329315  normal  0.699923  hitchhiker  0.000401334  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0095  CDS  NC_009637  112031  113392  1362  hypothetical protein  YP_001329316  normal  hitchhiker  0.00145664  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0096  CDS  NC_009637  113437  114066  630  hypothetical protein  YP_001329317  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0097  CDS  NC_009637  114122  114598  477  hypothetical protein  YP_001329318  normal  0.578349  hitchhiker  0.00635148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0098  CDS  NC_009637  114930  115757  828  nitrogenase reductase  YP_001329319  normal  0.380897  normal  0.0345089  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0099  CDS  NC_009637  115800  116117  318  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001329320  normal  0.477301  normal  0.031272  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0100  CDS  NC_009637  116127  116492  366  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001329321  normal  0.250689  normal  0.0316533  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>