7145 genes were found for organism Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
M446_0001  CDS  NC_010511  176  1660  +  1485  chromosomal replication initiation protein  YP_001767023  normal  0.852723  normal  0.138362  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0002  CDS  NC_010511  1863  2984  +  1122  DNA polymerase III subunit beta  YP_001767024  normal  1  normal  0.125376  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0003  CDS  NC_010511  3158  4306  +  1149  DNA replication and repair protein RecF  YP_001767025  normal  0.45272  normal  0.393317  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0004  CDS  NC_010511  4776  6623  +  1848  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_001767026  normal  1  normal  0.49802  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0005  CDS  NC_010511  6842  9055  +  2214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_001767027  normal  1  normal  0.0508779  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0006  CDS  NC_010511  9096  9332  +  237  BolA family protein  YP_001767028  normal  1  normal  0.059102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0007  CDS  NC_010511  9388  9726  +  339  glutaredoxin-like protein  YP_001767029  normal  1  normal  0.0681902  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0008  CDS  NC_010511  9849  10748  +  900  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001767030  normal  1  normal  0.0767976  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0009  CDS  NC_010511  11318  11755  +  438  hypothetical protein  YP_001767031  normal  1  normal  0.0696546  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0010  CDS  NC_010511  11759  12640  -  882  hypothetical protein  YP_001767032  normal  1  normal  0.0777049  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0011  CDS  NC_010511  12759  14810  -  2052  peptidyl-dipeptidase Dcp  YP_001767033  normal  1  normal  0.100519  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0012  CDS  NC_010511  14971  15768  +  798  extensin family protein  YP_001767034  normal  1  normal  0.138362  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0013  CDS  NC_010511  15830  16843  +  1014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001767035  normal  1  normal  0.153019  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0014  CDS  NC_010511  16852  17955  -  1104  hypothetical protein  YP_001767036  normal  0.869851  normal  0.147049  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0015  CDS  NC_010511  18197  19237  -  1041  phytanoyl-CoA dioxygenase  YP_001767037  normal  0.349617  normal  0.130137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0016  CDS  NC_010511  19693  20427  -  735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001767038  normal  0.0719758  normal  0.0648485  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0017  CDS  NC_010511  20424  21575  -  1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001767039  normal  0.387266  normal  0.0728154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0018  CDS  NC_010511  21891  22832  -  942  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_001767040  normal  0.74705  normal  0.0751929  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0019  CDS  NC_010511  23055  23444  +  390  response regulator receiver protein  YP_001767041  normal  1  normal  0.0611118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0020  CDS  NC_010511  23401  23631  -  231  hypothetical protein  YP_001767042  normal  1  normal  0.0567423  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0021  CDS  NC_010511  23723  24124  -  402  hypothetical protein  YP_001767043  normal  1  normal  0.0577391  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0022  CDS  NC_010511  24111  25154  -  1044  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  YP_001767044  normal  1  normal  0.0674688  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0023  CDS  NC_010511  25318  26532  +  1215  extracellular ligand-binding receptor  YP_001767045  normal  1  normal  0.0633447  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0024  CDS  NC_010511  26600  27796  -  1197  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  YP_001767046  normal  1  normal  0.0304834  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0025  CDS  NC_010511  27958  28272  -  315  hypothetical protein  YP_001767047  normal  1  normal  0.0233008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0026  CDS  NC_010511  28269  28523  -  255  putative signal peptide  YP_001767048  normal  1  normal  0.0237146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0027  CDS  NC_010511  28599  29018  -  420  thioesterase superfamily protein  YP_001767049  normal  1  normal  0.0243965  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0028  CDS  NC_010511  29309  29635  +  327  hypothetical protein  YP_001767050  normal  1  normal  0.0485026  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0029  CDS  NC_010511  29749  30942  +  1194  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  YP_001767051  normal  0.760745  normal  0.0274344  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0030  CDS  NC_010511  31077  31490  +  414  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  YP_001767052  normal  0.480574  normal  0.0218985  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0031  CDS  NC_010511  31719  33920  +  2202  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_001767053  normal  0.514737  normal  0.0391032  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0032  CDS  NC_010511  33980  34570  +  591  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001767054  normal  1  normal  0.0215436  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0033  CDS  NC_010511  34760  35410  +  651  hypothetical protein  YP_001767055  normal  1  normal  0.0895202  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0034  CDS  NC_010511  35525  36481  -  957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001767056  normal  1  normal  0.0533139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0035  CDS  NC_010511  36513  37517  -  1005  glycosyl transferase family protein  YP_001767057  normal  1  normal  0.0284284  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0036  CDS  NC_010511  37700  39727  -  2028  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  YP_001767058  normal  0.0637775  decreased coverage  0.00272797  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0037  CDS  NC_010511  40013  41308  +  1296  crotonyl-CoA reductase  YP_001767059  normal  1  decreased coverage  0.00205217  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0038  CDS  NC_010511  41427  41822  +  396  DoxX family protein  YP_001767060  normal  1  hitchhiker  0.00373258  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0039  CDS  NC_010511  42036  43145  -  1110  LuxR family transcriptional regulator  YP_001767061  normal  1  hitchhiker  0.0051974  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0040  CDS  NC_010511  43426  44028  +  603  isopropylmalate isomerase small subunit  YP_001767062  normal  1  hitchhiker  0.00442875  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0041  CDS  NC_010511  44126  45322  +  1197  lytic murein transglycosylase  YP_001767063  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0042  CDS  NC_010511  45341  47500  -  2160  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_001767064  normal  0.18474  hitchhiker  0.0082739  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0043  CDS  NC_010511  47789  49168  -  1380  major facilitator transporter  YP_001767065  normal  0.294091  normal  0.0340585  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0044  CDS  NC_010511  49299  51134  -  1836  heat shock protein 90  YP_001767066  normal  1  normal  0.0195468  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0045  CDS  NC_010511  51254  51925  -  672  DNA polymerase III subunit epsilon  YP_001767067  normal  0.193012  normal  0.0131844  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0046  CDS  NC_010511  51927  53744  -  1818  CBS domain-containing protein  YP_001767068  normal  0.689982  normal  0.0185592  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0047  CDS  NC_010511  54051  54524  -  474  dehydratase  YP_001767069  normal  1  normal  0.0279175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0048  CDS  NC_010511  54542  55924  -  1383  MATE efflux family protein  YP_001767070  normal  1  normal  0.0386984  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0049  CDS  NC_010511  56045  56560  +  516  MarR family transcriptional regulator  YP_001767071  normal  0.68738  normal  0.0302985  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0050  CDS  NC_010511  56918  58372  -  1455  major facilitator transporter  YP_001767072  normal  1  normal  0.0174826  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0051  CDS  NC_010511  58880  59719  -  840  aminotransferase class IV  YP_001767073  normal  1  normal  0.0614511  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0052  CDS  NC_010511  59706  60311  -  606  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_001767074  normal  1  normal  0.054525  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0053  CDS  NC_010511  60537  61919  -  1383  para-aminobenzoate synthase, subunit I  YP_001767075  normal  1  normal  0.071611  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0054  CDS  NC_010511  61992  63008  -  1017  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  YP_001767076  normal  1  normal  0.0641109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0055  CDS  NC_010511  63053  63931  -  879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001767077  normal  1  normal  0.0652457  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0056  CDS  NC_010511  63958  64728  -  771  ABC transporter related  YP_001767078  normal  1  normal  0.128052  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0057  CDS  NC_010511  64843  65520  +  678  two component transcriptional regulator  YP_001767079  normal  1  normal  0.382743  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0058  CDS  NC_010511  65517  66905  +  1389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001767080  normal  1  normal  0.261111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0059  CDS  NC_010511  66902  68035  +  1134  extracellular solute-binding protein  YP_001767081  normal  1  normal  0.430633  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0060    NC_010511  68149  68843  -  695      normal  1  normal  0.401757  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0061  CDS  NC_010511  69473  69937  -  465  PEBP family protein  YP_001767082  normal  0.758418  normal  0.36925  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0062  CDS  NC_010511  70165  71475  -  1311  erythromycin esterase  YP_001767083  normal  0.716314  normal  0.483974  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0063  CDS  NC_010511  71513  72196  -  684  phospholipase/carboxylesterase  YP_001767084  normal  0.982882  normal  0.670301  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0064  CDS  NC_010511  72491  72784  +  294  hypothetical protein  YP_001767085  normal  0.285182  normal  0.411892  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0065  CDS  NC_010511  72852  73253  -  402  MucR family transcriptional regulator  YP_001767086  normal  0.126654  normal  0.420331  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0066  CDS  NC_010511  73371  73664  -  294  hypothetical protein  YP_001767087  normal  0.39252  normal  0.636279  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0067  CDS  NC_010511  73814  74038  -  225  hypothetical protein  YP_001767088  normal  0.513268  normal  0.640048  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0068  CDS  NC_010511  74161  75255  -  1095  hypothetical protein  YP_001767089  normal  1  normal  0.693925  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0069  CDS  NC_010511  75252  76595  -  1344  amino acid permease-associated region  YP_001767090  normal  1  normal  0.480186  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0070  CDS  NC_010511  76800  78167  +  1368  hypothetical protein  YP_001767091  normal  1  normal  0.474002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0071    NC_010511  78247  78963  +  717      normal  1  normal  0.411892  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0072  CDS  NC_010511  78979  79770  -  792  hypothetical protein  YP_001767092  normal  1  normal  0.625739  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0073  CDS  NC_010511  79767  80438  -  672  ABC transporter related  YP_001767093  normal  1  normal  0.606283  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0074  CDS  NC_010511  80661  81881  +  1221  hypothetical protein  YP_001767094  normal  1  normal  0.667411  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0075  CDS  NC_010511  81863  82093  -  231  hypothetical protein  YP_001767095  normal  1  normal  0.541494  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0076  CDS  NC_010511  82184  82588  -  405  alkylhydroperoxidase  YP_001767096  normal  1  normal  0.555975  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0077  CDS  NC_010511  82622  83068  -  447  hypothetical protein  YP_001767097  normal  0.616171  normal  0.536449  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0078    NC_010511  83466  84094  -  629      normal  0.132602  normal  0.555975  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0079  CDS  NC_010511  84300  85157  -  858  UspA domain-containing protein  YP_001767098  normal  0.288519  normal  0.367855  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0080  CDS  NC_010511  85246  86385  -  1140  ABC-2 type transporter  YP_001767099  normal  0.0879828  normal  0.577589  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0081  CDS  NC_010511  86389  89124  -  2736  ABC transporter related  YP_001767100  normal  0.111976  normal  0.167025  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0082  CDS  NC_010511  89121  90434  -  1314  secretion protein HlyD family protein  YP_001767101  normal  0.230236  normal  0.225984  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0083  CDS  NC_010511  90746  90961  +  216  hypothetical protein  YP_001767102  normal  0.107182  normal  0.15982  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0084  CDS  NC_010511  91153  92223  -  1071  PHA synthase subunit PhaC  YP_001767103  normal  1  normal  0.185436  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0085  CDS  NC_010511  92379  94193  -  1815  ABC transporter related  YP_001767104  normal  1  normal  0.217645  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0086  CDS  NC_010511  94183  95361  -  1179  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  YP_001767105  normal  1  normal  0.183317  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0087  CDS  NC_010511  95754  96992  +  1239  glycosyltransferase  YP_001767106  normal  1  normal  0.170697  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0088  CDS  NC_010511  97022  98194  +  1173  UDP-galactopyranose mutase  YP_001767107  normal  0.616523  normal  0.0498418  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0089  CDS  NC_010511  98272  99786  +  1515  hypothetical protein  YP_001767108  normal  0.461505  normal  0.0285875  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0090  CDS  NC_010511  99870  100403  -  534  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001767109  normal  0.247588  normal  0.0443693  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0091  CDS  NC_010511  100415  103360  -  2946  ABC transporter related  YP_001767110  normal  0.948742  normal  0.087256  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0092  CDS  NC_010511  103357  105540  -  2184  ABC transporter related  YP_001767111  normal  0.353929  normal  0.0328949  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0093  CDS  NC_010511  105547  106815  -  1269  membrane-fusion protein  YP_001767112  normal  0.149408  normal  0.100685  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0094  CDS  NC_010511  107063  107590  +  528  hypothetical protein  YP_001767113  normal  1  normal  0.153192  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0095  CDS  NC_010511  107692  109647  +  1956  radical SAM domain-containing protein  YP_001767114  normal  1  normal  0.0641109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0096  CDS  NC_010511  109718  110083  +  366  hypothetical protein  YP_001767115  normal  1  normal  0.0756768  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0097  CDS  NC_010511  110083  111204  +  1122  hypothetical protein  YP_001767116  normal  1  normal  0.0868984  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0098  CDS  NC_010511  111189  113339  +  2151  radical SAM domain-containing protein  YP_001767117  normal  0.21534  normal  0.126108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0099  CDS  NC_010511  113336  113770  +  435  hypothetical protein  YP_001767118  normal  0.0180722  normal  0.256001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
M446_0100  CDS  NC_010511  113841  115958  +  2118  radical SAM domain-containing protein  YP_001767119  normal  0.0253265  normal  0.373771  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>