3873 genes were found for organism Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mpe_A0001  CDS  NC_008825  186  1589  +  1404  chromosomal replication initiation protein  YP_001019198  normal  0.720821  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0002  CDS  NC_008825  1824  2930  +  1107  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001019199  normal  0.0430732  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0003  CDS  NC_008825  3028  5583  +  2556  DNA gyrase subunit B  YP_001019200  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0004  CDS  NC_008825  5597  5914  +  318  hypothetical protein  YP_001019201  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0005  CDS  NC_008825  5980  7566  +  1587  type I restriction-modification system, M subunit  YP_001019202  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0006  CDS  NC_008825  7643  8881  +  1239  restriction modification system, type I  YP_001019203  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0007  CDS  NC_008825  8934  10169  +  1236  ATPase  YP_001019204  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0008  CDS  NC_008825  10201  10773  +  573  hypothetical protein  YP_001019205  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0009  CDS  NC_008825  10870  11109  -  240  hypothetical protein  YP_001019206  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0010  CDS  NC_008825  11121  12272  +  1152  hypothetical protein  YP_001019207  normal  1  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0011  CDS  NC_008825  12269  15454  +  3186  type I site-specific deoxyribonuclease  YP_001019208  normal  1  normal  0.386666  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0012  CDS  NC_008825  15560  17260  +  1701  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001019209  normal  0.492266  normal  0.262588  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0013  CDS  NC_008825  17363  17515  +  153  hypothetical protein  YP_001019210  normal  0.331846  normal  0.328579  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0014  CDS  NC_008825  17722  18150  +  429  hypothetical protein  YP_001019211  normal  0.133834  normal  0.506679  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0015  CDS  NC_008825  18282  18611  +  330  putative transmembrane protein  YP_001019212  normal  0.0870168  normal  0.721209  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0016  CDS  NC_008825  18623  20065  -  1443  coenzyme F390 synthetase-like protein  YP_001019213  normal  0.0110032  normal  1  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0017  CDS  NC_008825  20193  21035  +  843  hypothetical protein  YP_001019214  normal  0.0334555  normal  0.756521  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0018  CDS  NC_008825  21070  21867  +  798  formate/nitrate transporter  YP_001019215  normal  0.135457  normal  0.535359  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0019  CDS  NC_008825  21840  23126  -  1287  putative RNA polymerase sigma factor  YP_001019216  normal  0.962895  normal  0.592717  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0020  CDS  NC_008825  23141  23554  -  414  hypothetical protein  YP_001019217  normal  0.440066  normal  0.528781  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0021  CDS  NC_008825  23594  24007  -  414  hypothetical protein  YP_001019218  normal  1  normal  0.512817  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0022  CDS  NC_008825  24138  24500  -  363  hypothetical protein  YP_001019219  normal  1  normal  0.346854  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0023  CDS  NC_008825  24591  26576  -  1986  putative cysteine desulfurase  YP_001019220  normal  1  normal  0.493291  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0024  CDS  NC_008825  26589  27518  -  930  hypothetical protein  YP_001019221  normal  1  normal  0.407086  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0025  CDS  NC_008825  27645  27890  -  246  putative DNA-binding protein  YP_001019222  normal  0.0532078  normal  0.345409  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0026  CDS  NC_008825  27887  28855  -  969  Serine O-acetyltransferase  YP_001019223  normal  0.602899  normal  0.244581  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0027  CDS  NC_008825  28840  29307  -  468  hypothetical protein  YP_001019224  normal  0.335991  normal  0.134752  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0028  CDS  NC_008825  29475  30776  -  1302  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  YP_001019225  normal  0.0558069  normal  0.0879223  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0029  CDS  NC_008825  30888  31310  -  423  PhnB protein  YP_001019226  normal  0.0403111  normal  0.0726467  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0030  CDS  NC_008825  31397  31645  -  249  hypothetical protein  YP_001019227  hitchhiker  0.00696955  normal  0.128102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0031  CDS  NC_008825  31703  32032  -  330  hypothetical protein  YP_001019228  normal  0.0327198  normal  0.132669  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0032  CDS  NC_008825  32643  34133  -  1491  hypothetical protein  YP_001019229  normal  0.0534564  normal  0.101968  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0033  CDS  NC_008825  34230  34457  +  228  hypothetical protein  YP_001019230  decreased coverage  0.00113494  normal  0.0729977  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0034  CDS  NC_008825  34465  35067  -  603  hypothetical protein  YP_001019231  decreased coverage  0.00139041  normal  0.0848547  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0035  CDS  NC_008825  35375  35995  +  621  TetR family transcriptional regulator  YP_001019232  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0036  CDS  NC_008825  36088  36786  +  699  putative short chain dehydrogenase  YP_001019233  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0037  CDS  NC_008825  36822  37454  -  633  hypothetical protein  YP_001019234  normal  0.19923  normal  0.0874847  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0038  CDS  NC_008825  37634  38236  +  603  putative paraquat-inducible protein  YP_001019235  normal  0.303986  normal  0.0916917  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0039  CDS  NC_008825  38347  39009  +  663  putative paraquat-inducible protein  YP_001019236  normal  0.355976  normal  0.169833  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0040  CDS  NC_008825  38997  40706  +  1710  paraquat-inducible protein  YP_001019237  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0041  CDS  NC_008825  40703  41323  +  621  putative lipoprotein  YP_001019238  normal  0.240026  normal  0.251629  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0042  CDS  NC_008825  41334  42218  -  885  BrkB-like serum-resistance protein  YP_001019239  normal  0.363004  normal  0.262588  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0043  CDS  NC_008825  42228  42422  -  195  hypothetical protein  YP_001019240  normal  0.0594397  normal  0.235635  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0044  CDS  NC_008825  42602  42904  -  303  hypothetical protein  YP_001019241  normal  0.126185  normal  0.244581  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0045  CDS  NC_008825  43073  43552  +  480  hypothetical protein  YP_001019242  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0046  CDS  NC_008825  43653  44651  -  999  hypothetical protein  YP_001019243  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0047  CDS  NC_008825  44687  45937  -  1251  cardiolipin synthase 2  YP_001019244  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0048  CDS  NC_008825  45934  46704  -  771  hypothetical protein  YP_001019245  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0049  CDS  NC_008825  46842  47468  +  627  DNA-directed DNA polymerase  YP_001019246  hitchhiker  0.00111641  normal  0.175204  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0050  CDS  NC_008825  47465  48262  +  798  RNA polymerase sigma factor for flagellar operon  YP_001019247  hitchhiker  0.00204994  normal  0.175204  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0051  CDS  NC_008825  48537  49634  +  1098  putative carboxypeptidase  YP_001019248  normal  0.103758  normal  0.203157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0052  CDS  NC_008825  49631  50422  +  792  hydrolase or acyltransferase-like protein  YP_001019249  normal  0.357757  normal  0.185343  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0053  CDS  NC_008825  50582  51397  +  816  transglutaminase-like domain-containing protein  YP_001019250  normal  0.573487  normal  0.187111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0054  CDS  NC_008825  51426  52172  -  747  carboxylesterase  YP_001019251  normal  0.691003  normal  0.104617  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0055  CDS  NC_008825  52184  52762  +  579  hypothetical protein  YP_001019252  normal  0.402029  normal  0.104076  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0056  CDS  NC_008825  52860  53261  -  402  hypothetical protein  YP_001019253  normal  0.55535  normal  0.101968  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0057  CDS  NC_008825  53590  54147  +  558  MarR family transcriptional regulator  YP_001019254  normal  0.584189  normal  0.103539  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0058  CDS  NC_008825  54198  54626  +  429  putative organic hydroperoxide resistance protein  YP_001019255  normal  1  normal  0.0984059  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0059  CDS  NC_008825  54678  55028  +  351  putative transmembrane protein  YP_001019256  normal  1  normal  0.0902612  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0060  CDS  NC_008825  55068  56669  -  1602  putative signal peptide protein  YP_001019257  normal  1  normal  0.0678938  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0061  CDS  NC_008825  56647  57447  -  801  fimbrial assembly protein  YP_001019258  normal  1  normal  0.0554772  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0062  CDS  NC_008825  57555  58070  +  516  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  YP_001019259  normal  1  normal  0.0515653  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0063  CDS  NC_008825  58085  59680  -  1596  O-antigen polymerase  YP_001019260  normal  1  normal  0.0639643  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0064  CDS  NC_008825  59890  60150  -  261  hypothetical protein  YP_001019261  normal  1  normal  0.150597  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0065  CDS  NC_008825  60158  60670  -  513  pilin  YP_001019262  normal  1  normal  0.154072  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0066  CDS  NC_008825  60884  61687  -  804  cAMP phosphodiesterase  YP_001019263  normal  1  normal  0.168362  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0067  CDS  NC_008825  61904  62566  -  663  hypothetical protein  YP_001019264  normal  1  normal  0.154072  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0068  CDS  NC_008825  62646  63455  -  810  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  YP_001019265  normal  1  normal  0.422678  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0069  CDS  NC_008825  63491  64573  -  1083  putative serine/threonine protein kinase  YP_001019266  normal  1  normal  0.446321  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0070  CDS  NC_008825  64743  65447  -  705  hypothetical protein  YP_001019267  normal  0.693932  normal  0.419682  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0071  CDS  NC_008825  65634  66527  -  894  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  YP_001019268  normal  0.657725  normal  0.417967  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0072  CDS  NC_008825  66548  67708  -  1161  succinyl-CoA synthetase subunit beta  YP_001019269  normal  1  normal  0.442706  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0073  CDS  NC_008825  67929  68852  +  924  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001019270  normal  1  normal  0.257959  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0074  CDS  NC_008825  68858  69367  -  510  putative regulatory protein RecX  YP_001019271  normal  1  normal  0.362102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0075  CDS  NC_008825  69411  70484  -  1074  recombinase A  YP_001019272  normal  1  normal  0.394042  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0076  CDS  NC_008825  70626  71297  +  672  two component transcriptional regulator  YP_001019273  normal  1  normal  0.225452  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0077  CDS  NC_008825  71330  72859  +  1530  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  YP_001019274  normal  1  normal  0.156508  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0078  CDS  NC_008825  72947  74248  +  1302  alpha/beta fold family hydrolase  YP_001019275  normal  1  normal  0.141844  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0079  CDS  NC_008825  74265  75422  -  1158  putative rod shape-determining transmembrane protein  YP_001019276  normal  1  normal  0.145723  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0080  CDS  NC_008825  75419  77530  -  2112  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001019277  normal  1  normal  0.313327  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0081  CDS  NC_008825  77559  78080  -  522  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  YP_001019278  normal  1  normal  0.140222  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0082  CDS  NC_008825  78077  79012  -  936  rod shape-determining protein MreC  YP_001019279  normal  1  normal  0.147193  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0083  CDS  NC_008825  79154  80197  -  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_001019280  normal  1  normal  0.400729  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0084  CDS  NC_008825  80485  80784  +  300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  YP_001019281  normal  1  normal  0.34807  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0085  CDS  NC_008825  80781  82271  +  1491  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_001019282  normal  1  normal  0.43524  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0086  CDS  NC_008825  82273  83721  +  1449  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B  YP_001019283  normal  1  normal  0.412565  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0087  CDS  NC_008825  83755  84468  -  714  hypothetical protein  YP_001019284  normal  1  normal  0.518244  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0088  CDS  NC_008825  84496  85200  -  705  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001019285  normal  1  normal  0.516044  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0089  CDS  NC_008825  85229  86020  +  792  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_001019286  normal  1  normal  0.499029  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0090  CDS  NC_008825  86052  86270  +  219  hypothetical protein  YP_001019287  normal  1  normal  0.674503  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0091  CDS  NC_008825  86301  87506  +  1206  acyltransferase-like protein  YP_001019288  normal  1  normal  0.801479  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0092  CDS  NC_008825  87547  88194  +  648  putative metallo-beta-lactamase family protein  YP_001019289  normal  1  normal  0.76232  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0093  CDS  NC_008825  88219  89241  -  1023  putative signal peptide protein  YP_001019290  normal  0.485946  normal  0.563302  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0094  CDS  NC_008825  89238  90773  -  1536  hypothetical protein  YP_001019291  normal  0.4429  normal  0.916942  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0095  CDS  NC_008825  90899  91135  +  237  hypothetical protein  YP_001019292  normal  0.037694  normal  0.756521  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0096  CDS  NC_008825  91316  91888  +  573  hypothetical protein  YP_001019293  normal  0.134789  normal  0.826504  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0097  CDS  NC_008825  91908  92552  -  645  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001019294  normal  0.235254  normal  0.805383  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0098  CDS  NC_008825  92605  92841  -  237  hypothetical protein  YP_001019295  normal  0.453408  normal  0.549813  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0099  CDS  NC_008825  92985  95801  -  2817  signal transduction histidine kinase-like protein  YP_001019296  normal  1  normal  0.878773  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Mpe_A0100  CDS  NC_008825  95876  96481  -  606  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  YP_001019297  normal  1  normal  0.243641  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>