48 genes were found for organism Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PCC8801_4508    NC_011723  167  3315  3149      normal  normal  0.597199  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4509  CDS  NC_011723  495  1487  993  transposase IS4 family protein  YP_002364787  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4510  CDS  NC_011723  3561  3725  165  hypothetical protein  YP_002364788  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4511  CDS  NC_011723  3840  4700  861  HEAT domain containing protein  YP_002364789  normal  0.715352  normal  0.801323  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4512  CDS  NC_011723  4820  6097  1278  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  YP_002364790  normal  0.0839106  normal  0.594133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4513  CDS  NC_011723  6162  6788  627  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  YP_002364791  normal  0.283819  normal  0.759424  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4514  CDS  NC_011723  7330  8484  1155  transposase IS4 family protein  YP_002364792  normal  0.810745  normal  0.887559  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4515  CDS  NC_011723  8806  9300  495  Phycobilisome protein  YP_002364793  normal  normal  0.915449  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4516  CDS  NC_011723  9378  9932  555  Phycobilisome protein  YP_002364794  normal  0.667174  normal  0.759424  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4517  CDS  NC_011723  10236  10976  741  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  YP_002364795  normal  0.991072  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4518  CDS  NC_011723  11043  11786  744  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  YP_002364796  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4519  CDS  NC_011723  11851  12435  585  Phycobilisome protein  YP_002364797  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4520  CDS  NC_011723  12597  13418  822  pentapeptide repeat protein  YP_002364798  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4521  CDS  NC_011723  14018  14602  585  hypothetical protein  YP_002364799  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4522  CDS  NC_011723  14695  15969  1275  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  YP_002364800  normal  normal  0.839734  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4523  CDS  NC_011723  15999  16412  414  transposase IS200-family protein  YP_002364801  normal  0.998354  normal  0.81056  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4524    NC_011723  16491  16571  81      normal  0.789183  normal  0.740642  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4525  CDS  NC_011723  16603  16908  306  phycoerythrin-associated linker protein, CpeR  YP_002364802  normal  0.763615  normal  0.644834  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4526  CDS  NC_011723  16993  17595  603  protein of unknown function DUF1001  YP_002364803  normal  0.390851  normal  0.829315  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4527  CDS  NC_011723  17814  18353  540  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  YP_002364804  normal  0.447395  normal  0.851635  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4528  CDS  NC_011723  18579  19346  768  Phycobilisome linker polypeptide  YP_002364805  normal  0.242343  normal  0.716968  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4529  CDS  NC_011723  19445  20320  876  Phycobilisome linker polypeptide  YP_002364806  normal  0.0956288  normal  0.913369  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4530  CDS  NC_011723  20500  20745  246  hypothetical protein  YP_002364807  normal  0.0721096  normal  0.941528  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4531    NC_011723  20778  21019  242      normal  0.0748808  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4532  CDS  NC_011723  21171  22421  1251  hypothetical protein  YP_002364808  normal  0.0112828  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4533  CDS  NC_011723  23089  27300  4212  hypothetical protein  YP_002364809  normal  0.0371536  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4534  CDS  NC_011723  27340  27576  237  hypothetical protein  YP_002364810  normal  0.0423065  normal  0.947801  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4535  CDS  NC_011723  27563  27871  309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_002364811  normal  0.0469599  normal  0.805558  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4536  CDS  NC_011723  28123  29277  1155  transposase IS4 family protein  YP_002364812  normal  0.0600651  normal  0.65428  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4537  CDS  NC_011723  29726  30226  501  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002364813  normal  normal  0.69779  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4538  CDS  NC_011723  30223  30501  279  Protein of unknown function DUF1778  YP_002364814  normal  normal  0.642193  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4539  CDS  NC_011723  30630  30842  213  hypothetical protein  YP_002364815  normal  normal  0.916812  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4540  CDS  NC_011723  30894  32288  1395  Relaxase/mobilization nuclease family protein  YP_002364816  normal  normal  0.727703  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4541  CDS  NC_011723  32484  32813  330  transcriptional regulator  YP_002364817  normal  normal  0.800191  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4542  CDS  NC_011723  32829  33191  363  hypothetical protein  YP_002364818  normal  normal  0.812135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4543  CDS  NC_011723  33207  33557  351  hypothetical protein  YP_002364819  normal  normal  0.797661  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4544  CDS  NC_011723  33649  33885  237  hypothetical protein  YP_002364820  normal  normal  0.926534  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4545  CDS  NC_011723  34036  34440  405  hypothetical protein  YP_002364821  normal  normal  0.663104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4546  CDS  NC_011723  34544  34696  153  hypothetical protein  YP_002364822  normal  normal  0.63257  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4547  CDS  NC_011723  34971  35309  339  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_002364823  normal  normal  0.653702  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4548  CDS  NC_011723  35296  35520  225  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  YP_002364824  normal  normal  0.649479  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4549  CDS  NC_011723  35683  35946  264  hypothetical protein  YP_002364825  normal  normal  0.668069  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4550  CDS  NC_011723  36115  37203  1089  integrase family protein  YP_002364826  normal  normal  0.798479  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4551    NC_011723  37348  37617  270      normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4552  CDS  NC_011723  37828  38982  1155  transposase IS4 family protein  YP_002364827  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4553  CDS  NC_011723  39289  39474  186  hypothetical protein  YP_002364828  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4554  CDS  NC_011723  39573  40163  591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002364829  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
PCC8801_4555  CDS  NC_011723  40160  40420  261  helix-turn-helix protein, CopG  YP_002364830  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>