4667 genes were found for organism Shewanella baltica OS223



Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sbal223_0001  CDS  NC_011663  77  1465  1389  chromosomal replication initiation protein  YP_002355968  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0002  CDS  NC_011663  1485  2585  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002355969  hitchhiker  6.37071e-08  unclonable  3.26658e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0003  CDS  NC_011663  2787  3869  1083  recombination protein F  YP_002355970  normal  0.0851424  hitchhiker  1.17147e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0004  CDS  NC_011663  3886  6303  2418  DNA gyrase, B subunit  YP_002355971  normal  0.405147  hitchhiker  3.01601e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0005  CDS  NC_011663  6418  7080  663  Glutathione S-transferase domain protein  YP_002355972  normal  hitchhiker  7.59122e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0006  CDS  NC_011663  7321  7623  303  monoheme cytochrome c  YP_002355973  normal  hitchhiker  7.73885e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0007  CDS  NC_011663  7625  8851  1227  oxidoreductase molybdopterin binding protein  YP_002355974  normal  hitchhiker  5.59992e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0008  CDS  NC_011663  8851  9234  384  monoheme cytochrome c, putative  YP_002355975  normal  hitchhiker  3.51615e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0009  CDS  NC_011663  9231  9566  336  cytochrome c class I  YP_002355976  normal  hitchhiker  3.57526e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0010  CDS  NC_011663  9657  10577  921  urea amidolyase related protein  YP_002355977  normal  hitchhiker  5.28176e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0011  CDS  NC_011663  10911  11951  1041  putative signal transduction protein  YP_002355978  normal  hitchhiker  6.19076e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0012  CDS  NC_011663  12039  14108  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_002355979  normal  hitchhiker  4.99537e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0013  CDS  NC_011663  14119  15024  906  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_002355980  normal  hitchhiker  2.39617e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0014  CDS  NC_011663  15142  15744  603  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_002355981  normal  hitchhiker  1.64435e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0015  CDS  NC_011663  15944  19132  3189  amidohydrolase  YP_002355982  normal  hitchhiker  7.11997e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0016  CDS  NC_011663  19396  19842  447  hypothetical protein  YP_002355983  normal  hitchhiker  1.49396e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0017  CDS  NC_011663  19890  20135  246  sulfur transfer protein SirA  YP_002355984  normal  hitchhiker  1.23371e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0018  CDS  NC_011663  20306  21469  1164  diguanylate cyclase  YP_002355985  normal  hitchhiker  2.19286e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0019  CDS  NC_011663  21712  22875  1164  3-ketoacyl-CoA thiolase  YP_002355986  normal  hitchhiker  2.05749e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0020  CDS  NC_011663  22898  25048  2151  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  YP_002355987  normal  hitchhiker  3.56561e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0021  CDS  NC_011663  25539  26861  1323  proline dipeptidase  YP_002355988  normal  hitchhiker  2.47485e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0022  CDS  NC_011663  26889  27503  615  protein of unknown function UPF0029  YP_002355989  normal  hitchhiker  1.69816e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0023  CDS  NC_011663  27581  29038  1458  potassium uptake protein, TrkH family  YP_002355990  normal  hitchhiker  2.99675e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0024  CDS  NC_011663  29041  29565  525  Protoporphyrinogen oxidase  YP_002355991  normal  0.776203  hitchhiker  1.79508e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0025  CDS  NC_011663  29629  29937  309  transcriptional regulator, ArsR family  YP_002355992  normal  0.111257  hitchhiker  1.53005e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0026  CDS  NC_011663  30138  30689  552  Protoporphyrinogen oxidase  YP_002355993  normal  hitchhiker  1.81014e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0027  CDS  NC_011663  30760  32202  1443  potassium uptake protein, TrkH family  YP_002355994  normal  hitchhiker  3.04543e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0028  CDS  NC_011663  32223  33632  1410  potassium transporter peripheral membrane component  YP_002355995  normal  hitchhiker  2.83519e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0029  CDS  NC_011663  33648  34934  1287  sun protein  YP_002355996  normal  hitchhiker  2.39617e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0030  CDS  NC_011663  34936  35892  957  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_002355997  normal  hitchhiker  1.88499e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0031  CDS  NC_011663  35901  36413  513  peptide deformylase  YP_002355998  normal  hitchhiker  1.64435e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0032  CDS  NC_011663  36539  37669  1131  Peptidoglycan-binding LysM  YP_002355999  normal  hitchhiker  2.35775e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0033  CDS  NC_011663  37753  38769  1017  DNA protecting protein DprA  YP_002356000  normal  hitchhiker  2.24726e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0034  CDS  NC_011663  38772  39245  474  protein of unknown function DUF494  YP_002356001  normal  hitchhiker  3.45632e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0035  CDS  NC_011663  39365  39928  564  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  YP_002356002  normal  hitchhiker  6.68977e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0036  CDS  NC_011663  40055  40621  567  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_002356003  normal  hitchhiker  7.7729e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0037  CDS  NC_011663  40647  41555  909  coproporphyrinogen III oxidase  YP_002356004  normal  hitchhiker  1.49114e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0038  CDS  NC_011663  41590  42027  438  globin  YP_002356005  normal  hitchhiker  1.22438e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0039  CDS  NC_011663  42181  43029  849  shikimate 5-dehydrogenase  YP_002356006  normal  0.0451521  unclonable  5.12206e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0040  CDS  NC_011663  43035  43310  276  protein of unknown function DUF1488  YP_002356007  hitchhiker  0.00230269  unclonable  3.50952e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0041  CDS  NC_011663  43430  43978  549  carbonic anhydrase, family 3  YP_002356008  hitchhiker  5.08164e-06  unclonable  4.48586e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0042  CDS  NC_011663  50105  50359  255  protein of unknown function UPF0153  YP_002356009  normal  unclonable  2.33524e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0043  CDS  NC_011663  50382  50837  456  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  YP_002356010  normal  hitchhiker  7.67573e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0044  CDS  NC_011663  50812  51567  756  protein of unknown function DUF610 YibQ  YP_002356011  normal  hitchhiker  1.52753e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0045  CDS  NC_011663  51580  52785  1206  carboxyl-terminal protease  YP_002356012  normal  hitchhiker  2.23993e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0046  CDS  NC_011663  52818  53906  1089  Peptidase M23  YP_002356013  normal  hitchhiker  1.5395e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0047  CDS  NC_011663  53962  55506  1545  phosphoglyceromutase  YP_002356014  normal  hitchhiker  6.62777e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0048  CDS  NC_011663  55774  56208  435  Rhodanese domain protein  YP_002356015  normal  normal  0.0338944  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0049  CDS  NC_011663  56504  56989  486  preprotein translocase subunit SecB  YP_002356016  normal  normal  0.0975103  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0050  CDS  NC_011663  56994  58010  1017  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_002356017  normal  normal  0.265986  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0051  CDS  NC_011663  58204  59388  1185  HI0933 family protein  YP_002356018  normal  normal  0.71818  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0052  CDS  NC_011663  59501  61471  1971  putative transcriptional regulator  YP_002356019  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0053  CDS  NC_011663  62093  63457  1365  potassium uptake protein, TrkH family  YP_002356020  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0054  CDS  NC_011663  63459  64157  699  TrkA-N domain protein  YP_002356021  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0055  CDS  NC_011663  64208  64897  690  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002356022  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0056  CDS  NC_011663  64898  65944  1047  histidine kinase  YP_002356023  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0057  CDS  NC_011663  66246  67169  924  Pirin domain protein  YP_002356024  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0058  CDS  NC_011663  67695  69368  1674  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_002356025  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0059  CDS  NC_011663  69362  70093  732  two component transcriptional regulator, LytTR family  YP_002356026  normal  0.182784  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0060  CDS  NC_011663  70201  71445  1245  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002356027  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0061  CDS  NC_011663  71580  72317  738  protein of unknown function DUF81  YP_002356028  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0062  CDS  NC_011663  72454  72918  465  NLP/P60 protein  YP_002356029  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0063  CDS  NC_011663  72978  74441  1464  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002356030  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0064  CDS  NC_011663  74534  75565  1032  transcriptional regulator, LacI family  YP_002356031  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0065  CDS  NC_011663  75680  77158  1479  sucrose phosphorylase  YP_002356032  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0066  CDS  NC_011663  77419  78639  1221  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002356033  normal  0.574631  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0067  CDS  NC_011663  78918  81314  2397  outer membrane insertion C-terminal signal  YP_002356034  decreased coverage  0.00013463  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0068  CDS  NC_011663  81434  82393  960  PfkB domain protein  YP_002356035  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0069  CDS  NC_011663  82649  83182  534  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_002356036  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0070  CDS  NC_011663  83255  83503  249  hypothetical protein  YP_002356037  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0071  CDS  NC_011663  83583  84722  1140  transport protein, putative  YP_002356038  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0072  CDS  NC_011663  84817  85551  735  ABC transporter related  YP_002356039  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0073  CDS  NC_011663  85555  87192  1638  TAP domain protein  YP_002356040  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0074  CDS  NC_011663  87286  87657  372  transcriptional regulator, GntR family  YP_002356041  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0075  CDS  NC_011663  87711  88574  864  ABC transporter related  YP_002356042  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0076  CDS  NC_011663  88571  89881  1311  hypothetical protein  YP_002356043  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0077  CDS  NC_011663  90010  91815  1806  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_002356044  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0078    NC_011663  91959  95782  3824      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0079  CDS  NC_011663  92345  93361  1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002356045  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0080  CDS  NC_011663  95911  96321  411  thioesterase superfamily protein  YP_002356046  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0081  CDS  NC_011663  96445  96993  549  HPP family protein  YP_002356047  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0082  CDS  NC_011663  97014  97277  264  hypothetical protein  YP_002356048  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0083  CDS  NC_011663  97340  97768  429  thioesterase superfamily protein  YP_002356049  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0084  CDS  NC_011663  97925  98320  396  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  YP_002356050  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0085  CDS  NC_011663  98324  98680  357  transcriptional regulator, MerR family  YP_002356051  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0086  CDS  NC_011663  98874  99260  387  Carboxymuconolactone decarboxylase  YP_002356052  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0087  CDS  NC_011663  99556  100638  1083  hypothetical protein  YP_002356053  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0088  CDS  NC_011663  100734  101414  681  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  YP_002356054  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0089  CDS  NC_011663  101798  102232  435  hypothetical protein  YP_002356055  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0090  CDS  NC_011663  102329  103342  1014  hypothetical protein  YP_002356056  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0091  CDS  NC_011663  103847  105670  1824  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_002356057  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0092  CDS  NC_011663  105889  106506  618  FMN-binding negative transcriptional regulator  YP_002356058  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0093  CDS  NC_011663  106578  106763  186  hypothetical protein  YP_002356059  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0094  CDS  NC_011663  106984  107742  759  protein of unknown function DUF347  YP_002356060  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0095  CDS  NC_011663  108204  108764  561  transcriptional regulator, MarR family  YP_002356061  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0096  CDS  NC_011663  108757  109500  744  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  YP_002356062  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0097    NC_011663  109617  113981  4365      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0098  CDS  NC_011663  110826  111935  1110  transposase IS4 family protein  YP_002356063  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0099  CDS  NC_011663  114076  115308  1233  imidazolonepropionase  YP_002356064  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_0100    NC_011663  115542  117476  1935      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>