7177 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcenmc03_0001  CDS  NC_010508  303  1880  1578  chromosomal replication initiation protein  YP_001763304  normal  normal  0.54964  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0002  CDS  NC_010508  2051  3157  1107  DNA polymerase III subunit beta  YP_001763305  normal  0.481367  normal  0.530719  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0003  CDS  NC_010508  3350  5824  2475  DNA gyrase subunit B  YP_001763306  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0004  CDS  NC_010508  6207  6974  768  HNH nuclease  YP_001763307  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0005  CDS  NC_010508  7418  9991  2574  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  YP_001763308  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0006  CDS  NC_010508  9988  11481  1494  hypothetical protein  YP_001763309  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0007  CDS  NC_010508  11478  14372  2895  hypothetical protein  YP_001763310  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0008  CDS  NC_010508  14383  15366  984  hypothetical protein  YP_001763311  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0009  CDS  NC_010508  15369  17138  1770  hypothetical protein  YP_001763312  normal  0.101809  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0010  CDS  NC_010508  17153  17620  468  DNA mismatch endonuclease Vsr  YP_001763313  normal  0.191415  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0011  CDS  NC_010508  17661  18818  1158  hypothetical protein  YP_001763314  normal  0.102816  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0012  CDS  NC_010508  18815  19816  1002  C-5 cytosine-specific DNA methylase  YP_001763315  normal  0.684081  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0013  CDS  NC_010508  20554  20961  408  XRE family transcriptional regulator  YP_001763316  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0014  CDS  NC_010508  21239  21877  639  hypothetical protein  YP_001763317  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0015  CDS  NC_010508  21891  23852  1962  integrase catalytic region  YP_001763318  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0016  CDS  NC_010508  23842  24780  939  AAA ATPase  YP_001763319  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0017  CDS  NC_010508  24782  26293  1512  hypothetical protein  YP_001763320  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0018  CDS  NC_010508  26290  27993  1704  hypothetical protein  YP_001763321  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0019  CDS  NC_010508  28045  28662  618  hypothetical protein  YP_001763322  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0020  CDS  NC_010508  28701  29540  840  metallophosphoesterase  YP_001763323  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0021    NC_010508  29573  29728  156      normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0022  CDS  NC_010508  29911  30810  900  hypothetical protein  YP_001763324  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0023  CDS  NC_010508  30814  33024  2211  AAA ATPase  YP_001763325  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0024  CDS  NC_010508  33486  33866  381  hypothetical protein  YP_001763326  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0025  CDS  NC_010508  34141  34476  336  hypothetical protein  YP_001763327  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0026  CDS  NC_010508  35349  36251  903  RepB plasmid partition  YP_001763328  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0027  CDS  NC_010508  36248  37150  903  parB-like partition protein  YP_001763329  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0028  CDS  NC_010508  37147  38760  1614  recombinase  YP_001763330  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0029  CDS  NC_010508  38873  39244  372  hypothetical protein  YP_001763331  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0030  CDS  NC_010508  45668  46201  534  cytochrome B561  YP_001763332  hitchhiker  6.93928e-09  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0031  CDS  NC_010508  46198  47283  1086  catalase domain-containing protein  YP_001763333  hitchhiker  0.000121953  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0032  CDS  NC_010508  47442  47963  522  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001763334  hitchhiker  0.00832626  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0033  CDS  NC_010508  47960  48718  759  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_001763335  hitchhiker  0.00163217  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0034  CDS  NC_010508  48968  49567  600  hypothetical protein  YP_001763336  normal  0.114685  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0035  CDS  NC_010508  50050  50235  186  hypothetical protein  YP_001763337  normal  0.269712  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0036  CDS  NC_010508  50363  50725  363  hypothetical protein  YP_001763338  normal  0.333872  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0037  CDS  NC_010508  51601  52116  516  hypothetical protein  YP_001763339  normal  0.894017  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0038  CDS  NC_010508  52220  53101  882  RNA polymerase sigma factor SigJ  YP_001763340  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0039  CDS  NC_010508  53101  53577  477  alkylhydroperoxidase  YP_001763341  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0040  CDS  NC_010508  54158  55384  1227  hypothetical protein  YP_001763342  normal  0.793849  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0041  CDS  NC_010508  55368  56381  1014  hypothetical protein  YP_001763343  normal  0.706965  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0042  CDS  NC_010508  56675  56977  303  hypothetical protein  YP_001763344  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0043  CDS  NC_010508  56994  57959  966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001763345  normal  0.706965  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0044  CDS  NC_010508  58211  58465  255  hypothetical protein  YP_001763346  normal  0.862683  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0045  CDS  NC_010508  58661  59041  381  hypothetical protein  YP_001763347  normal  0.469392  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0046  CDS  NC_010508  59311  62337  3027  type III restriction protein res subunit  YP_001763348  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0047  CDS  NC_010508  62337  64343  2007  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  YP_001763349  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0048  CDS  NC_010508  64702  65829  1128  porin  YP_001763350  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0049  CDS  NC_010508  66112  66789  678  two component transcriptional regulator  YP_001763351  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0050  CDS  NC_010508  66803  68170  1368  histidine kinase  YP_001763352  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0051  CDS  NC_010508  68259  69107  849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001763353  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0052  CDS  NC_010508  69175  69972  798  ABC transporter related  YP_001763354  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0053  CDS  NC_010508  70094  71098  1005  NMT1/THI5-like domain-containing protein  YP_001763355  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0054  CDS  NC_010508  71283  72065  783  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_001763356  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0055  CDS  NC_010508  72090  72362  273  flagellar biosynthesis protein FliQ  YP_001763357  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0056  CDS  NC_010508  72379  73140  762  flagellar biosynthesis protein FliP  YP_001763358  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0057  CDS  NC_010508  73177  73719  543  flagellar biosynthesis protein FliO  YP_001763359  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0058  CDS  NC_010508  73743  74231  489  flagellar motor switch protein FliN  YP_001763360  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0059  CDS  NC_010508  74224  75222  999  flagellar motor switch protein FliM  YP_001763361  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0060  CDS  NC_010508  75245  75778  534  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_001763362  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0061  CDS  NC_010508  75981  76703  723  LrgB family protein  YP_001763363  normal  0.775871  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0062  CDS  NC_010508  76717  77190  474  LrgA family protein  YP_001763364  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0063  CDS  NC_010508  77332  78258  927  LysR family transcriptional regulator  YP_001763365  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0064  CDS  NC_010508  78283  78669  387  PilT domain-containing protein  YP_001763366  normal  0.859731  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0065  CDS  NC_010508  78666  78914  249  prevent-host-death family protein  YP_001763367  normal  0.436483  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0066  CDS  NC_010508  79020  80582  1563  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_001763368  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0067  CDS  NC_010508  80759  81247  489  MarR family transcriptional regulator  YP_001763369  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0068  CDS  NC_010508  81422  81706  285  hypothetical protein  YP_001763370  normal  0.756917  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0069  CDS  NC_010508  81991  83562  1572  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001763371  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0070  CDS  NC_010508  83588  84376  789  hypothetical protein  YP_001763372  normal  0.726501  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0071  CDS  NC_010508  84413  84919  507  general secretion pathway M protein  YP_001763373  normal  0.434377  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0072  CDS  NC_010508  84916  86289  1374  general secretion pathway protein L  YP_001763374  normal  0.73764  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0073  CDS  NC_010508  86316  87425  1110  general secretion pathway protein K  YP_001763375  normal  0.662453  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0074  CDS  NC_010508  87428  88096  669  putative general secretion pathway protein J  YP_001763376  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0075  CDS  NC_010508  88104  88505  402  general secretion pathway protein I  YP_001763377  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0076  CDS  NC_010508  88508  89077  570  general secretion pathway protein H  YP_001763378  normal  0.692629  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0077  CDS  NC_010508  89117  89569  453  general secretion pathway protein G  YP_001763379  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0078  CDS  NC_010508  89745  90155  411  hypothetical protein  YP_001763380  normal  0.875923  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0079  CDS  NC_010508  90193  91410  1218  general secretion pathway protein F  YP_001763381  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0080  CDS  NC_010508  91415  92914  1500  general secretory pathway protein E  YP_001763382  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0081  CDS  NC_010508  92911  95253  2343  general secretion pathway protein D  YP_001763383  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0082  CDS  NC_010508  95622  96107  486  lytic transglycosylase catalytic  YP_001763384  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0083  CDS  NC_010508  96261  97574  1314  cobalamin synthesis protein P47K  YP_001763385  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0084  CDS  NC_010508  97703  97981  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001763386  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0085  CDS  NC_010508  98370  100301  1932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  YP_001763387  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0086  CDS  NC_010508  100973  102187  1215  sodium/hydrogen exchanger  YP_001763388  normal  0.12771  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0087  CDS  NC_010508  102202  103317  1116  carboxylate-amine ligase  YP_001763389  normal  0.457524  normal  0.765551  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0088  CDS  NC_010508  103822  104460  639  MarR family transcriptional regulator  YP_001763390  normal  normal  0.519459  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0089  CDS  NC_010508  104489  105199  711  glutamine amidotransferase  YP_001763391  normal  normal  0.697232  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0090  CDS  NC_010508  105428  106540  1113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001763392  normal  normal  0.552825  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0091  CDS  NC_010508  106718  107248  531  nuclear protein SET  YP_001763393  normal  normal  0.354373  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0092  CDS  NC_010508  107402  108886  1485  histidine kinase  YP_001763394  normal  normal  0.438311  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0093  CDS  NC_010508  109008  109700  693  two component transcriptional regulator  YP_001763395  normal  normal  0.51453  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0094  CDS  NC_010508  109823  110053  231  hypothetical protein  YP_001763396  normal  normal  0.628035  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0095  CDS  NC_010508  110153  110461  309  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_001763397  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0096  CDS  NC_010508  110603  111565  963  phenylalanine 4-monooxygenase  YP_001763398  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0097  CDS  NC_010508  111635  112120  486  AsnC family transcriptional regulator  YP_001763399  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0098  CDS  NC_010508  112187  112720  534  adenylate cyclase  YP_001763400  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0099  CDS  NC_010508  112924  113862  939  LysR family transcriptional regulator  YP_001763401  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0100  CDS  NC_010508  114101  115786  1686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_001763402  normal  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>