1752 genes were found for organism Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 18    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mevan_0001  CDS  NC_009634  5036  5551  516  flavin reductase domain-containing protein  YP_001322528  normal  0.117623  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0002  CDS  NC_009634  5608  6180  573  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  YP_001322529  normal  0.0478932  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0003  CDS  NC_009634  6323  7189  867  hypothetical protein  YP_001322530  normal  0.0184186  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0004  CDS  NC_009634  7243  8121  879  diaminopimelate epimerase  YP_001322531  normal  0.0554484  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0005  CDS  NC_009634  8346  8600  255  PRC-barrel domain-containing protein  YP_001322532  normal  0.164752  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0006  CDS  NC_009634  8601  9206  606  5'-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  YP_001322533  normal  0.318315  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0007  CDS  NC_009634  9339  10049  711  hypothetical protein  YP_001322534  normal  0.121063  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0008  CDS  NC_009634  10071  10448  378  hypothetical protein  YP_001322535  normal  0.318029  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0009  CDS  NC_009634  10569  10760  192  4-oxalocrotonate tautomerase  YP_001322536  normal  0.235995  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0010  CDS  NC_009634  10868  11452  585  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001322537  normal  0.21951  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0011  CDS  NC_009634  11535  11963  429  hypothetical protein  YP_001322538  normal  0.937117  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0012  CDS  NC_009634  11997  12476  480  SNARE associated Golgi protein  YP_001322539  normal  0.566831  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0013  CDS  NC_009634  12483  12866  384  signal transduction protein  YP_001322540  normal  0.636073  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0014  CDS  NC_009634  13034  13426  393  transcriptional regulator, TrmB  YP_001322541  normal  0.682046  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0015  CDS  NC_009634  13459  14406  948  ribonuclease Z  YP_001322542  normal  0.134703  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0016  CDS  NC_009634  14519  15088  570  hypothetical protein  YP_001322543  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0017  CDS  NC_009634  15172  16179  1008  selenophosphate synthetase  YP_001322544  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0018  CDS  NC_009634  16480  16716  237  hypothetical protein  YP_001322545  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0019  CDS  NC_009634  16774  17169  396  hypothetical protein  YP_001322546  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0020  CDS  NC_009634  17233  18276  1044  small GTP-binding protein  YP_001322547  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0021  CDS  NC_009634  18341  19012  672  rhodanese domain-containing protein  YP_001322548  normal  0.45235  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0022  CDS  NC_009634  19028  19687  660  ATP/GTP-binding motif-containing protein  YP_001322549  normal  0.450925  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0023  CDS  NC_009634  19823  21049  1227  bifunctional ornithine acetyltransferase/N-acetylglutamate synthase protein  YP_001322550  normal  0.450244  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0024  CDS  NC_009634  21153  22442  1290  polysaccharide biosynthesis protein  YP_001322551  normal  0.014677  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0025  CDS  NC_009634  22511  23104  594  TPR repeat-containing protein  YP_001322552  normal  0.0226285  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0026  CDS  NC_009634  23135  23485  351  TPR repeat-containing protein  YP_001322553  normal  0.042859  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0027  CDS  NC_009634  23701  24633  933  GMP synthase subunit B  YP_001322554  normal  0.0586295  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0028  CDS  NC_009634  24675  26279  1605  CTP synthetase  YP_001322555  normal  0.23296  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0029  CDS  NC_009634  26578  27147  570  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  YP_001322556  normal  0.929727  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0030  CDS  NC_009634  27367  29622  2256  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001322557  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0031  CDS  NC_009634  29960  30598  639  cobalt transport protein CbiM  YP_001322558  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0032  CDS  NC_009634  30591  30917  327  cobalt transport protein CbiN  YP_001322559  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0033  CDS  NC_009634  31061  31363  303  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  YP_001322560  normal  0.412966  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0034  CDS  NC_009634  31494  32258  765  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  YP_001322561  normal  0.0846524  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0035  CDS  NC_009634  32447  33655  1209  TPR repeat-containing protein  YP_001322562  normal  0.446314  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0036  CDS  NC_009634  33762  34259  498  hypothetical protein  YP_001322563  normal  0.474218  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0037  CDS  NC_009634  34295  35260  966  hypothetical protein  YP_001322564  normal  0.260176  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0038  CDS  NC_009634  35283  36164  882  AIR synthase related protein  YP_001322565  normal  0.0184186  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0039  CDS  NC_009634  36414  36800  387  hypothetical protein  YP_001322566  normal  0.178978  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0040  CDS  NC_009634  36893  37906  1014  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  YP_001322567  normal  0.101406  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0041  CDS  NC_009634  38064  39608  1545  seryl-tRNA synthetase  YP_001322568  normal  0.481913  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0042  CDS  NC_009634  39884  40276  393  ribonuclease P-related  YP_001322569  normal  0.300402  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0043  CDS  NC_009634  40314  41207  894  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  YP_001322570  normal  0.541216  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0044  CDS  NC_009634  41250  42305  1056  FO synthase subunit 1  YP_001322571  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0045  CDS  NC_009634  42322  43920  1599  S-layer protein  YP_001322572  normal  0.198912  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0046  CDS  NC_009634  44104  44955  852  methyltransferase type 12  YP_001322573  normal  0.165361  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0047  CDS  NC_009634  44993  46513  1521  TPR repeat-containing protein  YP_001322574  normal  0.0614925  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0048  CDS  NC_009634  46591  47505  915  porphobilinogen deaminase  YP_001322575  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0049  CDS  NC_009634  47712  48905  1194  hypothetical protein  YP_001322576  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0050    NC_009634  48973  49454  482      normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0051  CDS  NC_009634  49601  50041  441  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_001322577  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0052  CDS  NC_009634  50483  51652  1170  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  YP_001322578  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0053  CDS  NC_009634  51668  52501  834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001322579  normal  0.316827  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0054  CDS  NC_009634  52556  53440  885  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_001322580  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0055  CDS  NC_009634  53555  54958  1404  aminotransferase class-III  YP_001322581  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0056  CDS  NC_009634  55010  56176  1167  sodium/hydrogen exchanger  YP_001322582  normal  0.0601402  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0057  CDS  NC_009634  56186  56662  477  signal transduction protein  YP_001322583  normal  0.0922375  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0058  CDS  NC_009634  56858  57178  321  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  YP_001322584  normal  0.0199747  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0059  CDS  NC_009634  57144  58520  1377  nitrogenase  YP_001322585  normal  0.148206  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0060  CDS  NC_009634  58530  59960  1431  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  YP_001322586  normal  0.477113  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0061  CDS  NC_009634  59986  61374  1389  nitrogenase  YP_001322587  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0062  CDS  NC_009634  61371  62798  1428  nitrogenase alpha chain  YP_001322588  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0063  CDS  NC_009634  62898  63263  366  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001322589  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0064  CDS  NC_009634  63272  63589  318  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001322590  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0065  CDS  NC_009634  63631  64458  828  nitrogenase reductase  YP_001322591  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0066  CDS  NC_009634  64726  65202  477  hypothetical protein  YP_001322592  normal  0.905175  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0067  CDS  NC_009634  65270  66574  1305  molybdopterin oxidoreductase  YP_001322593  normal  0.589018  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0068  CDS  NC_009634  66630  68594  1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001322594  normal  0.829089  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0069  CDS  NC_009634  68684  69877  1194  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001322595  normal  0.416863  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0070  CDS  NC_009634  69886  71301  1416  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_001322596  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0071  CDS  NC_009634  71323  72225  903  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  YP_001322597  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0072  CDS  NC_009634  72243  72665  423  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  YP_001322598  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0073  CDS  NC_009634  73023  74255  1233  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_001322599  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0074  CDS  NC_009634  74266  74766  501  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  YP_001322600  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0075  CDS  NC_009634  74777  75505  729  coenzyme F420 hydrogenase  YP_001322601  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0076  CDS  NC_009634  75527  76375  849  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  YP_001322602  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0077  CDS  NC_009634  76468  76950  483  flavodoxin-like protein  YP_001322603  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0078  CDS  NC_009634  77008  77439  432  hypothetical protein  YP_001322604  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0079  CDS  NC_009634  77604  79166  1563  type I restriction-modification system, M subunit  YP_001322605  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0080  CDS  NC_009634  79169  80347  1179  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_001322606  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0081  CDS  NC_009634  80350  81807  1458  putative transcriptional regulator  YP_001322607  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0082  CDS  NC_009634  81811  84855  3045  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  YP_001322608  normal  0.0348133  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0083  CDS  NC_009634  85039  85266  228  seryl-tRNA synthetase-like protein  YP_001322609  normal  0.116715  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0084  CDS  NC_009634  85261  85878  618  CRISPR-associated DNA-binding protein  YP_001322610  normal  0.0369746  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0085  CDS  NC_009634  86006  89056  3051  UvrD/REP helicase  YP_001322611  normal  0.60174  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0086  CDS  NC_009634  89088  89309  222  hypothetical protein  YP_001322612  normal  0.0363306  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0087  CDS  NC_009634  89363  94231  4869  superfamily I DNA/RNA helicase  YP_001322613  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0088  CDS  NC_009634  94332  94931  600  resolvase domain-containing protein  YP_001322614  normal  0.223955  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0089  CDS  NC_009634  95281  96447  1167  TPR repeat-containing protein  YP_001322615  normal  0.159552  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0090  CDS  NC_009634  97624  98421  798  hypothetical protein  YP_001322616  normal  0.739458  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0091  CDS  NC_009634  98439  101624  3186  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  YP_001322617  normal  0.387859  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0092  CDS  NC_009634  101618  102514  897  hypothetical protein  YP_001322618  normal  0.166149  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0093  CDS  NC_009634  102534  104255  1722  2-alkenal reductase  YP_001322619  decreased coverage  0.00453751  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0094  CDS  NC_009634  104352  104780  429  hypothetical protein  YP_001322620  normal  0.0941216  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0095  CDS  NC_009634  105487  106776  1290  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_001322621  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0096  CDS  NC_009634  107037  108308  1272  hypothetical protein  YP_001322622  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0097  CDS  NC_009634  108760  108915  156  hypothetical protein  YP_001322623  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0098  CDS  NC_009634  109263  109664  402  hypothetical protein  YP_001322624  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0099  CDS  NC_009634  109657  109953  297  hypothetical protein  YP_001322625  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Mevan_0100  CDS  NC_009634  110228  110533  306  hypothetical protein  YP_001322626  normal  n/a    Methanococcus vannielii SB  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 18    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>