2320 genes were found for organism Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
XfasM23_0001  CDS  NC_010577  25  1356  1332  chromosomal replication initiation protein  YP_001828733  normal  0.0269853  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0002  CDS  NC_010577  1638  2738  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_001828734  normal  0.0811992  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0003  CDS  NC_010577  3044  4138  1095  recombination protein F  YP_001828735  normal  0.26612  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0004  CDS  NC_010577  4467  4637  171  hypothetical protein  YP_001828736  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0005  CDS  NC_010577  4634  7078  2445  DNA gyrase subunit B  YP_001828737  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0006  CDS  NC_010577  7123  7953  831  abortive infection protein  YP_001828738  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0007  CDS  NC_010577  8018  8833  816  peptidase M48 Ste24p  YP_001828739  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0008  CDS  NC_010577  8937  10130  1194  TPR repeat-containing protein  YP_001828740  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0009  CDS  NC_010577  10574  11239  666  TonB family protein  YP_001828741  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0010  CDS  NC_010577  11335  12099  765  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_001828742  normal  0.686858  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0011  CDS  NC_010577  12156  12566  411  biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_001828743  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0012  CDS  NC_010577  12573  12983  411  biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_001828744  normal  0.511922  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0013  CDS  NC_010577  13701  16088  2388  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  YP_001828745  normal  0.439144  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0014  CDS  NC_010577  16143  16685  543  hypothetical protein  YP_001828746  normal  0.482383  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0015  CDS  NC_010577  16837  17832  996  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001828747  normal  0.91658  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0016  CDS  NC_010577  20736  20909  174  hypothetical protein  YP_001828748  normal  0.864646  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0017  CDS  NC_010577  21500  22594  1095  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_001828749  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0018  CDS  NC_010577  23221  23409  189  hypothetical protein  YP_001828750  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0019  CDS  NC_010577  23753  24328  576  pre-pilin like leader sequence  YP_001828751  normal  0.808404  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0020  CDS  NC_010577  24338  24817  480  type IV pilus modification protein PilV  YP_001828752  normal  0.908433  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0021  CDS  NC_010577  24814  25764  951  hypothetical protein  YP_001828753  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0022  CDS  NC_010577  25761  26348  588  PilX protein  YP_001828754  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0023  CDS  NC_010577  26372  30016  3645  pilus tip-associated protein  YP_001828755  normal  0.639019  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0024  CDS  NC_010577  30019  30438  420  PilE protein  YP_001828756  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0025  CDS  NC_010577  30869  31603  735  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001828757  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0026  CDS  NC_010577  32727  33929  1203  aromatic amino acid aminotransferase  YP_001828758  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0027  CDS  NC_010577  34813  35217  405  large-conductance mechanosensitive channel  YP_001828759  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0028  CDS  NC_010577  36187  37446  1260  hypothetical protein  YP_001828760  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0029  CDS  NC_010577  37629  38510  882  hypothetical protein  YP_001828761  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0030  CDS  NC_010577  39107  39646  540  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001828762  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0031  CDS  NC_010577  39714  43301  3588  transcription-repair coupling factor  YP_001828763  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0032  CDS  NC_010577  43923  44369  447  3-dehydroquinate dehydratase  YP_001828764  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0033  CDS  NC_010577  44432  44917  486  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  YP_001828765  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0034  CDS  NC_010577  44975  46342  1368  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  YP_001828766  normal  0.71768  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0035  CDS  NC_010577  46520  48691  2172  DNA-dependent helicase II  YP_001828767  normal  0.193678  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0036  CDS  NC_010577  49987  51180  1194  nitric oxide dioxygenase  YP_001828768  normal  0.0192544  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0037  CDS  NC_010577  53017  53292  276  hypothetical protein  YP_001828769  normal  0.0304972  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0038  CDS  NC_010577  53289  54071  783  pyridoxine 5'-phosphate synthase  YP_001828770  normal  0.0740712  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0039  CDS  NC_010577  54566  55600  1035  parB-like partition protein  YP_001828771  normal  0.103386  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0040  CDS  NC_010577  56714  57439  726  competence protein F  YP_001828772  normal  0.648348  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0041  CDS  NC_010577  57489  58514  1026  biotin synthase  YP_001828773  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0042  CDS  NC_010577  58909  59949  1041  patatin  YP_001828774  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0043  CDS  NC_010577  60367  60609  243  hypothetical protein  YP_001828775  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0044  CDS  NC_010577  60725  61624  900  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  YP_001828776  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0045  CDS  NC_010577  71119  71934  816  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001828777  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0046  CDS  NC_010577  72071  72862  792  cytochrome c assembly protein  YP_001828778  normal  0.975637  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0047  CDS  NC_010577  73003  74370  1368  signal recognition particle protein  YP_001828779  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0048  CDS  NC_010577  74694  75065  372  hypothetical protein  YP_001828780  normal  0.842818  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0049  CDS  NC_010577  75108  75905  798  hypothetical protein  YP_001828781  normal  0.732388  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0050  CDS  NC_010577  76217  77281  1065  fimbrial protein  YP_001828782  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0051    NC_010577  77851  78825  975      normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0052  CDS  NC_010577  78879  81584  2706  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  YP_001828783  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0053  CDS  NC_010577  81611  82411  801  Pili assembly chaperone, N-terminal  YP_001828784  normal  0.541811  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0054  CDS  NC_010577  82483  83037  555  fimbrial protein  YP_001828785  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0055  CDS  NC_010577  84645  85133  489  CinA domain-containing protein  YP_001828786  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0056  CDS  NC_010577  85213  86520  1308  major facilitator transporter  YP_001828787  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0057  CDS  NC_010577  86569  87921  1353  GTP-binding proten HflX  YP_001828788  normal  0.583436  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0058  CDS  NC_010577  87936  88214  279  RNA-binding protein Hfq  YP_001828789  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0059  CDS  NC_010577  88318  89271  954  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_001828790  normal  0.392141  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0060  CDS  NC_010577  89271  90167  897  dihydropteroate synthase  YP_001828791  normal  0.404361  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0061  CDS  NC_010577  90268  90474  207  hypothetical protein  YP_001828792  normal  0.30008  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0062  CDS  NC_010577  90476  92413  1938  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_001828793  normal  0.107147  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0063  CDS  NC_010577  92460  93101  642  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  YP_001828794  normal  0.452145  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0064  CDS  NC_010577  93171  93476  306  hypothetical protein  YP_001828795  normal  0.618195  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0065  CDS  NC_010577  93495  93875  381  hypothetical protein  YP_001828796  normal  0.983005  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0066  CDS  NC_010577  94459  96291  1833  dihydroxy-acid dehydratase  YP_001828797  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0067  CDS  NC_010577  97194  97478  285  hypothetical protein  YP_001828798  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0068  CDS  NC_010577  97479  98609  1131  glycosyl transferase group 1  YP_001828799  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0069  CDS  NC_010577  98590  99921  1332  O-antigen polymerase  YP_001828800  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0070  CDS  NC_010577  100110  101030  921  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_001828801  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0071  CDS  NC_010577  101073  102419  1347  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase  YP_001828802  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0072  CDS  NC_010577  102803  104185  1383  Alpha-L-fucosidase  YP_001828803  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0073  CDS  NC_010577  104401  104661  261  30S ribosomal protein S16  YP_001828804  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0074  CDS  NC_010577  104705  105217  513  16S rRNA-processing protein RimM  YP_001828805  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0075  CDS  NC_010577  105327  106112  786  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001828806  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0076  CDS  NC_010577  106277  106687  411  50S ribosomal protein L19  YP_001828807  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0077  CDS  NC_010577  106708  106971  264  hypothetical protein  YP_001828808  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0078  CDS  NC_010577  107111  107890  780  methionine aminopeptidase  YP_001828809  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0079  CDS  NC_010577  108561  109463  903  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_001828810  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0080  CDS  NC_010577  109478  109834  357  arsenate reductase and related  YP_001828811  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0081  CDS  NC_010577  109990  111123  1134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_001828812  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0082  CDS  NC_010577  111525  113216  1692  asparagine synthetase B  YP_001828813  normal  0.645286  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0083  CDS  NC_010577  113274  114302  1029  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  YP_001828814  normal  0.0198036  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0084  CDS  NC_010577  115348  116379  1032  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_001828815  hitchhiker  0.00133989  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0085  CDS  NC_010577  116852  117487  636  LexA repressor  YP_001828816  hitchhiker  0.00110389  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0086  CDS  NC_010577  117669  118712  1044  recombinase A  YP_001828817  decreased coverage  1.39683e-07  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0087  CDS  NC_010577  119200  121854  2655  alanyl-tRNA synthetase  YP_001828818  decreased coverage  0.000138455  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0088  CDS  NC_010577  121993  122208  216  carbon storage regulator  YP_001828819  normal  0.0821619  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0089  CDS  NC_010577  123323  125347  2025  oligopeptidase A  YP_001828820  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0090  CDS  NC_010577  125407  126564  1158  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  YP_001828821  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0091  CDS  NC_010577  126867  127409  543  hypothetical protein  YP_001828822  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0092  CDS  NC_010577  127509  129329  1821  CopA family copper resistance protein  YP_001828823  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0093  CDS  NC_010577  129326  130270  945  copper resistance B precursor  YP_001828824  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0094  CDS  NC_010577  130527  133511  2985  valyl-tRNA synthetase  YP_001828825  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0095  CDS  NC_010577  133564  133758  195  hypothetical protein  YP_001828826  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0096  CDS  NC_010577  133821  134246  426  DNA polymerase III subunit chi  YP_001828827  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0097  CDS  NC_010577  134246  134677  432  hypothetical protein  YP_001828828  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0098  CDS  NC_010577  134692  136167  1476  leucyl aminopeptidase  YP_001828829  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0099  CDS  NC_010577  136277  137362  1086  permease YjgP/YjgQ family protein  YP_001828830  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
XfasM23_0100  CDS  NC_010577  137359  138465  1107  permease YjgP/YjgQ family protein  YP_001828831  normal  n/a    Xylella fastidiosa M23  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>