4596 genes were found for organism Shewanella baltica OS185



Page 1 of 46    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Shew185_0001  CDS  NC_009665  382  1770  1389  chromosomal replication initiation protein  YP_001364237  unclonable  5.62887e-10  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0002  CDS  NC_009665  1790  2890  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001364238  hitchhiker  1.03765e-10  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0003  CDS  NC_009665  3092  4174  1083  recombination protein F  YP_001364239  normal  0.0977543  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0004  CDS  NC_009665  4191  6608  2418  DNA gyrase, B subunit  YP_001364240  normal  0.986187  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0005  CDS  NC_009665  6694  7356  663  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001364241  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0006  CDS  NC_009665  7461  8381  921  urea amidolyase related protein  YP_001364242  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0007  CDS  NC_009665  8715  9755  1041  putative signal transduction protein  YP_001364243  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0008  CDS  NC_009665  9843  11912  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001364244  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0009  CDS  NC_009665  11923  12828  906  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_001364245  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0010  CDS  NC_009665  12946  13548  603  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001364246  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0011  CDS  NC_009665  13745  16933  3189  amidohydrolase  YP_001364247  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0012  CDS  NC_009665  17197  17643  447  hypothetical protein  YP_001364248  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0013  CDS  NC_009665  17691  17936  246  sulfur transfer protein SirA  YP_001364249  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0014  CDS  NC_009665  18106  19269  1164  diguanylate cyclase  YP_001364250  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0015  CDS  NC_009665  19512  20675  1164  3-ketoacyl-CoA thiolase  YP_001364251  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0016  CDS  NC_009665  20698  22848  2151  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  YP_001364252  normal  0.283529  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0017  CDS  NC_009665  23339  24661  1323  proline dipeptidase  YP_001364253  normal  0.173112  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0018  CDS  NC_009665  24689  25303  615  hypothetical protein  YP_001364254  normal  0.919089  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0019  CDS  NC_009665  25381  26838  1458  TrkH family potassium uptake protein  YP_001364255  normal  0.195703  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0020  CDS  NC_009665  26841  27365  525  protoporphyrinogen oxidase  YP_001364256  hitchhiker  0.000993803  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0021  CDS  NC_009665  27429  27737  309  regulatory protein ArsR  YP_001364257  decreased coverage  0.00282375  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0022  CDS  NC_009665  27938  28489  552  protoporphyrinogen oxidase  YP_001364258  normal  0.0671098  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0023  CDS  NC_009665  28560  30002  1443  TrkH family potassium uptake protein  YP_001364259  normal  0.991161  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0024  CDS  NC_009665  30023  31432  1410  potassium transporter peripheral membrane component  YP_001364260  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0025  CDS  NC_009665  31448  32734  1287  sun protein  YP_001364261  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0026  CDS  NC_009665  32736  33692  957  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_001364262  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0027  CDS  NC_009665  33701  34213  513  peptide deformylase  YP_001364263  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0028  CDS  NC_009665  34339  35469  1131  peptidoglycan-binding LysM  YP_001364264  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0029  CDS  NC_009665  35553  36569  1017  DNA protecting protein DprA  YP_001364265  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0030  CDS  NC_009665  36572  37045  474  hypothetical protein  YP_001364266  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0031  CDS  NC_009665  37159  37728  570  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  YP_001364267  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0032  CDS  NC_009665  37855  38421  567  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001364268  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0033  CDS  NC_009665  38447  39355  909  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001364269  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0034  CDS  NC_009665  39390  39824  435  globin  YP_001364270  normal  0.674256  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0035  CDS  NC_009665  39977  40825  849  shikimate 5-dehydrogenase  YP_001364271  normal  0.265435  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0036  CDS  NC_009665  40831  41106  276  hypothetical protein  YP_001364272  hitchhiker  0.0051156  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0037  CDS  NC_009665  41241  41789  549  carbonic anhydrase  YP_001364273  hitchhiker  1.98121e-08  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0038  CDS  NC_009665  47947  48201  255  hypothetical protein  YP_001364274  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0039  CDS  NC_009665  48224  48679  456  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001364275  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0040  CDS  NC_009665  48654  49409  756  protein of unknown function DUF610 YibQ  YP_001364276  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0041  CDS  NC_009665  49422  50627  1206  carboxyl-terminal protease  YP_001364277  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0042  CDS  NC_009665  50660  51748  1089  peptidase M23B  YP_001364278  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0043  CDS  NC_009665  51804  53348  1545  phosphoglyceromutase  YP_001364279  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0044  CDS  NC_009665  53601  54050  450  rhodanese domain-containing protein  YP_001364280  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0045  CDS  NC_009665  54346  54831  486  preprotein translocase subunit SecB  YP_001364281  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0046  CDS  NC_009665  54836  55852  1017  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_001364282  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0047  CDS  NC_009665  56038  57222  1185  hypothetical protein  YP_001364283  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0048  CDS  NC_009665  57335  59305  1971  putative transcriptional regulator  YP_001364284  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0049  CDS  NC_009665  59927  61288  1362  TrkH family potassium uptake protein  YP_001364285  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0050  CDS  NC_009665  61290  61988  699  TrkA domain-containing protein  YP_001364286  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0051  CDS  NC_009665  62033  62722  690  two component transcriptional regulator  YP_001364287  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0052  CDS  NC_009665  62723  63769  1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001364288  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0053  CDS  NC_009665  64040  64963  924  pirin domain-containing protein  YP_001364289  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0054  CDS  NC_009665  65350  67023  1674  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_001364290  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0055  CDS  NC_009665  67017  67748  732  LytTR family two component transcriptional regulator  YP_001364291  normal  0.868518  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0056  CDS  NC_009665  67855  69099  1245  major facilitator transporter  YP_001364292  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0057  CDS  NC_009665  69234  69971  738  hypothetical protein  YP_001364293  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0058  CDS  NC_009665  70078  70572  495  NLP/P60 protein  YP_001364294  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0059  CDS  NC_009665  70631  72094  1464  major facilitator transporter  YP_001364295  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0060  CDS  NC_009665  72187  73218  1032  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_001364296  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0061  CDS  NC_009665  73333  74811  1479  sucrose phosphorylase  YP_001364297  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0062  CDS  NC_009665  75073  76293  1221  major facilitator transporter  YP_001364298  normal  0.7183  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0063  CDS  NC_009665  76572  78968  2397  TonB-dependent receptor  YP_001364299  normal  0.0128619  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0064  CDS  NC_009665  79088  80047  960  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001364300  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0065  CDS  NC_009665  80302  80835  534  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_001364301  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0066  CDS  NC_009665  81044  86662  5619  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  YP_001364302  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0067  CDS  NC_009665  86659  88947  2289  penicillin-binding protein 1C  YP_001364303  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0068  CDS  NC_009665  88966  89217  252  hypothetical protein  YP_001364304  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0069  CDS  NC_009665  89325  90464  1140  transport protein, putative  YP_001364305  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0070  CDS  NC_009665  90559  91293  735  ABC transporter related  YP_001364306  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0071  CDS  NC_009665  91297  92913  1617  TAP domain-containing protein  YP_001364307  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0072  CDS  NC_009665  93007  93378  372  regulatory protein GntR HTH  YP_001364308  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0073  CDS  NC_009665  93432  94295  864  ABC transporter related  YP_001364309  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0074  CDS  NC_009665  94292  95602  1311  hypothetical protein  YP_001364310  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0075  CDS  NC_009665  95731  97536  1806  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001364311  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0076  CDS  NC_009665  97680  100130  2451  MORN repeat-containing protein  YP_001364312  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0077  CDS  NC_009665  100259  100669  411  thioesterase superfamily protein  YP_001364313  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0078  CDS  NC_009665  100793  101341  549  HPP family protein?  YP_001364314  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0079  CDS  NC_009665  101362  101625  264  hypothetical protein  YP_001364315  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0080  CDS  NC_009665  101688  102140  453  thioesterase superfamily protein  YP_001364316  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0081  CDS  NC_009665  102273  102668  396  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  YP_001364317  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0082  CDS  NC_009665  102672  103028  357  MerR family transcriptional regulator  YP_001364318  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0083  CDS  NC_009665  103222  103608  387  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001364319  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0084  CDS  NC_009665  103915  104997  1083  hypothetical protein  YP_001364320  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0085  CDS  NC_009665  105093  105773  681  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  YP_001364321  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0086  CDS  NC_009665  105935  107173  1239  hypothetical protein  YP_001364322  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0087  CDS  NC_009665  107377  107811  435  hypothetical protein  YP_001364323  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0088  CDS  NC_009665  107908  108921  1014  hypothetical protein  YP_001364324  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0089    NC_009665  109257  109424  168      normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0090  CDS  NC_009665  109437  111260  1824  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_001364325  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0091  CDS  NC_009665  111479  112096  618  FMN-binding negative transcriptional regulator  YP_001364326  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0092  CDS  NC_009665  112586  113332  747  hypothetical protein  YP_001364327  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0093  CDS  NC_009665  113890  114450  561  MarR family transcriptional regulator  YP_001364328  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0094  CDS  NC_009665  114443  115195  753  siderophore-interacting protein  YP_001364329  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0095  CDS  NC_009665  115313  116539  1227  imidazolonepropionase  YP_001364330  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0096  CDS  NC_009665  116773  117480  708  GntR family transcriptional regulator  YP_001364331  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0097  CDS  NC_009665  117636  119303  1668  urocanate hydratase  YP_001364332  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0098  CDS  NC_009665  119356  120897  1542  histidine ammonia-lyase  YP_001364333  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0099  CDS  NC_009665  121578  124592  3015  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  YP_001364334  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Shew185_0101  CDS  NC_009665  124595  125506  912  formate dehydrogenase, beta subunit  YP_001364335  normal  n/a    Shewanella baltica OS185  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 46    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>