5064 genes were found for organism Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Spro_0001  CDS  NC_009832  565  948  384  F0F1 ATP synthase subunit I  YP_001476239  hitchhiker  1.74013e-09  hitchhiker  0.0034501  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0002  CDS  NC_009832  969  1790  822  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_001476240  hitchhiker  7.55904e-07  hitchhiker  0.00410129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0003  CDS  NC_009832  1840  2079  240  F0F1 ATP synthase subunit C  YP_001476241  hitchhiker  0.000246194  hitchhiker  0.00331454  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0004  CDS  NC_009832  2137  2607  471  F0F1 ATP synthase subunit B  YP_001476242  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0005  CDS  NC_009832  2622  3155  534  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_001476243  hitchhiker  0.000453389  hitchhiker  0.00865282  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0006  CDS  NC_009832  3168  4709  1542  F0F1 ATP synthase subunit alpha  YP_001476244  hitchhiker  0.00898891  normal  0.0113321  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0007  CDS  NC_009832  4768  5631  864  F0F1 ATP synthase subunit gamma  YP_001476245  normal  0.180546  normal  0.0207901  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0008  CDS  NC_009832  5664  7046  1383  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_001476246  normal  0.366806  normal  0.022382  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0009  CDS  NC_009832  7067  7486  420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  YP_001476247  normal  0.31863  normal  0.0360831  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0010  CDS  NC_009832  7783  9153  1371  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  YP_001476248  normal  0.771465  normal  0.0459341  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0011  CDS  NC_009832  9365  11194  1830  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_001476249  normal  0.855162  normal  0.0514603  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0012  CDS  NC_009832  11524  12564  1041  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein PstS  YP_001476250  normal  0.265101  normal  0.0445722  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0013  CDS  NC_009832  12657  13613  957  phosphate transporter permease subunit PstC  YP_001476251  normal  0.468415  normal  0.0760881  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0014  CDS  NC_009832  13624  14505  882  phosphate transporter permease subunit PtsA  YP_001476252  normal  0.252026  normal  0.138563  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0015  CDS  NC_009832  14554  15330  777  phosphate transporter ATP-binding protein  YP_001476253  normal  0.426365  normal  0.139833  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0016  CDS  NC_009832  15342  16076  735  transcriptional regulator PhoU  YP_001476254  normal  0.417309  normal  0.132936  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0017  CDS  NC_009832  16245  17084  840  extracellular solute-binding protein  YP_001476255  normal  0.822209  normal  0.141798  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0018  CDS  NC_009832  17162  17875  714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001476256  normal  normal  0.219606  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0019  CDS  NC_009832  17877  18617  741  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001476257  normal  0.973133  normal  0.345394  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0020  CDS  NC_009832  18610  19275  666  6-phosphogluconate phosphatase  YP_001476258  normal  normal  0.334296  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0021  CDS  NC_009832  19501  20838  1338  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001476259  normal  normal  0.395104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0022  CDS  NC_009832  21100  22152  1053  hypothetical protein  YP_001476260  normal  normal  0.352802  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0023  CDS  NC_009832  22248  22814  567  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001476261  normal  normal  0.335563  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0024  CDS  NC_009832  22989  23714  726  hypothetical protein  YP_001476262  normal  normal  0.211359  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0025  CDS  NC_009832  23811  25124  1314  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  YP_001476263  normal  normal  0.227506  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0026  CDS  NC_009832  25247  26047  801  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001476264  normal  normal  0.21687  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0027  CDS  NC_009832  26077  27441  1365  tRNA modification GTPase TrmE  YP_001476265  normal  normal  0.151422  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0028  CDS  NC_009832  27544  29181  1638  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_001476266  normal  0.15409  normal  0.0935166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0029  CDS  NC_009832  29184  29441  258  hypothetical protein  YP_001476267  normal  0.0101085  normal  0.116893  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0030  CDS  NC_009832  29405  29764  360  ribonuclease P  YP_001476268  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0031  CDS  NC_009832  29783  29923  141  50S ribosomal protein L34  YP_001476269  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0032  CDS  NC_009832  30606  31997  1392  chromosomal replication initiation protein  YP_001476270  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0033  CDS  NC_009832  32002  33102  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_001476271  decreased coverage  2.34864e-08  normal  0.233091  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0034  CDS  NC_009832  33271  34356  1086  recombination protein F  YP_001476272  hitchhiker  9.27918e-06  normal  0.243305  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0035  CDS  NC_009832  34375  36789  2415  DNA gyrase subunit B  YP_001476273  normal  0.373833  normal  0.195519  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0036  CDS  NC_009832  36913  37728  816  sugar phosphatase  YP_001476274  normal  normal  0.148039  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0037  CDS  NC_009832  37845  38813  969  hypothetical protein  YP_001476275  normal  normal  0.24531  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0038  CDS  NC_009832  38810  39415  606  YheO domain-containing protein  YP_001476276  normal  normal  0.214034  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0039  CDS  NC_009832  39690  41006  1317  major facilitator transporter  YP_001476277  normal  normal  0.257163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0040  CDS  NC_009832  40999  41946  948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_001476278  normal  normal  0.136717  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0041  CDS  NC_009832  42130  42888  759  GntR domain-containing protein  YP_001476279  normal  normal  0.340559  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0042  CDS  NC_009832  42885  43778  894  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  YP_001476280  normal  normal  0.351596  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0043  CDS  NC_009832  43762  44379  618  2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase  YP_001476281  normal  normal  0.31961  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0044  CDS  NC_009832  44376  45524  1149  galactonate dehydratase  YP_001476282  normal  normal  0.360565  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0045  CDS  NC_009832  45743  47035  1293  d-galactonate transporter  YP_001476283  normal  normal  0.249209  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0046  CDS  NC_009832  47082  48362  1281  hypothetical protein  YP_001476284  normal  normal  0.379833  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0047  CDS  NC_009832  48397  48741  345  hypothetical protein  YP_001476285  normal  normal  0.320831  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0048  CDS  NC_009832  49046  49459  414  heat shock protein IbpA  YP_001476286  normal  normal  0.208212  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0049  CDS  NC_009832  49568  49996  429  heat shock chaperone IbpB  YP_001476287  normal  normal  0.206343  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0050  CDS  NC_009832  50164  51822  1659  hypothetical protein  YP_001476288  normal  normal  0.259185  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0051  CDS  NC_009832  51859  52239  381  PilT domain-containing protein  YP_001476289  normal  normal  0.330837  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0052  CDS  NC_009832  52239  52448  210  hypothetical protein  YP_001476290  normal  normal  0.215127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0053  CDS  NC_009832  52549  53871  1323  valine--pyruvate transaminase  YP_001476291  normal  normal  0.100706  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0054  CDS  NC_009832  53931  55997  2067  periplasmic alpha-amylase precursor  YP_001476292  normal  normal  0.308839  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0055  CDS  NC_009832  56186  56434  249  CopG family transcriptional regulator  YP_001476293  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0056  CDS  NC_009832  56424  56711  288  plasmid stabilization system protein  YP_001476294  normal  0.834491  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0057  CDS  NC_009832  56756  57733  978  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_001476295  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0058  CDS  NC_009832  57838  59106  1269  major facilitator transporter  YP_001476296  normal  0.788855  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0059  CDS  NC_009832  59204  60163  960  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001476297  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0060  CDS  NC_009832  60170  60922  753  xylose isomerase domain-containing protein  YP_001476298  normal  normal  0.994278  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0061  CDS  NC_009832  61106  62140  1035  LacI family transcription regulator  YP_001476299  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0062  CDS  NC_009832  62260  62922  663  putative outer membrane lipoprotein  YP_001476300  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0063  CDS  NC_009832  63191  63649  459  hypothetical protein  YP_001476301  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0064  CDS  NC_009832  63625  64188  564  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001476302  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0065  CDS  NC_009832  64387  66375  1989  outer membrane autotransporter  YP_001476303  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0066  CDS  NC_009832  67169  67915  747  LuxR family transcriptional regulator  YP_001476304  normal  0.961932  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0067  CDS  NC_009832  67874  68548  675  autoinducer synthesis protein  YP_001476305  normal  0.719257  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0068  CDS  NC_009832  68897  70240  1344  major facilitator transporter  YP_001476306  normal  0.274354  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0069  CDS  NC_009832  70502  71416  915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_001476307  normal  0.055597  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0070  CDS  NC_009832  71426  73495  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001476308  normal  0.118047  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0071  CDS  NC_009832  73841  74560  720  hypothetical protein  YP_001476309  normal  0.249103  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0072  CDS  NC_009832  75110  77029  1920  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  YP_001476310  normal  0.337525  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0073  CDS  NC_009832  77088  78239  1152  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  YP_001476311  normal  0.804562  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0074  CDS  NC_009832  78334  78885  552  mannitol repressor protein  YP_001476312  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0075  CDS  NC_009832  78882  79490  609  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001476313  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0076  CDS  NC_009832  79630  81096  1467  transcriptional regulator  YP_001476314  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0077  CDS  NC_009832  81118  81531  414  hypothetical protein  YP_001476315  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0078  CDS  NC_009832  81566  82345  780  methyltransferase type 11  YP_001476316  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0079  CDS  NC_009832  82460  83131  672  hypothetical protein  YP_001476317  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0080  CDS  NC_009832  83225  85153  1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001476318  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0081  CDS  NC_009832  85281  85901  621  superoxide dismutase  YP_001476319  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0082  CDS  NC_009832  86032  86868  837  formate dehydrogenase accessory protein  YP_001476320  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0083  CDS  NC_009832  87013  87600  588  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  YP_001476321  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0084  CDS  NC_009832  87649  90060  2412  formate dehydrogenase, alpha subunit  YP_001476322  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0085  CDS  NC_009832  90073  90972  900  formate dehydrogenase, beta subunit  YP_001476323  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0086  CDS  NC_009832  90969  91604  636  formate dehydrogenase-O subunit gamma  YP_001476324  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0087  CDS  NC_009832  91604  92533  930  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  YP_001476325  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0088  CDS  NC_009832  92673  93320  648  hypothetical protein  YP_001476326  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0089  CDS  NC_009832  93355  93960  606  putative glutathione S-transferase  YP_001476327  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0090  CDS  NC_009832  94027  95418  1392  selenocysteine synthase  YP_001476328  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0091  CDS  NC_009832  95415  97262  1848  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  YP_001476329  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0092  CDS  NC_009832  97654  98901  1248  major facilitator transporter  YP_001476330  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0093  CDS  NC_009832  99120  100112  993  hypothetical protein  YP_001476331  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0094  CDS  NC_009832  100107  101030  924  AraC family transcriptional regulator  YP_001476332  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0095  CDS  NC_009832  101033  101584  552  isochorismatase hydrolase  YP_001476333  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0096  CDS  NC_009832  101685  103079  1395  putative deaminase  YP_001476334  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0097  CDS  NC_009832  103226  104677  1452  xylulokinase  YP_001476335  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0098  CDS  NC_009832  104720  106039  1320  xylose isomerase  YP_001476336  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0099  CDS  NC_009832  106406  107401  996  D-xylose transporter subunit XylF  YP_001476337  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Spro_0100  CDS  NC_009832  107431  108972  1542  xylose transporter ATP-binding subunit  YP_001476338  normal  normal  Serratia proteamaculans 568  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>