81 genes were found for organism Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Glov_3646  CDS  NC_010815  1080  1697  -  618  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  YP_001953866  normal  0.427209  normal  0.259327  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3647  CDS  NC_010815  1679  2464  -  786  precorrin-6x reductase  YP_001953867  normal  1  normal  0.496702  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3648  CDS  NC_010815  2461  3129  -  669  precorrin-3B C17-methyltransferase  YP_001953868  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3649  CDS  NC_010815  3171  3950  -  780  cobalamin biosynthesis protein CbiG  YP_001953869  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3650  CDS  NC_010815  3947  4705  -  759  precorrin-4 C11-methyltransferase  YP_001953870  normal  0.796321  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3651  CDS  NC_010815  4702  5778  -  1077  cobalamin biosynthesis protein CbiD  YP_001953871  normal  1  normal  0.880674  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3652  CDS  NC_010815  5775  6512  -  738  precorrin-2 C20-methyltransferase  YP_001953872  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3653  CDS  NC_010815  6512  7297  -  786  anaerobic cobalt chelatase  YP_001953873  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3654  CDS  NC_010815  7294  7980  -  687  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  YP_001953874  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3655  CDS  NC_010815  7955  9397  -  1443  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001953875  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3656  CDS  NC_010815  9397  10809  -  1413  uroporphyrin-III C-methyltransferase  YP_001953876  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3657  CDS  NC_010815  10809  11669  -  861  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  YP_001953877  normal  0.910975  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3658  CDS  NC_010815  11666  12394  -  729  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  YP_001953878  normal  0.411896  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3659  CDS  NC_010815  12388  12720  -  333  cobalt transport protein CbiN  YP_001953879  normal  0.999431  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3660  CDS  NC_010815  12717  13394  -  678  cobalt transport protein CbiM  YP_001953880  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3661  CDS  NC_010815  14132  14359  -  228  hypothetical protein  YP_001953881  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3662    NC_010815  14491  14592  -  102      normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3663  CDS  NC_010815  14803  15834  -  1032  hypothetical protein  YP_001953882  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3664  CDS  NC_010815  15985  16272  +  288  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001953883  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3665  CDS  NC_010815  16241  17158  +  918  Integrase catalytic region  YP_001953884  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3666  CDS  NC_010815  17239  18567  -  1329  transposase IS4 family protein  YP_001953885  normal  0.850388  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3667  CDS  NC_010815  18773  20647  -  1875  TonB-dependent receptor plug  YP_001953886  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3668  CDS  NC_010815  20681  21415  -  735  TonB family protein  YP_001953887  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3669  CDS  NC_010815  21408  21791  -  384  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_001953888  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3670  CDS  NC_010815  21772  22206  -  435  tonB-system energizer ExbB  YP_001953889  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3671  CDS  NC_010815  22251  26351  -  4101  Cobaltochelatase  YP_001953890  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3672  CDS  NC_010815  26338  26676  -  339  hypothetical protein  YP_001953891  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3673  CDS  NC_010815  26663  27259  -  597  biopolymer transport protein-like protein  YP_001953892  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3674  CDS  NC_010815  27256  27957  -  702  hypothetical protein  YP_001953893  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3675  CDS  NC_010815  27969  30182  -  2214  TonB-dependent receptor  YP_001953894  normal  0.0831004  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3676  CDS  NC_010815  30753  31787  -  1035  O-methyltransferase family 2  YP_001953895  normal  0.410958  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3677  CDS  NC_010815  31795  33105  -  1311  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_001953896  normal  0.286824  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3678  CDS  NC_010815  33334  34386  -  1053  nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  YP_001953897  normal  0.830751  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3679  CDS  NC_010815  34843  37434  +  2592  cobyric acid synthase CobQ  YP_001953898  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3680  CDS  NC_010815  37482  37775  +  294  hypothetical protein  YP_001953899  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3681  CDS  NC_010815  38254  39366  -  1113  plasmid encoded RepA protein  YP_001953900  normal  0.936981  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3682  CDS  NC_010815  39370  39564  -  195  hypothetical protein  YP_001953901  normal  1  normal  0.92009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3683  CDS  NC_010815  39945  40367  -  423  hypothetical protein  YP_001953902  normal  0.538156  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3684  CDS  NC_010815  40357  41007  -  651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001953903  normal  0.444567  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3685  CDS  NC_010815  41196  41477  +  282  histone family protein DNA-binding protein  YP_001953904  normal  0.166156  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3686  CDS  NC_010815  41474  44230  +  2757  hypothetical protein  YP_001953905  normal  0.619967  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3687  CDS  NC_010815  44293  44532  +  240  transcriptional regulator, XRE family  YP_001953906  normal  1  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3688  CDS  NC_010815  44533  45744  +  1212  HipA N-terminal domain protein  YP_001953907  normal  0.649488  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3689  CDS  NC_010815  45856  46209  +  354  transcriptional regulator, XRE family  YP_001953908  normal  0.18369  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3690  CDS  NC_010815  46202  47446  +  1245  HipA domain protein  YP_001953909  normal  0.325167  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3691  CDS  NC_010815  47466  47720  +  255  WGR domain protein  YP_001953910  normal  0.476572  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3692  CDS  NC_010815  47717  48421  -  705  hypothetical protein  YP_001953911  normal  0.307019  normal  0.750452  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3693  CDS  NC_010815  48422  48931  -  510  hypothetical protein  YP_001953912  normal  0.477396  normal  0.419118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3694  CDS  NC_010815  48928  49152  -  225  hypothetical protein  YP_001953913  normal  0.265195  normal  0.864399  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3695  CDS  NC_010815  49597  50532  +  936  hypothetical protein  YP_001953914  normal  0.483298  normal  1  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3696  CDS  NC_010815  50550  51563  -  1014  integrase domain protein SAM domain protein  YP_001953915  normal  0.851802  normal  0.785312  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3697  CDS  NC_010815  51578  51808  -  231  hypothetical protein  YP_001953916  normal  0.681599  normal  0.682122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3698  CDS  NC_010815  52063  54987  +  2925  transposase Tn3 family protein  YP_001953917  normal  0.0861191  normal  0.131988  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3699    NC_010815  55012  55566  -  555      normal  0.295745  normal  0.227886  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3700  CDS  NC_010815  55533  56036  -  504  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001953918  normal  0.438401  normal  0.207291  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3701  CDS  NC_010815  56099  56554  -  456  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  YP_001953919  normal  0.716433  normal  0.202413  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3702  CDS  NC_010815  56587  56862  -  276  hypothetical protein  YP_001953920  normal  1  normal  0.201679  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3703  CDS  NC_010815  56920  57327  -  408  hypothetical protein  YP_001953921  normal  1  normal  0.204631  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3704  CDS  NC_010815  57571  58143  +  573  transcriptional regulator, TetR family  YP_001953922  normal  1  normal  0.21281  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3705  CDS  NC_010815  58213  58548  -  336  hypothetical protein  YP_001953923  normal  1  normal  0.195583  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3706  CDS  NC_010815  58837  59073  +  237  Hypothetical protein MTH865  YP_001953924  normal  1  normal  0.0789316  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3707  CDS  NC_010815  59272  59898  -  627  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001953925  normal  1  normal  0.0930977  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3708  CDS  NC_010815  60055  60453  -  399  tautomerase  YP_001953926  normal  1  normal  0.0855197  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3709  CDS  NC_010815  60516  61493  -  978  Integrase catalytic region  YP_001953927  normal  1  normal  0.108327  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3710  CDS  NC_010815  61609  62196  -  588  hypothetical protein  YP_001953928  normal  1  normal  0.0961165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3711  CDS  NC_010815  62229  62816  -  588  DSBA oxidoreductase  YP_001953929  normal  1  normal  0.0949861  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3712  CDS  NC_010815  62850  63584  -  735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001953930  normal  1  normal  0.0912876  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3713  CDS  NC_010815  63846  64154  +  309  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001953931  normal  1  normal  0.0736019  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3714  CDS  NC_010815  64151  65011  +  861  Integrase catalytic region  YP_001953932  normal  1  normal  0.0904484  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3715  CDS  NC_010815  65045  65806  -  762  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_001953933  normal  1  normal  0.0923789  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3716  CDS  NC_010815  65784  67355  -  1572  Integrase catalytic region  YP_001953934  normal  1  normal  0.124306  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3717  CDS  NC_010815  67609  68475  +  867  transcriptional regulator, LysR family  YP_001953935  normal  1  normal  0.168673  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3718  CDS  NC_010815  68479  69141  -  663  cob(I)alamin adenosyltransferase  YP_001953936  normal  0.78592  normal  0.171689  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3719  CDS  NC_010815  69174  70175  -  1002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  YP_001953937  normal  1  normal  0.267798  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3720  CDS  NC_010815  70194  72047  -  1854  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_001953938  normal  1  normal  0.596241  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3721  CDS  NC_010815  72223  73320  -  1098  Methionine synthase vitamin-B12 independent  YP_001953939  normal  0.0129115  normal  0.3687  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3722  CDS  NC_010815  73351  73641  -  291  hypothetical protein  YP_001953940  hitchhiker  0.00401371  normal  0.304189  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3723  CDS  NC_010815  73679  74680  -  1002  ribosome small subunit-dependent GTPase A  YP_001953941  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3724  CDS  NC_010815  74718  75359  -  642  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001953942  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3725  CDS  NC_010815  75494  76207  -  714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_001953943  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_3726  CDS  NC_010815  76204  76890  -  687  haloacid dehalogenase, type II  YP_001953944  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>