3780 genes were found for organism Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Glov_0001  CDS  NC_010814  261  1640  1380  chromosomal replication initiation protein  YP_001950260  decreased coverage  3.86226e-05  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0002  CDS  NC_010814  1870  2988  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001950261  unclonable  1.38199e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0003  CDS  NC_010814  2996  4102  1107  recombination protein F  YP_001950262  hitchhiker  0.00792918  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0004  CDS  NC_010814  4099  6507  2409  DNA gyrase, B subunit  YP_001950263  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0005  CDS  NC_010814  6869  7249  381  hypothetical protein  YP_001950264  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0006  CDS  NC_010814  7397  8479  1083  transposase IS4 family protein  YP_001950265  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0007  CDS  NC_010814  8837  9946  1110  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001950266  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0008    NC_010814  10298  10477  180      normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0009  CDS  NC_010814  10814  11815  1002  cell division protein FtsZ  YP_001950267  normal  0.428293  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0010  CDS  NC_010814  11831  12718  888  hypothetical protein  YP_001950268  normal  0.358836  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0011  CDS  NC_010814  12879  13751  873  hypothetical protein  YP_001950269  normal  0.125821  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0012  CDS  NC_010814  13873  15354  1482  hypothetical protein  YP_001950270  normal  0.140441  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0013  CDS  NC_010814  15388  16017  630  hypothetical protein  YP_001950271  hitchhiker  0.000991464  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0014  CDS  NC_010814  16041  16379  339  hypothetical protein  YP_001950272  hitchhiker  3.44022e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0015  CDS  NC_010814  16415  16651  237  hypothetical protein  YP_001950273  decreased coverage  2.46849e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0016  CDS  NC_010814  16986  18500  1515  Integrase catalytic region  YP_001950274  normal  0.0423553  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0017  CDS  NC_010814  18487  19224  738  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_001950275  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0018  CDS  NC_010814  19659  20486  828  Integrase catalytic region  YP_001950276  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0019  CDS  NC_010814  20483  20788  306  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001950277  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0020  CDS  NC_010814  20816  21214  399  hypothetical protein  YP_001950278  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0021  CDS  NC_010814  21281  22549  1269  beta-lactamase domain protein  YP_001950279  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0022  CDS  NC_010814  22581  23522  942  hypothetical protein  YP_001950280  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0023  CDS  NC_010814  23532  25043  1512  hypothetical protein  YP_001950281  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0024  CDS  NC_010814  25100  26092  993  transcriptional regulator-like protein  YP_001950282  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0025  CDS  NC_010814  26238  26609  372  hypothetical protein  YP_001950283  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0026  CDS  NC_010814  26716  27672  957  DnaB domain protein  YP_001950284  normal  0.114415  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0027  CDS  NC_010814  28298  30844  2547  DNA gyrase, A subunit  YP_001950285  unclonable  0.000124476  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0028  CDS  NC_010814  30849  32444  1596  hypothetical protein  YP_001950286  normal  0.288643  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0029  CDS  NC_010814  32441  33442  1002  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  YP_001950287  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0030  CDS  NC_010814  33660  34475  816  OmpA/MotB domain protein  YP_001950288  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0031  CDS  NC_010814  34487  35236  750  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_001950289  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0032  CDS  NC_010814  35240  35557  318  flagellar FlbD family protein  YP_001950290  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0033  CDS  NC_010814  35648  36745  1098  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  YP_001950291  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0034  CDS  NC_010814  36748  37260  513  type IV pilus assembly PilZ  YP_001950292  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0035  CDS  NC_010814  37416  37616  201  thiamine biosynthesis protein ThiS  YP_001950293  normal  0.91579  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0036  CDS  NC_010814  37620  38399  780  thiazole synthase  YP_001950294  normal  0.739485  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0037  CDS  NC_010814  38396  39016  621  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  YP_001950295  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0038  CDS  NC_010814  39136  40092  957  conserved hypothetical radical SAM protein  YP_001950296  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0039  CDS  NC_010814  40278  41126  849  hypothetical protein  YP_001950297  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0040  CDS  NC_010814  41186  42289  1104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_001950298  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0041  CDS  NC_010814  42391  42693  303  hypothetical protein  YP_001950299  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0042  CDS  NC_010814  42765  42956  192  hypothetical protein  YP_001950300  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0043  CDS  NC_010814  42982  45036  2055  TonB-dependent receptor  YP_001950301  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0044  CDS  NC_010814  45211  46083  873  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like protein  YP_001950302  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0045  CDS  NC_010814  46083  48077  1995  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_001950303  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0046  CDS  NC_010814  48074  48514  441  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_001950304  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0047  CDS  NC_010814  48520  48804  285  hypothetical protein  YP_001950305  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0048  CDS  NC_010814  48991  49605  615  protein tyrosine/serine phosphatase  YP_001950306  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0049  CDS  NC_010814  49624  50739  1116  metal dependent phosphohydrolase  YP_001950307  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0050  CDS  NC_010814  50925  51632  708  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_001950308  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0051  CDS  NC_010814  51629  52798  1170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001950309  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0052  CDS  NC_010814  52803  53312  510  hypothetical protein  YP_001950310  normal  0.255952  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0053  CDS  NC_010814  53394  54749  1356  MATE efflux family protein  YP_001950311  normal  0.39001  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0054  CDS  NC_010814  54819  57725  2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_001950312  normal  0.317983  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0055  CDS  NC_010814  57808  58305  498  hypothetical protein  YP_001950313  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0056  CDS  NC_010814  58353  59588  1236  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001950314  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0057  CDS  NC_010814  59588  60541  954  metal dependent phosphohydrolase  YP_001950315  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0058  CDS  NC_010814  60648  61232  585  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001950316  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0059  CDS  NC_010814  61396  61722  327  HicB family protein  YP_001950317  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0060  CDS  NC_010814  61719  61973  255  hypothetical protein  YP_001950318  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0061  CDS  NC_010814  62105  62902  798  hypothetical protein  YP_001950319  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0062  CDS  NC_010814  63332  65194  1863  Zn-dependent protease-like protein  YP_001950320  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0063  CDS  NC_010814  65197  66651  1455  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_001950321  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0064  CDS  NC_010814  66711  67340  630  transglutaminase domain protein  YP_001950322  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0065  CDS  NC_010814  67385  68578  1194  acetylornithine transaminase protein  YP_001950323  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0066  CDS  NC_010814  68932  70086  1155  hypothetical protein  YP_001950324  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0067  CDS  NC_010814  70176  70592  417  PilT protein domain protein  YP_001950325  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0068  CDS  NC_010814  70589  70834  246  hypothetical protein  YP_001950326  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0069  CDS  NC_010814  70932  72152  1221  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001950327  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0070  CDS  NC_010814  72284  73450  1167  5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide transformylase  YP_001950328  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0071  CDS  NC_010814  73462  74640  1179  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001950329  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0072  CDS  NC_010814  74731  75366  636  membrane protein-like protein  YP_001950330  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0073  CDS  NC_010814  75366  76067  702  hypothetical protein  YP_001950331  normal  0.46079  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0074  CDS  NC_010814  76093  76416  324  protein of unknown function DUF1634  YP_001950332  normal  0.5587  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0075  CDS  NC_010814  76413  77243  831  protein of unknown function DUF81  YP_001950333  normal  0.393989  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0076    NC_010814  77328  77471  144      normal  0.659327  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0077  CDS  NC_010814  77496  78407  912  cyclase family protein  YP_001950334  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0078  CDS  NC_010814  78461  79150  690  hypothetical protein  YP_001950335  normal  0.715697  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0079  CDS  NC_010814  79188  79958  771  hypothetical protein  YP_001950336  normal  0.990933  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0080  CDS  NC_010814  80162  80635  474  hypothetical protein  YP_001950337  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0081  CDS  NC_010814  80681  81406  726  PEGA domain protein  YP_001950338  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0082  CDS  NC_010814  81697  82773  1077  ribosome small subunit-dependent GTPase A  YP_001950339  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0083  CDS  NC_010814  82779  83261  483  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001950340  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0084  CDS  NC_010814  83264  83854  591  hypothetical protein  YP_001950341  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0085  CDS  NC_010814  83876  84586  711  Methyltransferase type 11  YP_001950342  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0086  CDS  NC_010814  84641  85255  615  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_001950343  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0087  CDS  NC_010814  85390  85854  465  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_001950344  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0088  CDS  NC_010814  85931  87439  1509  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  YP_001950345  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0089  CDS  NC_010814  87450  87740  291  YCII-related  YP_001950346  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0090  CDS  NC_010814  87813  88574  762  CoA-substrate-specific enzyme activase  YP_001950347  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0091  CDS  NC_010814  88577  89866  1290  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase D-component  YP_001950348  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0092  CDS  NC_010814  90119  90991  873  hypothetical protein  YP_001950349  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0093  CDS  NC_010814  91105  92319  1215  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_001950350  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0094  CDS  NC_010814  92490  93422  933  hypothetical protein  YP_001950351  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0095  CDS  NC_010814  93523  94710  1188  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001950352  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0096  CDS  NC_010814  94719  95726  1008  aldo/keto reductase  YP_001950353  normal  0.69349  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0097  CDS  NC_010814  95816  97621  1806  beta-lactamase  YP_001950354  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0098  CDS  NC_010814  97652  97960  309  hypothetical protein  YP_001950355  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0099  CDS  NC_010814  98082  98609  528  hypothetical protein  YP_001950356  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0100  CDS  NC_010814  98619  98831  213  transcriptional regulator, XRE family  YP_001950357  normal  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>