4438 genes were found for organism Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Spea_0001  CDS  NC_009901  223  1608  1386  chromosomal replication initiation protein  YP_001499865  unclonable  1.02323e-08  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0002  CDS  NC_009901  1628  2728  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001499866  unclonable  2.67756e-09  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0003  CDS  NC_009901  2849  3931  1083  recombination protein F  YP_001499867  normal  0.0130388  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0004  CDS  NC_009901  3924  6365  2442  DNA gyrase, B subunit  YP_001499868  normal  0.821769  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0005  CDS  NC_009901  6442  7506  1065  metal dependent phosphohydrolase  YP_001499869  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0006  CDS  NC_009901  7582  9651  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001499870  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0007  CDS  NC_009901  9663  10526  864  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_001499871  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0008  CDS  NC_009901  10686  11246  561  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001499872  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0009  CDS  NC_009901  11265  11930  666  hypothetical protein  YP_001499873  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0010  CDS  NC_009901  12160  15360  3201  amidohydrolase  YP_001499874  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0011  CDS  NC_009901  15705  16142  438  hypothetical protein  YP_001499875  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0012  CDS  NC_009901  16177  16422  246  sulfur transfer protein SirA  YP_001499876  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0013  CDS  NC_009901  16567  17037  471  ybaK/ebsC protein  YP_001499877  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0014  CDS  NC_009901  17096  17557  462  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001499878  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0015  CDS  NC_009901  17680  18432  753  integrase catalytic region  YP_001499879  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0016  CDS  NC_009901  18516  18914  399  transposase  YP_001499880  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0017  CDS  NC_009901  19009  20172  1164  3-ketoacyl-CoA thiolase  YP_001499881  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0018  CDS  NC_009901  20191  22344  2154  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  YP_001499882  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0019  CDS  NC_009901  22709  24031  1323  proline dipeptidase  YP_001499883  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0020  CDS  NC_009901  24050  24664  615  hypothetical protein  YP_001499884  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0021  CDS  NC_009901  24810  26267  1458  TrkH family potassium uptake protein  YP_001499885  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0022  CDS  NC_009901  26409  26936  528  protoporphyrinogen oxidase  YP_001499886  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0023  CDS  NC_009901  27037  27435  399  transposase  YP_001499887  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0024  CDS  NC_009901  27519  28271  753  integrase catalytic region  YP_001499888  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0025  CDS  NC_009901  28334  28639  306  ArsR family transcriptional regulator  YP_001499889  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0026  CDS  NC_009901  28851  29390  540  protoporphyrinogen oxidase  YP_001499890  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0027  CDS  NC_009901  29446  30888  1443  TrkH family potassium uptake protein  YP_001499891  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0028  CDS  NC_009901  30910  32319  1410  potassium transporter peripheral membrane component  YP_001499892  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0029  CDS  NC_009901  32327  33607  1281  sun protein  YP_001499893  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0030  CDS  NC_009901  33614  34579  966  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_001499894  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0031  CDS  NC_009901  34584  35183  600  peptide deformylase  YP_001499895  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0032  CDS  NC_009901  35245  36333  1089  peptidoglycan-binding LysM  YP_001499896  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0033  CDS  NC_009901  36489  37508  1020  DNA protecting protein DprA  YP_001499897  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0034  CDS  NC_009901  37511  37984  474  hypothetical protein  YP_001499898  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0035  CDS  NC_009901  38252  39811  1560  collagenase  YP_001499899  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0036  CDS  NC_009901  40012  40575  564  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  YP_001499900  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0037  CDS  NC_009901  40662  41225  564  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  YP_001499901  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0038  CDS  NC_009901  41250  42164  915  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001499902  normal  0.381478  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0039  CDS  NC_009901  42219  42653  435  globin  YP_001499903  normal  0.102658  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0040  CDS  NC_009901  42821  43636  816  shikimate 5-dehydrogenase  YP_001499904  normal  0.0102694  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0041  CDS  NC_009901  43660  43938  279  hypothetical protein  YP_001499905  hitchhiker  0.000318858  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0042  CDS  NC_009901  43968  44525  558  carbonic anhydrase  YP_001499906  hitchhiker  5.8127e-06  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0043  CDS  NC_009901  57162  59639  2478  hypothetical protein  YP_001499907  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0044  CDS  NC_009901  59713  59967  255  hypothetical protein  YP_001499908  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0045  CDS  NC_009901  59964  61265  1302  hypothetical protein  YP_001499909  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0046  CDS  NC_009901  61701  62882  1182  polysaccharide biosynthesis protein CapD  YP_001499910  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0047  CDS  NC_009901  62895  64055  1161  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  YP_001499911  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0048  CDS  NC_009901  64064  65242  1179  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  YP_001499912  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0049  CDS  NC_009901  65250  66323  1074  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  YP_001499913  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0050  CDS  NC_009901  66316  66960  645  sialic acid biosynthesis protein NeuD  YP_001499914  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0051  CDS  NC_009901  66980  68035  1056  nucleotidyl transferase  YP_001499915  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0052  CDS  NC_009901  68035  68727  693  acylneuraminate cytidylyltransferase  YP_001499916  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0053  CDS  NC_009901  68776  69063  288  hypothetical protein  YP_001499917  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0054  CDS  NC_009901  69114  69545  432  hypothetical protein  YP_001499918  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0055  CDS  NC_009901  69530  70540  1011  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001499919  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0056  CDS  NC_009901  70540  71397  858  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_001499920  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0057  CDS  NC_009901  71412  72134  723  flagellar biosynthesis sigma factor  YP_001499921  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0058  CDS  NC_009901  72146  72601  456  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_001499922  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0059  CDS  NC_009901  72616  73788  1173  flagellar hook-length control protein  YP_001499923  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0060  CDS  NC_009901  73781  74104  324  hypothetical protein  YP_001499924  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0061  CDS  NC_009901  74073  74453  381  flagellar protein FliS  YP_001499925  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0062  CDS  NC_009901  74467  75885  1419  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  YP_001499926  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0063  CDS  NC_009901  76202  77020  819  flagellin domain-containing protein  YP_001499927  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0064  CDS  NC_009901  77319  78350  1032  hypothetical protein  YP_001499928  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0065  CDS  NC_009901  78369  79286  918  flagellar hook-associated protein 3  YP_001499929  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0066  CDS  NC_009901  79297  80670  1374  flagellar hook-associated protein FlgK  YP_001499930  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0067  CDS  NC_009901  80721  81143  423  peptidoglycan hydrolase  YP_001499931  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0068  CDS  NC_009901  81143  82273  1131  flagellar basal body P-ring protein  YP_001499932  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0069  CDS  NC_009901  82311  82985  675  flagellar basal body L-ring protein  YP_001499933  normal  0.320449  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0070  CDS  NC_009901  83033  83818  786  flagellar basal-body rod protein FlgG  YP_001499934  normal  0.584028  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0071  CDS  NC_009901  83843  84568  726  flagellar basal-body rod protein FlgF  YP_001499935  normal  0.931219  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0072  CDS  NC_009901  84587  85795  1209  flagellar hook protein FlgE  YP_001499936  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0073  CDS  NC_009901  85819  86478  660  flagellar hook capping protein  YP_001499937  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0074  CDS  NC_009901  86478  86897  420  flagellar basal-body rod protein FlgC  YP_001499938  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0075  CDS  NC_009901  86906  87256  351  flagellar basal body rod protein FlgB  YP_001499939  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0076  CDS  NC_009901  87320  88084  765  SAF domain-containing protein  YP_001499940  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0077  CDS  NC_009901  88187  88471  285  hypothetical protein  YP_001499941  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0078  CDS  NC_009901  88464  88922  459  hypothetical protein  YP_001499942  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0079  CDS  NC_009901  88938  89351  414  hypothetical protein  YP_001499943  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0080  CDS  NC_009901  89366  90703  1338  FliI/YscN family ATPase  YP_001499944  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0081  CDS  NC_009901  90681  91436  756  flagellar assembly protein H  YP_001499945  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0082  CDS  NC_009901  91436  92449  1014  flagellar motor switch protein G  YP_001499946  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0083  CDS  NC_009901  92510  94210  1701  flagellar MS-ring protein  YP_001499947  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0084  CDS  NC_009901  94286  94624  339  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  YP_001499948  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0085  CDS  NC_009901  94655  95962  1308  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_001499949  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0086  CDS  NC_009901  95949  96860  912  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001499950  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0087  CDS  NC_009901  97405  98286  882  hypothetical protein  YP_001499951  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0088  CDS  NC_009901  98279  98635  357  flagellar motor switch protein FliN  YP_001499952  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0089  CDS  NC_009901  98638  99366  729  flagellar biosynthesis protein FliP  YP_001499953  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0090  CDS  NC_009901  99553  99822  270  flagellar biosynthetic protein FliQ  YP_001499954  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0091  CDS  NC_009901  99901  100680  780  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_001499955  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0092  CDS  NC_009901  100677  101807  1131  flagellar biosynthetic protein FlhB  YP_001499956  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0093  CDS  NC_009901  101823  103904  2082  flagellar biosynthesis protein FlhA  YP_001499957  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0094  CDS  NC_009901  103963  104937  975  alpha/beta hydrolase fold  YP_001499958  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0095  CDS  NC_009901  105266  107065  1800  hypothetical protein  YP_001499959  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0096  CDS  NC_009901  107416  108756  1341  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001499960  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0097  CDS  NC_009901  109044  109511  468  hypothetical protein  YP_001499961  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0098  CDS  NC_009901  109605  110141  537  hypothetical protein  YP_001499962  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0099  CDS  NC_009901  110195  110863  669  hypothetical protein  YP_001499963  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Spea_0100  CDS  NC_009901  111657  112277  621  cytochrome c class I  YP_001499964  normal  n/a    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>