6886 genes were found for organism Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 69    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BamMC406_0001  CDS  NC_010551  302  1879  1578  chromosomal replication initiation protein  YP_001806720  normal  0.470928  normal  0.147682  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0002  CDS  NC_010551  2048  3154  1107  DNA polymerase III subunit beta  YP_001806721  normal  0.011531  normal  0.38726  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0003  CDS  NC_010551  3361  5835  2475  DNA gyrase subunit B  YP_001806722  normal  0.180708  normal  0.538686  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0004    NC_010551  5908  6207  300      normal  0.237375  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0005  CDS  NC_010551  6695  8713  2019  hypothetical protein  YP_001806723  normal  0.509914  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0006  CDS  NC_010551  8737  10242  1506  cell divisionFtsK/SpoIIIE  YP_001806724  normal  0.168458  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0007  CDS  NC_010551  10239  11381  1143  AAA ATPase  YP_001806725  normal  0.711251  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0008  CDS  NC_010551  11374  12258  885  hypothetical protein  YP_001806726  normal  0.212334  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0009  CDS  NC_010551  12361  12747  387  DNA sulfur modification protein DndE  YP_001806727  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0010  CDS  NC_010551  12744  14726  1983  DNA sulfur modification protein DndD  YP_001806728  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0011  CDS  NC_010551  14731  16185  1455  hypothetical protein  YP_001806729  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0012  CDS  NC_010551  16182  17309  1128  hypothetical protein  YP_001806730  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0013  CDS  NC_010551  17851  18099  249  HSP20-like protein  YP_001806731  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0014  CDS  NC_010551  24061  24591  531  cytochrome B561  YP_001806732  hitchhiker  1.67547e-09  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0015  CDS  NC_010551  24591  25682  1092  catalase domain-containing protein  YP_001806733  hitchhiker  2.85009e-05  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0016  CDS  NC_010551  25840  26358  519  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001806734  hitchhiker  0.000257028  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0017  CDS  NC_010551  26355  27116  762  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_001806735  hitchhiker  0.00133889  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0018  CDS  NC_010551  27547  27870  324  hypothetical protein  YP_001806736  hitchhiker  0.00184687  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0019  CDS  NC_010551  28003  28443  441  hypothetical protein  YP_001806737  normal  0.0159325  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0020  CDS  NC_010551  29322  30203  882  RNA polymerase sigma factor SigJ  YP_001806738  normal  0.104667  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0021  CDS  NC_010551  30203  30679  477  alkylhydroperoxidase  YP_001806739  normal  0.106747  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0022  CDS  NC_010551  31254  32480  1227  hypothetical protein  YP_001806740  normal  0.45707  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0023  CDS  NC_010551  32464  33477  1014  hypothetical protein  YP_001806741  normal  0.361712  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0024  CDS  NC_010551  33758  34063  306  hypothetical protein  YP_001806742  normal  0.79005  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0025  CDS  NC_010551  34163  34315  153  hypothetical protein  YP_001806743  normal  0.246457  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0026  CDS  NC_010551  34710  34982  273  hypothetical protein  YP_001806744  normal  0.434634  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0027  CDS  NC_010551  34979  35275  297  hypothetical protein  YP_001806745  normal  0.360303  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0028  CDS  NC_010551  35356  38370  3015  type III restriction protein res subunit  YP_001806746  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0029  CDS  NC_010551  38370  40376  2007  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  YP_001806747  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0030  CDS  NC_010551  40761  41990  1230  outer membrane protein (porin)-like protein  YP_001806748  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0031  CDS  NC_010551  42173  42850  678  two component transcriptional regulator  YP_001806749  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0032  CDS  NC_010551  42863  44230  1368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001806750  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0033  CDS  NC_010551  44304  45152  849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001806751  normal  0.589022  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0034  CDS  NC_010551  45202  45999  798  ABC transporter related  YP_001806752  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0035  CDS  NC_010551  46121  47125  1005  NMT1/THI5-like domain-containing protein  YP_001806753  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0036  CDS  NC_010551  47269  48051  783  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_001806754  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0037  CDS  NC_010551  48080  48352  273  flagellar biosynthesis protein FliQ  YP_001806755  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0038  CDS  NC_010551  48369  49130  762  flagellar biosynthesis protein FliP  YP_001806756  normal  0.853389  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0039  CDS  NC_010551  49167  49727  561  flagellar biosynthesis protein FliO  YP_001806757  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0040  CDS  NC_010551  49724  50215  492  flagellar motor switch protein FliN  YP_001806758  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0041  CDS  NC_010551  50208  51206  999  flagellar motor switch protein FliM  YP_001806759  normal  0.215724  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0042  CDS  NC_010551  51229  51765  537  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_001806760  normal  0.200475  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0043  CDS  NC_010551  51937  52659  723  LrgB family protein  YP_001806761  normal  0.690541  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0044  CDS  NC_010551  52673  53149  477  LrgA family protein  YP_001806762  normal  0.8296  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0045  CDS  NC_010551  53290  54216  927  LysR family transcriptional regulator  YP_001806763  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0046  CDS  NC_010551  54338  55900  1563  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_001806764  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0047  CDS  NC_010551  56076  56564  489  MarR family transcriptional regulator  YP_001806765  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0048  CDS  NC_010551  56738  57022  285  hypothetical protein  YP_001806766  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0049  CDS  NC_010551  57302  58831  1530  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001806767  normal  0.963186  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0050  CDS  NC_010551  59075  59233  159  hypothetical protein  YP_001806768  normal  0.356965  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0051  CDS  NC_010551  59398  60186  789  hypothetical protein  YP_001806769  normal  0.356869  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0052  CDS  NC_010551  60218  60724  507  general secretion pathway M protein  YP_001806770  normal  0.563062  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0053  CDS  NC_010551  60721  62091  1371  general secretion pathway protein L  YP_001806771  normal  0.0324738  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0054  CDS  NC_010551  62116  63237  1122  general secretion pathway protein K  YP_001806772  normal  0.350854  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0055  CDS  NC_010551  63240  63914  675  putative general secretion pathway protein J  YP_001806773  normal  0.0954003  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0056  CDS  NC_010551  63922  64275  354  general secretion pathway protein I  YP_001806774  normal  0.216245  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0057  CDS  NC_010551  64326  64874  549  general secretion pathway protein H  YP_001806775  normal  0.12302  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0058  CDS  NC_010551  64918  65370  453  general secretion pathway protein G  YP_001806776  normal  0.663302  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0059  CDS  NC_010551  65548  65958  411  general secretion pathway protein C  YP_001806777  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0060  CDS  NC_010551  65989  67206  1218  general secretion pathway protein F  YP_001806778  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0061  CDS  NC_010551  67211  68710  1500  general secretory pathway protein E  YP_001806779  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0062  CDS  NC_010551  68707  71022  2316  general secretion pathway protein D  YP_001806780  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0063  CDS  NC_010551  71413  71862  450  lytic transglycosylase catalytic  YP_001806781  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0064  CDS  NC_010551  72049  73359  1311  cobalamin synthesis protein P47K  YP_001806782  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0065  CDS  NC_010551  73494  73772  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001806783  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0066  CDS  NC_010551  74163  76121  1959  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  YP_001806784  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0067  CDS  NC_010551  76797  78011  1215  sodium/hydrogen exchanger  YP_001806785  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0068  CDS  NC_010551  78026  79141  1116  carboxylate-amine ligase  YP_001806786  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0069  CDS  NC_010551  79647  80285  639  MarR family transcriptional regulator  YP_001806787  normal  0.373152  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0070  CDS  NC_010551  80314  81024  711  glutamine amidotransferase  YP_001806788  normal  0.200851  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0071  CDS  NC_010551  81240  82352  1113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001806789  normal  0.282645  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0072  CDS  NC_010551  82533  83069  537  nuclear protein SET  YP_001806790  normal  0.837528  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0073  CDS  NC_010551  83160  84644  1485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001806791  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0074  CDS  NC_010551  84761  85453  693  two component transcriptional regulator  YP_001806792  normal  0.948307  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0075  CDS  NC_010551  85576  85806  231  hypothetical protein  YP_001806793  normal  0.639778  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0076  CDS  NC_010551  85905  86213  309  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_001806794  normal  0.889998  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0077  CDS  NC_010551  86374  87300  927  phenylalanine 4-monooxygenase  YP_001806795  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0078  CDS  NC_010551  87407  87892  486  AsnC family transcriptional regulator  YP_001806796  normal  0.746042  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0079  CDS  NC_010551  87947  88480  534  adenylate cyclase  YP_001806797  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0080  CDS  NC_010551  88614  89417  804  hypothetical protein  YP_001806798  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0081  CDS  NC_010551  89417  90226  810  hypothetical protein  YP_001806799  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0082  CDS  NC_010551  90228  91229  1002  hypothetical protein  YP_001806800  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0083  CDS  NC_010551  91381  92280  900  LysR family transcriptional regulator  YP_001806801  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0084  CDS  NC_010551  92455  94140  1686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_001806802  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0085  CDS  NC_010551  94563  95342  780  ABC transporter related  YP_001806803  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0086  CDS  NC_010551  95339  96094  756  ABC transporter related  YP_001806804  normal  0.610645  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0087  CDS  NC_010551  96172  97371  1200  extracellular ligand-binding receptor  YP_001806805  normal  0.0356646  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0088  CDS  NC_010551  97491  98375  885  inner-membrane translocator  YP_001806806  normal  0.240945  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0089  CDS  NC_010551  98375  99349  975  inner-membrane translocator  YP_001806807  normal  normal  0.828472  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0090  CDS  NC_010551  100453  101610  1158  extracellular ligand-binding receptor  YP_001806808  normal  normal  0.230544  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0091  CDS  NC_010551  101812  102867  1056  inner-membrane translocator  YP_001806809  normal  normal  0.452731  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0092  CDS  NC_010551  102872  104656  1785  ABC transporter related  YP_001806810  normal  normal  0.500773  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0093  CDS  NC_010551  104656  105414  759  ABC transporter related  YP_001806811  normal  0.899173  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0094  CDS  NC_010551  105896  107866  1971  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_001806812  normal  normal  0.948234  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0095  CDS  NC_010551  107863  108549  687  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_001806813  normal  normal  0.706349  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0096  CDS  NC_010551  108601  109380  780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001806814  normal  0.560799  normal  0.715658  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0097  CDS  NC_010551  109412  110305  894  parB-like partition protein  YP_001806815  normal  0.328689  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0098  CDS  NC_010551  110316  111449  1134  citrate transporter  YP_001806816  normal  0.0442697  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0099  CDS  NC_010551  112020  112547  528  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  YP_001806817  decreased coverage  0.00813238  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_0100  CDS  NC_010551  112658  113506  849  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_001806818  normal  0.0156743  normal  0.745937  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 69    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>