168 genes were found for organism Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bphyt_7242  CDS  NC_010679  107  592  +  486  hypothetical protein  YP_001893457  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7243  CDS  NC_010679  605  2401  +  1797  hypothetical protein  YP_001893458  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7244  CDS  NC_010679  2404  3792  +  1389  hypothetical protein  YP_001893459  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7245  CDS  NC_010679  3801  4601  +  801  hypothetical protein  YP_001893460  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7246  CDS  NC_010679  4608  6626  +  2019  type II secretion system protein E  YP_001893461  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7247  CDS  NC_010679  6650  7768  +  1119  type II secretory pathway component PulF-like protein  YP_001893462  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7248  CDS  NC_010679  7782  8426  +  645  hypothetical protein  YP_001893463  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7249  CDS  NC_010679  8499  9779  +  1281  hypothetical protein  YP_001893464  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7250  CDS  NC_010679  10534  10998  +  465  histidine kinase  YP_001893465  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7251  CDS  NC_010679  11115  11516  +  402  response regulator receiver protein  YP_001893466  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7252  CDS  NC_010679  12038  12550  +  513  transcriptional regulator, MarR family  YP_001893467  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7253  CDS  NC_010679  12754  13758  -  1005  ferredoxin  YP_001893468  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7254  CDS  NC_010679  13772  15064  -  1293  Rieske (2Fe-2S) domain protein  YP_001893469  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7255  CDS  NC_010679  15070  16416  -  1347  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001893470  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7256    NC_010679  16784  16903  +  120      normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7257  CDS  NC_010679  17007  17534  -  528  transcriptional regulator, LysR family  YP_001893471  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7258  CDS  NC_010679  17590  17805  -  216  hypothetical protein  YP_001893472  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7259  CDS  NC_010679  17807  18664  -  858  AAA ATPase  YP_001893473  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7260  CDS  NC_010679  18661  20097  -  1437  Integrase catalytic region  YP_001893474  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7261  CDS  NC_010679  20196  20774  -  579  hypothetical protein  YP_001893475  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7262  CDS  NC_010679  20901  21293  -  393  NmrA family protein  YP_001893476  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7263  CDS  NC_010679  21599  22021  +  423  hypothetical protein  YP_001893477  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7264  CDS  NC_010679  22170  22385  -  216  hypothetical protein  YP_001893478  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7265  CDS  NC_010679  22472  22660  -  189  hypothetical protein  YP_001893479  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7266  CDS  NC_010679  22799  23167  -  369  response regulator receiver protein  YP_001893480  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7267  CDS  NC_010679  23629  24282  +  654  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_001893481  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7268  CDS  NC_010679  24367  24672  +  306  hypothetical protein  YP_001893482  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7269  CDS  NC_010679  24690  24863  -  174  hypothetical protein  YP_001893483  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7270  CDS  NC_010679  24937  25128  -  192  hypothetical protein  YP_001893484  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7271  CDS  NC_010679  25549  27171  +  1623  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001893485  normal  1  normal  0.839285  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7272  CDS  NC_010679  27216  27434  -  219  hypothetical protein  YP_001893486  normal  1  normal  0.440127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7273  CDS  NC_010679  27468  28610  -  1143  integrase family protein  YP_001893487  normal  0.488643  normal  0.163849  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7274  CDS  NC_010679  28641  28880  -  240  transcriptional regulator, XRE family  YP_001893488  normal  0.21577  normal  0.150525  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7275  CDS  NC_010679  29046  30161  -  1116  hypothetical protein  YP_001893489  hitchhiker  0.000693016  normal  0.0932533  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7276  CDS  NC_010679  30229  31026  -  798  hypothetical protein  YP_001893490  decreased coverage  0.0000010313  hitchhiker  0.00519152  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7277  CDS  NC_010679  31235  31435  -  201  putative transcriptional regulator, XRE family  YP_001893491  hitchhiker  0.0000471226  hitchhiker  0.00476067  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7278  CDS  NC_010679  31521  31730  -  210  hypothetical protein  YP_001893492  hitchhiker  0.0000557755  hitchhiker  0.00476067  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7279  CDS  NC_010679  31778  31987  -  210  hypothetical protein  YP_001893493  hitchhiker  0.0000638868  hitchhiker  0.00472264  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7280  CDS  NC_010679  32052  32171  -  120  hypothetical protein  YP_001893494  hitchhiker  0.0000467411  hitchhiker  0.00107265  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7281  CDS  NC_010679  32185  32595  -  411  hypothetical protein  YP_001893495  hitchhiker  0.0000198336  hitchhiker  0.00114861  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7282  CDS  NC_010679  32661  32903  -  243  hypothetical protein  YP_001893496  hitchhiker  0.0000121372  hitchhiker  0.00109156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7283  CDS  NC_010679  32914  33042  -  129  hypothetical protein  YP_001893497  hitchhiker  0.00000901525  hitchhiker  0.00104557  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7284  CDS  NC_010679  33055  33375  -  321  hypothetical protein  YP_001893498  hitchhiker  0.0000160557  hitchhiker  0.00108214  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7285  CDS  NC_010679  33439  33981  -  543  hypothetical protein  YP_001893499  hitchhiker  0.0000412361  hitchhiker  0.00116833  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7286  CDS  NC_010679  33974  34252  -  279  hypothetical protein  YP_001893500  hitchhiker  0.0000190105  hitchhiker  0.00103639  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7287  CDS  NC_010679  34290  34607  -  318  hypothetical protein  YP_001893501  hitchhiker  0.00000320254  hitchhiker  0.00103639  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7288  CDS  NC_010679  34722  35090  +  369  hypothetical protein  YP_001893502  hitchhiker  0.000000377814  hitchhiker  0.00109156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7289  CDS  NC_010679  35087  35560  +  474  hypothetical protein  YP_001893503  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.000171233  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7290  CDS  NC_010679  35605  36024  -  420  hypothetical protein  YP_001893504  hitchhiker  0.000000340263  hitchhiker  0.000171233  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7291  CDS  NC_010679  36028  36657  -  630  hypothetical protein  YP_001893505  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7292  CDS  NC_010679  36654  36911  -  258  hypothetical protein  YP_001893506  hitchhiker  0.000000162261  hitchhiker  0.000163525  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7293  CDS  NC_010679  36932  37393  -  462  hypothetical protein  YP_001893507  unclonable  0.0000000200713  hitchhiker  0.000172886  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7294  CDS  NC_010679  37402  37695  -  294  hypothetical protein  YP_001893508  unclonable  0.00000000759951  hitchhiker  0.000157514  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7295  CDS  NC_010679  37705  38094  -  390  hypothetical protein  YP_001893509  unclonable  0.0000000112304  hitchhiker  0.000159012  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7296  CDS  NC_010679  38102  38296  -  195  hypothetical protein  YP_001893510  unclonable  0.00000000484371  hitchhiker  0.000151743  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7297  CDS  NC_010679  38296  38571  -  276  hypothetical protein  YP_001893511  unclonable  0.00000000730056  unclonable  0.0000118373  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7298  CDS  NC_010679  38866  40512  +  1647  DNA restriction methylase  YP_001893512  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7299  CDS  NC_010679  40568  40915  -  348  hypothetical protein  YP_001893513  hitchhiker  0.000561963  hitchhiker  0.000134495  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7300  CDS  NC_010679  40912  41403  -  492  hypothetical protein  YP_001893514  normal  0.057619  hitchhiker  0.00014354  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7301  CDS  NC_010679  41832  42038  +  207  hypothetical protein  YP_001893515  normal  0.244109  hitchhiker  0.000888754  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7302  CDS  NC_010679  42058  42396  +  339  hypothetical protein  YP_001893516  normal  0.44587  hitchhiker  0.000912101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7303  CDS  NC_010679  42411  42680  +  270  hypothetical protein  YP_001893517  normal  0.636128  hitchhiker  0.00092006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7304  CDS  NC_010679  42735  43067  +  333  hypothetical protein  YP_001893518  normal  0.922816  hitchhiker  0.000888754  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7305  CDS  NC_010679  43108  43332  +  225  hypothetical protein  YP_001893519  normal  0.586058  hitchhiker  0.00088106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7306  CDS  NC_010679  43776  44009  +  234  hypothetical protein  YP_001893520  normal  0.633889  hitchhiker  0.000781005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7307  CDS  NC_010679  44254  44436  +  183  hypothetical protein  YP_001893521  normal  0.617554  hitchhiker  0.000774231  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7308  CDS  NC_010679  44481  44810  +  330  hypothetical protein  YP_001893522  normal  0.766316  hitchhiker  0.00081588  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7309  CDS  NC_010679  44853  44996  +  144  hypothetical protein  YP_001893523  normal  0.60749  hitchhiker  0.000808923  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7310  CDS  NC_010679  45416  45631  +  216  hypothetical protein  YP_001893524  normal  0.645886  hitchhiker  0.000747385  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7311  CDS  NC_010679  45705  46664  +  960  hypothetical protein  YP_001893525  normal  0.408768  hitchhiker  0.000851428  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7312  CDS  NC_010679  46724  46978  +  255  hypothetical protein  YP_001893526  normal  0.225691  hitchhiker  0.000760745  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7313  CDS  NC_010679  47493  47726  +  234  hypothetical protein  YP_001893527  normal  0.0128632  hitchhiker  0.000794958  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7314  CDS  NC_010679  47732  47947  +  216  hypothetical protein  YP_001893528  hitchhiker  0.00557896  hitchhiker  0.000781005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7315  CDS  NC_010679  48026  48514  +  489  hypothetical protein  YP_001893529  hitchhiker  0.000000415544  hitchhiker  0.000801911  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7316  CDS  NC_010679  48825  49037  +  213  hypothetical protein  YP_001893530  decreased coverage  0.000000165392  hitchhiker  0.000754253  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7317  CDS  NC_010679  49030  49224  +  195  hypothetical protein  YP_001893531  decreased coverage  0.000000176776  hitchhiker  0.000760745  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7318  CDS  NC_010679  49262  49411  +  150  hypothetical protein  YP_001893532  decreased coverage  0.000000153258  hitchhiker  0.000747385  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7319  CDS  NC_010679  50077  50421  +  345  hypothetical protein  YP_001893533  hitchhiker  0.00000306208  hitchhiker  0.000697118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7320  CDS  NC_010679  50440  50697  +  258  hypothetical protein  YP_001893534  hitchhiker  0.0000150008  hitchhiker  0.000709591  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7321  CDS  NC_010679  50732  51109  +  378  hypothetical protein  YP_001893535  hitchhiker  0.0000234835  hitchhiker  0.000760745  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7322  CDS  NC_010679  51114  51710  +  597  hypothetical protein  YP_001893536  hitchhiker  0.0000508641  hitchhiker  0.000788064  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7323  CDS  NC_010679  52409  52783  +  375  protein of unknown function DUF932  YP_001893537  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7324  CDS  NC_010679  52823  54271  +  1449  integrase family protein  YP_001893538  normal  0.0744771  hitchhiker  0.000888754  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7325  CDS  NC_010679  54268  56151  +  1884  integrase family protein  YP_001893539  normal  1  hitchhiker  0.00394718  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7326  CDS  NC_010679  56148  58031  +  1884  integrase family protein  YP_001893540  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7327  CDS  NC_010679  58028  58390  +  363  hypothetical protein  YP_001893541  normal  0.59536  hitchhiker  0.00250275  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7328  CDS  NC_010679  58443  59036  +  594  protein of unknown function DUF932  YP_001893542  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7329  CDS  NC_010679  59088  59288  +  201  hypothetical protein  YP_001893543  normal  0.348978  hitchhiker  0.00920376  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7330  CDS  NC_010679  59266  59538  +  273  hypothetical protein  YP_001893544  normal  0.351581  hitchhiker  0.00934559  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7331  CDS  NC_010679  59528  59788  +  261  hypothetical protein  YP_001893545  normal  0.235192  hitchhiker  0.00948376  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7332  CDS  NC_010679  60480  60860  +  381  hypothetical protein  YP_001893546  normal  0.0595827  hitchhiker  0.00900243  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7333  CDS  NC_010679  60909  61121  +  213  hypothetical protein  YP_001893547  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7334  CDS  NC_010679  61140  61418  +  279  hypothetical protein  YP_001893548  hitchhiker  0.00848151  hitchhiker  0.00920376  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7335  CDS  NC_010679  61578  61940  +  363  hypothetical protein  YP_001893549  normal  0.0207898  hitchhiker  0.00941371  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7336  CDS  NC_010679  62061  62321  +  261  hypothetical protein  YP_001893550  normal  0.0176961  hitchhiker  0.00927512  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7337  CDS  NC_010679  62684  63091  -  408  hypothetical protein  YP_001893551  hitchhiker  0.00455905  hitchhiker  0.00941371  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7338  CDS  NC_010679  63088  63843  -  756  hypothetical protein  YP_001893552  hitchhiker  0.000613796  hitchhiker  0.00990107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7339  CDS  NC_010679  64283  64789  +  507  hypothetical protein  YP_001893553  decreased coverage  0.00000393644  normal  0.0259861  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7340  CDS  NC_010679  64812  65195  +  384  hypothetical protein  YP_001893554  hitchhiker  0.0030565  normal  0.025652  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_7341  CDS  NC_010679  65197  66885  +  1689  type IV secretion system protein VirD4  YP_001893555  normal  0.0552655  normal  0.0313402  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>