3267 genes were found for organism Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 33    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bphyt_3990  CDS  NC_010676  270  479  -  210  hypothetical protein  YP_001887746  normal  0.143163  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3991  CDS  NC_010676  663  947  -  285  hypothetical protein  YP_001887747  normal  0.451962  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3992  CDS  NC_010676  1036  1314  -  279  hypothetical protein  YP_001887748  normal  0.43481  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3993  CDS  NC_010676  1730  3865  +  2136  serine/threonine protein kinase  YP_001887749  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3994  CDS  NC_010676  3938  5911  -  1974  protein of unknown function DUF323  YP_001887750  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3995  CDS  NC_010676  6280  6783  +  504  hypothetical protein  YP_001887751  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3996  CDS  NC_010676  6831  7265  +  435  hypothetical protein  YP_001887752  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3997  CDS  NC_010676  7569  7850  +  282  hypothetical protein  YP_001887753  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3998  CDS  NC_010676  8076  9530  +  1455  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  YP_001887754  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_3999  CDS  NC_010676  9760  12342  +  2583  FHA domain containing protein  YP_001887755  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4000  CDS  NC_010676  12320  13693  +  1374  secretion protein HlyD family protein  YP_001887756  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4001  CDS  NC_010676  13731  14483  +  753  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001887757  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4002  CDS  NC_010676  14550  17606  +  3057  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  YP_001887758  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4003  CDS  NC_010676  17606  18961  +  1356  putative sigma54 specific transcriptional regulator  YP_001887759  normal  0.731384  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4004  CDS  NC_010676  18986  19756  -  771  protein serine/threonine phosphatase  YP_001887760  normal  0.467216  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4005  CDS  NC_010676  19762  20049  -  288  hypothetical protein  YP_001887761  normal  0.678721  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4006  CDS  NC_010676  20520  21017  +  498  hypothetical protein  YP_001887762  normal  0.848587  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4007  CDS  NC_010676  21085  21342  +  258  hypothetical protein  YP_001887763  normal  0.786723  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4008  CDS  NC_010676  21339  22217  -  879  transcriptional regulator, LysR family  YP_001887764  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4009  CDS  NC_010676  22318  23265  +  948  Beta-lactamase  YP_001887765  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4010  CDS  NC_010676  23311  23556  +  246  hypothetical protein  YP_001887766  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4011  CDS  NC_010676  23615  24631  -  1017  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  YP_001887767  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4012  CDS  NC_010676  24912  25676  +  765  transcriptional regulator, IclR family  YP_001887768  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4013  CDS  NC_010676  25706  26530  -  825  citrate synthase  YP_001887769  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4014  CDS  NC_010676  26533  27732  -  1200  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_001887770  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4015  CDS  NC_010676  27774  29207  -  1434  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001887771  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4016  CDS  NC_010676  29413  29763  -  351  response regulator receiver protein  YP_001887772  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4017  CDS  NC_010676  29770  31245  -  1476  Non-specific serine/threonine protein kinase  YP_001887773  normal  0.546145  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4018  CDS  NC_010676  31599  33332  -  1734  Feruloyl esterase  YP_001887774  hitchhiker  0.000882838  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4019  CDS  NC_010676  33343  34482  -  1140  porin Gram-negative type  YP_001887775  hitchhiker  0.00000808591  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4020  CDS  NC_010676  34544  35791  -  1248  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  YP_001887776  hitchhiker  0.00000164842  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4021  CDS  NC_010676  36123  36623  -  501  transcriptional regulator, MarR family  YP_001887777  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4022  CDS  NC_010676  36761  37588  +  828  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  YP_001887778  hitchhiker  0.00000000430426  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4023  CDS  NC_010676  37670  39121  +  1452  Aldehyde Dehydrogenase  YP_001887779  hitchhiker  0.0000030517  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4024  CDS  NC_010676  39158  41059  +  1902  feruloyl-CoA synthase  YP_001887780  normal  0.0243699  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4025  CDS  NC_010676  41099  41983  +  885  amidohydrolase 2  YP_001887781  normal  0.0646692  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4026  CDS  NC_010676  42010  43176  +  1167  Squalene/phytoene synthase  YP_001887782  normal  0.600735  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4027  CDS  NC_010676  43294  43542  +  249  hypothetical protein  YP_001887783  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4028  CDS  NC_010676  43885  44202  -  318  hypothetical protein  YP_001887784  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4029  CDS  NC_010676  44430  45122  -  693  hypothetical protein  YP_001887785  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4030  CDS  NC_010676  45122  45604  -  483  protein of unknown function DUF847  YP_001887786  normal  0.788419  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4031  CDS  NC_010676  45686  47119  -  1434  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_001887787  normal  0.636683  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4032  CDS  NC_010676  47455  47721  -  267  hypothetical protein  YP_001887788  normal  0.552136  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4033  CDS  NC_010676  48178  49041  -  864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001887789  normal  0.753159  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4034  CDS  NC_010676  49058  49852  -  795  ABC transporter related  YP_001887790  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4035  CDS  NC_010676  49893  50912  -  1020  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_001887791  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4036  CDS  NC_010676  51162  51839  +  678  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_001887792  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4037  CDS  NC_010676  51829  53223  +  1395  histidine kinase  YP_001887793  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4038  CDS  NC_010676  53349  54419  +  1071  NMT1/THI5 like domain protein  YP_001887794  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4039  CDS  NC_010676  54486  55868  +  1383  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001887795  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4040  CDS  NC_010676  55894  56592  +  699  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_001887796  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4041  CDS  NC_010676  56775  57899  +  1125  porin Gram-negative type  YP_001887797  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4042    NC_010676  57987  58271  +  285      normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4043  CDS  NC_010676  58278  58511  +  234  hypothetical protein  YP_001887798  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4044    NC_010676  58634  58882  -  249      normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4045  CDS  NC_010676  59188  60105  +  918  diguanylate phosphodiesterase  YP_001887799  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4046  CDS  NC_010676  60302  61030  -  729  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  YP_001887800  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4047  CDS  NC_010676  61098  62264  -  1167  hypothetical protein  YP_001887801  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4048  CDS  NC_010676  62261  63058  -  798  hypothetical protein  YP_001887802  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4049  CDS  NC_010676  63055  64146  -  1092  glycosyl transferase group 1  YP_001887803  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4050  CDS  NC_010676  64143  65402  -  1260  hypothetical protein  YP_001887804  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4051  CDS  NC_010676  65399  66730  -  1332  hypothetical protein  YP_001887805  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4052  CDS  NC_010676  66730  67968  -  1239  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  YP_001887806  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4053  CDS  NC_010676  68137  70359  -  2223  exopolysaccharide transport protein family  YP_001887807  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4054  CDS  NC_010676  70416  70868  -  453  protein tyrosine phosphatase  YP_001887808  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4055  CDS  NC_010676  70865  72037  -  1173  polysaccharide export protein  YP_001887809  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4056  CDS  NC_010676  72169  73584  -  1416  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  YP_001887810  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4057  CDS  NC_010676  74659  74976  -  318  hypothetical protein  YP_001887811  normal  0.912828  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4058  CDS  NC_010676  75390  76658  -  1269  hypothetical protein  YP_001887812  normal  0.73924  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4059  CDS  NC_010676  76739  77755  -  1017  putative lipoprotein  YP_001887813  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4060  CDS  NC_010676  77907  78833  +  927  hypothetical protein  YP_001887814  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4061  CDS  NC_010676  78863  80026  -  1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001887815  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4062  CDS  NC_010676  80023  80331  -  309  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_001887816  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4063  CDS  NC_010676  80806  81477  +  672  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  YP_001887817  normal  1  normal  0.806814  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4064  CDS  NC_010676  81606  81845  +  240  MbtH domain protein  YP_001887818  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4065  CDS  NC_010676  81933  82967  +  1035  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  YP_001887819  normal  1  normal  0.669565  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4066  CDS  NC_010676  82964  83830  +  867  ABC transporter related  YP_001887820  normal  1  normal  0.501197  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4067  CDS  NC_010676  83827  85935  +  2109  iron-hydroxamate transporter permease subunit  YP_001887821  normal  1  normal  0.696001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4068  CDS  NC_010676  85932  86750  +  819  putative iron reductase  YP_001887822  normal  0.42261  normal  0.237664  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4069  CDS  NC_010676  86828  87856  +  1029  periplasmic binding protein  YP_001887823  normal  1  normal  0.423894  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4070  CDS  NC_010676  87949  88236  -  288  hypothetical protein  YP_001887824  normal  1  normal  0.265953  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4071  CDS  NC_010676  88236  90002  -  1767  cyclic peptide transporter  YP_001887825  normal  1  normal  0.324358  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4072  CDS  NC_010676  90294  99986  +  9693  amino acid adenylation domain protein  YP_001887826  normal  1  normal  0.753138  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4073  CDS  NC_010676  100021  105045  +  5025  amino acid adenylation domain protein  YP_001887827  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4074  CDS  NC_010676  105179  106549  +  1371  L-ornithine 5-monooxygenase  YP_001887828  normal  0.0146729  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4075  CDS  NC_010676  106597  108834  +  2238  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001887829  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4076  CDS  NC_010676  108869  109711  +  843  hypothetical protein  YP_001887830  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4077  CDS  NC_010676  109779  111503  -  1725  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001887831  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4078  CDS  NC_010676  111631  112569  +  939  transcriptional regulator, LysR family  YP_001887832  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4079  CDS  NC_010676  112566  114749  -  2184  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001887833  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4080  CDS  NC_010676  115165  117393  +  2229  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  YP_001887834  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4081  CDS  NC_010676  117501  117731  -  231  hypothetical protein  YP_001887835  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4082  CDS  NC_010676  118124  118942  -  819  alpha/beta hydrolase fold  YP_001887836  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4083  CDS  NC_010676  119127  120515  -  1389  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001887837  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4084  CDS  NC_010676  120657  122909  -  2253  CoA-binding domain protein  YP_001887838  normal  0.030706  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4085  CDS  NC_010676  122918  124114  -  1197  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_001887839  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4086  CDS  NC_010676  124279  125130  +  852  transcriptional regulator, IclR family  YP_001887840  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4087  CDS  NC_010676  125233  126573  -  1341  hypothetical protein  YP_001887841  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4088  CDS  NC_010676  126604  127098  -  495  hypothetical protein  YP_001887842  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_4089  CDS  NC_010676  127277  128170  -  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_001887843  normal  1  normal  1  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 33    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>