4700 genes were found for organism Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cyan8802_0001  CDS  NC_013161  98  1459  1362  chromosomal replication initiation protein  YP_003135808  normal  0.755155  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0002  CDS  NC_013161  1903  2955  1053  diguanylate cyclase  YP_003135809  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0003  CDS  NC_013161  3060  3833  774  hypothetical protein  YP_003135810  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0004  CDS  NC_013161  3912  4196  285  protein of unknown function DUF427  YP_003135811  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0005  CDS  NC_013161  4262  4876  615  hypothetical protein  YP_003135812  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0006  CDS  NC_013161  5053  6291  1239  hypothetical protein  YP_003135813  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0007  CDS  NC_013161  6314  8980  2667  ATP-dependent chaperone ClpB  YP_003135814  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0008  CDS  NC_013161  9079  9504  426  protein of unknown function DUF29  YP_003135815  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0009  CDS  NC_013161  9599  10414  816  glycosyl transferase family 2  YP_003135816  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0010  CDS  NC_013161  10578  11534  957  tocopherol phytyltransferase  YP_003135817  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0011  CDS  NC_013161  11662  12093  432  hydrogenase maturation protease  YP_003135818  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0012  CDS  NC_013161  12099  12959  861  hypothetical protein  YP_003135819  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0013  CDS  NC_013161  13009  14415  1407  Carotenoid oxygenase  YP_003135820  normal  0.768827  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0014  CDS  NC_013161  14461  14868  408  hypothetical protein  YP_003135821  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0015  CDS  NC_013161  15195  15515  321  hypothetical protein  YP_003135822  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0016  CDS  NC_013161  15646  16044  399  hypothetical protein  YP_003135823  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0017  CDS  NC_013161  16164  17195  1032  aldo/keto reductase  YP_003135824  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0018  CDS  NC_013161  17215  17847  633  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_003135825  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0019  CDS  NC_013161  18145  20151  2007  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_003135826  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0020  CDS  NC_013161  20166  21041  876  PfkB domain protein  YP_003135827  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0021  CDS  NC_013161  21053  21922  870  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_003135828  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0022  CDS  NC_013161  21933  22664  732  protein of unknown function DUF820  YP_003135829  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0023  CDS  NC_013161  22823  25192  2370  ATPase AAA-2 domain protein  YP_003135830  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0024  CDS  NC_013161  25379  26119  741  diguanylate phosphodiesterase  YP_003135831  normal  0.481277  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0025  CDS  NC_013161  26147  27499  1353  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_003135832  normal  0.136516  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0026  CDS  NC_013161  27843  29654  1812  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003135833  normal  0.0227659  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0027  CDS  NC_013161  29623  30048  426  phosphopantetheine-binding  YP_003135834  normal  0.0175854  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0028  CDS  NC_013161  30253  31710  1458  membrane bound O-acyl transferase MBOAT family protein  YP_003135835  normal  0.0253173  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0029  CDS  NC_013161  31710  32951  1242  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_003135836  normal  0.0938494  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0030  CDS  NC_013161  33243  33581  339  thioredoxin domain protein  YP_003135837  normal  0.170038  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0031  CDS  NC_013161  33787  34302  516  hypothetical protein  YP_003135838  normal  0.325782  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0032  CDS  NC_013161  34304  34867  564  hypothetical protein  YP_003135839  normal  0.360638  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0033  CDS  NC_013161  34884  35606  723  hypothetical protein  YP_003135840  normal  0.378174  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0034  CDS  NC_013161  35737  36396  660  protein of unknown function DUF1486  YP_003135841  normal  0.363938  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0035  CDS  NC_013161  36597  37640  1044  hypothetical protein  YP_003135842  normal  0.352802  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0036  CDS  NC_013161  37683  38849  1167  peptidase M20  YP_003135843  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0037  CDS  NC_013161  38929  39537  609  hypothetical protein  YP_003135844  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0038  CDS  NC_013161  39864  41654  1791  TrkA-C domain protein  YP_003135845  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0039  CDS  NC_013161  41690  42889  1200  glycosyl transferase group 1  YP_003135846  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0040  CDS  NC_013161  42918  43787  870  hypothetical protein  YP_003135847  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0041  CDS  NC_013161  43875  44888  1014  UDP-glucose 4-epimerase  YP_003135848  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0042  CDS  NC_013161  44895  45875  981  glycosyl transferase family 2  YP_003135849  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0043  CDS  NC_013161  45887  47200  1314  glycosyl transferase group 1  YP_003135850  normal  0.46781  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0044  CDS  NC_013161  47266  48102  837  methyltransferase FkbM family  YP_003135851  normal  0.170743  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0045  CDS  NC_013161  48146  49129  984  glycosyl transferase family 2  YP_003135852  normal  0.288326  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0046  CDS  NC_013161  49329  50189  861  hypothetical protein  YP_003135853  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0047  CDS  NC_013161  50242  50883  642  cyclase family protein  YP_003135854  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0048  CDS  NC_013161  50940  52148  1209  hypothetical protein  YP_003135855  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0049  CDS  NC_013161  52168  53268  1101  glycosyl transferase group 1  YP_003135856  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0050  CDS  NC_013161  53319  54056  738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003135857  normal  0.795595  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0051  CDS  NC_013161  54053  55012  960  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_003135858  normal  0.295989  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0052  CDS  NC_013161  55044  55739  696  acylneuraminate cytidylyltransferase  YP_003135859  normal  0.0163138  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0053  CDS  NC_013161  55855  57237  1383  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  YP_003135860  unclonable  4.98494e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0054  CDS  NC_013161  57221  58279  1059  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  YP_003135861  decreased coverage  3.10792e-05  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0055  CDS  NC_013161  58731  59342  612  protein of unknown function DUF820  YP_003135862  hitchhiker  0.000675907  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0056  CDS  NC_013161  59349  60110  762  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  YP_003135863  normal  0.0107681  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0057  CDS  NC_013161  60263  61030  768  ABC transporter related  YP_003135864  normal  0.0112195  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0058  CDS  NC_013161  61073  61861  789  protein of unknown function DUF990  YP_003135865  normal  0.0285838  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0059  CDS  NC_013161  61861  62625  765  hypothetical protein  YP_003135866  normal  0.0112195  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0060  CDS  NC_013161  62754  63152  399  hypothetical protein  YP_003135867  hitchhiker  0.00595323  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0061  CDS  NC_013161  63175  64245  1071  folate-binding protein YgfZ  YP_003135868  hitchhiker  0.000369449  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0062    NC_013161  64396  64752  357      hitchhiker  7.22815e-05  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0063  CDS  NC_013161  64971  65942  972  NmrA family protein  YP_003135869  unclonable  2.16715e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0064  CDS  NC_013161  65970  66887  918  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  YP_003135870  unclonable  1.62022e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0065  CDS  NC_013161  66964  68109  1146  8-amino-7-oxononanoate synthase  YP_003135871  hitchhiker  0.00162329  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0066  CDS  NC_013161  68138  69493  1356  peptidase M24  YP_003135872  normal  0.0179653  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0067  CDS  NC_013161  69782  70444  663  protein of unknown function DUF124  YP_003135873  normal  0.226937  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0068  CDS  NC_013161  70467  71144  678  protein of unknown function DUF124  YP_003135874  normal  0.345818  normal  0.773898  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0069  CDS  NC_013161  71212  71910  699  protein of unknown function DUF124  YP_003135875  normal  0.381731  normal  0.770139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0070  CDS  NC_013161  71946  72728  783  peptidase M48 Ste24p  YP_003135876  normal  0.885024  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0071  CDS  NC_013161  72759  75203  2445  7TM receptor with intracellular metal dependent phosphohydrolase  YP_003135877  normal  0.478942  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0072  CDS  NC_013161  75411  76619  1209  hypothetical protein  YP_003135878  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0073  CDS  NC_013161  76661  77254  594  SH3 type 3 domain protein  YP_003135879  normal  normal  0.945138  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0074  CDS  NC_013161  77281  77856  576  protein of unknown function DUF820  YP_003135880  normal  normal  0.716542  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0075  CDS  NC_013161  77870  78964  1095  glycosyl transferase family 4  YP_003135881  normal  normal  0.594869  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0076  CDS  NC_013161  79136  80977  1842  HTTM domain protein  YP_003135882  normal  0.373411  normal  0.667135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0077  CDS  NC_013161  80980  81963  984  hypothetical protein  YP_003135883  normal  0.0605767  normal  0.752303  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0078  CDS  NC_013161  82017  83831  1815  hypothetical protein  YP_003135884  normal  0.279291  normal  0.306117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0079  CDS  NC_013161  83919  84377  459  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_003135885  normal  0.443052  normal  0.236331  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0080  CDS  NC_013161  84383  85498  1116  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  YP_003135886  normal  normal  0.182547  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0081  CDS  NC_013161  85508  86908  1401  hypothetical protein  YP_003135887  normal  normal  0.281812  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0082  CDS  NC_013161  86930  88201  1272  DNA-cytosine methyltransferase  YP_003135888  normal  normal  0.576583  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0083  CDS  NC_013161  88225  89799  1575  carbohydrate kinase, YjeF related protein  YP_003135889  normal  normal  0.452837  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0084  CDS  NC_013161  89833  90315  483  protein of unknown function DUF55  YP_003135890  normal  normal  0.260704  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0085  CDS  NC_013161  90361  91482  1122  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_003135891  normal  normal  0.196497  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0086  CDS  NC_013161  91647  92291  645  protein of unknown function DUF820  YP_003135892  normal  normal  0.176594  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0087  CDS  NC_013161  92425  92838  414  UspA domain protein  YP_003135893  normal  normal  0.270919  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0088  CDS  NC_013161  93005  93535  531  hypothetical protein  YP_003135894  normal  0.592865  normal  0.192178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0089  CDS  NC_013161  93751  94365  615  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  YP_003135895  normal  0.922879  normal  0.290643  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0090  CDS  NC_013161  94570  96486  1917  protein serine/threonine phosphatase  YP_003135896  normal  0.918341  normal  0.249808  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0091  CDS  NC_013161  96505  97389  885  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  YP_003135897  normal  normal  0.42855  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0092  CDS  NC_013161  97612  99036  1425  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_003135898  normal  normal  0.643449  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0093  CDS  NC_013161  99053  99598  546  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  YP_003135899  normal  normal  0.574923  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0094  CDS  NC_013161  99632  100348  717  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  YP_003135900  normal  normal  0.604003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0095  CDS  NC_013161  100360  101967  1608  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_003135901  normal  normal  0.693174  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0096  CDS  NC_013161  102008  102547  540  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  YP_003135902  normal  normal  0.598667  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0097  CDS  NC_013161  102836  103582  747  protein of unknown function DUF820  YP_003135903  normal  normal  0.609374  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0098  CDS  NC_013161  103860  104630  771  Heme oxygenase  YP_003135904  normal  normal  0.627475  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0099  CDS  NC_013161  104797  106194  1398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  YP_003135905  normal  normal  0.98373  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan8802_0100  CDS  NC_013161  106529  107107  579  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_003135906  normal  normal  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>