228 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rleg2_6355  CDS  NC_011371  26  1315  1290  cytosine deaminase  YP_002284111  normal  0.616526  normal  0.149808  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6356  CDS  NC_011371  1342  2286  945  inner-membrane translocator  YP_002284112  normal  0.420004  normal  0.20423  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6357  CDS  NC_011371  2283  3332  1050  inner-membrane translocator  YP_002284113  normal  0.15152  normal  0.206957  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6358  CDS  NC_011371  3322  4845  1524  ABC transporter related  YP_002284114  normal  0.189938  normal  0.105894  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6359  CDS  NC_011371  4842  6254  1413  Amidase  YP_002284115  normal  normal  0.0595447  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6360  CDS  NC_011371  6263  7249  987  basic membrane lipoprotein  YP_002284116  normal  0.521403  normal  0.125495  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6361  CDS  NC_011371  7518  8147  630  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  YP_002284117  normal  0.368915  normal  0.164318  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6362  CDS  NC_011371  8144  8764  621  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_002284118  normal  normal  0.167177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6363  CDS  NC_011371  8761  9690  930  phosphatidate cytidylyltransferase  YP_002284119  normal  0.459085  normal  0.173645  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6364  CDS  NC_011371  9713  10036  324  hypothetical protein  YP_002284120  normal  0.278619  normal  0.148278  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6365  CDS  NC_011371  10039  10953  915  chaperone DnaJ domain protein  YP_002284121  normal  0.0593575  normal  0.238878  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6366  CDS  NC_011371  11047  11514  468  UspA domain protein  YP_002284122  normal  0.0890005  normal  0.312841  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6367  CDS  NC_011371  11727  12593  867  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  YP_002284123  normal  0.707828  normal  0.820897  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6368  CDS  NC_011371  12669  12959  291  plasmid stabilization system  YP_002284124  normal  normal  0.718684  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6369  CDS  NC_011371  12956  13204  249  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  YP_002284125  normal  normal  0.547419  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6370  CDS  NC_011371  13416  14291  876  putative glutathione S-transferase YghU  YP_002284126  normal  normal  0.609192  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6371  CDS  NC_011371  14374  15888  1515  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002284127  normal  normal  0.37487  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6372  CDS  NC_011371  15908  17617  1710  ABC transporter related  YP_002284128  normal  normal  0.623258  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6373  CDS  NC_011371  17614  18462  849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002284129  normal  normal  0.962921  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6374  CDS  NC_011371  18459  19397  939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002284130  normal  normal  0.732123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6375  CDS  NC_011371  19449  20339  891  proline-specific peptidase  YP_002284131  normal  normal  0.713939  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6376  CDS  NC_011371  20465  21241  777  transcriptional regulator, LuxR family  YP_002284132  normal  normal  0.888984  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6377  CDS  NC_011371  21324  22226  903  proline-specific peptidase  YP_002284133  normal  0.843826  normal  0.494551  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6378  CDS  NC_011371  22277  23188  912  Acetamidase/Formamidase  YP_002284134  normal  normal  0.344554  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6379    NC_011371  23337  23453  117      normal  0.670897  normal  0.412698  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6380  CDS  NC_011371  23615  27088  3474  hypothetical protein  YP_002284135  normal  0.717273  normal  0.28767  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6381  CDS  NC_011371  27088  28356  1269  metallophosphoesterase  YP_002284136  normal  normal  0.446574  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6382  CDS  NC_011371  28683  30056  1374  Integrase catalytic region  YP_002284137  normal  normal  0.583373  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6383  CDS  NC_011371  30365  31069  705  transcriptional regulator, GntR family  YP_002284138  normal  normal  0.910943  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6384  CDS  NC_011371  31185  32153  969  Dihydrodipicolinate synthase  YP_002284139  normal  normal  0.956523  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6385  CDS  NC_011371  32229  33263  1035  Malate/L-lactate dehydrogenase  YP_002284140  normal  normal  0.738936  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6386    NC_011371  33401  33640  240      normal  0.593655  normal  0.663761  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6387  CDS  NC_011371  33682  34611  930  ribokinase  YP_002284141  normal  0.906333  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6388  CDS  NC_011371  34608  35066  459  RbsD or FucU transport  YP_002284142  normal  0.522318  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6389  CDS  NC_011371  35109  36137  1029  transcriptional regulator, LacI family  YP_002284143  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6390  CDS  NC_011371  36154  37065  912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002284144  normal  0.96233  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6391  CDS  NC_011371  37065  38183  1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002284145  normal  0.452199  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6392  CDS  NC_011371  38256  39896  1641  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002284146  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6393  CDS  NC_011371  40236  41303  1068  ABC transporter related  YP_002284147  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6394  CDS  NC_011371  41416  41862  447  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002284148  normal  0.423137  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6395  CDS  NC_011371  42222  44048  1827  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_002284149  normal  0.0500237  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6396  CDS  NC_011371  44050  45000  951  glycine oxidase ThiO  YP_002284150  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6397  CDS  NC_011371  45020  45217  198  sulfur carrier protein ThiS  YP_002284151  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6398  CDS  NC_011371  45220  45993  774  thiazole synthase  YP_002284152  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6399  CDS  NC_011371  46091  46582  492  putative GAF sensor protein  YP_002284153  normal  0.568608  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6400  CDS  NC_011371  46619  47143  525  protein of unknown function UPF0066  YP_002284154  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6401    NC_011371  47165  47458  294      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6402  CDS  NC_011371  47460  47885  426  PilT protein domain protein  YP_002284155  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6403  CDS  NC_011371  47885  48139  255  prevent-host-death family protein  YP_002284156  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6404  CDS  NC_011371  48428  49324  897  diguanylate cyclase  YP_002284157  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6405  CDS  NC_011371  49496  50374  879  putative exopolysaccharide synthesis protein  YP_002284158  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6406  CDS  NC_011371  50737  52179  1443  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  YP_002284159  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6407  CDS  NC_011371  52176  54320  2145  ABC transporter related  YP_002284160  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6408  CDS  NC_011371  54364  54666  303  hypothetical protein  YP_002284161  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6409  CDS  NC_011371  54732  55964  1233  cobalamin synthesis protein P47K  YP_002284162  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6410  CDS  NC_011371  56014  61359  5346  hypothetical protein  YP_002284163  normal  0.885103  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6411  CDS  NC_011371  61574  62758  1185  cobalamin synthesis protein P47K  YP_002284164  normal  0.352865  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6412  CDS  NC_011371  62859  69872  7014  outer membrane adhesin like proteiin  YP_002284165  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6413  CDS  NC_011371  70398  71714  1317  polysaccharide export protein  YP_002284166  normal  0.0105958  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6414  CDS  NC_011371  71848  73356  1509  polysaccharide biosynthesis protein  YP_002284167  normal  0.0705751  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6415  CDS  NC_011371  73428  74645  1218  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  YP_002284168  normal  0.854254  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6416  CDS  NC_011371  74642  75613  972  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002284169  normal  0.955033  normal  0.769273  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6417  CDS  NC_011371  75610  76329  720  hypothetical protein  YP_002284170  normal  0.701218  normal  0.982762  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6418  CDS  NC_011371  76319  77422  1104  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  YP_002284171  normal  0.50729  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6419  CDS  NC_011371  77419  78456  1038  oxidoreductase domain protein  YP_002284172  normal  0.477739  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6420  CDS  NC_011371  78456  78959  504  transferase hexapeptide repeat containing protein  YP_002284173  normal  0.45706  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6421  CDS  NC_011371  79524  80279  756  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_002284174  normal  0.872179  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6422  CDS  NC_011371  80492  82321  1830  hypothetical protein  YP_002284175  normal  0.297493  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6423  CDS  NC_011371  82326  83366  1041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002284176  normal  0.544479  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6424  CDS  NC_011371  83406  84899  1494  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  YP_002284177  normal  normal  0.955006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6425  CDS  NC_011371  84914  85771  858  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  YP_002284178  normal  0.615805  normal  0.823764  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6426  CDS  NC_011371  86354  88480  2127  hypothetical protein  YP_002284179  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6427  CDS  NC_011371  88477  89796  1320  O-antigen polymerase  YP_002284180  normal  0.445902  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6428  CDS  NC_011371  90191  90352  162  hypothetical protein  YP_002284181  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6429  CDS  NC_011371  90362  91312  951  glycosyl transferase family 2  YP_002284182  normal  0.596703  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6430  CDS  NC_011371  91309  92409  1101  glycosyl transferase group 1  YP_002284183  normal  0.706841  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6431  CDS  NC_011371  92403  93545  1143  glycosyl transferase group 1  YP_002284184  normal  normal  0.823764  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6432  CDS  NC_011371  93542  95746  2205  lipopolysaccharide biosynthesis protein  YP_002284185  normal  normal  0.402351  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6433  CDS  NC_011371  95811  96914  1104  GDP-mannose 4,6-dehydratase  YP_002284186  normal  0.418914  normal  0.286402  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6434  CDS  NC_011371  96907  97944  1038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002284187  normal  normal  0.141904  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6435  CDS  NC_011371  98042  98173  132  hypothetical protein  YP_002284188  normal  normal  0.160036  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6436  CDS  NC_011371  98387  99685  1299  MscS Mechanosensitive ion channel  YP_002284189  normal  normal  0.227593  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6437  CDS  NC_011371  99817  100083  267  hypothetical protein  YP_002284190  normal  normal  0.175327  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6438  CDS  NC_011371  100377  101561  1185  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  YP_002284191  normal  normal  0.204863  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6439  CDS  NC_011371  101572  102024  453  conserved hypothetical membrane-anchored protein  YP_002284192  normal  normal  0.180212  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6440  CDS  NC_011371  102188  102994  807  alpha/beta hydrolase fold  YP_002284193  normal  normal  0.200854  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6441  CDS  NC_011371  102996  104123  1128  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_002284194  normal  normal  0.152019  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6442  CDS  NC_011371  104226  104990  765  GntR domain protein  YP_002284195  normal  normal  0.143546  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6443  CDS  NC_011371  105012  106073  1062  hypothetical protein  YP_002284196  normal  normal  0.235172  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6444  CDS  NC_011371  106070  107062  993  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002284197  normal  0.116745  normal  0.247483  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6445  CDS  NC_011371  107062  108069  1008  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002284198  normal  0.134411  normal  0.258493  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6446  CDS  NC_011371  108066  109025  960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002284199  normal  0.0184678  normal  0.258493  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6447  CDS  NC_011371  109028  109984  957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002284200  normal  0.150998  normal  0.176605  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6448  CDS  NC_011371  110113  111750  1638  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002284201  decreased coverage  0.00292129  normal  0.318047  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6449  CDS  NC_011371  112078  112980  903  dihydrodipicolinate synthetase  YP_002284202  normal  normal  0.0770365  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6450  CDS  NC_011371  112992  114176  1185  putative glycosyl hydrolase protein  YP_002284203  normal  0.645858  normal  0.142716  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6451  CDS  NC_011371  114528  115661  1134  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_002284204  normal  normal  0.135191  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6452  CDS  NC_011371  115676  116683  1008  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_002284205  normal  normal  0.279092  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6453  CDS  NC_011371  116658  117749  1092  acyltransferase 3  YP_002284206  normal  normal  0.292089  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6454  CDS  NC_011371  117896  119422  1527  polysaccharide biosynthesis protein  YP_002284207  normal  normal  0.24308  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>