282 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rleg2_6073  CDS  NC_011370  31  1041  1011  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  YP_002283855  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6074  CDS  NC_011370  1193  1576  384  Esterase/lipase-like protein  YP_002283856  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6075  CDS  NC_011370  1569  2372  804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002283857  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6076  CDS  NC_011370  2369  3229  861  transcriptional regulator, IclR family  YP_002283858  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6077  CDS  NC_011370  3226  4398  1173  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_002283859  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6078  CDS  NC_011370  4395  6023  1629  acyl-CoA synthetase  YP_002283860  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6079  CDS  NC_011370  6026  6793  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002283861  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6080  CDS  NC_011370  6790  7647  858  hypothetical protein  YP_002283862  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6081  CDS  NC_011370  7745  8890  1146  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002283863  normal  0.517442  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6082  CDS  NC_011370  8890  9897  1008  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_002283864  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6083  CDS  NC_011370  9924  10769  846  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  YP_002283865  normal  0.662698  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6084  CDS  NC_011370  10766  11542  777  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_002283866  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6085  CDS  NC_011370  11744  12526  783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002283867  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6086  CDS  NC_011370  12629  13453  825  hypothetical protein  YP_002283868  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6087  CDS  NC_011370  13618  13974  357  protein of unknown function DUF419  YP_002283869  normal  0.987598  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6088  CDS  NC_011370  14003  14533  531  hypothetical protein  YP_002283870  normal  0.229843  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6089  CDS  NC_011370  14591  15490  900  transcriptional regulator, LysR family  YP_002283871  normal  0.631201  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6090  CDS  NC_011370  15671  16948  1278  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002283872  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6091  CDS  NC_011370  16998  17876  879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002283873  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6092  CDS  NC_011370  17876  18766  891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002283874  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6093  CDS  NC_011370  18848  20365  1518  sulfatase  YP_002283875  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6094  CDS  NC_011370  20438  21439  1002  ABC transporter related  YP_002283876  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6095  CDS  NC_011370  21479  22438  960  protein of unknown function DUF323  YP_002283877  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6096    NC_011370  22548  23595  1048      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6097  CDS  NC_011370  24011  24904  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_002283878  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6098  CDS  NC_011370  24966  26504  1539  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_002283879  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6099  CDS  NC_011370  26848  28020  1173  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002283880  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6100  CDS  NC_011370  28074  28787  714  ABC transporter related  YP_002283881  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6101  CDS  NC_011370  28789  29508  720  ABC transporter related  YP_002283882  normal  0.840532  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6102  CDS  NC_011370  29513  30415  903  inner-membrane translocator  YP_002283883  normal  0.401287  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6103  CDS  NC_011370  30412  31440  1029  inner-membrane translocator  YP_002283884  normal  0.106487  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6104  CDS  NC_011370  31450  32499  1050  amidohydrolase 2  YP_002283885  normal  0.0105705  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6105  CDS  NC_011370  33381  34937  1557  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002283886  decreased coverage  0.0000312198  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6106    NC_011370  35194  35459  266      decreased coverage  0.0000137327  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6107    NC_011370  35526  35630  105      hitchhiker  0.00000651224  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6108  CDS  NC_011370  35672  36478  807  HpcH/HpaI aldolase  YP_002283887  hitchhiker  0.0000904095  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6109  CDS  NC_011370  36535  37179  645  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  YP_002283888  hitchhiker  0.00060099  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6110  CDS  NC_011370  37262  37792  531  NADPH-dependent FMN reductase  YP_002283889  normal  0.0256323  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6111  CDS  NC_011370  37812  38936  1125  flavin reductase domain protein FMN-binding  YP_002283890  normal  0.575038  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6112  CDS  NC_011370  39007  40161  1155  Luciferase-like monooxygenase  YP_002283891  normal  0.385771  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6113  CDS  NC_011370  40250  41650  1401  Aldehyde Dehydrogenase  YP_002283892  normal  0.401659  normal  0.835317  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6114  CDS  NC_011370  41707  42312  606  Glutathione S-transferase domain  YP_002283893  normal  0.564135  normal  0.67703  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6115    NC_011370  42359  42433  75      normal  normal  0.973359  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6116  CDS  NC_011370  42865  44058  1194  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_002283894  normal  0.233297  normal  0.948819  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6117  CDS  NC_011370  44137  45795  1659  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002283895  normal  0.154468  normal  0.620567  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6118  CDS  NC_011370  46633  50130  3498  pyruvate carboxylase  YP_002283896  normal  normal  0.410789  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6119  CDS  NC_011370  50544  52055  1512  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  YP_002283897  normal  normal  0.244405  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6120  CDS  NC_011370  52209  53117  909  transcriptional regulator, LysR family  YP_002283898  normal  normal  0.274534  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6121  CDS  NC_011370  53128  54654  1527  citrate lyase, alpha subunit  YP_002283899  normal  normal  0.32733  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6122  CDS  NC_011370  54800  55951  1152  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_002283900  normal  0.476523  normal  0.155201  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6123    NC_011370  56252  56427  176      normal  0.400241  normal  0.113166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6124  CDS  NC_011370  56542  57558  1017  transcriptional regulator, AraC family  YP_002283901  normal  0.609477  normal  0.144124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6125    NC_011370  57652  57909  258      normal  0.245539  normal  0.116477  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6126  CDS  NC_011370  58349  60301  1953  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002283902  normal  0.375381  normal  0.0878449  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6127  CDS  NC_011370  60607  61587  981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_002283903  normal  normal  0.0714054  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6128  CDS  NC_011370  61607  62776  1170  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_002283904  normal  normal  0.0513705  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6129  CDS  NC_011370  62808  63614  807  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_002283905  normal  0.799266  normal  0.0721671  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6130  CDS  NC_011370  63636  64406  771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002283906  normal  0.843826  normal  0.0452195  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6131  CDS  NC_011370  64396  66069  1674  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_002283907  normal  normal  0.0231902  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6132    NC_011370  66261  66733  473      normal  0.341381  normal  0.0264971  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6133  CDS  NC_011370  66767  68425  1659  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002283908  normal  0.376404  normal  0.0270764  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6134  CDS  NC_011370  68782  69468  687  transcriptional regulator, TetR family  YP_002283909  normal  0.0948812  normal  0.0489287  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6135  CDS  NC_011370  69569  69967  399  methylmalonyl-CoA epimerase  YP_002283910  hitchhiker  0.00511607  normal  0.152762  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6136  CDS  NC_011370  69975  72128  2154  methylmalonyl-CoA mutase  YP_002283911  normal  0.0179109  normal  0.120378  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6137  CDS  NC_011370  72128  74131  2004  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  YP_002283912  normal  0.768375  normal  0.18157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6138  CDS  NC_011370  74139  74351  213  hypothetical protein  YP_002283913  normal  0.221742  normal  0.148909  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6139  CDS  NC_011370  74362  75894  1533  carboxyl transferase  YP_002283914  normal  normal  0.222288  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6140  CDS  NC_011370  76009  77409  1401  transcriptional regulator, XRE family  YP_002283915  normal  0.29056  normal  0.20843  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6141  CDS  NC_011370  77716  78252  537  hypothetical protein  YP_002283916  normal  0.416343  normal  0.33399  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6142  CDS  NC_011370  78382  79056  675  hypothetical protein  YP_002283917  normal  0.551083  normal  0.349913  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6143  CDS  NC_011370  79338  79685  348  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002283918  normal  normal  0.420061  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6144    NC_011370  79964  80322  359      normal  normal  0.415473  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6145  CDS  NC_011370  80407  81330  924  transcriptional regulator, LysR family  YP_002283919  normal  0.506053  normal  0.493104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6146  CDS  NC_011370  81428  82414  987  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_002283920  normal  normal  0.485636  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6147  CDS  NC_011370  82451  83470  1020  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  YP_002283921  normal  normal  0.372275  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6148  CDS  NC_011370  83480  84397  918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002283922  normal  normal  0.870156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6149  CDS  NC_011370  84394  85905  1512  choline-sulfatase  YP_002283923  normal  normal  0.989807  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6150    NC_011370  86033  86396  364      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6151    NC_011370  86639  87078  440      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6152  CDS  NC_011370  88431  89036  606  hypothetical protein  YP_002283924  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6153  CDS  NC_011370  89046  90125  1080  protein of unknown function DUF955  YP_002283925  normal  0.782766  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6154  CDS  NC_011370  90189  91433  1245  response regulator receiver protein  YP_002283926  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6155  CDS  NC_011370  91434  91889  456  response regulator receiver protein  YP_002283927  normal  0.831592  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6156  CDS  NC_011370  91901  95005  3105  hypothetical protein  YP_002283928  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6157    NC_011370  95123  95308  186      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6158  CDS  NC_011370  95331  96065  735  hypothetical protein  YP_002283929  normal  0.842924  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6159  CDS  NC_011370  96254  96493  240  prevent-host-death family protein  YP_002283930  normal  0.598446  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6160  CDS  NC_011370  96493  96909  417  PilT protein domain protein  YP_002283931  normal  0.668901  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6161  CDS  NC_011370  96899  98047  1149  integrase family protein  YP_002283932  normal  0.365462  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6162  CDS  NC_011370  100559  101773  1215  plasmid partitioning protein RepA  YP_002283933  normal  0.49965  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6163  CDS  NC_011370  101770  102768  999  plasmid partitioning protein RepB  YP_002283934  normal  0.331476  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6164  CDS  NC_011370  102968  104245  1278  replication initiation protein RepC  YP_002283935  normal  0.194324  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6165  CDS  NC_011370  104713  105645  933  transcriptional regulator, LysR family  YP_002283936  normal  0.516449  normal  0.771556  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6166  CDS  NC_011370  105653  106585  933  hypothetical protein  YP_002283937  normal  0.335866  normal  0.687763  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6167  CDS  NC_011370  106582  107553  972  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_002283938  normal  0.224463  normal  0.398183  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6168  CDS  NC_011370  108557  109321  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002283939  normal  normal  0.535154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6169  CDS  NC_011370  109325  110029  705  regulatory protein GntR HTH  YP_002283940  normal  normal  0.398183  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6170  CDS  NC_011370  110119  110925  807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002283941  normal  normal  0.343653  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6171  CDS  NC_011370  110957  111913  957  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_002283942  normal  normal  0.367394  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_6172  CDS  NC_011370  111969  113951  1983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002283943  normal  normal  0.445711  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>