458 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rleg2_5615  CDS  NC_011366  169  1107  939  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  YP_002277890  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5616  CDS  NC_011366  2010  2405  396  hypothetical protein  YP_002277891  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5617  CDS  NC_011366  2874  5093  2220  hypothetical protein  YP_002277892  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5618  CDS  NC_011366  5141  6016  876  FHA domain containing protein  YP_002277893  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5619  CDS  NC_011366  6019  6921  903  type II secretion system protein  YP_002277894  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5620  CDS  NC_011366  6921  7784  864  type II secretion system protein  YP_002277895  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5621  CDS  NC_011366  7839  9737  1899  type II secretion system protein E  YP_002277896  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5622  CDS  NC_011366  9758  10696  939  Flp pilus assembly protein CpaB  YP_002277897  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5623  CDS  NC_011366  10693  11610  918  hypothetical protein  YP_002277898  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5624  CDS  NC_011366  11612  12289  678  hypothetical protein  YP_002277899  normal  0.713711  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5625  CDS  NC_011366  12261  13901  1641  hypothetical protein  YP_002277900  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5626  CDS  NC_011366  13898  14695  798  hypothetical protein  YP_002277901  normal  0.165913  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5627  CDS  NC_011366  14701  15264  564  peptidase A24A prepilin type IV  YP_002277902  normal  0.0178766  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5628  CDS  NC_011366  15279  15482  204  hypothetical protein  YP_002277903  normal  0.0132805  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5629  CDS  NC_011366  15992  16123  132  hypothetical protein  YP_002277904  normal  0.0161402  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5630  CDS  NC_011366  16123  17265  1143  type II secretion system protein E  YP_002277905  decreased coverage  0.00466879  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5631  CDS  NC_011366  17584  18714  1131  hypothetical protein  YP_002277906  normal  0.280064  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5632  CDS  NC_011366  19177  19722  546  Sarcosine oxidase gamma subunit  YP_002277907  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5633  CDS  NC_011366  19715  22669  2955  sarcosine oxidase, alpha subunit family  YP_002277908  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5634  CDS  NC_011366  22666  22947  282  sarcosine oxidase, delta subunit family  YP_002277909  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5635  CDS  NC_011366  22960  24210  1251  sarcosine oxidase, beta subunit family  YP_002277910  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5636  CDS  NC_011366  24298  25257  960  transcriptional regulator, AraC family  YP_002277911  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5637  CDS  NC_011366  25328  26011  684  transcriptional regulator, XRE family  YP_002277912  normal  0.76756  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5638  CDS  NC_011366  26101  27006  906  glutamine amidotransferase class-II  YP_002277913  normal  0.52916  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5639  CDS  NC_011366  27062  27748  687  glutamate synthase alpha subunit domain protein  YP_002277914  normal  0.55547  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5640  CDS  NC_011366  27763  29091  1329  ferredoxin-dependent glutamate synthase  YP_002277915  normal  0.0331257  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5641  CDS  NC_011366  29172  30479  1308  glutamine synthetase, type III  YP_002277916  normal  0.294213  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5642  CDS  NC_011366  30577  31461  885  formyltetrahydrofolate deformylase  YP_002277917  normal  0.60464  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5643  CDS  NC_011366  31465  32364  900  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_002277918  normal  0.667833  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5644  CDS  NC_011366  32456  33589  1134  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  YP_002277919  normal  0.457364  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5645  CDS  NC_011366  33601  34206  606  hypothetical protein  YP_002277920  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5646  CDS  NC_011366  34203  35168  966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  YP_002277921  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5647  CDS  NC_011366  35203  36243  1041  hypothetical protein  YP_002277922  normal  0.999402  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5648  CDS  NC_011366  36341  37678  1338  flavin-containing monooxygenase FMO  YP_002277923  normal  0.177675  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5649  CDS  NC_011366  37805  38407  603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  YP_002277924  normal  0.0906449  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5650  CDS  NC_011366  38618  39340  723  septum formation inhibitor  YP_002277925  normal  0.177009  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5651  CDS  NC_011366  39417  40232  816  septum site-determining protein MinD  YP_002277926  normal  0.531855  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5652  CDS  NC_011366  40229  40489  261  cell division topological specificity factor MinE  YP_002277927  normal  0.375925  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5653  CDS  NC_011366  40531  40911  381  hypothetical protein  YP_002277928  normal  0.192157  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5654  CDS  NC_011366  41056  41277  222  hypothetical protein  YP_002277929  normal  0.0221626  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5655  CDS  NC_011366  41631  41840  210  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002277930  normal  0.313891  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5656  CDS  NC_011366  42136  44505  2370  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  YP_002277931  normal  0.240642  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5657  CDS  NC_011366  44758  46542  1785  amino acid permease-associated region  YP_002277932  normal  0.0675998  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5658  CDS  NC_011366  46640  47671  1032  aldo/keto reductase  YP_002277933  normal  0.590758  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5659  CDS  NC_011366  47894  49162  1269  amine oxidase  YP_002277934  normal  0.436535  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5660  CDS  NC_011366  49279  50259  981  DNA polymerase III subunit epsilon  YP_002277935  normal  0.606784  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5661  CDS  NC_011366  50447  50593  147  protein of unknown function DUF1127  YP_002277936  normal  0.647025  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5662  CDS  NC_011366  51199  52035  837  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  YP_002277937  normal  0.425748  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5663  CDS  NC_011366  52041  52796  756  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  YP_002277938  normal  0.363313  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5664  CDS  NC_011366  52974  53720  747  GntR domain protein  YP_002277939  decreased coverage  0.0098751  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5665  CDS  NC_011366  53724  57026  3303  hypothetical protein  YP_002277940  normal  0.24035  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5666  CDS  NC_011366  57128  58666  1539  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_002277941  normal  0.456892  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5667  CDS  NC_011366  58879  59787  909  flagellin domain protein  YP_002277942  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5668  CDS  NC_011366  60142  61815  1674  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002277943  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5669  CDS  NC_011366  61834  62814  981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002277944  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5670  CDS  NC_011366  62814  63716  903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002277945  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5671  CDS  NC_011366  63713  64528  816  ABC transporter related  YP_002277946  normal  0.673193  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5672  CDS  NC_011366  64525  65469  945  ABC transporter related  YP_002277947  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5673  CDS  NC_011366  65522  67543  2022  Beta-N-acetylhexosaminidase  YP_002277948  normal  0.869284  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5674  CDS  NC_011366  67731  68399  669  haloacid dehalogenase, type II  YP_002277949  normal  0.799696  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5675  CDS  NC_011366  68705  69727  1023  Methyltransferase type 12  YP_002277950  normal  0.196275  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5676  CDS  NC_011366  69743  70945  1203  ROK family protein  YP_002277951  normal  0.0716593  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5677  CDS  NC_011366  71022  72245  1224  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002277952  normal  0.813519  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5678  CDS  NC_011366  72342  73118  777  short chain dehydrogenase  YP_002277953  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5679  CDS  NC_011366  73144  74007  864  transcriptional regulator, RpiR family  YP_002277954  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5680  CDS  NC_011366  74029  74418  390  Endoribonuclease L-PSP  YP_002277955  normal  0.979461  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5681  CDS  NC_011366  74530  75012  483  hypothetical protein  YP_002277956  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5682  CDS  NC_011366  75043  76518  1476  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  YP_002277957  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5683  CDS  NC_011366  76519  77619  1101  alanine racemase domain protein  YP_002277958  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5684  CDS  NC_011366  77919  82778  4860  hypothetical protein  YP_002277959  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5685  CDS  NC_011366  82814  84220  1407  hypothetical protein  YP_002277960  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5686  CDS  NC_011366  84533  85666  1134  ABC transporter related  YP_002277961  normal  0.661701  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5687  CDS  NC_011366  85758  86963  1206  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002277962  normal  0.627079  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5688  CDS  NC_011366  87037  87894  858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002277963  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5689  CDS  NC_011366  87891  88775  885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002277964  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5690  CDS  NC_011366  88789  89946  1158  oxidoreductase domain protein  YP_002277965  normal  0.324305  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5691  CDS  NC_011366  90244  91131  888  Carboxymethylenebutenolidase  YP_002277966  normal  0.175838  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5692  CDS  NC_011366  91389  92522  1134  putative amidase expression-regulating protein  YP_002277967  normal  0.0892365  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5693  CDS  NC_011366  92524  93147  624  ANTAR domain protein with unknown sensor  YP_002277968  normal  0.0468503  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5694  CDS  NC_011366  93342  94187  846  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_002277969  normal  0.0362224  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5695  CDS  NC_011366  94218  95366  1149  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002277970  normal  0.0211011  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5696  CDS  NC_011366  95418  96251  834  inner-membrane translocator  YP_002277971  normal  0.0633933  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5697  CDS  NC_011366  96244  98001  1758  ABC transporter related  YP_002277972  normal  0.435877  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5698  CDS  NC_011366  97994  98701  708  ABC transporter related  YP_002277973  normal  0.107636  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5699  CDS  NC_011366  98713  99873  1161  Amidase  YP_002277974  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5700  CDS  NC_011366  100057  100275  219  hypothetical protein  YP_002277975  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5701  CDS  NC_011366  100320  100757  438  hypothetical protein  YP_002277976  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5702  CDS  NC_011366  100754  101239  486  hypothetical protein  YP_002277977  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5703  CDS  NC_011366  101418  101657  240  hypothetical protein  YP_002277978  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5704  CDS  NC_011366  101722  103488  1767  TrkA-C domain protein  YP_002277979  normal  0.859269  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5705  CDS  NC_011366  103682  106333  2652  ATP-dependent DNA ligase  YP_002277980  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5706  CDS  NC_011366  106525  107580  1056  periplasmic binding protein  YP_002277981  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5707  CDS  NC_011366  107577  108611  1035  transport system permease protein  YP_002277982  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5708  CDS  NC_011366  108601  109389  789  ABC transporter related  YP_002277983  normal  normal  0.780398  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5709  CDS  NC_011366  109386  110108  723  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  YP_002277984  normal  normal  0.405999  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5710  CDS  NC_011366  110262  110987  726  GntR domain protein  YP_002277985  normal  normal  0.274671  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5711  CDS  NC_011366  111039  112031  993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002277986  normal  normal  0.272869  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5712  CDS  NC_011366  112180  113247  1068  ABC transporter related  YP_002277987  normal  normal  0.268173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5713  CDS  NC_011366  113404  114708  1305  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002277988  normal  normal  0.285791  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg2_5714  CDS  NC_011366  114854  115786  933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002277989  normal  normal  0.568061  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>