7295 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 73    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rleg_0001  CDS  NC_012850  55  1605  1551  chromosomal replication initiation protein  YP_002973852  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0002  CDS  NC_012850  1743  2825  1083  Saccharopine dehydrogenase  YP_002973853  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0003  CDS  NC_012850  2893  4095  1203  coproporphyrinogen III oxidase  YP_002973854  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0004  CDS  NC_012850  4105  4749  645  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  YP_002973855  normal  0.933245  hitchhiker  0.00157878  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0005  CDS  NC_012850  4750  5166  417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002973856  normal  0.742613  hitchhiker  0.00144174  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0006  CDS  NC_012850  5172  5891  720  ribonuclease PH  YP_002973857  normal  hitchhiker  0.00173681  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0007  CDS  NC_012850  6020  7108  1089  heat-inducible transcription repressor  YP_002973858  normal  hitchhiker  0.000387776  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0008  CDS  NC_012850  7220  7852  633  heat shock protein GrpE  YP_002973859  normal  hitchhiker  0.000108771  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0009  CDS  NC_012850  7917  8861  945  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_002973860  normal  hitchhiker  0.000140534  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0010  CDS  NC_012850  9139  9564  426  heat shock protein Hsp20  YP_002973861  normal  hitchhiker  0.000317964  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0011  CDS  NC_012850  9612  9869  258  protein of unknown function DUF1150  YP_002973862  normal  hitchhiker  0.000282298  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0012  CDS  NC_012850  10030  10296  267  hypothetical protein  YP_002973863  normal  hitchhiker  0.000302425  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0013  CDS  NC_012850  10650  11054  405  hypothetical protein  YP_002973864  normal  hitchhiker  0.000118508  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0014  CDS  NC_012850  11244  11945  702  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_002973865  normal  0.758859  decreased coverage  4.55468e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0015  CDS  NC_012850  11954  13192  1239  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002973866  normal  decreased coverage  6.16083e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0016  CDS  NC_012850  13371  13787  417  transcriptional regulator, XRE family  YP_002973867  normal  hitchhiker  0.000711578  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0017  CDS  NC_012850  13939  15543  1605  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_002973868  normal  hitchhiker  0.00536194  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0018  CDS  NC_012850  15910  17172  1263  adenylate/guanylate cyclase  YP_002973869  normal  normal  0.0171686  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0019  CDS  NC_012850  17871  18377  507  hypothetical protein  YP_002973870  normal  normal  0.0145718  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0020  CDS  NC_012850  18450  19442  993  Nitrilase  YP_002973871  normal  normal  0.0301643  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0021  CDS  NC_012850  19503  20096  594  hypothetical protein  YP_002973872  normal  normal  0.0146424  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0022  CDS  NC_012850  20099  21478  1380  Formamidase  YP_002973873  normal  0.846742  normal  0.0101399  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0023  CDS  NC_012850  22088  22723  636  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  YP_002973874  normal  hitchhiker  0.00721211  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0024  CDS  NC_012850  22950  24371  1422  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  YP_002973875  normal  normal  0.0173306  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0025  CDS  NC_012850  24569  25030  462  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  YP_002973876  normal  normal  0.0126747  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0026  CDS  NC_012850  25147  25437  291  chorismate mutase  YP_002973877  normal  0.630084  normal  0.0206275  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0027    NC_012850  25468  25773  306      normal  0.194485  normal  0.0205357  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0028  CDS  NC_012850  25777  26910  1134  CBS domain containing protein  YP_002973878  normal  0.490023  normal  0.0271352  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0029  CDS  NC_012850  26907  27422  516  protein of unknown function UPF0054  YP_002973879  normal  normal  0.0226276  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0030  CDS  NC_012850  27422  28471  1050  PhoH family protein  YP_002973880  normal  normal  0.04719  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0031  CDS  NC_012850  28490  29911  1422  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_002973881  normal  normal  0.191379  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0032  CDS  NC_012850  30232  31029  798  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_002973882  normal  normal  0.171039  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0033  CDS  NC_012850  31057  31485  429  ferric uptake regulator, Fur family  YP_002973883  normal  0.968997  normal  0.145253  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0034  CDS  NC_012850  31568  32062  495  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002973884  normal  normal  0.156182  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0035  CDS  NC_012850  32065  32727  663  peptidase M22 glycoprotease  YP_002973885  normal  normal  0.16685  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0036  CDS  NC_012850  32816  33382  567  Scaffold protein Nfu/NifU  YP_002973886  normal  normal  0.231277  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0037  CDS  NC_012850  33593  34084  492  UspA domain protein  YP_002973887  normal  0.451642  normal  0.156711  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0038  CDS  NC_012850  34214  35278  1065  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_002973888  normal  0.0701529  normal  0.176582  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0039  CDS  NC_012850  35409  35807  399  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002973889  normal  0.179033  normal  0.149996  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0040  CDS  NC_012850  35996  36424  429  Peptidase M15A  YP_002973890  normal  normal  0.21382  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0041  CDS  NC_012850  36507  37127  621  transcriptional regulator, TetR family  YP_002973891  normal  normal  0.218146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0042  CDS  NC_012850  37209  38207  999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002973892  normal  0.527428  normal  0.235169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0043  CDS  NC_012850  38256  38660  405  hypothetical protein  YP_002973893  normal  0.456021  normal  0.419625  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0044  CDS  NC_012850  38688  40268  1581  integral membrane protein MviN  YP_002973894  normal  normal  0.579561  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0045  CDS  NC_012850  40307  43213  2907  PII uridylyl-transferase  YP_002973895  normal  normal  0.893675  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0046  CDS  NC_012850  43368  43643  276  hypothetical protein  YP_002973896  normal  0.820289  normal  0.930839  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0047  CDS  NC_012850  43656  46382  2727  DNA mismatch repair protein MutS  YP_002973897  normal  0.967716  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0048  CDS  NC_012850  46496  48781  2286  malic enzyme  YP_002973898  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0049  CDS  NC_012850  49014  50003  990  transcriptional regulator, AraC family  YP_002973899  normal  0.80049  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0050  CDS  NC_012850  50340  51215  876  hypothetical protein  YP_002973900  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0051  CDS  NC_012850  51324  53606  2283  histidine kinase  YP_002973901  normal  0.553636  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0052  CDS  NC_012850  53662  54165  504  lipoprotein signal peptidase  YP_002973902  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0053  CDS  NC_012850  54162  55022  861  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_002973903  normal  0.87191  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0054  CDS  NC_012850  55019  56116  1098  putative SAM-dependent methyltransferase protein  YP_002973904  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0055  CDS  NC_012850  56302  56892  591  NUDIX hydrolase  YP_002973905  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0056  CDS  NC_012850  57016  57471  456  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  YP_002973906  normal  0.752516  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0057  CDS  NC_012850  57506  57943  438  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002973907  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0058  CDS  NC_012850  57996  58328  333  hypothetical protein  YP_002973908  normal  0.772862  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0059  CDS  NC_012850  58490  58789  300  integration host factor subunit beta  YP_002973909  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0060  CDS  NC_012850  58819  59769  951  signal peptide peptidase SppA, 36K type  YP_002973910  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0061  CDS  NC_012850  59995  60660  666  protein of unknown function DUF1239  YP_002973911  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0062  CDS  NC_012850  60715  61329  615  OstA family protein  YP_002973912  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0063  CDS  NC_012850  61370  62146  777  ABC transporter related  YP_002973913  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0064  CDS  NC_012850  62320  63879  1560  RNA polymerase factor sigma-54  YP_002973914  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0065  CDS  NC_012850  64007  64930  924  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_002973915  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0066  CDS  NC_012850  65223  65798  576  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  YP_002973916  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0067  CDS  NC_012850  65869  66333  465  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  YP_002973917  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0068  CDS  NC_012850  66479  66673  195  hypothetical protein  YP_002973918  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0069  CDS  NC_012850  66833  67732  900  PfkB domain protein  YP_002973919  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0070  CDS  NC_012850  67813  69036  1224  protein of unknown function DUF195  YP_002973920  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0071  CDS  NC_012850  69243  70727  1485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002973921  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0072  CDS  NC_012850  70825  71340  516  peptide deformylase  YP_002973922  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0073  CDS  NC_012850  71406  71666  261  putative plasmid stabilization protein  YP_002973923  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0074  CDS  NC_012850  71663  72082  420  PilT protein domain protein  YP_002973924  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0075  CDS  NC_012850  72103  73038  936  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_002973925  normal  0.716754  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0076  CDS  NC_012850  73038  73856  819  tRNA pseudouridine synthase A  YP_002973926  normal  0.426936  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0077  CDS  NC_012850  73863  74459  597  hypothetical protein  YP_002973927  normal  0.508565  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0078  CDS  NC_012850  74446  75639  1194  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_002973928  normal  0.191051  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0079  CDS  NC_012850  75741  76601  861  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_002973929  normal  0.0706947  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0080  CDS  NC_012850  76794  77660  867  hypothetical protein  YP_002973930  normal  0.569789  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0081  CDS  NC_012850  77747  78385  639  Calcium-binding EF-hand-containing protein  YP_002973931  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0082  CDS  NC_012850  78490  79197  708  pyrimidine 5'-nucleotidase  YP_002973932  normal  0.723897  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0083  CDS  NC_012850  79300  80376  1077  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  YP_002973933  normal  0.869567  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0084  CDS  NC_012850  80373  81143  771  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  YP_002973934  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0085  CDS  NC_012850  81209  82357  1149  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  YP_002973935  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0086  CDS  NC_012850  82427  83314  888  acetylglutamate kinase  YP_002973936  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0087  CDS  NC_012850  83458  83997  540  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002973937  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0088  CDS  NC_012850  83994  84713  720  hypothetical protein  YP_002973938  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0089  CDS  NC_012850  84836  85390  555  beta-Ig-H3/fasciclin  YP_002973939  normal  0.759896  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0090  CDS  NC_012850  85663  86739  1077  signal transduction histidine kinase  YP_002973940  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0091  CDS  NC_012850  86861  87136  276  hypothetical protein  YP_002973941  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0092  CDS  NC_012850  87257  87481  225  hypothetical protein  YP_002973942  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0093  CDS  NC_012850  87615  87824  210  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002973943  normal  0.941798  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0094  CDS  NC_012850  88092  88745  654  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_002973944  normal  0.0913226  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0095  CDS  NC_012850  88899  90692  1794  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_002973945  normal  0.10916  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0096  CDS  NC_012850  90692  91093  402  ribonuclease P  YP_002973946  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0097  CDS  NC_012850  91114  91248  135  50S ribosomal protein L34  YP_002973947  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0098  CDS  NC_012850  91668  93665  1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002973948  normal  0.713215  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0099  CDS  NC_012850  93823  95343  1521  histidine kinase  YP_002973949  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_0100  CDS  NC_012850  96024  97955  1932  hypothetical protein  YP_002973950  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 73    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>