4941 genes were found for organism Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 50    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Swit_0001  CDS  NC_009511  245  1678  1434  chromosomal replication initiation protein  YP_001260512  normal  0.839498  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0002  CDS  NC_009511  1789  2307  519  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  YP_001260513  normal  0.306655  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0003  CDS  NC_009511  2304  4091  1788  sodium/hydrogen exchanger  YP_001260514  normal  0.808331  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0004  CDS  NC_009511  4078  4431  354  hypothetical protein  YP_001260515  normal  0.230025  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0005  CDS  NC_009511  4444  6153  1710  band 7 protein  YP_001260516  normal  0.0238234  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0006  CDS  NC_009511  6150  6767  618  hypothetical protein  YP_001260517  normal  0.204292  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0007  CDS  NC_009511  6840  7949  1110  3-dehydroquinate synthase  YP_001260518  normal  0.313295  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0008  CDS  NC_009511  7946  8509  564  shikimate kinase  YP_001260519  normal  0.780526  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0009  CDS  NC_009511  8622  8759  138  hypothetical protein  YP_001260520  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0010  CDS  NC_009511  8740  10554  1815  hypothetical protein  YP_001260521  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0011  CDS  NC_009511  10709  11614  906  phage integrase family protein  YP_001260522  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0012  CDS  NC_009511  11706  13289  1584  major facilitator transporter  YP_001260523  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0013  CDS  NC_009511  13318  14364  1047  alanine racemase  YP_001260524  normal  0.326952  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0014  CDS  NC_009511  14366  15160  795  hypothetical protein  YP_001260525  normal  0.394088  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0015  CDS  NC_009511  15160  15918  759  ABC transporter related  YP_001260526  normal  0.0891779  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0016  CDS  NC_009511  16023  16577  555  redoxin domain-containing protein  YP_001260527  normal  0.276317  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0017  CDS  NC_009511  16635  17213  579  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001260528  normal  0.268724  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0018  CDS  NC_009511  17449  18300  852  metallophosphoesterase  YP_001260529  normal  0.511643  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0019  CDS  NC_009511  18302  19330  1029  glycosyl transferase, group 1  YP_001260530  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0020  CDS  NC_009511  19473  20150  678  hypothetical protein  YP_001260531  normal  0.559705  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0021  CDS  NC_009511  20286  20603  318  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  YP_001260532  normal  0.804691  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0022  CDS  NC_009511  20611  21504  894  farnesyl-diphosphate synthase  YP_001260533  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0023  CDS  NC_009511  21529  22026  498  phosphopantetheine adenylyltransferase  YP_001260534  normal  0.567178  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0024  CDS  NC_009511  22115  23023  909  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  YP_001260535  normal  0.185753  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0025  CDS  NC_009511  23033  24067  1035  S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase  YP_001260536  normal  0.109836  normal  0.983563  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0026  CDS  NC_009511  24171  25175  1005  hypothetical protein  YP_001260537  normal  0.0419187  normal  0.700261  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0027  CDS  NC_009511  25334  27262  1929  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  YP_001260538  normal  0.018636  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0028  CDS  NC_009511  27309  28004  696  aquaporin Z  YP_001260539  normal  0.0322686  normal  0.857355  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0029  CDS  NC_009511  28114  29760  1647  peptidase M28  YP_001260540  normal  0.204643  normal  0.983563  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0030  CDS  NC_009511  29952  30374  423  nucleoside diphosphate kinase  YP_001260541  normal  0.348386  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0031  CDS  NC_009511  30629  31009  381  hypothetical protein  YP_001260542  normal  0.247027  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0032  CDS  NC_009511  31009  31635  627  hypothetical protein  YP_001260543  normal  0.462789  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0033  CDS  NC_009511  31628  32206  579  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  YP_001260544  normal  0.519316  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0034  CDS  NC_009511  32247  33347  1101  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  YP_001260545  normal  0.430989  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0035  CDS  NC_009511  33408  34622  1215  hypothetical protein  YP_001260546  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0036  CDS  NC_009511  34619  35242  624  DNA replication initiation ATPase  YP_001260547  normal  0.804087  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0037  CDS  NC_009511  35252  37417  2166  polyphosphate kinase  YP_001260548  normal  0.859837  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0038  CDS  NC_009511  37404  38015  612  phosphoesterase, PA-phosphatase related  YP_001260549  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0039  CDS  NC_009511  38110  39609  1500  Ppx/GppA phosphatase  YP_001260550  normal  0.935227  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0040  CDS  NC_009511  39831  41738  1908  acyltransferase 3  YP_001260551  normal  0.578182  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0041  CDS  NC_009511  41890  42510  621  hypothetical protein  YP_001260552  hitchhiker  0.00622205  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0042  CDS  NC_009511  42513  43700  1188  ribonuclease D  YP_001260553  hitchhiker  0.00728921  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0043  CDS  NC_009511  43785  45566  1782  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001260554  hitchhiker  5.54718e-05  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0044  CDS  NC_009511  45783  46568  786  hypothetical protein  YP_001260555  decreased coverage  1.23179e-05  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0045  CDS  NC_009511  46707  46979  273  histone family protein DNA-binding protein  YP_001260556  decreased coverage  1.65888e-06  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0046  CDS  NC_009511  47310  47702  393  hypothetical protein  YP_001260557  decreased coverage  2.35341e-06  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0047  CDS  NC_009511  47725  47925  201  YcfA family protein  YP_001260558  decreased coverage  4.25869e-07  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0048  CDS  NC_009511  47976  48782  807  aminoglycoside phosphotransferase  YP_001260559  hitchhiker  0.000121913  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0049  CDS  NC_009511  48911  49090  180  hypothetical protein  YP_001260560  hitchhiker  0.000114389  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0050  CDS  NC_009511  49131  49778  648  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  YP_001260561  hitchhiker  0.000985448  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0051  CDS  NC_009511  49891  50949  1059  cysteine desulfurase  YP_001260562  normal  0.0157831  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0052  CDS  NC_009511  50946  52040  1095  aminotransferase, class V  YP_001260563  normal  0.0175702  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0053  CDS  NC_009511  52037  52372  336  ferredoxin  YP_001260564  normal  0.0123989  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0054  CDS  NC_009511  52456  53235  780  hypothetical protein  YP_001260565  normal  0.0571188  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0055  CDS  NC_009511  53421  55169  1749  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_001260566  normal  0.0628794  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0056  CDS  NC_009511  55166  55504  339  hypothetical protein  YP_001260567  normal  0.0233417  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0057  CDS  NC_009511  55679  56374  696  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  YP_001260568  normal  0.0334436  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0058  CDS  NC_009511  56388  57884  1497  hypothetical protein  YP_001260569  normal  0.0660277  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0059  CDS  NC_009511  57948  58745  798  hypothetical protein  YP_001260570  normal  0.110579  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0060  CDS  NC_009511  58880  59785  906  RNA polymerase factor sigma-32  YP_001260571  normal  0.0322341  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0061  CDS  NC_009511  59881  60846  966  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  YP_001260572  normal  0.102185  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0062  CDS  NC_009511  60864  61289  426  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  YP_001260573  normal  0.323006  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0063  CDS  NC_009511  61351  61977  627  hypothetical protein  YP_001260574  normal  0.917122  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0064  CDS  NC_009511  61990  62538  549  hypothetical protein  YP_001260575  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0065  CDS  NC_009511  62610  65048  2439  CheA signal transduction histidine kinase  YP_001260576  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0066  CDS  NC_009511  65051  65482  432  CheW protein  YP_001260577  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0067  CDS  NC_009511  65601  65969  369  response regulator receiver protein  YP_001260578  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0068  CDS  NC_009511  66005  67111  1107  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  YP_001260579  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0069  CDS  NC_009511  67102  67944  843  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_001260580  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0070  CDS  NC_009511  68054  68779  726  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001260581  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0071  CDS  NC_009511  69284  69814  531  hypothetical protein  YP_001260582  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0072  CDS  NC_009511  69781  70128  348  hypothetical protein  YP_001260583  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0073  CDS  NC_009511  70165  70599  435  response regulator receiver protein  YP_001260584  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0074  CDS  NC_009511  70997  71530  534  peptide methionine sulfoxide reductase  YP_001260585  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0075  CDS  NC_009511  71669  72610  942  translation factor SUA5  YP_001260586  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0076  CDS  NC_009511  72764  73111  348  GntR family transcriptional regulator  YP_001260587  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0077  CDS  NC_009511  73154  73744  591  nitroreductase  YP_001260588  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0078  CDS  NC_009511  73968  75779  1812  amino acid/peptide transporter  YP_001260589  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0079  CDS  NC_009511  75766  77181  1416  amidohydrolase  YP_001260590  normal  0.23873  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0080  CDS  NC_009511  77178  78464  1287  amidohydrolase 3  YP_001260591  normal  0.600035  normal  0.524396  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0081  CDS  NC_009511  78671  80008  1338  phosphoglucosamine mutase  YP_001260592  normal  0.494438  normal  0.513534  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0082  CDS  NC_009511  80133  80936  804  phosphomethylpyrimidine kinase  YP_001260593  normal  0.287429  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0083  CDS  NC_009511  81126  81734  609  50S ribosomal protein L9  YP_001260594  normal  0.584189  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0084  CDS  NC_009511  81753  81977  225  30S ribosomal protein S18  YP_001260595  normal  0.448199  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0085    NC_009511  82112  82423  312      normal  0.67061  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0086  CDS  NC_009511  82646  83581  936  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  YP_001260596  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0087  CDS  NC_009511  83687  84427  741  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  YP_001260597  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0088  CDS  NC_009511  84535  84771  237  acyl carrier protein  YP_001260598  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0089  CDS  NC_009511  84906  86171  1266  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  YP_001260599  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0090  CDS  NC_009511  86195  87166  972  aminodeoxychorismate lyase  YP_001260600  normal  0.537273  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0091  CDS  NC_009511  87345  87791  447  hypothetical protein  YP_001260601  normal  0.766626  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0092  CDS  NC_009511  87868  88284  417  hypothetical protein  YP_001260602  normal  0.905306  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0093  CDS  NC_009511  88304  88882  579  AsnC family transcriptional regulator  YP_001260603  normal  0.867547  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0094  CDS  NC_009511  88912  89811  900  hypothetical protein  YP_001260604  normal  0.73224  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0095  CDS  NC_009511  89819  90760  942  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001260605  normal  0.580266  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0096  CDS  NC_009511  90757  91695  939  NLP/P60 protein  YP_001260606  normal  0.7705  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0097  CDS  NC_009511  91652  91981  330  MarR family transcriptional regulator  YP_001260607  normal  0.427273  normal  0.972576  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0098  CDS  NC_009511  92121  93518  1398  leucyl aminopeptidase  YP_001260608  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0099  CDS  NC_009511  93521  93907  387  thioesterase superfamily protein  YP_001260609  normal  0.809262  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_0100  CDS  NC_009511  93907  94395  489  thioesterase superfamily protein  YP_001260610  normal  0.975371  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 50    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>