288 genes were found for organism Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Swit_5113  CDS  NC_009507  38  370  333  hypothetical protein  YP_001259991  normal  0.215351  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5114  CDS  NC_009507  945  1457  513  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  YP_001259992  normal  0.156794  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5115  CDS  NC_009507  1502  2416  915  phage integrase family protein  YP_001259993  normal  0.244336  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5116  CDS  NC_009507  2413  3042  630  phosphoglycerate mutase  YP_001259994  normal  0.156451  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5117  CDS  NC_009507  3043  3324  282  addiction module antitoxin  YP_001259995  normal  0.313763  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5118  CDS  NC_009507  3311  3577  267  addiction module antitoxin  YP_001259996  normal  0.659791  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5119  CDS  NC_009507  3996  4625  630  hypothetical protein  YP_001259997  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5120  CDS  NC_009507  4708  5361  654  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001259998  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5121  CDS  NC_009507  5358  5672  315  hypothetical protein  YP_001259999  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5122  CDS  NC_009507  6236  7108  873  resolvase domain-containing protein  YP_001260000  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5123  CDS  NC_009507  7245  7514  270  transposase  YP_001260001  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5124  CDS  NC_009507  7623  8996  1374  IS4 family transposase  YP_001260002  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5125  CDS  NC_009507  9061  11685  2625  transposase Tn3 family protein  YP_001260003  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5126  CDS  NC_009507  11699  12067  369  hypothetical protein  YP_001260004  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5127  CDS  NC_009507  12109  13674  1566  peptide chain release factor 3  YP_001260005  normal  0.166056  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5128  CDS  NC_009507  13687  14943  1257  major facilitator transporter  YP_001260006  normal  0.221032  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5129  CDS  NC_009507  15110  17425  2316  TonB-dependent receptor  YP_001260007  normal  0.283474  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5130  CDS  NC_009507  17655  19160  1506  integrase catalytic subunit  YP_001260008  normal  0.819554  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5131  CDS  NC_009507  19147  19875  729  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001260009  normal  0.701045  normal  0.85319  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5132  CDS  NC_009507  19945  21993  2049  TonB-dependent receptor  YP_001260010  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5133  CDS  NC_009507  22271  24025  1755  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  YP_001260011  normal  0.0596409  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5134  CDS  NC_009507  24439  25995  1557  AMP-binding domain protein  YP_001260012  normal  0.0657606  normal  0.735688  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5135  CDS  NC_009507  26067  27470  1404  aldehyde dehydrogenase  YP_001260013  normal  0.450877  normal  0.542224  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5136  CDS  NC_009507  27643  29772  2130  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_001260014  normal  0.388908  normal  0.506379  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5137  CDS  NC_009507  29836  30684  849  hypothetical protein  YP_001260015  normal  normal  0.510015  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5138  CDS  NC_009507  31056  31823  768  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001260016  normal  0.16967  normal  0.673975  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5139  CDS  NC_009507  31820  33226  1407  hypothetical protein  YP_001260017  normal  0.235994  normal  0.315254  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5140  CDS  NC_009507  33213  34718  1506  integrase catalytic subunit  YP_001260018  normal  0.920886  normal  0.438385  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5141  CDS  NC_009507  35066  35344  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001260019  normal  normal  0.467193  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5142  CDS  NC_009507  35720  36784  1065  hypothetical protein  YP_001260020  normal  normal  0.533774  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5143  CDS  NC_009507  36884  37858  975  patatin  YP_001260021  normal  normal  0.527098  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5144  CDS  NC_009507  37860  38279  420  hypothetical protein  YP_001260022  normal  normal  0.65649  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5145  CDS  NC_009507  38831  39523  693  hypothetical protein  YP_001260023  normal  normal  0.688934  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5146  CDS  NC_009507  39596  39904  309  hypothetical protein  YP_001260024  normal  normal  0.630327  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5147  CDS  NC_009507  39901  40575  675  hypothetical protein  YP_001260025  normal  normal  0.688934  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5148  CDS  NC_009507  40579  40842  264  hypothetical protein  YP_001260026  normal  normal  0.620606  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5149  CDS  NC_009507  41146  41880  735  hypothetical protein  YP_001260027  normal  normal  0.720779  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5150  CDS  NC_009507  42085  43284  1200  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  YP_001260028  normal  0.384118  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5151  CDS  NC_009507  43355  44752  1398  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_001260029  normal  0.0369329  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5152  CDS  NC_009507  44773  46035  1263  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  YP_001260030  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5153  CDS  NC_009507  46055  47425  1371  pyruvate dehydrogenase subunit beta  YP_001260031  normal  0.467221  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5154  CDS  NC_009507  47425  48507  1083  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  YP_001260032  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5155  CDS  NC_009507  48608  49519  912  LysR family transcriptional regulator  YP_001260033  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5156  CDS  NC_009507  49557  50216  660  hypothetical protein  YP_001260034  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5157  CDS  NC_009507  50222  50731  510  hypothetical protein  YP_001260035  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5158  CDS  NC_009507  50745  50945  201  hypothetical protein  YP_001260036  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5159  CDS  NC_009507  50996  54040  3045  conjugative relaxase region-like protein  YP_001260037  normal  0.734563  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5160  CDS  NC_009507  54040  56346  2307  hypothetical protein  YP_001260038  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5161  CDS  NC_009507  56336  56626  291  hypothetical protein  YP_001260039  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5162  CDS  NC_009507  57446  57670  225  hypothetical protein  YP_001260040  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5163  CDS  NC_009507  58042  58857  816  hypothetical protein  YP_001260041  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5164  CDS  NC_009507  59418  59702  285  hypothetical protein  YP_001260042  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5165  CDS  NC_009507  59709  60398  690  hypothetical protein  YP_001260043  normal  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5166  CDS  NC_009507  60462  61541  1080  hypothetical protein  YP_001260044  normal  0.31471  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5167  CDS  NC_009507  62443  63045  603  hypothetical protein  YP_001260045  normal  0.0883436  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5168  CDS  NC_009507  63078  63407  330  hypothetical protein  YP_001260046  normal  0.0167985  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5169  CDS  NC_009507  63466  63795  330  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  YP_001260047  normal  0.0108263  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5170  CDS  NC_009507  64404  64712  309  PhnA-like protein  YP_001260048  hitchhiker  0.00732124  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5171  CDS  NC_009507  64728  66548  1821  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_001260049  normal  0.0325265  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5172  CDS  NC_009507  66722  67036  315  XRE family transcriptional regulator  YP_001260050  hitchhiker  0.00460667  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5173  CDS  NC_009507  67039  68319  1281  sulphate transporter  YP_001260051  decreased coverage  0.00867302  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5174  CDS  NC_009507  68443  68994  552  hypothetical protein  YP_001260052  normal  0.0282662  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5175  CDS  NC_009507  69216  69782  567  hypothetical protein  YP_001260053  normal  0.0199058  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5176  CDS  NC_009507  69779  70051  273  hypothetical protein  YP_001260054  normal  0.051462  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5177  CDS  NC_009507  70160  71098  939  hypothetical protein  YP_001260055  normal  0.193477  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5178  CDS  NC_009507  71176  71460  285  hypothetical protein  YP_001260056  normal  0.350143  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5179  CDS  NC_009507  71473  72168  696  hypothetical protein  YP_001260057  normal  0.295611  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5180  CDS  NC_009507  72600  72914  315  hypothetical protein  YP_001260058  normal  0.0737722  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5181  CDS  NC_009507  73105  73515  411  PilT domain-containing protein  YP_001260059  normal  0.0895046  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5182  CDS  NC_009507  73515  73796  282  prevent-host-death family protein  YP_001260060  normal  0.104067  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5183  CDS  NC_009507  73809  74201  393  hypothetical protein  YP_001260061  normal  0.30118  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5184  CDS  NC_009507  74205  74675  471  hypothetical protein  YP_001260062  normal  0.181222  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5185  CDS  NC_009507  74678  75214  537  hypothetical protein  YP_001260063  normal  0.110518  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5186  CDS  NC_009507  75317  75781  465  hypothetical protein  YP_001260064  normal  0.093904  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5187  CDS  NC_009507  75919  76245  327  hypothetical protein  YP_001260065  normal  0.0224718  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5188  CDS  NC_009507  76460  78121  1662  hypothetical protein  YP_001260066  decreased coverage  0.00222761  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5189  CDS  NC_009507  78621  79325  705  hypothetical protein  YP_001260067  normal  0.251569  normal  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5190  CDS  NC_009507  79657  80583  927  MucR family transcriptional regulator  YP_001260068  normal  normal  0.533774  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5191  CDS  NC_009507  80651  81421  771  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  YP_001260069  normal  normal  0.511652  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5192  CDS  NC_009507  81316  82065  750  hypothetical protein  YP_001260070  normal  normal  0.374053  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5193  CDS  NC_009507  82068  82892  825  hypothetical protein  YP_001260071  normal  normal  0.264545  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5194  CDS  NC_009507  82900  83991  1092  hypothetical protein  YP_001260072  normal  normal  0.911534  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5195  CDS  NC_009507  84322  84747  426  hypothetical protein  YP_001260073  normal  0.615566  normal  0.785118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5196  CDS  NC_009507  84783  86432  1650  ParB family protein  YP_001260074  normal  normal  0.791015  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5197  CDS  NC_009507  86750  87901  1152  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001260075  normal  0.273009  normal  0.772032  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5198  CDS  NC_009507  88467  89435  969  hypothetical protein  YP_001260076  normal  normal  0.756457  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5199  CDS  NC_009507  90202  90804  603  hypothetical protein  YP_001260077  normal  normal  0.669876  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5200  CDS  NC_009507  90886  93165  2280  putative nitric-oxide reductase  YP_001260078  normal  normal  0.707045  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5201  CDS  NC_009507  93186  93656  471  hypothetical protein  YP_001260079  normal  normal  0.47253  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5202  CDS  NC_009507  93656  93934  279  hypothetical protein  YP_001260080  normal  normal  0.335815  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5203  CDS  NC_009507  93931  94380  450  nitric oxide dioxygenase  YP_001260081  normal  normal  0.34382  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5204  CDS  NC_009507  94424  95209  786  CRP/FNR family transcriptional regulator  YP_001260082  normal  normal  0.26828  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5205    NC_009507  95868  96017  150      normal  normal  0.32096  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5206  CDS  NC_009507  96094  96870  777  hypothetical protein  YP_001260083  normal  normal  0.369756  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5207  CDS  NC_009507  97073  97624  552  MucR family transcriptional regulator  YP_001260084  normal  normal  0.240071  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5208  CDS  NC_009507  97653  98201  549  hypothetical protein  YP_001260085  normal  normal  0.334826  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5209  CDS  NC_009507  98261  99064  804  hypothetical protein  YP_001260086  normal  0.767147  normal  0.342725  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5210  CDS  NC_009507  99231  99884  654  hypothetical protein  YP_001260087  normal  0.63102  normal  0.225819  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5211  CDS  NC_009507  100023  100817  795  integrase catalytic subunit  YP_001260088  normal  0.12008  normal  0.236418  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_5212    NC_009507  100937  101731  795      normal  0.016248  normal  0.23168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>