150 genes were found for organism Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dvul_2955  CDS  NC_008741  180  3527  -  3348  hypothetical protein  YP_961154  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2956  CDS  NC_008741  3578  4396  -  819  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_961155  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2957  CDS  NC_008741  4936  5196  +  261  hypothetical protein  YP_961156  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2958  CDS  NC_008741  6044  7339  -  1296  HipA domain-containing protein  YP_961157  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2959  CDS  NC_008741  7329  7721  -  393  DNA-binding protein, putative  YP_961158  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2960  CDS  NC_008741  8183  8971  +  789  extracellular solute-binding protein  YP_961159  normal  0.374689  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2961  CDS  NC_008741  9180  10916  -  1737  hypothetical protein  YP_961160  normal  0.392549  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2962  CDS  NC_008741  10948  13890  -  2943  major facilitator superfamily transporter  YP_961161  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2963  CDS  NC_008741  13898  15136  -  1239  hypothetical protein  YP_961162  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2964  CDS  NC_008741  15699  16160  -  462  TIR chaperone family protein  YP_961163  normal  0.612924  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2965  CDS  NC_008741  16171  19896  -  3726  hypothetical protein  YP_961164  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2966  CDS  NC_008741  21064  22611  +  1548  transcriptional regulator NifA  YP_961165  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2967  CDS  NC_008741  22791  23252  +  462  hypothetical protein  YP_961166  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2968  CDS  NC_008741  23558  25723  +  2166  outer membrane autotransporter  YP_961167  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2969  CDS  NC_008741  25887  27971  +  2085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_961168  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2970  CDS  NC_008741  27958  28605  +  648  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_961169  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2971  CDS  NC_008741  28727  29560  +  834  zinc transporter ZupT  YP_961170  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2972  CDS  NC_008741  32801  33091  -  291  CRISPR-associated Cas2 family protein  YP_961171  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2973  CDS  NC_008741  33096  34127  -  1032  CRISPR-associated Cas1 family protein  YP_961172  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2974  CDS  NC_008741  34111  34749  -  639  CRISPR-associated Cas4 family protein  YP_961173  normal  0.948346  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2975  CDS  NC_008741  34751  35623  -  873  CRISPR-associated Csd2 family protein  YP_961174  normal  0.989998  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2976  CDS  NC_008741  35626  37425  -  1800  CRISPR-associated RAMP Csd1 family protein  YP_961175  normal  0.952495  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2977  CDS  NC_008741  37422  38105  -  684  CRISPR-associated Cas5 family protein  YP_961176  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2978  CDS  NC_008741  38119  40356  -  2238  metal dependent phosphohydrolase  YP_961177  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2979  CDS  NC_008741  40641  43202  +  2562  hypothetical protein  YP_961178  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2980  CDS  NC_008741  43199  43666  -  468  TIR chaperone family protein  YP_961179  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2981  CDS  NC_008741  44039  45355  -  1317  lytic transglycosylase, catalytic  YP_961180  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2982  CDS  NC_008741  45366  45782  -  417  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_961181  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2983  CDS  NC_008741  45798  46133  -  336  anti-sigma-factor antagonist  YP_961182  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2984  CDS  NC_008741  46164  46814  -  651  type III secretion system protein  YP_961183  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2985  CDS  NC_008741  46811  48238  -  1428  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  YP_961184  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2986  CDS  NC_008741  48240  48917  -  678  type III secretion system needle length determinant  YP_961185  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2987  CDS  NC_008741  48948  49442  -  495  type III secretion YscO fmaily protein  YP_961186  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2988  CDS  NC_008741  49446  50762  -  1317  type III secretion system ATPase  YP_961187  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2989  CDS  NC_008741  51090  51707  -  618  type III secretion system protein  YP_961188  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2990  CDS  NC_008741  51686  52582  -  897  hypothetical protein  YP_961189  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2991  CDS  NC_008741  52589  53404  -  816  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  YP_961190  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2992  CDS  NC_008741  53429  54289  -  861  hypothetical protein  YP_961191  normal  0.439347  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2993  CDS  NC_008741  54332  54697  -  366  hypothetical protein  YP_961192  normal  0.704164  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2994  CDS  NC_008741  54901  55152  -  252  type III secretion system needle protein  YP_961193  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2995  CDS  NC_008741  55178  55387  -  210  hypothetical protein  YP_961194  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2996  CDS  NC_008741  55380  57176  -  1797  YscD/HrpQ family type III secretion apparatus protein  YP_961195  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2997  CDS  NC_008741  57173  59047  -  1875  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  YP_961196  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2998  CDS  NC_008741  59350  59805  -  456  TIR chaperone family protein  YP_961197  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2999  CDS  NC_008741  59858  60691  -  834  type III secretion system protein IpaC family  YP_961198  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3000  CDS  NC_008741  60703  61710  -  1008  type III secretion system target, YopB family  YP_961199  normal  0.328389  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3001  CDS  NC_008741  61707  62207  -  501  type III secretion low calcium response chaperone LcrH/SycD  YP_961200  normal  0.340103  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3002  CDS  NC_008741  62216  62725  -  510  hypothetical protein  YP_961201  normal  0.224134  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3003  CDS  NC_008741  62761  63063  -  303  hypothetical protein  YP_961202  normal  0.37426  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3004  CDS  NC_008741  63775  64899  +  1125  type III secretion regulator YopN/LcrE/InvE/MxiC  YP_961203  normal  0.552336  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3005  CDS  NC_008741  64902  65276  +  375  type III secretion chaperone SycN  YP_961204  normal  0.412179  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3006  CDS  NC_008741  65273  65641  +  369  hypothetical protein  YP_961205  normal  0.416545  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3007  CDS  NC_008741  65644  66003  +  360  tetratricopeptide TPR_4  YP_961206  normal  0.150492  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3008  CDS  NC_008741  66000  68093  +  2094  HrcV family type III secretion protein  YP_961207  normal  0.181145  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3009  CDS  NC_008741  68370  68630  +  261  HrpO family type III secretion protein  YP_961208  normal  0.189658  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3010  CDS  NC_008741  68637  69452  +  816  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  YP_961209  normal  0.100088  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3011  CDS  NC_008741  69449  70489  +  1041  YscD family type III secretion protein  YP_961210  normal  0.859866  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3012  CDS  NC_008741  70538  72382  +  1845  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_961211  normal  0.344125  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3013  CDS  NC_008741  72379  72753  +  375  hypothetical protein  YP_961212  normal  0.337109  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3014  CDS  NC_008741  72741  74912  +  2172  stage II sporulation E family protein  YP_961213  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3015  CDS  NC_008741  75093  76142  +  1050  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  YP_961214  normal  0.397676  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3016  CDS  NC_008741  76355  77896  -  1542  radical SAM domain-containing protein  YP_961215  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3017  CDS  NC_008741  78204  78683  +  480  hypothetical protein  YP_961216  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3018  CDS  NC_008741  78903  80360  -  1458  catalase  YP_961217  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3019  CDS  NC_008741  80497  81369  -  873  hypothetical protein  YP_961218  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3020  CDS  NC_008741  81914  82576  +  663  hypothetical protein  YP_961219  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3021  CDS  NC_008741  82883  84088  +  1206  hypothetical protein  YP_961220  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3022  CDS  NC_008741  84085  87390  +  3306  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_961221  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3023  CDS  NC_008741  87387  87779  +  393  response regulator receiver protein  YP_961222  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3024  CDS  NC_008741  87776  88867  +  1092  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  YP_961223  normal  0.433593  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3025  CDS  NC_008741  88979  92509  -  3531  hypothetical protein  YP_961224  normal  0.0376122  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3026  CDS  NC_008741  92563  92913  -  351  hypothetical protein  YP_961225  normal  0.0655104  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3027  CDS  NC_008741  93165  94196  +  1032  phage integrase family protein  YP_961226  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3028  CDS  NC_008741  94502  96616  -  2115  glycosyl transferase family protein  YP_961227  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3029  CDS  NC_008741  96616  97497  -  882  glycosyl transferase family protein  YP_961228  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3030  CDS  NC_008741  97595  98314  -  720  adenylyl-sulfate kinase  YP_961229  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3031  CDS  NC_008741  98749  99633  +  885  ABC-2 type transporter  YP_961230  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3032  CDS  NC_008741  99623  101059  +  1437  ABC transporter related  YP_961231  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3033  CDS  NC_008741  101074  102480  +  1407  radical SAM domain-containing protein  YP_961232  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3034  CDS  NC_008741  102568  103257  +  690  sulfotransferase family protein  YP_961233  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3035  CDS  NC_008741  103348  105996  +  2649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  YP_961234  normal  0.608951  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3036  CDS  NC_008741  106105  107442  +  1338  glycosyl transferase, group 1  YP_961235  normal  0.258746  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3037  CDS  NC_008741  107571  109727  +  2157  glycosyl transferase family protein  YP_961236  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3038  CDS  NC_008741  109820  111751  +  1932  methyltransferase type 11  YP_961237  normal  0.236938  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3039  CDS  NC_008741  111748  113484  +  1737  methyltransferase type 12  YP_961238  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3040  CDS  NC_008741  113528  115510  +  1983  hypothetical protein  YP_961239  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3041  CDS  NC_008741  115562  116686  +  1125  hypothetical protein  YP_961240  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3042  CDS  NC_008741  117058  118818  -  1761  patatin  YP_961241  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3043  CDS  NC_008741  118947  120983  -  2037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_961242  normal  0.546021  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3044  CDS  NC_008741  120980  122701  -  1722  hypothetical protein  YP_961243  normal  0.584506  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3045  CDS  NC_008741  122769  123776  -  1008  methicillin resistance protein  YP_961244  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3046  CDS  NC_008741  123773  125416  -  1644  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  YP_961245  normal  0.552764  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3047  CDS  NC_008741  125404  126723  -  1320  hypothetical protein  YP_961246  normal  0.836021  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3048  CDS  NC_008741  126720  128042  -  1323  hypothetical protein  YP_961247  normal  0.634245  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3049  CDS  NC_008741  128039  129379  -  1341  hypothetical protein  YP_961248  normal  0.623992  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3050  CDS  NC_008741  129506  130879  -  1374  hypothetical protein  YP_961249  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3051  CDS  NC_008741  130927  133656  -  2730  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  YP_961250  normal  0.640117  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3052  CDS  NC_008741  133724  135154  -  1431  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_961251  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3053  CDS  NC_008741  135309  135929  -  621  hypothetical protein  YP_961252  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_3054  CDS  NC_008741  135919  136848  -  930  eight transmembrane protein EpsH  YP_961253  normal  1  n/a    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>