3190 genes were found for organism Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dvul_0001  CDS  NC_008751  339  1724  +  1386  asparaginyl-tRNA synthetase  YP_965452  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0002  CDS  NC_008751  1758  2363  +  606  UspA domain-containing protein  YP_965453  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0003  CDS  NC_008751  2656  3441  -  786  putative lipoprotein  YP_965454  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0004  CDS  NC_008751  3444  6014  -  2571  DNA gyrase, A subunit  YP_965455  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0005  CDS  NC_008751  6114  8510  -  2397  DNA gyrase, B subunit  YP_965456  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0006  CDS  NC_008751  8512  9666  -  1155  DNA polymerase III, beta subunit  YP_965457  normal  0.590435  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0007  CDS  NC_008751  9812  11113  -  1302  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_965458  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0008  CDS  NC_008751  11465  12718  +  1254  peptidase M23B  YP_965459  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0009  CDS  NC_008751  13340  14683  -  1344  glutamine synthetase, type I  YP_965460  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0010  CDS  NC_008751  15142  15996  +  855  hypothetical protein  YP_965461  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0011  CDS  NC_008751  16232  18514  -  2283  DNA topoisomerase I  YP_965462  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0012  CDS  NC_008751  18620  19474  +  855  peptidase M48, Ste24p  YP_965463  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0013  CDS  NC_008751  19642  20655  +  1014  hypothetical protein  YP_965464  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0014  CDS  NC_008751  21358  22713  +  1356  permease  YP_965465  normal  0.700794  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0015  CDS  NC_008751  23278  23799  -  522  zinc resistance-associated protein  YP_965466  normal  0.893884  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0016  CDS  NC_008751  24392  26431  +  2040  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  YP_965467  normal  0.225702  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0017  CDS  NC_008751  26433  27812  +  1380  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_965468  normal  0.120309  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0018  CDS  NC_008751  28329  30674  +  2346  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  YP_965469  normal  0.132839  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0019  CDS  NC_008751  31155  31616  +  462  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  YP_965470  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0020  CDS  NC_008751  31710  32093  +  384  diacylglycerol kinase  YP_965471  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0021  CDS  NC_008751  32099  33673  +  1575  sulfatase  YP_965472  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0022  CDS  NC_008751  33873  34589  +  717  cell division ATP-binding protein FtsE  YP_965473  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0023  CDS  NC_008751  34589  35464  +  876  hypothetical protein  YP_965474  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0024  CDS  NC_008751  35497  37161  +  1665  dihydroxy-acid dehydratase  YP_965475  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0025  CDS  NC_008751  37633  40026  +  2394  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  YP_965476  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0026  CDS  NC_008751  40534  41322  +  789  methyltransferase type 11  YP_965477  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0027  CDS  NC_008751  41443  42696  +  1254  histidyl-tRNA synthetase  YP_965478  normal  0.583474  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0028  CDS  NC_008751  42715  44547  +  1833  aspartyl-tRNA synthetase  YP_965479  normal  0.607813  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0029  CDS  NC_008751  44849  45364  +  516  peptide deformylase  YP_965480  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0030  CDS  NC_008751  45337  46329  +  993  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_965481  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0031  CDS  NC_008751  46449  47372  +  924  hypothetical protein  YP_965482  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0032  CDS  NC_008751  47604  49127  +  1524  NusB/RsmB/TIM44  YP_965483  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0033  CDS  NC_008751  49224  49604  -  381  hypothetical protein  YP_965484  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0034  CDS  NC_008751  49686  50711  -  1026  ribokinase-like domain-containing protein  YP_965485  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0035  CDS  NC_008751  50722  51636  -  915  parB-like partition proteins  YP_965486  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0036  CDS  NC_008751  51713  52132  +  420  hypothetical protein  YP_965487  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0037  CDS  NC_008751  52137  52925  -  789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_965488  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0038  CDS  NC_008751  53683  54690  -  1008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_965489  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0039  CDS  NC_008751  54738  55493  -  756  band 7 protein  YP_965490  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0040  CDS  NC_008751  55963  56880  -  918  hypothetical protein  YP_965491  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0041  CDS  NC_008751  56862  58076  -  1215  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_965492  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0042  CDS  NC_008751  58076  58645  -  570  putative lipoprotein  YP_965493  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0043  CDS  NC_008751  58758  59873  +  1116  S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase  YP_965494  normal  0.660188  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0044  CDS  NC_008751  60237  60470  +  234  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_965495  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0045  CDS  NC_008751  60474  61547  +  1074  2-ketoisovalerate ferredoxin reductase  YP_965496  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0046  CDS  NC_008751  61547  62329  +  783  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  YP_965497  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0047  CDS  NC_008751  62329  62877  +  549  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_965498  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0048  CDS  NC_008751  62874  63119  -  246  hypothetical protein  YP_965499  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0049  CDS  NC_008751  63153  63524  -  372  hypothetical protein  YP_965500  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0050  CDS  NC_008751  63548  64717  -  1170  hypothetical protein  YP_965501  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0051  CDS  NC_008751  64729  65148  -  420  TadE family protein  YP_965502  normal  0.818933  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0052  CDS  NC_008751  65145  65561  -  417  TadE family protein  YP_965503  normal  0.780206  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0053  CDS  NC_008751  66201  67910  +  1710  potassium-transporting ATPase subunit A  YP_965504  normal  0.350618  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0054  CDS  NC_008751  67927  69963  +  2037  K+-transporting ATPase, B subunit  YP_965505  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0055  CDS  NC_008751  69973  70530  +  558  potassium-transporting ATPase, C subunit  YP_965506  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0056  CDS  NC_008751  70612  71751  +  1140  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  YP_965507  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0057  CDS  NC_008751  71748  73529  +  1782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_965508  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0058  CDS  NC_008751  73526  74875  +  1350  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_965509  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0059  CDS  NC_008751  75167  75625  -  459  hypothetical protein  YP_965510  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0060  CDS  NC_008751  75622  77880  -  2259  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_965511  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0061  CDS  NC_008751  77892  78167  -  276  hypothetical protein  YP_965512  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0062  CDS  NC_008751  78341  78673  +  333  hypothetical protein  YP_965513  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0063  CDS  NC_008751  78965  79378  +  414  small multidrug resistance protein  YP_965514  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0064  CDS  NC_008751  79375  79707  +  333  small multidrug resistance protein  YP_965515  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0065  CDS  NC_008751  79754  80026  +  273  hypothetical protein  YP_965516  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0066  CDS  NC_008751  80094  80804  -  711  ABC transporter related  YP_965517  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0067  CDS  NC_008751  80979  82445  -  1467  hypothetical protein  YP_965518  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0068  CDS  NC_008751  82442  82900  -  459  hypothetical protein  YP_965519  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0069  CDS  NC_008751  83134  83550  +  417  hypothetical protein  YP_965520  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0070  CDS  NC_008751  83815  86835  -  3021  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  YP_965521  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0071  CDS  NC_008751  86930  87283  +  354  hypothetical protein  YP_965522  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0072  CDS  NC_008751  87284  88207  -  924  dihydroorotate dehydrogenase family protein  YP_965523  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0073  CDS  NC_008751  88216  89112  -  897  oxidoreductase FAD-binding subunit  YP_965524  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0074  CDS  NC_008751  89298  91391  +  2094  peptidase U32  YP_965525  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0075  CDS  NC_008751  92060  92950  +  891  LysR family transcriptional regulator  YP_965526  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0076  CDS  NC_008751  92981  93436  -  456  hypothetical protein  YP_965527  normal  0.375945  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0077  CDS  NC_008751  93604  95058  -  1455  GntR family transcriptional regulator  YP_965528  normal  0.994833  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0078  CDS  NC_008751  95240  95716  +  477  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_965529  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0079  CDS  NC_008751  96130  97728  -  1599  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_965530  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0080  CDS  NC_008751  97716  98069  -  354  excinuclease ABC subunit C  YP_965531  normal  0.76446  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0081  CDS  NC_008751  98080  98799  -  720  beta-lactamase domain-containing protein  YP_965532  normal  0.316272  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0082  CDS  NC_008751  98906  99469  -  564  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  YP_965533  normal  0.257133  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0083  CDS  NC_008751  101089  101370  -  282  hypothetical protein  YP_965534  normal  0.088543  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0084  CDS  NC_008751  101367  101684  -  318  hypothetical protein  YP_965535  normal  0.051748  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0085  CDS  NC_008751  101700  101921  -  222  DNA binding domain-containing protein  YP_965536  normal  0.0754203  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0086  CDS  NC_008751  102296  102829  -  534  hypothetical protein  YP_965537  normal  0.176439  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0087  CDS  NC_008751  102826  105174  -  2349  TOPRIM domain-containing protein  YP_965538  normal  0.417262  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0088  CDS  NC_008751  105174  105422  -  249  hypothetical protein  YP_965539  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0089  CDS  NC_008751  105895  107097  -  1203  phage integrase family protein  YP_965540  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0090  CDS  NC_008751  107967  109322  -  1356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_965541  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0091  CDS  NC_008751  109337  110797  -  1461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_965542  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0092  CDS  NC_008751  110794  112842  -  2049  response regulator receiver protein  YP_965543  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0093  CDS  NC_008751  113322  113864  +  543  hypothetical protein  YP_965544  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0094  CDS  NC_008751  113926  114219  +  294  hypothetical protein  YP_965545  normal  1  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0095  CDS  NC_008751  114233  115303  +  1071  hypothetical protein  YP_965546  normal  0.571557  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0096  CDS  NC_008751  115290  116072  +  783  hypothetical protein  YP_965547  normal  0.157525  normal  0.724798  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0097  CDS  NC_008751  116317  117576  +  1260  aromatic amino acid transporter  YP_965548  normal  0.103921  normal  0.507347  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0098  CDS  NC_008751  117604  118131  -  528  hypothetical protein  YP_965549  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0099  CDS  NC_008751  118322  118969  +  648  hemolysin III family channel protein  YP_965550  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0100  CDS  NC_008751  119275  120669  -  1395  aldehyde dehydrogenase  YP_965551  normal  0.0407141  normal  0.302016  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>