5172 genes were found for organism Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sare_0001  CDS  NC_009953  148  1923  1776  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001534928  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0002  CDS  NC_009953  2705  3838  1134  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001534929  hitchhiker  0.00244113  unclonable  1.86271e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0003  CDS  NC_009953  3877  4749  873  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_001534930  hitchhiker  0.00595784  unclonable  1.31137e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0004  CDS  NC_009953  4766  5896  1131  recombination protein F  YP_001534931  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0005  CDS  NC_009953  5889  6494  606  hypothetical protein  YP_001534932  normal  unclonable  1.27236e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0006  CDS  NC_009953  6485  7066  582  hypothetical protein  YP_001534933  normal  unclonable  1.4647e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0007  CDS  NC_009953  7563  9509  1947  DNA gyrase, B subunit  YP_001534934  normal  hitchhiker  6.47413e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0008  CDS  NC_009953  9641  12160  2520  DNA gyrase subunit A  YP_001534935  normal  hitchhiker  1.16309e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0009  CDS  NC_009953  12165  13073  909  hypothetical protein  YP_001534936  normal  hitchhiker  0.000183119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0010  CDS  NC_009953  14087  15292  1206  XRE family transcriptional regulator  YP_001534937  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0011  CDS  NC_009953  15477  15656  180  hypothetical protein  YP_001534938  normal  0.455135  hitchhiker  0.00670582  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0012  CDS  NC_009953  15656  15889  234  hypothetical protein  YP_001534939  normal  0.70619  hitchhiker  0.00675709  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0013  CDS  NC_009953  16357  16869  513  hypothetical protein  YP_001534940  normal  hitchhiker  0.00708005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0014  CDS  NC_009953  17038  17418  381  hypothetical protein  YP_001534941  normal  normal  0.0552285  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0015  CDS  NC_009953  17613  17879  267  regulator of chromosome condensation, RCC1  YP_001534942  normal  normal  0.0528961  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0016  CDS  NC_009953  18032  18661  630  regulator of chromosome condensation, RCC1  YP_001534943  normal  normal  0.0650172  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0017  CDS  NC_009953  19079  20239  1161  hemolysin-type calcium-binding region  YP_001534944  normal  normal  0.206697  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0018  CDS  NC_009953  20879  21007  129  hypothetical protein  YP_001534945  normal  normal  0.308201  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0019  CDS  NC_009953  21409  23997  2589  valyl-tRNA synthetase  YP_001534946  normal  normal  0.661225  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0020  CDS  NC_009953  24135  25088  954  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001534947  normal  0.857779  normal  0.7385  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0021  CDS  NC_009953  25147  29685  4539  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  YP_001534948  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0022  CDS  NC_009953  29847  30164  318  hypothetical protein  YP_001534949  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0023  CDS  NC_009953  30307  30501  195  hypothetical protein  YP_001534950  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0024  CDS  NC_009953  30588  31223  636  DSBA oxidoreductase  YP_001534951  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0025  CDS  NC_009953  31244  31663  420  Fe-S metabolism associated SufE  YP_001534952  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0026  CDS  NC_009953  31823  32248  426  CBS domain-containing protein  YP_001534953  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0027  CDS  NC_009953  32505  33272  768  GDSL family lipase  YP_001534954  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0028  CDS  NC_009953  33356  34249  894  rhodanese domain-containing protein  YP_001534955  normal  0.53804  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0029  CDS  NC_009953  34333  35568  1236  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_001534956  normal  0.282311  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0030  CDS  NC_009953  35894  36475  582  TetR family transcriptional regulator  YP_001534957  normal  0.19641  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0031  CDS  NC_009953  36598  37935  1338  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  YP_001534958  normal  0.508002  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0032  CDS  NC_009953  38129  39040  912  pyruvate carboxyltransferase  YP_001534959  normal  0.624868  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0033  CDS  NC_009953  39238  40770  1533  propionyl-CoA carboxylase  YP_001534960  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0034  CDS  NC_009953  40828  41982  1155  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001534961  normal  0.211865  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0035  CDS  NC_009953  42110  44671  2562  XRE family transcriptional regulator  YP_001534962  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0036  CDS  NC_009953  45043  45207  165  hypothetical protein  YP_001534963  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0037  CDS  NC_009953  45370  46848  1479  hypothetical protein  YP_001534964  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0038  CDS  NC_009953  46934  48370  1437  hypothetical protein  YP_001534965  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0039  CDS  NC_009953  48473  48883  411  hypothetical protein  YP_001534966  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0040  CDS  NC_009953  48987  49274  288  hypothetical protein  YP_001534967  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0041  CDS  NC_009953  49693  50574  882  XRE family transcriptional regulator  YP_001534968  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0042  CDS  NC_009953  50544  50765  222  hypothetical protein  YP_001534969  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0043  CDS  NC_009953  50962  51366  405  hypothetical protein  YP_001534970  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0044  CDS  NC_009953  51562  53118  1557  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_001534971  normal  normal  0.61029  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0045  CDS  NC_009953  53191  53994  804  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  YP_001534972  normal  normal  0.561065  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0046  CDS  NC_009953  53991  55064  1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001534973  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0047  CDS  NC_009953  55506  56267  762  FHA domain-containing protein  YP_001534974  normal  normal  0.183651  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0048  CDS  NC_009953  56274  56759  486  FHA domain-containing protein  YP_001534975  normal  normal  0.177514  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0049  CDS  NC_009953  56756  58192  1437  protein serine/threonine phosphatase  YP_001534976  normal  normal  0.24969  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0050  CDS  NC_009953  58221  59711  1491  cell cycle protein  YP_001534977  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0051  CDS  NC_009953  59708  61219  1512  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001534978  normal  0.948858  normal  0.601931  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0052  CDS  NC_009953  61221  62648  1428  serine/threonine protein kinase  YP_001534979  normal  0.302171  normal  0.296682  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0053  CDS  NC_009953  62645  64456  1812  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_001534980  normal  normal  0.319641  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0054  CDS  NC_009953  64501  65151  651  para-aminobenzoate synthase component II  YP_001534981  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0055  CDS  NC_009953  65155  65439  285  hypothetical protein  YP_001534982  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0056  CDS  NC_009953  65444  67114  1671  sortase family protein  YP_001534983  normal  normal  0.761592  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0057  CDS  NC_009953  67111  67914  804  hypothetical protein  YP_001534984  normal  normal  0.573043  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0058  CDS  NC_009953  68100  68363  264  hypothetical protein  YP_001534985  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0059  CDS  NC_009953  68671  70827  2157  hypothetical protein  YP_001534986  normal  0.149051  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0060  CDS  NC_009953  71210  72223  1014  NLP/P60 protein  YP_001534987  normal  0.306663  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0061  CDS  NC_009953  72345  72923  579  deoxycytidine triphosphate deaminase  YP_001534988  normal  0.767795  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0062  CDS  NC_009953  73001  73534  534  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_001534989  normal  0.882537  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0063  CDS  NC_009953  73610  74614  1005  hypothetical protein  YP_001534990  normal  0.430351  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0064  CDS  NC_009953  75029  75577  549  hypothetical protein  YP_001534991  normal  0.895332  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0065  CDS  NC_009953  76641  77435  795  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  YP_001534992  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0066  CDS  NC_009953  77525  78124  600  hypothetical protein  YP_001534993  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0067  CDS  NC_009953  78756  79595  840  methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP(+))  YP_001534994  normal  0.582205  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0068  CDS  NC_009953  79903  80340  438  hypothetical protein  YP_001534995  normal  0.614538  normal  0.391518  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0069  CDS  NC_009953  80497  81000  504  hypothetical protein  YP_001534996  normal  0.504973  normal  0.388355  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0070  CDS  NC_009953  81072  81755  684  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001534997  normal  normal  0.376283  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0071    NC_009953  82224  82457  234      normal  normal  0.282343  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0072  CDS  NC_009953  83114  83716  603  hypothetical protein  YP_001534998  normal  normal  0.736738  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0073  CDS  NC_009953  84240  84572  333  ArsR family transcriptional regulator  YP_001534999  normal  normal  0.77483  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0074  CDS  NC_009953  84865  86082  1218  FAD dependent oxidoreductase  YP_001535000  normal  normal  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0075  CDS  NC_009953  86607  89450  2844  peptidase M28  YP_001535001  normal  0.11414  normal  0.170085  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0076  CDS  NC_009953  89708  90382  675  two component transcriptional regulator  YP_001535002  normal  0.609657  normal  0.228369  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0077  CDS  NC_009953  90861  91730  870  alpha/beta hydrolase fold  YP_001535003  normal  0.775579  normal  0.0946583  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0078  CDS  NC_009953  91940  93550  1611  major facilitator transporter  YP_001535004  normal  normal  0.0195486  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0079  CDS  NC_009953  93741  94757  1017  RNA polymerase factor sigma-70  YP_001535005  normal  normal  0.0146816  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0080  CDS  NC_009953  94729  95007  279  hypothetical protein  YP_001535006  normal  normal  0.028522  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0081  CDS  NC_009953  94988  95458  471  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001535007  normal  normal  0.0306136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0082  CDS  NC_009953  95530  96420  891  luciferase family protein  YP_001535008  normal  0.852377  normal  0.035271  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0083  CDS  NC_009953  96426  96977  552  phosphoribosyltransferase  YP_001535009  normal  0.448882  normal  0.0337922  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0084  CDS  NC_009953  97223  97864  642  rare lipoprotein A  YP_001535010  normal  0.332012  normal  0.0350309  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0085  CDS  NC_009953  97965  99092  1128  protein serine/threonine phosphatase  YP_001535011  normal  0.611394  normal  0.0411446  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0086  CDS  NC_009953  99175  101028  1854  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001535012  normal  normal  0.0567626  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0087  CDS  NC_009953  101213  101482  270  hypothetical protein  YP_001535013  normal  normal  0.0299124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0088  CDS  NC_009953  101564  102193  630  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  YP_001535014  normal  normal  0.0118265  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0089  CDS  NC_009953  102219  103157  939  AraC family transcriptional regulator  YP_001535015  normal  hitchhiker  0.00450491  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0090  CDS  NC_009953  103264  103971  708  ThiJ/PfpI domain-containing protein  YP_001535016  normal  hitchhiker  0.00447064  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0091  CDS  NC_009953  103968  104444  477  hypothetical protein  YP_001535017  normal  hitchhiker  0.00457566  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0092  CDS  NC_009953  104441  104722  282  hypothetical protein  YP_001535018  normal  hitchhiker  0.000380218  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0093  CDS  NC_009953  104846  105523  678  hemolysin III family channel protein  YP_001535019  normal  hitchhiker  0.00042868  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0094  CDS  NC_009953  105786  106529  744  allophanate hydrolase subunit 1  YP_001535020  normal  hitchhiker  0.000483676  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0095  CDS  NC_009953  106526  107461  936  urea amidolyase related protein  YP_001535021  normal  hitchhiker  0.000550439  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0096  CDS  NC_009953  107445  108194  750  LamB/YcsF family protein  YP_001535022  normal  hitchhiker  0.000523388  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0097  CDS  NC_009953  108238  110076  1839  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001535023  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0098  CDS  NC_009953  111087  111854  768  hypothetical protein  YP_001535024  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0099  CDS  NC_009953  111845  112036  192  hypothetical protein  YP_001535025  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0100  CDS  NC_009953  112116  112304  189  hypothetical protein  YP_001535026  normal  0.041732  hitchhiker  0.000709703  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>