1864 genes were found for organism Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tpet_0001  CDS  NC_009486  72  1394  1323  chromosomal replication initiation protein  YP_001243606  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0002  CDS  NC_009486  1518  2567  1050  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_001243607  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0003  CDS  NC_009486  2558  3418  861  radical SAM domain-containing protein  YP_001243608  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0004  CDS  NC_009486  3415  4548  1134  TPR repeat-containing protein  YP_001243609  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0005  CDS  NC_009486  4545  6041  1497  carbohydrate kinase, YjeF related protein  YP_001243610  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0006  CDS  NC_009486  6046  6510  465  lytic transglycosylase, catalytic  YP_001243611  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0007  CDS  NC_009486  6507  7586  1080  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001243612  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0008  CDS  NC_009486  7597  8013  417  OsmC family protein  YP_001243613  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0009  CDS  NC_009486  8023  10008  1986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001243614  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0010  CDS  NC_009486  10043  10972  930  phosphate transporter  YP_001243615  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0011  CDS  NC_009486  11313  12167  855  hypothetical protein  YP_001243616  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0012  CDS  NC_009486  12154  12870  717  ribonuclease HII  YP_001243617  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0013  CDS  NC_009486  12821  13462  642  hypothetical protein  YP_001243618  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0014  CDS  NC_009486  13464  14231  768  MazG family protein  YP_001243619  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0015  CDS  NC_009486  14228  15217  990  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001243620  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0016  CDS  NC_009486  15214  16245  1032  aIF-2BI family translation initiation factor  YP_001243621  normal  0.339634  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0017  CDS  NC_009486  16249  17019  771  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_001243622  normal  0.0289665  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0018  CDS  NC_009486  16950  18074  1125  flagellar biosynthetic protein FlhB  YP_001243623  hitchhiker  9.37461e-05  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0019  CDS  NC_009486  18071  20107  2037  flagellar biosynthesis protein FlhA  YP_001243624  unclonable  1.47503e-08  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0020  CDS  NC_009486  20104  21240  1137  flagellar biosynthesis regulator FlhF  YP_001243625  unclonable  3.98912e-10  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0021  CDS  NC_009486  21206  22033  828  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001243626  hitchhiker  4.72925e-08  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0022  CDS  NC_009486  22040  22729  690  type IV pilus assembly PilZ  YP_001243627  hitchhiker  2.12001e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0023  CDS  NC_009486  22726  23340  615  CheC, inhibitor of MCP methylation  YP_001243628  decreased coverage  1.67071e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0024  CDS  NC_009486  23337  23810  474  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  YP_001243629  decreased coverage  1.54554e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0025  CDS  NC_009486  23828  24472  645  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  YP_001243630  decreased coverage  4.17711e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0026  CDS  NC_009486  24456  24761  306  hypothetical protein  YP_001243631  hitchhiker  1.45367e-08  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0027  CDS  NC_009486  24758  25240  483  hypothetical protein  YP_001243632  decreased coverage  1.99805e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0028  CDS  NC_009486  25225  25890  666  hypothetical protein  YP_001243633  decreased coverage  5.02789e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0029  CDS  NC_009486  25874  26104  231  hypothetical protein  YP_001243634  decreased coverage  1.2193e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0030  CDS  NC_009486  26104  26379  276  stage V sporulation protein S  YP_001243635  unclonable  5.73648e-11  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0031  CDS  NC_009486  26443  27453  1011  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_001243636  decreased coverage  2.58935e-08  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0032  CDS  NC_009486  27458  28918  1461  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  YP_001243637  hitchhiker  4.64637e-05  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0033  CDS  NC_009486  28915  29544  630  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001243638  hitchhiker  0.000234295  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0034  CDS  NC_009486  29551  30264  714  bacitracin resistance protein BacA  YP_001243639  hitchhiker  5.86999e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0035  CDS  NC_009486  30266  30871  606  CBS domain-containing protein  YP_001243640  hitchhiker  0.000268631  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0036  CDS  NC_009486  30868  31902  1035  4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase  YP_001243641  hitchhiker  0.00218078  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0037  CDS  NC_009486  31899  33404  1506  peptidase M50  YP_001243642  hitchhiker  1.00693e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0038  CDS  NC_009486  33380  34510  1131  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001243643  hitchhiker  0.000153353  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0039  CDS  NC_009486  34489  35097  609  thiamine pyrophosphokinase  YP_001243644  hitchhiker  9.9633e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0040  CDS  NC_009486  35162  35572  411  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  YP_001243645  hitchhiker  6.92082e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0041  CDS  NC_009486  35569  37500  1932  glycosyl transferase family protein  YP_001243646  decreased coverage  6.12567e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0042  CDS  NC_009486  37504  38061  558  hypothetical protein  YP_001243647  hitchhiker  0.00261676  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0043  CDS  NC_009486  38027  39370  1344  radical SAM domain-containing protein  YP_001243648  normal  0.0628937  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0044  CDS  NC_009486  39367  40122  756  pantothenate kinase  YP_001243649  normal  0.504635  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0045  CDS  NC_009486  40243  41535  1293  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  YP_001243650  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0046  CDS  NC_009486  41540  42454  915  homoserine O-succinyltransferase  YP_001243651  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0047  CDS  NC_009486  42530  43654  1125  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  YP_001243652  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0048  CDS  NC_009486  43666  43863  198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001243653  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0049  CDS  NC_009486  43865  45010  1146  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit alpha  YP_001243654  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0050  CDS  NC_009486  45066  46355  1290  phosphopyruvate hydratase  YP_001243655  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0051  CDS  NC_009486  46406  47326  921  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001243656  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0052  CDS  NC_009486  47323  47799  477  hypothetical protein  YP_001243657  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0053  CDS  NC_009486  47809  48429  621  peptidase M22, glycoprotease  YP_001243658  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0054  CDS  NC_009486  48436  50814  2379  ATPase  YP_001243659  hitchhiker  0.000145392  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0055  CDS  NC_009486  51070  51969  900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_001243660  hitchhiker  0.000417254  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0056  CDS  NC_009486  52037  52225  189  hypothetical protein  YP_001243661  hitchhiker  0.000586494  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0057  CDS  NC_009486  52235  53983  1749  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001243662  normal  0.0254868  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0058  CDS  NC_009486  53974  54927  954  thioredoxin reductase  YP_001243663  hitchhiker  0.00992397  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0059  CDS  NC_009486  54934  55599  666  glutaredoxin-like domain-containing protein  YP_001243664  decreased coverage  0.000207157  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0060  CDS  NC_009486  55629  56111  483  hypothetical protein  YP_001243665  hitchhiker  0.00043067  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0061  CDS  NC_009486  56108  57025  918  band 7 protein  YP_001243666  hitchhiker  0.00313093  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0062  CDS  NC_009486  57039  57461  423  hypothetical protein  YP_001243667  normal  0.351134  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0063  CDS  NC_009486  57474  58316  843  ribonuclease Z  YP_001243668  normal  0.715887  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0064  CDS  NC_009486  58313  58762  450  50S ribosomal protein L9  YP_001243669  normal  0.452229  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0065  CDS  NC_009486  58845  59912  1068  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  YP_001243670  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0066  CDS  NC_009486  59936  60817  882  protein-export membrane protein SecF  YP_001243671  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0067  CDS  NC_009486  60814  62211  1398  protein-export membrane protein SecD  YP_001243672  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0068  CDS  NC_009486  62215  62565  351  preprotein translocase, YajC subunit  YP_001243673  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0069  CDS  NC_009486  62558  63058  501  hypothetical protein  YP_001243674  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0070  CDS  NC_009486  63066  63947  882  riboflavin biosynthesis protein RibF  YP_001243675  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0071  CDS  NC_009486  63953  64882  930  tRNA pseudouridine synthase B  YP_001243676  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0072  CDS  NC_009486  64879  65274  396  ribosome-binding factor A  YP_001243677  normal  0.884445  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0073  CDS  NC_009486  65287  66144  858  metal dependent phosphohydrolase  YP_001243678  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0074  CDS  NC_009486  66113  67594  1482  histidine kinase  YP_001243679  normal  0.376042  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0075  CDS  NC_009486  67602  68609  1008  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001243680  hitchhiker  0.000138931  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0076  CDS  NC_009486  68880  69896  1017  heat-inducible transcription repressor HrcA  YP_001243681  hitchhiker  6.66316e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0077  CDS  NC_009486  69902  70420  519  GrpE protein  YP_001243682  hitchhiker  7.49846e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0078  CDS  NC_009486  70427  71536  1110  chaperone protein DnaJ  YP_001243683  hitchhiker  0.000211475  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0079  CDS  NC_009486  71533  72624  1092  GTP-binding protein, HSR1-related  YP_001243684  hitchhiker  2.12587e-07  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0080  CDS  NC_009486  72636  73538  903  GTP-binding protein Era  YP_001243685  hitchhiker  1.15632e-07  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0081  CDS  NC_009486  73528  73926  399  cytidine deaminase  YP_001243686  unclonable  4.36242e-11  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0082  CDS  NC_009486  73865  75232  1368  hypothetical protein  YP_001243687  unclonable  1.79952e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0083  CDS  NC_009486  75249  75704  456  hypothetical protein  YP_001243688  hitchhiker  8.37778e-07  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0084  CDS  NC_009486  75701  76615  915  glutamate formiminotransferase  YP_001243689  hitchhiker  1.4964e-05  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0085  CDS  NC_009486  76612  77373  762  response regulator receiver protein  YP_001243690  hitchhiker  2.52622e-05  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0086  CDS  NC_009486  77412  78782  1371  PEGA domain-containing protein  YP_001243691  hitchhiker  0.00061684  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0087  CDS  NC_009486  78799  79446  648  hypothetical protein  YP_001243692  hitchhiker  2.66726e-05  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0088  CDS  NC_009486  79495  80505  1011  cell cycle protein  YP_001243693  hitchhiker  7.0241e-05  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0089  CDS  NC_009486  80572  81777  1206  S-layer-like domain-containing protein  YP_001243694  hitchhiker  3.64346e-05  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0090  CDS  NC_009486  81774  83477  1704  type II secretion system protein E  YP_001243695  hitchhiker  7.79667e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0091  CDS  NC_009486  83477  84532  1056  cell division protein FtsZ  YP_001243696  hitchhiker  6.55014e-06  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0092  CDS  NC_009486  84549  85799  1251  cell division protein FtsA  YP_001243697  unclonable  1.48304e-09  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0093  CDS  NC_009486  85801  86355  555  hypothetical protein  YP_001243698  unclonable  1.27724e-10  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0094  CDS  NC_009486  86358  88268  1911  DNA gyrase, B subunit  YP_001243699  hitchhiker  3.63706e-07  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0095  CDS  NC_009486  88249  88554  306  Zn-ribbon-containing protein  YP_001243700  hitchhiker  0.00142092  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0096  CDS  NC_009486  88551  89372  822  aminotransferase, class IV  YP_001243701  normal  0.198329  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0097  CDS  NC_009486  89332  90636  1305  MiaB-like tRNA modifying enzyme  YP_001243702  normal  0.698002  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0098  CDS  NC_009486  90633  91085  453  CBS domain-containing protein  YP_001243703  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0099  CDS  NC_009486  91086  92045  960  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001243704  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Tpet_0100  CDS  NC_009486  92075  92779  705  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  YP_001243705  normal  n/a    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>