2062 genes were found for organism Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pisl_0001  CDS  NC_008701  1492  1857  366  paREP9  YP_929528  normal  0.244204  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0002  CDS  NC_008701  1869  2660  792  hypothetical protein  YP_929529  normal  0.246824  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0003  CDS  NC_008701  3000  3623  624  hypothetical protein  YP_929530  normal  0.62536  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0004  CDS  NC_008701  3668  4570  903  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_929531  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0005  CDS  NC_008701  4829  6109  1281  transposase, IS605 OrfB  YP_929532  normal  0.741123  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0006  CDS  NC_008701  6216  6506  291  hypothetical protein  YP_929533  normal  0.578699  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0007  CDS  NC_008701  6710  6877  168  hypothetical protein  YP_929534  normal  0.338843  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0008  CDS  NC_008701  6907  7482  576  hypothetical protein  YP_929535  normal  0.244204  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0009  CDS  NC_008701  7469  8215  747  zinc/iron permease  YP_929536  normal  0.288224  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0010  CDS  NC_008701  8263  9234  972  zinc finger, RanBP2-type  YP_929537  normal  0.431527  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0011  CDS  NC_008701  9231  9527  297  hypothetical protein  YP_929538  normal  0.208903  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0012  CDS  NC_008701  9524  10444  921  hypothetical protein  YP_929539  normal  0.603813  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0013  CDS  NC_008701  10441  11241  801  hypothetical protein  YP_929540  normal  0.80548  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0014  CDS  NC_008701  11280  12122  843  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  YP_929541  normal  0.387521  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0015  CDS  NC_008701  12119  13117  999  hypothetical protein  YP_929542  normal  0.194764  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0016  CDS  NC_008701  13170  14108  939  aminotransferase, class I and II  YP_929543  normal  0.0382489  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0017  CDS  NC_008701  14031  14945  915  PP-loop domain-containing protein  YP_929544  normal  0.128893  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0018  CDS  NC_008701  14984  15613  630  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  YP_929545  normal  0.840157  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0019  CDS  NC_008701  16178  17203  1026  hypothetical protein  YP_929546  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0020  CDS  NC_008701  17273  18145  873  hypothetical protein  YP_929547  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0021  CDS  NC_008701  18145  19062  918  hypothetical protein  YP_929548  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0022  CDS  NC_008701  19059  20141  1083  radical SAM domain-containing protein  YP_929549  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0023  CDS  NC_008701  20302  20532  231  hypothetical protein  YP_929550  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0024  CDS  NC_008701  20507  22588  2082  hypothetical protein  YP_929551  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0025  CDS  NC_008701  22660  23862  1203  hypothetical protein  YP_929552  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0026  CDS  NC_008701  23859  24401  543  hypothetical protein  YP_929553  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0027  CDS  NC_008701  24374  24631  258  hypothetical protein  YP_929554  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0028  CDS  NC_008701  25003  26415  1413  hypothetical protein  YP_929555  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0029  CDS  NC_008701  26445  27653  1209  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_929556  normal  0.471693  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0030  CDS  NC_008701  27724  28878  1155  methionine synthase, vitamin-B12 independent  YP_929557  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0031  CDS  NC_008701  29216  30181  966  tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  YP_929558  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0032  CDS  NC_008701  30173  31096  924  peptidase M19, renal dipeptidase  YP_929559  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0033  CDS  NC_008701  31096  31230  135  hypothetical protein  YP_929560  normal  0.933791  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0034  CDS  NC_008701  31259  31909  651  radical SAM domain-containing protein  YP_929561  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0035  CDS  NC_008701  31906  32358  453  hypothetical protein  YP_929562  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0036  CDS  NC_008701  32578  33774  1197  SufBD protein  YP_929563  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0037  CDS  NC_008701  33752  34438  687  ABC transporter related  YP_929564  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0038  CDS  NC_008701  34482  34907  426  PadR-like family transcriptional regulator  YP_929565  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0039  CDS  NC_008701  34968  35900  933  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  YP_929566  normal  0.571239  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0040  CDS  NC_008701  35901  36635  735  hypothetical protein  YP_929567  normal  0.488133  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0041  CDS  NC_008701  36773  37198  426  hypothetical protein  YP_929568  normal  0.372109  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0042  CDS  NC_008701  37219  38229  1011  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_929569  normal  0.0725426  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0043  CDS  NC_008701  38226  38609  384  paREP9  YP_929570  hitchhiker  0.00594954  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0044  CDS  NC_008701  39940  40938  999  AsnC family transcriptional regulator  YP_929571  normal  0.268461  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0045  CDS  NC_008701  40935  41828  894  molybdate metabolism transcriptional regulator  YP_929572  normal  0.352642  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0046  CDS  NC_008701  41861  42790  930  binding protein, putative  YP_929573  normal  0.768713  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0047  CDS  NC_008701  42780  43424  645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_929574  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0048  CDS  NC_008701  43421  44020  600  ABC transporter related  YP_929575  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0049  CDS  NC_008701  44006  44341  336  hypothetical protein  YP_929576  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0050  CDS  NC_008701  44350  45255  906  porphobilinogen deaminase  YP_929577  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0051  CDS  NC_008701  45252  46421  1170  radical SAM domain-containing protein  YP_929578  normal  normal  0.865506  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0052  CDS  NC_008701  46476  47822  1347  hypothetical protein  YP_929579  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0053  CDS  NC_008701  47788  48063  276  hypothetical protein  YP_929580  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0054  CDS  NC_008701  48082  48978  897  homoserine kinase  YP_929581  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0055  CDS  NC_008701  49391  50677  1287  amino acid permease-associated region  YP_929582  normal  0.195903  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0056  CDS  NC_008701  50737  51762  1026  egghead-like protein  YP_929583  normal  0.350451  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0057  CDS  NC_008701  52005  52658  654  ABC transporter related  YP_929584  normal  0.268272  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0058  CDS  NC_008701  52643  53344  702  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  YP_929585  normal  0.0306121  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0059  CDS  NC_008701  53569  55635  2067  periplasmic binding protein  YP_929586  normal  0.932595  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0060  CDS  NC_008701  55655  56473  819  modD protein  YP_929587  normal  0.747163  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0061  CDS  NC_008701  56646  57761  1116  hypothetical protein  YP_929588  normal  0.97324  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0062  CDS  NC_008701  57764  58216  453  hypothetical protein  YP_929589  normal  0.638331  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0063  CDS  NC_008701  58583  59410  828  hypothetical protein  YP_929590  normal  0.129192  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0064  CDS  NC_008701  59966  60250  285  hypothetical protein  YP_929591  normal  0.262773  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0065  CDS  NC_008701  60312  60497  186  hypothetical protein  YP_929592  normal  0.241996  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0066  CDS  NC_008701  60983  61315  333  hypothetical protein  YP_929593  normal  0.307428  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0067  CDS  NC_008701  61701  61976  276  hypothetical protein  YP_929594  normal  0.125226  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0068  CDS  NC_008701  62931  63833  903  hypothetical protein  YP_929595  normal  0.363261  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0069  CDS  NC_008701  63862  65289  1428  ATPase  YP_929596  normal  0.977375  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0070  CDS  NC_008701  65293  66447  1155  hypothetical protein  YP_929597  normal  0.440626  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0071  CDS  NC_008701  66475  66819  345  hypothetical protein  YP_929598  normal  0.902341  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0072  CDS  NC_008701  66841  67050  210  hypothetical protein  YP_929599  normal  0.995023  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0073  CDS  NC_008701  67268  69127  1860  metallophosphoesterase  YP_929600  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0074  CDS  NC_008701  69124  70401  1278  hypothetical protein  YP_929601  normal  0.861381  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0075  CDS  NC_008701  70496  71992  1497  extracellular solute-binding protein  YP_929602  normal  0.735503  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0076  CDS  NC_008701  72004  73806  1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_929603  normal  0.147749  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0077  CDS  NC_008701  73803  74846  1044  ABC transporter related  YP_929604  normal  0.0473465  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0078  CDS  NC_008701  74920  76155  1236  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  YP_929605  normal  0.0695482  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0079  CDS  NC_008701  76263  76736  474  NUDIX hydrolase  YP_929606  normal  0.886246  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0080  CDS  NC_008701  76737  77858  1122  hypothetical protein  YP_929607  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0081  CDS  NC_008701  77839  79830  1992  hypothetical protein  YP_929608  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0082  CDS  NC_008701  79823  80302  480  hypothetical protein  YP_929609  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0083  CDS  NC_008701  80306  80605  300  hypothetical protein  YP_929610  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0084  CDS  NC_008701  80653  81708  1056  tRNA-modifying enzyme  YP_929611  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0085    NC_008701  81737  82041  305      normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0086  CDS  NC_008701  82100  82540  441  hypothetical protein  YP_929612  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0087  CDS  NC_008701  82590  82931  342  hypothetical protein  YP_929613  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0088  CDS  NC_008701  82953  83375  423  NUDIX hydrolase  YP_929614  normal  0.856049  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0089  CDS  NC_008701  83512  84225  714  ABC transporter related  YP_929615  normal  0.842138  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0090  CDS  NC_008701  84222  85721  1500  hypothetical protein  YP_929616  normal  0.99314  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0091  CDS  NC_008701  85712  86221  510  PaREP8 domain-containing protein  YP_929617  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0092  CDS  NC_008701  86345  86959  615  hypothetical protein  YP_929618  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0093  CDS  NC_008701  87116  87625  510  hypothetical protein  YP_929619  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0094  CDS  NC_008701  87632  88699  1068  5-formaminoimidazole-4-carboxamide-1-(beta)-D- ribofuranosyl 5'-monophosphate synthetase  YP_929620  normal  0.279967  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0095  CDS  NC_008701  88692  89762  1071  5-formaminoimidazole-4-carboxamide-1-(beta)-D- ribofuranosyl 5'-monophosphate synthetase-like protein  YP_929621  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0096  CDS  NC_008701  89809  90990  1182  glutamyl-tRNA reductase  YP_929622  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0097  CDS  NC_008701  91241  91708  468  PaREP8 domain-containing protein  YP_929623  normal  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0098  CDS  NC_008701  91705  93033  1329  hypothetical protein  YP_929624  normal  0.068103  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0099  CDS  NC_008701  93081  94157  1077  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  YP_929625  normal  0.0100977  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Pisl_0100  CDS  NC_008701  94228  94710  483  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, catalytic subunit  YP_929626  hitchhiker  0.00358232  normal  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>