1847 genes were found for organism Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Fnod_0001  CDS  NC_009718  43  1377  1335  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001409531  hitchhiker  0.000143167  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0002  CDS  NC_009718  1453  1635  183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001409532  hitchhiker  4.90188e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0003  CDS  NC_009718  1976  3829  1854  hypothetical protein  YP_001409533  hitchhiker  1.50593e-06  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0004  CDS  NC_009718  3826  4926  1101  basic membrane lipoprotein  YP_001409534  normal  0.0274031  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0005  CDS  NC_009718  5136  6701  1566  ABC transporter related  YP_001409535  normal  0.0667369  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0006  CDS  NC_009718  6698  7732  1035  inner-membrane translocator  YP_001409536  normal  0.0191826  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0007  CDS  NC_009718  7729  8688  960  inner-membrane translocator  YP_001409537  hitchhiker  0.00338005  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0008  CDS  NC_009718  8734  9132  399  hypothetical protein  YP_001409538  hitchhiker  0.000191173  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0009  CDS  NC_009718  9261  9617  357  hypothetical protein  YP_001409539  hitchhiker  0.00017434  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0010  CDS  NC_009718  9745  10020  276  histone family protein DNA-binding protein  YP_001409540  decreased coverage  6.49518e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0011  CDS  NC_009718  10098  11342  1245  metal dependent phosphohydrolase  YP_001409541  hitchhiker  7.14378e-05  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0012  CDS  NC_009718  11361  13514  2154  hypothetical protein  YP_001409542  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0013  CDS  NC_009718  13511  14161  651  hypothetical protein  YP_001409543  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0014  CDS  NC_009718  14158  15102  945  putative metal dependent phosphohydrolase  YP_001409544  normal  0.388397  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0015  CDS  NC_009718  15115  15969  855  putative adenylate/guanylate cyclase  YP_001409545  normal  0.391867  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0016  CDS  NC_009718  16022  17008  987  putative Chase2 sensor protein  YP_001409546  normal  0.0762118  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0017  CDS  NC_009718  17156  17566  411  hypothetical protein  YP_001409547  hitchhiker  0.00239143  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0018  CDS  NC_009718  17594  19282  1689  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_001409548  hitchhiker  2.32366e-06  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0019  CDS  NC_009718  19623  19859  237  hypothetical protein  YP_001409549  hitchhiker  3.94919e-08  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0020  CDS  NC_009718  19856  20074  219  hypothetical protein  YP_001409550  hitchhiker  1.45881e-06  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0021  CDS  NC_009718  20095  20289  195  hypothetical protein  YP_001409551  hitchhiker  2.30452e-05  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0022  CDS  NC_009718  20360  22552  2193  fibronectin type III domain-containing protein  YP_001409552  normal  0.0168573  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0023  CDS  NC_009718  22692  23990  1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  YP_001409553  hitchhiker  5.76582e-08  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0024  CDS  NC_009718  24184  27396  3213  polysaccharide export protein  YP_001409554  hitchhiker  0.00172785  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0025  CDS  NC_009718  27434  29395  1962  lipopolysaccharide biosynthesis protein  YP_001409555  normal  0.210943  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0026  CDS  NC_009718  29466  31289  1824  hypothetical protein  YP_001409556  hitchhiker  0.0048296  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0027    NC_009718  31579  32766  1188      unclonable  7.14263e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0028  CDS  NC_009718  33078  33278  201  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001409557  unclonable  6.70362e-12  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0029  CDS  NC_009718  33345  33548  204  FmdB family regulatory protein  YP_001409558  hitchhiker  2.04115e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0030  CDS  NC_009718  33673  34611  939  insertion element protein  YP_001409559  hitchhiker  8.55614e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0031  CDS  NC_009718  34748  36253  1506  diguanylate cyclase  YP_001409560  normal  0.0530472  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0032  CDS  NC_009718  36521  37318  798  pseudouridine synthase  YP_001409561  normal  0.604772  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0033  CDS  NC_009718  37355  38467  1113  hypothetical protein  YP_001409562  normal  0.374714  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0034  CDS  NC_009718  38748  39227  480  rubrerythrin  YP_001409563  normal  0.475045  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0035  CDS  NC_009718  39353  40303  951  ISCpe7, transposase  YP_001409564  normal  0.800546  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0036  CDS  NC_009718  40363  40803  441  cell wall biogenesis enzyme-like protein  YP_001409565  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0037    NC_009718  40903  42519  1617      normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0038  CDS  NC_009718  42584  43027  444  nucleoside-diphosphate kinase  YP_001409566  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0039  CDS  NC_009718  43009  43548  540  hypothetical protein  YP_001409567  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0040  CDS  NC_009718  43548  45608  2061  glycosyl transferase family protein  YP_001409568  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0041  CDS  NC_009718  45605  46066  462  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  YP_001409569  normal  0.154563  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0042  CDS  NC_009718  46149  46661  513  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_001409570  hitchhiker  0.00633059  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0043  CDS  NC_009718  46648  47469  822  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  YP_001409571  hitchhiker  0.000403503  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0044  CDS  NC_009718  47466  48062  597  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_001409572  hitchhiker  7.13229e-05  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0045  CDS  NC_009718  48049  48510  462  diacylglycerol kinase  YP_001409573  hitchhiker  7.39591e-08  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0046  CDS  NC_009718  48483  49520  1038  chemotaxis-specific methylesterase  YP_001409574  unclonable  3.24346e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0047  CDS  NC_009718  49571  50977  1407  S-layer domain-containing protein  YP_001409575  hitchhiker  4.98121e-08  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0048  CDS  NC_009718  51074  52153  1080  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001409576  normal  0.0244255  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0049  CDS  NC_009718  52238  53302  1065  inner-membrane translocator  YP_001409577  normal  0.562549  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0050  CDS  NC_009718  53304  54347  1044  inner-membrane translocator  YP_001409578  normal  0.617843  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0051  CDS  NC_009718  54340  55947  1608  ABC transporter related  YP_001409579  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0052  CDS  NC_009718  56049  57167  1119  lipoprotein  YP_001409580  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0053  CDS  NC_009718  57450  59321  1872  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  YP_001409581  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0054  CDS  NC_009718  59318  59908  591  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_001409582  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0055  CDS  NC_009718  59953  61638  1686  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  YP_001409583  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0056  CDS  NC_009718  61695  62525  831  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, beta subunit  YP_001409584  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0057  CDS  NC_009718  62522  63514  993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001409585  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0058    NC_009718  63809  64372  564      normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0059    NC_009718  64601  64800  200      normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0060  CDS  NC_009718  65239  66294  1056  nuclease  YP_001409586  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0061  CDS  NC_009718  66294  67730  1437  glycosyl transferase group 1  YP_001409587  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0062  CDS  NC_009718  67873  69141  1269  hypothetical protein  YP_001409588  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0063  CDS  NC_009718  69205  70395  1191  aspartate aminotransferase  YP_001409589  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0064  CDS  NC_009718  70723  71619  897  integrase catalytic region  YP_001409590  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0065  CDS  NC_009718  71706  72122  417  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001409591  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0066  CDS  NC_009718  72266  73525  1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001409592  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0067    NC_009718  74070  74411  342      normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0068    NC_009718  74720  75013  294      normal  0.748867  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0069  CDS  NC_009718  75432  77036  1605  diguanylate cyclase  YP_001409593  normal  0.222303  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0070  CDS  NC_009718  77379  78371  993  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_001409594  normal  0.627309  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0071  CDS  NC_009718  78377  79114  738  diaminopimelate epimerase  YP_001409595  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0072  CDS  NC_009718  79107  80021  915  dihydrodipicolinate synthase  YP_001409596  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0073  CDS  NC_009718  80018  80665  648  dihydrodipicolinate reductase  YP_001409597  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0074  CDS  NC_009718  80687  81436  750  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  YP_001409598  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0075  CDS  NC_009718  81443  82645  1203  aspartate kinase  YP_001409599  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0076  CDS  NC_009718  82678  83811  1134  aminotransferase class-III  YP_001409600  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0077  CDS  NC_009718  83783  84523  741  cobalt transport protein  YP_001409601  normal  0.67532  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0078  CDS  NC_009718  84648  85586  939  ISCpe7, transposase  YP_001409602  normal  0.516266  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0079  CDS  NC_009718  85627  86187  561  hypothetical protein  YP_001409603  normal  0.259095  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0080  CDS  NC_009718  86229  86987  759  hypothetical protein  YP_001409604  normal  0.158966  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0081  CDS  NC_009718  87016  88125  1110  amidohydrolase  YP_001409605  normal  0.348917  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0082  CDS  NC_009718  88275  89162  888  hypothetical protein  YP_001409606  normal  0.590083  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0083  CDS  NC_009718  89338  90477  1140  putative esterase  YP_001409607  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0084  CDS  NC_009718  90506  91516  1011  hypothetical protein  YP_001409608  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0085  CDS  NC_009718  91670  92938  1269  serine hydroxymethyltransferase  YP_001409609  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0086  CDS  NC_009718  92960  94195  1236  hypothetical protein  YP_001409610  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0087  CDS  NC_009718  94226  95290  1065  DNA integrity scanning protein DisA  YP_001409611  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0088  CDS  NC_009718  95422  96363  942  ROK family protein  YP_001409612  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0089  CDS  NC_009718  96411  96845  435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  YP_001409613  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0090  CDS  NC_009718  96882  97607  726  ABC transporter related  YP_001409614  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0091  CDS  NC_009718  97642  98229  588  uncharacterized protein-like protein  YP_001409615  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0092  CDS  NC_009718  98231  98593  363  response regulator receiver protein  YP_001409616  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0093  CDS  NC_009718  98580  99974  1395  stage II sporulation E family protein  YP_001409617  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0094  CDS  NC_009718  100018  100575  558  elongation factor P  YP_001409618  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0095  CDS  NC_009718  100603  100917  315  hypothetical protein  YP_001409619  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0096  CDS  NC_009718  100961  101386  426  transcription antitermination protein NusB  YP_001409620  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0097  CDS  NC_009718  101460  101975  516  hypothetical protein  YP_001409621  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0098  CDS  NC_009718  102004  102831  828  dihydropteroate synthase  YP_001409622  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0099  CDS  NC_009718  102828  103565  738  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_001409623  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0100  CDS  NC_009718  103633  104685  1053  von Willebrand factor type A  YP_001409624  normal  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>