1694 genes were found for organism Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
HY04AAS1_0001  CDS  NC_011126  265  1599  1335  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_002120671  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0002  CDS  NC_011126  1600  2403  804  protein of unknown function DUF81  YP_002120672  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0003  CDS  NC_011126  2400  2750  351  t-RNA-binding domain protein  YP_002120673  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0004  CDS  NC_011126  2810  4258  1449  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  YP_002120674  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0005  CDS  NC_011126  4258  5445  1188  dihydropteroate synthase  YP_002120675  decreased coverage  0.00021463  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0006  CDS  NC_011126  5438  6184  747  protein of unknown function DUF147  YP_002120676  hitchhiker  1.63488e-05  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0007  CDS  NC_011126  6189  7586  1398  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  YP_002120677  hitchhiker  0.000120725  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0008  CDS  NC_011126  7588  8679  1092  secretion protein HlyD family protein  YP_002120678  hitchhiker  3.02217e-05  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0009  CDS  NC_011126  8758  9465  708  ABC transporter related  YP_002120679  hitchhiker  4.06325e-06  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0010  CDS  NC_011126  9467  10609  1143  protein of unknown function DUF214  YP_002120680  hitchhiker  2.61565e-06  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0011  CDS  NC_011126  11078  11563  486  rare lipoprotein A  YP_002120681  hitchhiker  4.15587e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0012  CDS  NC_011126  11837  12499  663  phosphate uptake regulator, PhoU  YP_002120682  hitchhiker  2.24503e-10  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0013  CDS  NC_011126  12459  14255  1797  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_002120683  hitchhiker  1.83157e-08  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0014  CDS  NC_011126  14245  15384  1140  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002120684  hitchhiker  0.00955698  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0015  CDS  NC_011126  15381  16352  972  quinolinate synthetase  YP_002120685  normal  0.0180835  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0016  CDS  NC_011126  16463  17401  939  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_002120686  decreased coverage  0.000100275  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0017  CDS  NC_011126  17522  18241  720  pseudouridine synthase  YP_002120687  hitchhiker  3.55614e-05  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0018  CDS  NC_011126  18238  18786  549  GTP cyclohydrolase I  YP_002120688  hitchhiker  0.00365351  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0019  CDS  NC_011126  18866  19663  798  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  YP_002120689  normal  0.0906619  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0020  CDS  NC_011126  19653  20780  1128  peptide chain release factor 2  YP_002120690  hitchhiker  0.00724435  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0021  CDS  NC_011126  20782  20994  213  copper ion binding protein  YP_002120691  hitchhiker  0.00208737  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0022  CDS  NC_011126  21151  21885  735  hypothetical protein  YP_002120692  hitchhiker  0.000140473  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0023  CDS  NC_011126  22003  23157  1155  chaperone protein DnaJ  YP_002120693  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0024  CDS  NC_011126  23147  23542  396  transcriptional regulator, MerR family  YP_002120694  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0025  CDS  NC_011126  23571  23864  294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  YP_002120695  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0026  CDS  NC_011126  23857  25242  1386  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  YP_002120696  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0027  CDS  NC_011126  25252  26154  903  tRNA synthetase class II (D K and N)  YP_002120697  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0028  CDS  NC_011126  26151  26801  651  exsB protein  YP_002120698  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0029  CDS  NC_011126  26805  28427  1623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002120699  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0030  CDS  NC_011126  28417  29304  888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_002120700  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0031  CDS  NC_011126  29387  29803  417  hypothetical protein  YP_002120701  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0032  CDS  NC_011126  30182  31006  825  carboxylesterase  YP_002120702  normal  0.436632  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0033  CDS  NC_011126  31008  32369  1362  aminotransferase class-III  YP_002120703  normal  0.0794397  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0034  CDS  NC_011126  32317  32946  630  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  YP_002120704  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0035  CDS  NC_011126  33006  33512  507  Redoxin domain protein  YP_002120705  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0036  CDS  NC_011126  33590  34489  900  5'-3' exonuclease  YP_002120706  normal  0.974407  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0037  CDS  NC_011126  34490  34984  495  protein of unknown function DUF151  YP_002120707  normal  0.210982  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0038  CDS  NC_011126  35103  35372  270  hypothetical protein  YP_002120708  normal  0.124511  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0039  CDS  NC_011126  35376  35600  225  ferredoxin  YP_002120709  normal  0.294704  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0040  CDS  NC_011126  35611  36291  681  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  YP_002120710  normal  0.284048  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0041  CDS  NC_011126  36303  37169  867  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  YP_002120711  normal  0.155885  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0042  CDS  NC_011126  37200  38369  1170  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_002120712  normal  0.0698533  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0043  CDS  NC_011126  38385  39098  714  CO dehydrogenase beta subunit/acetyl-CoA synthase epsilon subunit  YP_002120713  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0044  CDS  NC_011126  39298  40050  753  hydrogenase accessory protein HypB  YP_002120714  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0045  CDS  NC_011126  40043  40432  390  HupH hydrogenase expression protein  YP_002120715  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0046  CDS  NC_011126  40426  42636  2211  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  YP_002120716  normal  0.890039  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0047  CDS  NC_011126  42633  42977  345  hydrogenase nickel insertion protein HypA  YP_002120717  normal  0.729496  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0048  CDS  NC_011126  42979  43965  987  hydrogenase expression/formation protein HypE  YP_002120718  normal  0.273112  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0049  CDS  NC_011126  43956  45050  1095  hydrogenase expression/formation protein HypD  YP_002120719  normal  0.185682  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0050  CDS  NC_011126  45028  45267  240  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  YP_002120720  normal  0.0199  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0051  CDS  NC_011126  45277  45777  501  hydrogenase maturation protease  YP_002120721  normal  0.0212564  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0052  CDS  NC_011126  45774  46469  696  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  YP_002120722  normal  0.036623  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0053  CDS  NC_011126  46462  48363  1902  nickel-dependent hydrogenase large subunit  YP_002120723  hitchhiker  7.25575e-06  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0054  CDS  NC_011126  48367  49437  1071  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  YP_002120724  unclonable  2.50606e-13  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0055  CDS  NC_011126  49700  51844  2145  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002120725  hitchhiker  7.59141e-07  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0056  CDS  NC_011126  51854  53233  1380  hypothetical protein  YP_002120726  hitchhiker  0.000444943  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0057  CDS  NC_011126  53236  53766  531  hypothetical protein  YP_002120727  hitchhiker  0.00383722  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0058  CDS  NC_011126  53808  54536  729  hypothetical protein  YP_002120728  normal  0.112316  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0059  CDS  NC_011126  54665  56569  1905  protein of unknown function DUF255  YP_002120729  normal  0.0512308  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0060  CDS  NC_011126  56614  57534  921  phosphoesterase DHHA1  YP_002120730  hitchhiker  0.00992253  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0061  CDS  NC_011126  57534  59111  1578  RNA binding S1 domain protein  YP_002120731  decreased coverage  6.65212e-06  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0062  CDS  NC_011126  59219  59377  159  hypothetical protein  YP_002120732  decreased coverage  2.51038e-10  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0063  CDS  NC_011126  59382  60137  756  MazG family protein  YP_002120733  hitchhiker  1.20209e-08  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0064  CDS  NC_011126  60800  61264  465  hypothetical protein  YP_002120734  hitchhiker  0.000229836  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0065  CDS  NC_011126  61362  62363  1002  ketol-acid reductoisomerase  YP_002120735  hitchhiker  3.48279e-07  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0066  CDS  NC_011126  62360  62983  624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  YP_002120736  normal  0.0596395  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0067  CDS  NC_011126  62976  63644  669  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  YP_002120737  normal  0.679825  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0068  CDS  NC_011126  63675  63932  258  hypothetical protein  YP_002120738  normal  0.724716  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0069  CDS  NC_011126  63929  64717  789  dihydrodipicolinate reductase  YP_002120739  normal  0.936348  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0070  CDS  NC_011126  64714  65238  525  HNH endonuclease  YP_002120740  normal  0.856435  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0071  CDS  NC_011126  65293  65484  192  ribosomal protein L28  YP_002120741  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0072  CDS  NC_011126  65536  66447  912  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002120742  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0073  CDS  NC_011126  66424  67596  1173  phosphate-selective porin O and P  YP_002120743  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0074  CDS  NC_011126  67679  67942  264  nitrogen-fixing NifU domain protein  YP_002120744  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0075  CDS  NC_011126  67957  68580  624  Superoxide dismutase  YP_002120745  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0076  CDS  NC_011126  68636  69223  588  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  YP_002120746  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0077  CDS  NC_011126  69216  70184  969  Lytic transglycosylase catalytic  YP_002120747  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0078  CDS  NC_011126  70234  72216  1983  general secretion pathway protein D  YP_002120748  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0079  CDS  NC_011126  72431  72835  405  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_002120749  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0080  CDS  NC_011126  72829  73830  1002  SMF family protein  YP_002120750  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0081  CDS  NC_011126  73823  74482  660  protein of unknown function DUF558  YP_002120751  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0082  CDS  NC_011126  74519  76174  1656  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_002120752  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0083  CDS  NC_011126  76181  77275  1095  hypothetical protein  YP_002120753  normal  0.0225127  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0084  CDS  NC_011126  77396  78196  801  hypothetical protein  YP_002120754  decreased coverage  7.52991e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0085  CDS  NC_011126  78216  79223  1008  putative sulfate-binding protein  YP_002120755  hitchhiker  3.72808e-10  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0086  CDS  NC_011126  79479  80222  744  ABC transporter related  YP_002120756  hitchhiker  0.000503646  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0087  CDS  NC_011126  80215  81468  1254  CBS domain containing protein  YP_002120757  hitchhiker  8.9448e-05  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0088  CDS  NC_011126  81425  82123  699  hypothetical protein  YP_002120758  normal  0.0780431  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0089  CDS  NC_011126  82156  84036  1881  acetate/CoA ligase  YP_002120759  normal  0.191746  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0090  CDS  NC_011126  84037  85557  1521  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_002120760  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0091  CDS  NC_011126  85619  86767  1149  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_002120761  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0092  CDS  NC_011126  86768  87100  333  hypothetical protein  YP_002120762  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0093  CDS  NC_011126  87097  87378  282  hypothetical protein  YP_002120763  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0094  CDS  NC_011126  87375  87773  399  hypothetical protein  YP_002120764  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0095  CDS  NC_011126  87770  88906  1137  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_002120765  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0096  CDS  NC_011126  89036  90628  1593  transposase, IS605 OrfB family  YP_002120766  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0097  CDS  NC_011126  90661  91845  1185  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  YP_002120767  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0098  CDS  NC_011126  91855  93654  1800  GTP-binding protein LepA  YP_002120768  normal  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0099  CDS  NC_011126  93651  94748  1098  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  YP_002120769  normal  0.521426  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0100  CDS  NC_011126  94906  95247  342  hypothetical protein  YP_002120770  normal  0.105721  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>